feat(deploy): Complete PostgreSQL migration and Docker image build

Summary:
- PostgreSQL database migration to RDS completed (90MB SQL, 11 schemas)
- Frontend Nginx Docker image built and pushed to ACR (v1.0, ~50MB)
- Python microservice Docker image built and pushed to ACR (v1.0, 1.12GB)
- Created 3 deployment documentation files

Docker Configuration Files:
- frontend-v2/Dockerfile: Multi-stage build with nginx:alpine
- frontend-v2/.dockerignore: Optimize build context
- frontend-v2/nginx.conf: SPA routing and API proxy
- frontend-v2/docker-entrypoint.sh: Dynamic env injection
- extraction_service/Dockerfile: Multi-stage build with Aliyun Debian mirror
- extraction_service/.dockerignore: Optimize build context
- extraction_service/requirements-prod.txt: Production dependencies (removed Nougat)

Deployment Documentation:
- docs/05-部署文档/00-部署进度总览.md: One-stop deployment status overview
- docs/05-部署文档/07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md: Frontend deployment guide
- docs/05-部署文档/08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md: Database deployment guide
- docs/00-系统总体设计/00-系统当前状态与开发指南.md: Updated with deployment status

Database Migration:
- RDS instance: pgm-2zex1m2y3r23hdn5 (2C4G, PostgreSQL 15.0)
- Database: ai_clinical_research
- Schemas: 11 business schemas migrated successfully
- Data: 3 users, 2 projects, 1204 literatures verified
- Backup: rds_init_20251224_154529.sql (90MB)

Docker Images:
- Frontend: crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0
- Python: crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0

Key Achievements:
- Resolved Docker Hub network issues (using generic tags)
- Fixed 30 TypeScript compilation errors
- Removed Nougat OCR to reduce image size by 1.5GB
- Used Aliyun Debian mirror to resolve apt-get network issues
- Implemented multi-stage builds for optimization

Next Steps:
- Deploy Python microservice to SAE
- Build Node.js backend Docker image
- Deploy Node.js backend to SAE
- Deploy frontend Nginx to SAE
- End-to-end verification testing

Status: Docker images ready, SAE deployment pending
This commit is contained in:
2025-12-24 18:21:55 +08:00
parent 5fa7b0bbe1
commit b64896a307
134 changed files with 4185 additions and 53 deletions

View File

@@ -242,6 +242,8 @@

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@@ -38,5 +38,7 @@ WHERE table_schema = 'dc_schema'

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@@ -78,3 +78,5 @@ ORDER BY ordinal_position;

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@@ -91,3 +91,5 @@ runMigration()

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@@ -25,3 +25,5 @@ COMMENT ON COLUMN "dc_schema"."dc_tool_c_sessions"."column_mapping" IS '列名

View File

@@ -49,6 +49,8 @@ COMMENT ON COLUMN dc_schema.dc_tool_c_sessions.expires_at IS '过期时间(创

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@@ -199,6 +199,8 @@ function extractCodeBlocks(obj, blocks = []) {

View File

@@ -218,6 +218,8 @@ checkDCTables();

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@@ -170,6 +170,8 @@ createAiHistoryTable()

View File

@@ -157,6 +157,8 @@ createToolCTable()

View File

@@ -154,6 +154,8 @@ createToolCTable()

View File

@@ -289,3 +289,5 @@ export function getBatchItems<T>(

View File

@@ -322,6 +322,8 @@ runTests().catch((error) => {

View File

@@ -301,6 +301,8 @@ Content-Type: application/json

View File

@@ -380,6 +380,8 @@ export class ExcelExporter {

View File

@@ -237,6 +237,8 @@ export const conflictDetectionService = new ConflictDetectionService();

View File

@@ -265,6 +265,8 @@ export const templateService = new TemplateService();

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@@ -187,6 +187,8 @@ curl -X POST http://localhost:3000/api/v1/dc/tool-c/test/execute \

View File

@@ -242,5 +242,7 @@ export const streamAIController = new StreamAIController();

View File

@@ -390,3 +390,5 @@ SET session_replication_role = 'origin';

View File

@@ -92,3 +92,5 @@ WHERE key = 'verify_test';

View File

@@ -235,3 +235,5 @@ verifyDatabase()

View File

@@ -25,3 +25,5 @@ export {}

View File

@@ -45,6 +45,8 @@ Write-Host "✅ 完成!" -ForegroundColor Green

View File

@@ -333,5 +333,7 @@ runAdvancedTests().catch(error => {

View File

@@ -398,6 +398,8 @@ runAllTests()

View File

@@ -356,6 +356,8 @@ runAllTests()

View File

@@ -143,3 +143,5 @@ Set-Location ..

View File

@@ -1,10 +1,10 @@
# AIclinicalresearch 系统当前状态与开发指南
> **文档版本:** v2.0
> **文档版本:** v2.1
> **创建日期:** 2025-11-28
> **维护者:** 开发团队
> **最后更新:** 2025-12-22
> **重大进展:** 🏆 **DC Tool C Postgres-Only异步架构改造完成** - 性能提升99%,异步任务处理标准建立
> **最后更新:** 2024-12-24
> **重大进展:** 🚀 **阿里云生产环境部署启动** - PostgreSQL数据迁移完成、前端Nginx与Python微服务镜像已推送ACR
> **文档目的:** 快速了解系统当前状态为新AI助手提供上下文
---
@@ -98,11 +98,13 @@
**云原生部署**
- 阿里云 SAE (Serverless 应用引擎)
- RDS PostgreSQL 15 + OSS (对象存储) + Redis (可选Dify需要)
- RDS PostgreSQL 15 + OSS (对象存储) + NAT网关
- ACR (容器镜像服务 - 个人版免费)
- **部署状态**:🚀 **进行中**PostgreSQL✅、前端镜像✅、Python镜像✅
---
## 🚀 当前开发状态2025-12-10
## 🚀 当前开发状态2024-12-24
### ✅ 已完成模块
@@ -254,6 +256,137 @@
---
## 🚀 阿里云生产环境部署状态2024-12-24
### ✅ 已完成部署
#### 1. 基础设施层
-**VPC网络**`vpc-2ze055cptkew9c38w4r06`172.17.0.0/16
-**NAT网关**`ngw-2zeec9ulzgw7ywvx1pst6`公网IP: 182.92.176.14
-**安全组**`sg-2zedk6fi8sgmmcwdu7tu`
-**交换机**2个可用区F + 可用区A
-**SAE命名空间**`cn-beijing:test-airesearch`
#### 2. 数据存储层
-**RDS PostgreSQL 15**
- 实例ID: `pgm-2zex1m2y3r23hdn5`
- 规格: 2核4GB
- 内网地址: `pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com:5432`
- 数据库: `ai_clinical_research`
- **数据迁移**: ✅ 完成90MB SQL文件约12秒导入
- **Schema验证**: ✅ 11个Schema全部迁移成功
- **数据验证**: ✅ 用户3条、项目2条、文献1204条
- **部署时间**: 2024-12-24
-**OSS对象存储**
- Bucket: `ai-clinical-research`
- 存储类型: 标准存储(同城冗余)
- 内网域名: `ai-clinical-research.oss-cn-beijing-internal.aliyuncs.com`
- RAM用户: `oss-bucket-put-object@1991407246109125.onaliyun.com`
- AccessKey: 已配置(不公开)
#### 3. 容器镜像服务ACR
-**命名空间**: `ai-clinical`
-**Registry**: `crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com`
-**已推送镜像**:
- **前端Nginx**: `ai-clinical_frontend-nginx:v1.0`约50MB
- 构建时间: 2024-12-24
- 基础镜像: `nginx:alpine`
- 功能: React SPA + Nginx反向代理 + 动态环境变量
- 配置文件: `frontend-v2/Dockerfile`, `nginx.conf`, `.dockerignore`
- **Python微服务**: `python-extraction:v1.0`1.12GB
- 构建时间: 2024-12-24
- 基础镜像: `python:3-slim`
- 功能: PDF提取PyMuPDF+ 数据清洗pandas/numpy/polars
- 特性: 移除Nougat减小1.5GB、使用阿里云Debian源
- 配置文件: `extraction_service/Dockerfile`, `requirements-prod.txt`, `.dockerignore`
### 🚧 进行中
#### 4. SAE应用部署
-**Python微服务**: 镜像已推送待部署到SAE
- 目标规格: 1核2GB
- 端口: 8000
- 健康检查: `/api/health`
-**Node.js后端**: Docker镜像待构建
- 目标规格: 2核4GB
- 端口: 3001
- 依赖: RDS PostgreSQL
-**前端Nginx**: 镜像已推送待部署到SAE
- 目标规格: 1核2GB
- 端口: 80
- 需配置: 后端API内网地址
### 📋 待完成
- [ ] Python微服务部署到SAE
- [ ] Node.js后端Docker镜像构建
- [ ] Node.js后端部署到SAE
- [ ] 前端Nginx部署到SAE
- [ ] 配置服务间内网通信
- [ ] 全链路验证测试
- [ ] Dify AI服务部署可选
### 📊 部署文档
**部署进度总览**
- [00-部署进度总览.md](../05-部署文档/00-部署进度总览.md) - 🎯 **一站式部署状态查看**
**操作手册**
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](../05-部署文档/07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md)
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](../05-部署文档/08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md)
- Python微服务SAE部署操作手册待创建
**技术指南**
- [01-快速部署SOP-零基础版.md](../05-部署文档/01-快速部署SOP-零基础版.md) - 完整部署流程
- [04-Python微服务-SAE容器部署指南.md](../05-部署文档/04-Python微服务-SAE容器部署指南.md)
- [06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md](../05-部署文档/06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md)
### 🎯 部署关键成就
1. **PostgreSQL数据迁移**
- 采用`pg_dump`全量导出/导入方案
- 11个Schema完整迁移
- 数据一致性验证通过
- 安全加固(外网访问已关闭)
2. **前端Nginx镜像优化**
- 解决Docker Hub网络问题使用通用标签
- 修复30个TypeScript编译错误
- 多阶段构建优化
- 健康检查通过
3. **Python微服务镜像优化**
- 移除Nougat OCR减小1.5GB
- 使用阿里云Debian镜像源解决apt-get网络问题
- 保留数据清洗功能pandas/numpy/polars
- 运行时依赖优化libgl1、libglib2.0
4. **镜像配置文件Git管理**
- Dockerfile: ✅ 已提交Git构建蓝图
- .dockerignore: ✅ 已提交Git优化构建
- 依赖文件: ✅ 已提交Git可复现
- 敏感信息: ❌ 禁止提交(.env等
### 💰 当前运行成本估算
| 服务 | 规格 | 月成本 | 状态 |
|------|------|-------|------|
| RDS PostgreSQL | 2核4GB | ¥260 | ✅ 运行中 |
| OSS存储 | 10GB | ¥2 | ✅ 运行中 |
| NAT网关 | 小型 | ¥60 | ✅ 运行中 |
| EIP流量 | 5Mbps | ¥40 | ✅ 运行中 |
| ACR镜像仓库 | 个人版 | ¥0免费 | ✅ 运行中 |
| SAE - Python | 1核2GB×1 | ¥60 | ⏳ 待部署 |
| SAE - Node.js | 2核4GB×1 | ¥120 | ⏳ 待部署 |
| SAE - Frontend | 1核2GB×1 | ¥60 | ⏳ 待部署 |
| **总计** | - | **¥602/月** | 部署中 |
---
## 📁 项目结构概览
```
@@ -336,33 +469,68 @@ AIclinicalresearch/
| **2025-11-18~21** | Week 3~4 | ✅ ASL标题摘要初筛MVP |
| **2025-11-22~23** | ASL Day 2-5 | ✅ ASL全文复筛后端完成 |
| **2025-11-26~27** | DC Day 2-3 | ✅ DC工具B健康检查+模板管理 |
| **2025-11-28** | 当前 | 🚧 ASL全文复筛前端 + DC工具B开发 |
| **2025-11-28** | DC Day 4-8 | ✅ DC Tool C MVP + UX重大改进完成 |
| **2025-12-13** | 架构优化 | ✅ Postgres-Only架构改造完成 |
| **2024-12-24** | **部署启动** 🚀 | ✅ PostgreSQL数据迁移 + 前端/Python镜像推送ACR |
| **当前** | 部署进行中 | 🚧 SAE应用部署 + Node.js后端构建 |
---
## 🎯 下一步计划
### 短期1-2周
1. **ASL全文复筛前端**Day 6-8
### 🔥 最高优先级1-2天- 部署到生产环境
1. **Python微服务部署到SAE**
- 创建SAE应用
- 配置环境变量
- 健康检查验证
- 获取内网地址
2. **Node.js后端Docker镜像构建**
- 创建Dockerfile
- 配置数据库连接RDS内网地址
- 构建并推送到ACR
3. **Node.js后端部署到SAE**
- 创建SAE应用2核4GB
- 配置环境变量DATABASE_URL、OSS等
- 配置Python微服务内网地址
- 健康检查验证
4. **前端Nginx部署到SAE**
- 创建SAE应用1核2GB
- 配置后端API内网地址
- 公网域名绑定
- SSL证书配置
5. **全链路验证测试**
- 前端→Node.js后端→Python微服务→RDS
- ASL文献筛选完整流程
- DC数据清洗完整流程
- 性能和稳定性测试
### 短期1-2周- 功能完善
6. **ASL全文复筛前端**Day 6-8
- 4个核心页面设置、进度、工作台、结果
- PDF上传和预览功能
- 双模型判断对比UI
- 实时进度监控
2. **DC工具B完成**Day 4-7
- ExtractionService实现
- 批量提取API
- 前端集成和测试
7. **DC工具B前端开发**
- 健康检查界面
- 模板管理界面
- 批量提取界面
- 冲突解决界面
### 中期1-2月
3. DC模块完整实现工具A、工具C、Portal
4. ASL模块优化Prompt优化、并发处理
5. LLM网关统一抽取
### 中期1-2月- 模块完善
8. DC模块完整实现工具A、Portal优化
9. ASL模块优化Prompt优化、并发处理
10. 监控和告警系统配置
11. CI/CD流程建立
### 长期3月+
6. SSA模块智能统计分析
7. ST模块统计分析工具
8. RVW模块稿件审查系统
### 长期3月+- 新模块开发
12. SSA模块智能统计分析
13. ST模块统计分析工具
14. RVW模块稿件审查系统
---
@@ -380,6 +548,12 @@ AIclinicalresearch/
- [DC模块README](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/README.md)
- [DC Day3完成总结](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/Day3完成总结.md)
### 🚀 部署文档(新增)
- ⭐ [00-部署进度总览.md](../05-部署文档/00-部署进度总览.md) - **一站式部署状态查看**
- [01-快速部署SOP-零基础版.md](../05-部署文档/01-快速部署SOP-零基础版.md) - 完整部署流程
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](../05-部署文档/07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md)
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](../05-部署文档/08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md)
### 🏗️ 架构设计
- [平台基础设施规划](../09-架构实施/04-平台基础设施规划.md)
- [云原生部署架构指南](../09-架构实施/03-云原生部署架构指南.md)
@@ -447,6 +621,13 @@ npm run dev # http://localhost:3000
- 🚧 **开发中**ASL80%、DCTool C 98%Tool B后端100%Tool B前端0%
- 📋 **未开始**SSA、ST、RVW
### 部署完成度
-**基础设施**VPC100%、NAT网关100%、安全组100%
-**数据存储**RDS PostgreSQL100%、OSS100%
-**容器镜像**前端Nginx100%、Python微服务100%
- 🚧 **SAE应用**Python微服务待部署、Node.js后端镜像待构建、前端Nginx待部署
- 📋 **验证测试**:全链路测试(待进行)
### 测试覆盖率
- **平台基础层**100%8/8模块全部通过
- **AIA模块**:手动测试通过
@@ -574,9 +755,9 @@ if (items.length >= 50) {
---
**文档版本**v1.8
**最后更新**2025-12-13
**下次更新**Phase 8 全面测试完成 或 Phase 9 SAE 部署完成
**文档版本**v2.1
**最后更新**2024-12-24
**下次更新**SAE应用部署完成 或 全链路验证测试完成
---

View File

@@ -585,3 +585,5 @@ async saveProcessedData(recordId, newData) {
**最后更新**: 2025-12-22
**文档状态**: ✅ 已完成

View File

@@ -772,3 +772,5 @@ export const AsyncProgressBar: React.FC<AsyncProgressBarProps> = ({
**最后更新**: 2025-12-22
**文档状态**: ✅ 初始版本

View File

@@ -1262,6 +1262,8 @@ interface FulltextScreeningResult {

View File

@@ -376,6 +376,8 @@ GET /api/v1/asl/fulltext-screening/tasks/:taskId/export

View File

@@ -478,6 +478,8 @@ Failed to open file '\\tmp\\extraction_service\\temp_10000_test.pdf'

View File

@@ -544,6 +544,8 @@ df['creatinine'] = pd.to_numeric(df['creatinine'], errors='coerce')

View File

@@ -959,6 +959,8 @@ export const aiController = new AIController();

View File

@@ -1293,6 +1293,8 @@ npm install react-markdown

View File

@@ -204,3 +204,5 @@ FMA___基线 | FMA___1个月 | FMA___2个月

View File

@@ -362,3 +362,5 @@ formula = "FMA总分0-100 / 100"

View File

@@ -196,3 +196,5 @@ async handleFillnaMice(request, reply) {

View File

@@ -168,3 +168,5 @@ method: 'mean' | 'median' | 'mode' | 'constant' | 'ffill' | 'bfill'

View File

@@ -616,6 +616,8 @@ import { logger } from '../../../../common/logging/index.js';

View File

@@ -419,6 +419,8 @@ import { ChatContainer } from '@/shared/components/Chat';

View File

@@ -329,6 +329,8 @@ const initialMessages = defaultMessages.length > 0 ? defaultMessages : [{

View File

@@ -617,6 +617,8 @@ http://localhost:5173/data-cleaning/tool-c

View File

@@ -405,6 +405,8 @@ Docs: docs/03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/DC模块重建

View File

@@ -278,6 +278,8 @@ ConflictDetectionService // 冲突检测(字段级对比)

View File

@@ -442,6 +442,8 @@ Tool B后端代码**100%复用**了平台通用能力层,无任何重复开发

View File

@@ -219,6 +219,8 @@ $ node scripts/check-dc-tables.mjs

View File

@@ -452,6 +452,8 @@ ${fields.map((f, i) => `${i + 1}. ${f.name}${f.desc}`).join('\n')}

View File

@@ -0,0 +1,699 @@
# 🚀 AI临床研究平台 - 部署进度总览
> **文档用途**:统一展示项目部署状态、资源信息、操作手册索引
> **更新时间**2024-12-24
> **维护人员**:开发团队
---
## 📊 一、部署进度一览表
| 服务名称 | 部署状态 | 镜像版本 | 部署位置 | 完成时间 | 操作文档 |
|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
| **PostgreSQL数据库** | ✅ 已完成 | PostgreSQL 15 | RDS | 2024-12-24 | [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](./08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md) |
| **前端Nginx服务** | ✅ 已完成 | v1.0 | SAE待部署 | 2024-12-24 | [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](./07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md) |
| **Python微服务** | ✅ 镜像已推送 | v1.0 | SAE待部署 | 2024-12-24 | 待创建 |
| **Node.js后端** | ⏳ 待开始 | - | - | - | - |
| **Dify AI服务** | ⏳ 待开始 | - | - | - | - |
**图例说明**
- ✅ 已完成:服务已成功部署并验证
- 🔄 进行中:正在部署或配置
- ⏳ 待开始:尚未开始
---
## 🔑 二、阿里云资源速查表
### 2.1 ACR容器镜像仓库
**基本信息**
- **命名空间**`ai-clinical`
- **Registry地址公网**`crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com`
- **Registry地址VPC**`crpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com`
- **用户名**`gofeng117@163.com`
- **密码**`fengzhibo117`
**镜像仓库列表**
| 仓库名称 | 最新版本 | 镜像大小 | 公网地址 | VPC地址 |
|---------|---------|---------|---------|---------|
| **python-extraction** | v1.0 | 1.12GB | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0` | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0` |
| **ai-clinical_frontend-nginx** | v1.0 | ~50MB | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0` | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0` |
| **nodejs-backend** | - | - | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/nodejs-backend` | `crpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/nodejs-backend` |
---
### 2.2 VPC网络与NAT网关
**VPC信息**
- **VPC ID**`vpc-2ze055cptkew9c38w4r06`
- **VPC名称**`ai-clinical-vpc`
- **网段**`172.17.0.0/16`
- **地域**华北2北京
- **交换机1**`vsw-2zevacop039bxrmj6yc0c`可用区F
- **交换机2**`vsw-2zehoeyw9ldncymcyvfwq`可用区A
- **安全组ID**`sg-2zedk6fi8sgmmcwdu7tu`
**NAT网关信息**
- **NAT网关名称**`NAT_airesearch`
- **NAT网关ID**`ngw-2zeec9ulzgw7ywvx1pst6`
- **公网IPEIP**`182.92.176.14`
- **SNAT表ID**`stb-2zesszmzx1qpwf1cb2bry`
- **SNAT条目**覆盖所有交换机允许VPC内资源访问公网
---
### 2.3 RDS PostgreSQL数据库
**实例信息**
- **实例ID**`pgm-2zex1m2y3r23hdn5`
- **规格**2核4GBpg.n2.2c.1m
- **存储空间**100GBSSD云盘
- **PostgreSQL版本**15.0
- **内网地址**`pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com:5432`
- **外网地址**`pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com`(⚠️ 已关闭)
- **最大连接数**400
- **时区**Asia/Shanghai
- **白名单**172.17.0.0/16VPC网段
**数据库配置**
- **数据库名**`ai_clinical_research`
- **用户名**`airesearch`
- **密码**`Xibahe@fengzhibo117`
- **字符集**UTF8
- **排序规则**en_US.utf8
**Schema架构**11个业务Schema
| Schema名称 | 功能模块 | 表数量 | 说明 |
|-----------|---------|-------|------|
| `platform_schema` | 平台核心 | 8 | 用户、权限、任务队列pg-boss |
| `asl_schema` | 系统文献筛查 | 6 | 项目、文献、筛查记录 |
| `aia_schema` | AI智能摘要 | 5 | AI项目、摘要任务 |
| `dc_schema` | 数据清洗 | 6 | 工具A/B/C数据处理 |
| `pkb_schema` | 个人知识库 | 5 | 文献管理、笔记 |
| `admin_schema` | 系统管理 | 0 | 预留 |
| `rvw_schema` | 文献回顾 | 0 | 预留 |
| `ssa_schema` | 智能统计分析 | 0 | 预留 |
| `st_schema` | 统计工具 | 0 | 预留 |
| `common_schema` | 公共模块 | 0 | 预留 |
| `information_schema` | 系统元数据 | - | PostgreSQL标准 |
**关键数据量**截至2024-12-24
- 用户3条
- AI项目2条
- 文献1204条
- 筛查记录783条
- pg-boss任务350条
**连接字符串格式**
```
postgresql://airesearch:Xibahe%40fengzhibo117@pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com:5432/ai_clinical_research
```
⚠️ 注意:密码中的 `@` 需要URL编码为 `%40`
---
### 2.4 SAE Serverless应用
**命名空间**
- **命名空间ID**`cn-beijing:test-airesearch`
- **地域**华北2北京
**已部署/待部署应用列表**
| 应用名称 | 状态 | 规格 | 实例数 | 端口 | 内网地址 | 公网地址 |
|---------|------|------|-------|------|---------|---------|
| **python-extraction** | 镜像已推送 | 1核2GB | 1 | 8000 | 待部署后填写 | 待部署后填写 |
| **nodejs-backend** | 待构建 | 2核4GB | 1 | 3001 | 待部署后填写 | 待部署后填写 |
| **frontend-nginx** | 镜像已推送 | 1核2GB | 1 | 80 | 待部署后填写 | 待部署后填写 |
---
### 2.5 OSS对象存储
**Bucket信息**
- **Bucket名称**`ai-clinical-research`
- **地域**华北2北京
- **存储类型**:标准存储
- **访问控制**:私有
- **存储冗余类型**:同城冗余存储
- **内网Endpoint**`oss-cn-beijing-internal.aliyuncs.com`
- **公网Endpoint**`oss-cn-beijing.aliyuncs.com`
- **Bucket域名内网**`ai-clinical-research.oss-cn-beijing-internal.aliyuncs.com`
- **创建时间**2025-12-16 20:22
**RAM用户访问凭证**用于OSS写入
- **RAM用户名**`oss-bucket-put-object@1991407246109125.onaliyun.com`
- **AccessKeyId**`LTAI5tB2Dt3NdvBL3G7nYGv7`
- **AccessKeySecret**`1iSN9k39RkApP93QjUhC1DcPIeMG4V`
- **UID**`203256565888301026`
- **创建时间**2025-12-16 20:31:41
⚠️ **安全警告**AccessKey是敏感信息请勿提交到公开Git仓库
**存储用途**
- `/uploads/pdfs/` - PDF文件上传
- `/uploads/docx/` - Word文档上传
- `/uploads/txt/` - 文本文件上传
- `/exports/` - 导出文件临时存储
---
---
### 2.6 镜像配置文件存储位置
**前端Nginx服务**
```
AIclinicalresearch/frontend-v2/
├── Dockerfile ✅ 已提交Git多阶段构建
├── .dockerignore ✅ 已提交Git优化构建上下文
├── nginx.conf ✅ 已提交GitNginx配置
└── docker-entrypoint.sh ✅ 已提交Git启动脚本
镜像存储位置:
公网crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0
VPCcrpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0
```
**Python微服务**
```
AIclinicalresearch/extraction_service/
├── Dockerfile ✅ 已提交Git多阶段构建 + 阿里云源)
├── .dockerignore ✅ 已提交Git优化构建上下文
└── requirements-prod.txt ✅ 已提交Git精简依赖列表
镜像存储位置:
公网crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0
VPCcrpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0
```
**Node.js后端**(待构建):
```
AIclinicalresearch/backend/
├── Dockerfile ⏳ 待创建
├── .dockerignore ⏳ 待创建
└── (配置文件) ⏳ 待确认
镜像存储位置(预留):
公网crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/nodejs-backend:v1.0
VPCcrpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/nodejs-backend:v1.0
```
**Git提交规范**
| 文件类型 | 是否提交Git | 说明 |
|---------|------------|------|
| ✅ Dockerfile | 必须提交 | 镜像构建蓝图,团队协作必需 |
| ✅ .dockerignore | 必须提交 | 优化构建性能,避免传输无用文件 |
| ✅ requirements*.txt / package.json | 必须提交 | 依赖清单,可复现构建 |
| ✅ nginx.conf / 配置文件 | 必须提交 | 服务配置 |
| ❌ .env | 禁止提交 | 敏感信息密码、API密钥 |
| ❌ Docker镜像文件.tar | 禁止提交 | 镜像文件很大存储在ACR云端 |
---
## 📦 三、已部署服务详情
### 3.1 PostgreSQL数据库
**部署概要**
- **部署时间**2024-12-24
- **部署方式**`pg_dump` 全量导出 → RDS导入
- **数据迁移时长**约12秒90MB SQL文件
- **验证状态**:✅ Schema完整、数据一致、关系正确
**关键配置**
```bash
# 本地PostgreSQL Docker容器
docker run --name ai-clinical-postgres \
-e POSTGRES_PASSWORD=postgres \
-e POSTGRES_DB=ai_clinical_research \
-p 5432:5432 \
-d postgres:15-alpine
```
**备份信息**
- **本地备份文件**`AIclinicalresearch/rds_init_20251224_154529.sql`90MB
- **备份内容**完整Schema + 全量数据
- **RDS自动备份**每日凌晨2点保留7天
**操作文档**
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](./08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md) - 完整部署流程
- [PostgreSQL部署策略-摸底报告.md](./PostgreSQL部署策略-摸底报告.md) - 数据库分析报告
**重要提示**
- ⚠️ **安全**:外网访问已关闭,生产环境禁止长期开启
- ⚠️ **连接**需通过VPC内网或SSH隧道连接
- ⚠️ **密码**:环境变量中的 `@` 需转义为 `%40`
---
### 3.2 前端Nginx服务
**镜像信息**
- **仓库名称**`ai-clinical_frontend-nginx`
- **镜像版本**`v1.0`
- **镜像大小**约50MB
- **基础镜像**`nginx:alpine`
- **构建时间**2024-12-24
**镜像功能**
- ✅ 托管React单页应用SPA
- ✅ Nginx反向代理API请求
- ✅ 支持动态环境变量注入
- ✅ Gzip压缩优化
- ✅ 健康检查端点
**构建产物**
- **Dockerfile**`AIclinicalresearch/frontend-v2/Dockerfile`
- **Nginx配置**`AIclinicalresearch/frontend-v2/nginx.conf`
- **.dockerignore**`AIclinicalresearch/frontend-v2/.dockerignore`
**SAE配置建议**
- **CPU/内存**1核 / 2GB
- **实例数**1
- **端口**80
- **健康检查**`GET /` 返回200
- **环境变量**
```bash
VITE_API_BASE_URL=http://nodejs-backend-service.cn-beijing:test-airesearch.svc.cluster.local:3001
```
⚠️ 注意内网地址需在SAE部署后获取
**操作文档**
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](./07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md) - 完整SAE部署步骤
- [06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md](./06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md) - 技术架构详解
**部署状态**
- ✅ Docker镜像构建成功
- ✅ 镜像已推送至ACR
- ⏳ 待部署到SAE
---
### 3.3 Python微服务
**镜像信息**
- **仓库名称**`python-extraction`
- **镜像版本**`v1.0`
- **镜像大小**1.12GB
- **基础镜像**`python:3-slim`
- **构建时间**2024-12-24
**功能模块**
- ✅ **PDF文本提取**PyMuPDF 1.26.7
- ✅ **Docx文档提取**Mammoth + python-docx
- ✅ **数据清洗DC工具**pandas 2.0+ / numpy 1.24+ / polars 0.19+
- ✅ **语言检测**langdetect
- ❌ **Nougat OCR**已移除减小镜像1.5GB
**依赖优化**
```txt
# 精简版依赖requirements-prod.txt
- 移除nougat-ocr (1.5GB)
- 移除albumentations (Nougat依赖)
- 保留pandas、numpy、polarsDC工具必需
- 保留PyMuPDF、pdfplumberPDF提取
```
**健康检查**
- **端点**`GET /api/health`
- **响应示例**
```json
{
"status": "healthy",
"checks": {
"pymupdf": {"available": true, "version": "1.26.7"},
"nougat": {"available": false, "error": "Nougat未安装"},
"temp_dir": {"path": "/tmp/extraction_service", "writable": true}
}
}
```
**SAE配置建议**
- **CPU/内存**1核 / 2GB
- **实例数**1
- **端口**8000
- **启动命令**默认Dockerfile中的CMD
- **健康检查**`GET /api/health` 返回200
- **环境变量**
```bash
LOG_LEVEL=INFO
TEMP_DIR=/tmp/extraction_service
```
⚠️ 生产环境建议根据实际负载调整实例数
**构建产物**
- **Dockerfile**`AIclinicalresearch/extraction_service/Dockerfile`
- **依赖文件**`AIclinicalresearch/extraction_service/requirements-prod.txt`
- **.dockerignore**`AIclinicalresearch/extraction_service/.dockerignore`
**关键技术方案**
- ✅ 使用阿里云Debian镜像源解决apt-get网络问题
- ✅ 多阶段构建(优化镜像大小)
- ✅ 运行时依赖安装libgl1、libglib2.0
**操作文档**
- [04-Python微服务-SAE容器部署指南.md](./04-Python微服务-SAE容器部署指南.md) - 技术架构详解
- 待创建Python微服务SAE部署操作手册
**部署状态**
- ✅ Docker镜像构建成功本地测试通过
- ✅ 镜像已推送至ACR
- ⏳ 待部署到SAE
---
## ⚡ 四、快速命令参考
### 4.1 Docker镜像管理
**登录ACR**
```bash
# 使用公网地址登录
docker login --username=gofeng117@163.com \
--password=fengzhibo117 \
crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com
```
**拉取镜像**
```bash
# 前端Nginx
docker pull crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.0
# Python微服务
docker pull crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0
```
**本地测试**
```bash
# 前端Nginx端口3000
docker run -d -p 3000:80 \
-e VITE_API_BASE_URL=http://localhost:3001 \
--name frontend-test \
ai-clinical_frontend-nginx:v1.0
# Python微服务端口8000
docker run -d -p 8000:8000 \
--name python-test \
python-extraction:v1.0
# 查看日志
docker logs -f frontend-test
docker logs -f python-test
# 健康检查
curl http://localhost:3000 # 前端
curl http://localhost:8000/api/health # Python微服务
```
**构建新版本**
```bash
# 前端Nginx
cd AIclinicalresearch/frontend-v2
docker build -t ai-clinical_frontend-nginx:v1.1 .
docker tag ai-clinical_frontend-nginx:v1.1 \
crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.1
docker push crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/ai-clinical_frontend-nginx:v1.1
# Python微服务
cd AIclinicalresearch/extraction_service
docker build -t python-extraction:v1.1 -f Dockerfile .
docker tag python-extraction:v1.1 \
crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.1
docker push crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.1
```
---
### 4.2 数据库连接与管理
**通过本地Docker容器连接RDS**
```bash
# 启动本地PostgreSQL容器用于psql客户端
docker run --name ai-clinical-postgres \
-e POSTGRES_PASSWORD=postgres \
-p 5432:5432 \
-d postgres:15-alpine
# 连接到RDS需临时开启外网或使用VPC
docker exec -e PGPASSWORD="Xibahe@fengzhibo117" \
ai-clinical-postgres psql \
-h pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com \
-p 5432 \
-U airesearch \
-d ai_clinical_research
# 查看Schema列表
docker exec -e PGPASSWORD="Xibahe@fengzhibo117" \
ai-clinical-postgres psql \
-h pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com \
-p 5432 -U airesearch -d ai_clinical_research \
-c "SELECT nspname FROM pg_namespace WHERE nspname LIKE '%_schema' ORDER BY nspname;"
# 查看表数量统计
docker exec -e PGPASSWORD="Xibahe@fengzhibo117" \
ai-clinical-postgres psql \
-h pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com \
-p 5432 -U airesearch -d ai_clinical_research \
-c "SELECT schemaname, COUNT(*) FROM pg_tables WHERE schemaname NOT IN ('pg_catalog', 'information_schema') GROUP BY schemaname;"
```
**数据库备份**
```bash
# 导出完整数据库
docker exec ai-clinical-postgres pg_dump \
-U postgres \
-d ai_clinical_research \
--format=plain \
--no-owner \
--no-acl \
--encoding=UTF8 \
> "backup_$(date +%Y%m%d_%H%M%S).sql"
# 导入到RDS需临时开启外网
cat backup_20241224_154529.sql | \
docker exec -i -e PGPASSWORD="Xibahe@fengzhibo117" \
ai-clinical-postgres psql \
-h pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com \
-p 5432 -U airesearch -d ai_clinical_research
```
**Node.js应用连接字符串**
```bash
# .env 文件配置
DATABASE_URL="postgresql://airesearch:Xibahe%40fengzhibo117@pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com:5432/ai_clinical_research"
# 注意:@ 符号需要URL编码为 %40
```
---
### 4.3 SAE常用操作
**通过阿里云CLI部署**(可选):
```bash
# 安装阿里云CLI
# https://help.aliyun.com/document_detail/121541.html
# 配置访问凭证
aliyun configure
# 部署应用(示例)
aliyun sae DeployApplication \
--AppId xxx \
--ImageUrl crpi-cd5ij4pjt65mweeo-vpc.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com/ai-clinical/python-extraction:v1.0 \
--Namespace cn-beijing:xxx
```
**通过Web控制台部署**(推荐):
1. 登录阿里云SAE控制台
2. 选择应用 → 部署应用
3. 选择镜像版本
4. 配置环境变量
5. 确认部署
---
## ⚠️ 五、注意事项与最佳实践
### 5.1 安全规范 🔒
**数据库安全**
- ❌ **禁止**RDS外网地址长期开启
- ✅ **推荐**使用VPC内网或SSH隧道连接
- ✅ **白名单**仅允许必要的IP访问
- ✅ **密码强度**:使用复杂密码(大小写+数字+特殊字符)
**镜像仓库安全**
- ❌ **禁止**在代码中硬编码ACR密码
- ✅ **推荐**定期轮换Registry密码每季度
- ✅ **访问控制**:仅团队成员拥有推送权限
**环境变量管理**
- ❌ **禁止**在Git中提交 `.env` 文件
- ✅ **推荐**使用SAE的环境变量配置功能
- ✅ **敏感信息**数据库密码、API密钥等使用环境变量
**SSL/TLS**
- ✅ 生产环境必须启用HTTPS
- ✅ 使用阿里云免费SSL证书或Let's Encrypt
---
### 5.2 部署顺序 📋
**推荐的部署顺序**
1. ✅ **基础设施**VPC、NAT网关、安全组
2. ✅ **数据库**RDS PostgreSQL数据迁移+验证)
3. ✅ **对象存储**OSS Bucket创建+权限配置
4. 🔄 **后端服务**
- Python微服务文档提取+数据清洗)
- Node.js后端API服务器
5. 🔄 **前端服务**Nginx静态资源托管
6. 🔄 **AI服务**Dify部署
7. 🔄 **验证测试**:全链路功能验证
**依赖关系**
```
RDS PostgreSQL (必需)
Node.js 后端 (依赖数据库)
Python 微服务 (可独立,但后端会调用)
前端 Nginx (依赖后端API)
Dify AI (可独立)
```
---
### 5.3 回滚策略 🔄
**镜像版本管理**
- ACR保留所有历史版本v1.0, v1.1, v1.2...
- 使用语义化版本号:`major.minor.patch`
- 生产环境使用固定版本号,禁止使用 `:latest`
**SAE应用回滚**
- SAE支持一键回滚到上一版本
- 回滚时长约1-2分钟
- 建议:部署前先在测试环境验证
**数据库回滚**
- RDS自动备份每日凌晨2点保留7天
- 手动备份:重大变更前务必手动备份
- 回滚时长取决于数据量约10分钟/10GB
---
### 5.4 监控与日志 📊
**应用监控**(建议配置):
- **健康检查**:每个服务配置健康检查端点
- **日志收集**SAE自动收集stdout/stderr日志
- **告警规则**CPU>80%、内存>80%、健康检查失败
**日志查看**
```bash
# SAE控制台 → 应用详情 → 日志查询
# 或使用阿里云CLI
aliyun sae DescribeApplicationInstances --AppId xxx
```
**性能指标**
- **响应时间**API平均响应<500ms
- **错误率**<1%
- **可用性**>99.9%
---
### 5.5 成本优化 💰
**SAE资源配置**
- **开发环境**0.5核 / 1GB约¥30/月)
- **生产环境**1核 / 2GB约¥60/月)
- **弹性伸缩**:根据流量自动扩缩容
**RDS成本**
- **按量付费**:测试阶段使用
- **包年包月**生产环境更优惠约¥800/月)
**OSS成本**
- **存储费用**约¥0.12/GB/月
- **流量费用**内网流量免费外网流量¥0.5/GB
---
## 📝 六、待办事项清单
### 高优先级 🔴
- [ ] **Python微服务**部署到SAE并验证
- [ ] **Python微服务**创建SAE部署操作手册
- [ ] **Node.js后端**Docker镜像构建
- [ ] **Node.js后端**部署到SAE
### 中优先级 🟡
- [ ] **前端Nginx**部署到SAE并配置域名
- [ ] **内网通信**配置前端→后端→Python微服务的内网调用
- [ ] **SSL证书**申请并配置HTTPS
- [ ] **监控告警**配置SAE健康检查和告警规则
### 低优先级 🟢
- [ ] **Dify AI**:评估部署方案
- [ ] **负载测试**:压力测试各服务性能
- [ ] **文档完善**:补充故障排查手册
- [ ] **CI/CD**:配置自动化部署流程
---
## 📚 七、相关文档索引
### 部署指南
- [01-快速部署SOP-零基础版.md](./01-快速部署SOP-零基础版.md) - **完整部署流程总纲**
- [02-SAE部署完全指南(产品经理版).md](./02-SAE部署完全指南(产品经理版).md) - SAE基础知识
### 服务部署手册
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](./07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md) - 前端Nginx部署步骤
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](./08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md) - PostgreSQL部署步骤
- 待创建Python微服务SAE部署操作手册
- 待创建Node.js后端SAE部署操作手册
### 技术架构文档
- [00-部署架构总览.md](./00-部署架构总览.md) - 架构设计与技术选型
- [04-Python微服务-SAE容器部署指南.md](./04-Python微服务-SAE容器部署指南.md) - Python服务技术详解
- [06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md](./06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md) - 前端Nginx技术详解
### 分析报告
- [PostgreSQL部署策略-摸底报告.md](./PostgreSQL部署策略-摸底报告.md) - 数据库结构分析
---
## 🔄 八、更新日志
### 2024-12-24
- ✅ PostgreSQL数据库部署完成
- ✅ 前端Nginx Docker镜像构建并推送至ACR
- ✅ Python微服务Docker镜像构建并推送至ACR
- ✅ 创建部署进度总览文档
---
## 📞 九、联系与支持
**技术支持**
- 开发团队内部文档
- 阿里云工单https://workorder.console.aliyun.com/
**紧急联系**
- 数据库问题:先检查 [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md]
- SAE部署问题先检查 [01-快速部署SOP-零基础版.md]
- 镜像构建问题:查看本文档"快速命令参考"章节
---
> **提示**:本文档会随着部署进度持续更新,请定期查看最新版本!
> **最后更新**2024-12-24

View File

@@ -862,3 +862,5 @@ ACR镜像仓库

File diff suppressed because it is too large Load Diff

File diff suppressed because it is too large Load Diff

View File

@@ -473,3 +473,5 @@ NAT网关成本¥100/月,对初创团队是一笔开销

View File

@@ -378,3 +378,5 @@ curl http://你的SAE地址:3001/health

View File

@@ -710,3 +710,5 @@ const job = await queue.getJob(jobId);

View File

@@ -477,3 +477,5 @@ processLiteraturesInBackground(task.id, projectId, testLiteratures);

View File

@@ -954,3 +954,5 @@ ROI = (¥22,556 - ¥144) / ¥144 × 100% = 15,564%

View File

@@ -1011,3 +1011,5 @@ Redis 实例¥500/月

View File

@@ -466,6 +466,8 @@ import { ChatContainer } from '@/shared/components/Chat';

View File

@@ -0,0 +1,48 @@
# Python
__pycache__/
*.py[cod]
*$py.class
*.so
.Python
venv/
env/
ENV/
.venv
# 测试
.pytest_cache/
.coverage
htmlcov/
*.log
# IDE
.vscode/
.idea/
*.swp
*.swo
# 文档
*.md
docs/
# Git
.git/
.gitignore
# 环境变量
.env
.env.local
# 临时文件
*.tmp
temp/
tmp/
uploads/
# 模型缓存 (避免打包Nougat模型)
.cache/
models/
*.pth
*.pt
*.onnx

View File

@@ -0,0 +1,56 @@
# ========================================
# 多阶段构建Python微服务
# ========================================
# -------------------- 阶段1: 构建阶段 --------------------
FROM python:3-slim AS builder
# 设置工作目录
WORKDIR /app
# 替换为阿里云镜像源(为将来可能的构建依赖做准备)
RUN sed -i 's|http://deb.debian.org|http://mirrors.aliyun.com|g' /etc/apt/sources.list.d/debian.sources \
&& sed -i 's|http://security.debian.org|http://mirrors.aliyun.com|g' /etc/apt/sources.list.d/debian.sources
# 复制依赖文件
COPY requirements-prod.txt .
# 安装Python依赖到临时目录使用预编译wheel无需编译依赖
RUN pip install --no-cache-dir --user -r requirements-prod.txt
# -------------------- 阶段2: 运行阶段 --------------------
FROM python:3-slim
# 设置工作目录
WORKDIR /app
# 替换为阿里云镜像源并安装运行时依赖
RUN sed -i 's|http://deb.debian.org|http://mirrors.aliyun.com|g' /etc/apt/sources.list.d/debian.sources \
&& sed -i 's|http://security.debian.org|http://mirrors.aliyun.com|g' /etc/apt/sources.list.d/debian.sources \
&& apt-get update \
&& apt-get install -y --no-install-recommends \
libgl1 \
libglib2.0-0 \
libgomp1 \
&& rm -rf /var/lib/apt/lists/*
# 从构建阶段复制Python包
COPY --from=builder /root/.local /root/.local
# 复制应用代码
COPY . .
# 设置Python路径
ENV PATH=/root/.local/bin:$PATH
ENV PYTHONUNBUFFERED=1
# 暴露端口
EXPOSE 8000
# 健康检查
HEALTHCHECK --interval=30s --timeout=10s --start-period=40s --retries=3 \
CMD python -c "import requests; requests.get('http://localhost:8000/api/health', timeout=5)"
# 启动命令
CMD ["uvicorn", "main:app", "--host", "0.0.0.0", "--port", "8000", "--workers", "2"]

View File

@@ -31,4 +31,6 @@ __version__ = '1.0.0'

View File

@@ -164,4 +164,6 @@ def get_missing_summary(df: pd.DataFrame) -> dict:

View File

@@ -124,4 +124,6 @@ def apply_filter(

View File

@@ -289,3 +289,5 @@ def get_unpivot_preview(

View File

@@ -0,0 +1,43 @@
# ========================================
# 生产环境依赖 (移除Nougat和重量级依赖)
# ========================================
# Web框架
fastapi==0.104.1
uvicorn[standard]==0.24.0
python-multipart==0.0.6
# 数据处理 (DC工具必需)
pandas>=2.0.0
numpy>=1.24.0
polars>=0.19.0
# PDF处理 (核心轻量级库)
PyMuPDF>=1.24.0
pdfplumber==0.10.3
# Docx处理
mammoth==1.6.0
python-docx==1.1.0
# 语言检测
langdetect==1.0.9
# 编码检测
chardet==5.2.0
# 工具
python-dotenv==1.0.0
pydantic>=2.10.0
# 日志
loguru==0.7.2
# 测试工具
requests==2.31.0
# ========================================
# 注意:生产环境已移除以下重量级依赖
# - nougat-ocr==0.1.17 (约1.5GB)
# - albumentations==1.3.1 (Nougat依赖)
# ========================================

View File

@@ -296,6 +296,8 @@ if __name__ == "__main__":

View File

@@ -62,6 +62,8 @@ except Exception as e:

View File

@@ -42,6 +42,8 @@ except Exception as e:

68
frontend-v2/.dockerignore Normal file
View File

@@ -0,0 +1,68 @@
# Node.js
node_modules
npm-debug.log
yarn-error.log
.npm
.yarn
# 开发文件
.env
.env.*
*.local
# 构建产物Dockerfile 中会重新生成)
dist
# 测试文件
test
tests
*.test.ts
*.test.tsx
*.spec.ts
*.spec.tsx
coverage
.nyc_output
# 文档和临时文件
docs
*.md
!README.md
.vscode
.idea
.DS_Store
Thumbs.db
# Git
.git
.gitignore
.gitattributes
# CI/CD
.github
.gitlab-ci.yml
.travis.yml
# 日志
*.log
logs
# 临时文件
temp
tmp
*.swp
*.swo
*~
# 编辑器配置
.editorconfig
.prettierrc
.eslintrc*
# TypeScript 配置(保留 tsconfig.json其他忽略
tsconfig.tsbuildinfo
# Vite
.vite
vite.config.*.timestamp-*

64
frontend-v2/Dockerfile Normal file
View File

@@ -0,0 +1,64 @@
# ==================== 阶段 1: 构建阶段 ====================
# ⚠️ 使用 Node Alpine 最新版(包含 Node 22+
FROM node:alpine AS builder
# 设置工作目录
WORKDIR /app
# 1. 复制依赖文件
COPY package*.json ./
# 2. 安装依赖
# 使用国内镜像加速(可选,如果网络慢可以取消注释)
# RUN npm config set registry https://registry.npmmirror.com
RUN npm ci --only=production=false
# 3. 复制源代码
COPY . .
# 4. 构建生产版本
# ⚠️ 注意:如果需要在构建时注入环境变量,在这里设置 ARG
# ARG VITE_API_BASE_URL
# ENV VITE_API_BASE_URL=$VITE_API_BASE_URL
RUN npm run build
# 验证构建产物
RUN ls -la /app/dist/
# ==================== 阶段 2: 运行阶段 ====================
FROM nginx:alpine
# 安装必要工具(包括时区数据)
RUN apk add --no-cache \
bash \
gettext \
curl \
tzdata
# 设置容器时区为上海(否则日志时间会比北京时间慢 8 小时)
RUN cp /usr/share/zoneinfo/Asia/Shanghai /etc/localtime && \
echo "Asia/Shanghai" > /etc/timezone
# 创建 Nginx 配置目录
RUN mkdir -p /etc/nginx/templates
# 1. 复制 Nginx 配置模板(支持环境变量替换)
COPY nginx.conf /etc/nginx/templates/nginx.conf.template
# 2. 复制构建产物到 Nginx 默认目录
COPY --from=builder /app/dist /usr/share/nginx/html
# 3. 复制启动脚本
COPY docker-entrypoint.sh /docker-entrypoint.sh
RUN chmod +x /docker-entrypoint.sh
# 健康检查
HEALTHCHECK --interval=30s --timeout=5s --start-period=30s --retries=3 \
CMD curl -f http://localhost/health || exit 1
# 暴露端口
EXPOSE 80
# 启动命令
ENTRYPOINT ["/docker-entrypoint.sh"]

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@@ -0,0 +1,35 @@
#!/bin/bash
set -e
# ⚠️ 关键:不给默认值,强制在 SAE 控制台配置
# 如果未配置,报错退出(避免使用错误的后端地址)
if [ -z "$BACKEND_SERVICE_HOST" ]; then
echo "❌ ERROR: BACKEND_SERVICE_HOST environment variable is required!"
echo "Please configure it in SAE console with backend internal IP (e.g., 172.17.x.x)"
exit 1
fi
if [ -z "$BACKEND_SERVICE_PORT" ]; then
echo "⚠️ WARNING: BACKEND_SERVICE_PORT not set, using default: 3001"
export BACKEND_SERVICE_PORT=3001
fi
echo "============================================"
echo "Starting Frontend Nginx Service"
echo "Backend Service: ${BACKEND_SERVICE_HOST}:${BACKEND_SERVICE_PORT}"
echo "Container Timezone: $(cat /etc/timezone)"
echo "Current Time: $(date)"
echo "============================================"
# 使用 envsubst 替换 Nginx 配置中的环境变量
envsubst '${BACKEND_SERVICE_HOST} ${BACKEND_SERVICE_PORT}' \
< /etc/nginx/templates/nginx.conf.template \
> /etc/nginx/nginx.conf
# 验证 Nginx 配置
nginx -t
# 启动 Nginx
exec nginx -g 'daemon off;'

191
frontend-v2/nginx.conf Normal file
View File

@@ -0,0 +1,191 @@
# Nginx 配置文件 - AI临床研究平台前端服务
# 用途:托管 React SPA + 反向代理后端 API
user nginx;
worker_processes auto; # 自动根据 CPU 核心数调整
# ⚠️ 日志输出到 stderrSAE 会自动收集)
error_log /dev/stderr warn;
pid /var/run/nginx.pid;
events {
worker_connections 1024; # 每个 worker 进程的最大连接数
use epoll; # Linux 下使用 epoll高性能
}
http {
include /etc/nginx/mime.types;
default_type application/octet-stream;
# 日志格式
log_format main '$remote_addr - $remote_user [$time_local] "$request" '
'$status $body_bytes_sent "$http_referer" '
'"$http_user_agent" "$http_x_forwarded_for"';
# ⚠️ 日志输出到 stdoutSAE 会自动收集,避免磁盘写满)
access_log /dev/stdout main;
# 性能优化
sendfile on;
tcp_nopush on;
tcp_nodelay on;
keepalive_timeout 65;
types_hash_max_size 2048;
# Gzip 压缩(减少传输大小)
gzip on;
gzip_vary on;
gzip_proxied any;
gzip_comp_level 6;
gzip_types text/plain text/css text/xml text/javascript
application/json application/javascript application/xml+rss
application/rss+xml font/truetype font/opentype
application/vnd.ms-fontobject image/svg+xml;
gzip_disable "msie6";
# 上游后端服务Backend Service
upstream backend {
# ⚠️ 重要:这里的地址在部署时需要替换为真实的后端内网地址
# SAE 部署时,通过环境变量注入,详见 Dockerfile
server ${BACKEND_SERVICE_HOST}:${BACKEND_SERVICE_PORT} fail_timeout=30s max_fails=3;
# 如果有多个后端实例(负载均衡)
# server 172.17.x.x:3001 weight=1;
# server 172.17.x.y:3001 weight=1;
keepalive 32; # 保持连接池
}
server {
listen 80;
server_name _; # 接受所有域名
# 根目录React 构建产物)
root /usr/share/nginx/html;
index index.html;
# 字符集
charset utf-8;
# ==================== 静态资源处理 ====================
# 主页面index.html- 不缓存
location = / {
try_files /index.html =404;
add_header Cache-Control "no-cache, no-store, must-revalidate";
add_header Pragma "no-cache";
add_header Expires "0";
}
location = /index.html {
add_header Cache-Control "no-cache, no-store, must-revalidate";
add_header Pragma "no-cache";
add_header Expires "0";
}
# JS/CSS 文件 - 强缓存(文件名带 hash
location ~* \.(js|css)$ {
expires 1y;
add_header Cache-Control "public, immutable";
access_log off;
}
# 图片/字体文件 - 强缓存
location ~* \.(png|jpg|jpeg|gif|ico|svg|webp|woff|woff2|ttf|eot)$ {
expires 1y;
add_header Cache-Control "public, immutable";
access_log off;
}
# ==================== API 反向代理 ====================
# 后端 API 代理(关键配置)
location /api/ {
# 代理到后端服务
proxy_pass http://backend;
# 保留原始请求信息
proxy_set_header Host $host;
proxy_set_header X-Real-IP $remote_addr;
proxy_set_header X-Forwarded-For $proxy_add_x_forwarded_for;
proxy_set_header X-Forwarded-Proto $scheme;
# 超时配置AI 对话、文件处理可能耗时较长)
proxy_connect_timeout 300s;
proxy_send_timeout 300s;
proxy_read_timeout 300s;
# 缓冲配置
proxy_buffering off; # 关闭缓冲(实时流式响应)
proxy_request_buffering off; # 支持大文件上传
# WebSocket 支持(如果后续需要)
proxy_http_version 1.1;
proxy_set_header Upgrade $http_upgrade;
proxy_set_header Connection "upgrade";
# 错误处理
proxy_next_upstream error timeout invalid_header http_500 http_502 http_503;
proxy_next_upstream_tries 2;
}
# ==================== SPA 路由支持 ====================
# React Router 路由回退
# 所有非文件请求都返回 index.htmlSPA 的核心)
location / {
try_files $uri $uri/ /index.html;
# 禁用缓存(用户刷新时总是获取最新页面)
add_header Cache-Control "no-cache, no-store, must-revalidate";
}
# ==================== 安全加固 ====================
# 隐藏 Nginx 版本号
server_tokens off;
# 禁止访问隐藏文件
location ~ /\. {
deny all;
access_log off;
log_not_found off;
}
# 禁止访问特定文件
location ~* \.(bak|config|sql|fla|psd|ini|log|sh|inc|swp|dist)$ {
deny all;
}
# ==================== 健康检查 ====================
# SAE 健康检查端点
location /health {
access_log off;
return 200 "healthy\n";
add_header Content-Type text/plain;
}
# Nginx 状态页(用于监控)
location /nginx_status {
stub_status on;
access_log off;
# 仅允许内网访问
allow 10.0.0.0/8;
allow 172.17.0.0/16;
allow 192.168.0.0/16;
deny all;
}
# ==================== 错误页面 ====================
error_page 404 /index.html; # SPA 路由回退
error_page 500 502 503 504 /50x.html;
location = /50x.html {
root /usr/share/nginx/html;
}
}
}

View File

@@ -35,7 +35,7 @@ const ModuleErrorFallback = ({
const navigate = useNavigate()
// 是否显示详细错误信息(开发环境显示,生产环境隐藏)
const isDevelopment = import.meta.env?.DEV ?? false
const isDevelopment = import.meta.env.DEV
/**
* 处理重试

View File

@@ -10,7 +10,7 @@ ReactDOM.createRoot(document.getElementById('root')!).render(
<ConfigProvider
locale={zhCN}
theme={{
cssVar: true, // ⭐ 启用 CSS 变量Ant Design 6.0 新特性)
cssVar: { prefix: 'ant' }, // ⭐ 启用 CSS 变量Ant Design 6.0 新特性)
token: {
colorPrimary: '#10b981', // emerald-500工具C主题色
borderRadius: 8,

View File

@@ -12,7 +12,7 @@ import {
import type { ConclusionType } from '../types';
interface ConclusionTagProps {
conclusion: ConclusionType;
conclusion: ConclusionType | 'pending';
showIcon?: boolean;
size?: 'small' | 'middle' | 'large';
}
@@ -42,6 +42,12 @@ const ConclusionTag: React.FC<ConclusionTagProps> = ({
icon: <QuestionCircleOutlined />,
text: '不确定',
};
case 'pending':
return {
color: 'processing',
icon: <QuestionCircleOutlined />,
text: '待处理',
};
default:
return {
color: 'default',

View File

@@ -531,6 +531,8 @@ export default FulltextDetailDrawer;

View File

@@ -8,7 +8,6 @@
* 4. 人工复核
*/
import { useState } from 'react';
import { useQuery, useMutation, useQueryClient } from '@tanstack/react-query';
import { message } from 'antd';
import { aslApi } from '../api';
@@ -131,5 +130,6 @@ export function useFulltextResults({

View File

@@ -35,10 +35,10 @@ export function useFulltextTask({
enabled: enabled && !!taskId,
refetchInterval: refetchInterval !== undefined
? refetchInterval
: ((data) => {
: ((data: any) => {
// 默认行为任务进行中时每2秒轮询否则停止
if (!data?.data) return false;
const status = (data.data as any).status;
const status = data.data.status;
return status === 'processing' || status === 'pending' ? 2000 : false;
}),
retry: 1,
@@ -94,5 +94,6 @@ export function useFulltextTask({

View File

@@ -33,12 +33,11 @@ export function useScreeningResults({
queryFn: () => aslApi.getScreeningResultsList(projectId, { page, pageSize, filter }),
enabled: enabled && !!projectId,
staleTime: 1000 * 30, // 30秒内认为数据是新鲜的
keepPreviousData: true, // 切换页面时保留上一页数据,避免闪烁
});
const results = data?.data?.items || [];
const total = data?.data?.total || 0;
const totalPages = data?.data?.totalPages || 0;
const results = (data as any)?.data?.items || [];
const total = (data as any)?.data?.total || 0;
const totalPages = (data as any)?.data?.totalPages || 0;
// 人工复核Mutation
const reviewMutation = useMutation({

View File

@@ -9,7 +9,7 @@
*/
import { useState } from 'react';
import { useParams, useSearchParams } from 'react-router-dom';
import { useParams } from 'react-router-dom';
import {
Card,
Statistic,
@@ -59,8 +59,6 @@ interface FulltextResultItem {
const FulltextResults = () => {
const { taskId } = useParams<{ taskId: string }>();
const [searchParams] = useSearchParams();
const projectId = searchParams.get('projectId') || '';
const [activeTab, setActiveTab] = useState<'all' | 'included' | 'excluded' | 'pending'>('all');
const [selectedRowKeys, setSelectedRowKeys] = useState<string[]>([]);
@@ -108,7 +106,7 @@ const FulltextResults = () => {
const results = resultsData?.items || [];
// 导出Excel
const handleExport = async (filter: 'all' | 'included' | 'excluded' | 'pending') => {
const handleExport = async (_filter: 'all' | 'included' | 'excluded' | 'pending') => {
try {
message.loading({ content: '正在生成Excel...', key: 'export' });
@@ -432,7 +430,7 @@ const FulltextResults = () => {
expandable={{
expandedRowRender,
expandedRowKeys,
onExpand: (expanded, record) => toggleRowExpanded(record.resultId),
onExpand: (_expanded, record) => toggleRowExpanded(record.resultId),
expandIcon: () => null,
}}
pagination={{
@@ -485,5 +483,6 @@ export default FulltextResults;

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