HaHafeng 96290d2f76 feat(aia): Implement Protocol Agent MVP with reusable Agent framework
Sprint 1-3 Completed (Backend + Frontend):

Backend (Sprint 1-2):
- Implement 5-layer Agent framework (Query->Planner->Executor->Tools->Reflection)
- Create agent_schema with 6 tables (agent_definitions, stages, prompts, sessions, traces, reflexion_rules)
- Create protocol_schema with 2 tables (protocol_contexts, protocol_generations)
- Implement Protocol Agent core services (Orchestrator, ContextService, PromptBuilder)
- Integrate LLM service adapter (DeepSeek/Qwen/GPT-5/Claude)
- 6 API endpoints with full authentication
- 10/10 API tests passed

Frontend (Sprint 3):
- Add Protocol Agent entry in AgentHub (indigo theme card)
- Implement ProtocolAgentPage with 3-column layout
- Collapsible sidebar (Gemini style, 48px <-> 280px)
- StatePanel with 5 stage cards (scientific_question, pico, study_design, sample_size, endpoints)
- ChatArea with sync button and action cards integration
- 100% prototype design restoration (608 lines CSS)
- Detailed endpoints structure: baseline, exposure, outcomes, confounders

Features:
- 5-stage dialogue flow for research protocol design
- Conversation-driven interaction with sync-to-protocol button
- Real-time context state management
- One-click protocol generation button (UI ready, backend pending)

Database:
- agent_schema: 6 tables for reusable Agent framework
- protocol_schema: 2 tables for Protocol Agent
- Seed data: 1 agent + 5 stages + 9 prompts + 4 reflexion rules

Code Stats:
- Backend: 13 files, 4338 lines
- Frontend: 14 files, 2071 lines
- Total: 27 files, 6409 lines

Status: MVP core functionality completed, pending frontend-backend integration testing

Next: Sprint 4 - One-click protocol generation + Word export
2026-01-24 17:29:24 +08:00

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  • React 18 + TypeScript
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  • Node.js + Fastify + TypeScript
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  • PostgreSQL
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  • DifyRAG知识库
  • DeepSeek-V3主力LLM
  • Qwen3备用LLM

核心功能

1. 智能问答系统

  • 基于项目背景的上下文对话
  • 支持@知识库引用
  • 3种对话模式RAG快速检索、全文阅读、批处理

2. 知识库管理

  • 文档上传与管理支持PDF/Word/Txt
  • 智能文本提取Python微服务
  • RAG检索优化top_k=15, chunk_size=1500

3. 批处理模式

  • 批量提取结构化信息3-50个文档
  • 预设模板+自定义Prompt
  • Excel导出

4. 稿件审查功能 新增

  • 双维度智能评估
    • 稿约规范性评估11个标准
    • 方法学评估3个部分20个检查点
  • 完整工作流程
    • Word文档上传.doc/.docx
    • 实时进度展示
    • 详细评估报告
    • PDF导出+文本复制
  • 多模型支持DeepSeek-V3 / Qwen3-72B / Qwen-Long
  • 独立导航入口:左侧菜单"稿件审查"

5. 12个智能体规划中

  • 选题评价智能体(已完成)
  • 其他11个智能体计划中

🚀 快速开始

1. 启动基础服务

# 启动PostgreSQL和Redis
docker-compose up -d

2. 后端开发

cd backend
npm install
npm run dev

3. 前端开发

cd frontend
npm install
npm run dev

📦 目录结构

AIclinicalresearch/
├── frontend/           # 前端项目
├── backend/            # 后端项目
├── docs/               # 项目文档
├── docker-compose.yml  # Docker配置
└── README.md           # 本文件

🔑 环境变量

请参考 .env.example 文件配置环境变量。

📖 开发指南

请查看 开发里程碑 了解详细的开发计划。

📄 License

MIT


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当前开发阶段: 里程碑1 - Day 6前端基础架构
开发进度: 50% - 前后端基础架构已完成

Description
No description provided
Readme 76 MiB
Languages
TypeScript 83%
Python 6.2%
JavaScript 3.8%
CSS 3.2%
R 2.5%
Other 1.2%