AIclinicalresearch/backend/test-output/user_prompt_example.md

# User Prompt Template

## 任务说明

请根据以下研究方案（PICOS标准）和论文全文，评估这篇论文的**12个字段的完整性和可用性**。

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## 研究方案（PICOS标准）

### Population（研究人群）
成年房颤患者（≥18岁，有卒中风险因素）

### Intervention（干预措施）
利伐沙班 20mg 每日一次（肾功能不全者15mg）

### Comparison（对照措施）
华法林剂量调整（目标INR 2.0-3.0）

### Outcome（结局指标）
卒中或系统性栓塞（主要）、大出血（次要）

### Study Design（研究设计）
RCT（多中心、随机、双盲）

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## 论文全文

**文档格式**：markdown  
（`markdown` = 结构化Markdown，由Nougat提取；`plaintext` = 纯文本，由PyMuPDF提取）

**预估字数**：363 字

**⚠️ 重要提醒**：
- 如果是**markdown格式**，请注意利用章节标记（如`# Abstract`, `## Methods`）快速定位
- 如果是**plaintext格式**，请通过章节标题（如"METHODS"、"RESULTS"）来识别结构
- 无论哪种格式，都要**逐段阅读**，不要跳过中间段落

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### 论文全文内容

```
# A Randomized Trial of Rivaroxaban in Atrial Fibrillation

## Abstract
Background: Atrial fibrillation increases stroke risk...
Methods: We randomly assigned 1,000 patients...
Results: Primary outcome occurred in 2.1% vs 3.4%...

## Introduction
Atrial fibrillation is a common cardiac arrhythmia...

## Methods
### Study Design
This was a multicenter, randomized, double-blind trial...

### Randomization
Randomization was performed using a computer-generated random sequence...

## Results
Between 2020 and 2022, we enrolled 1,000 patients...
```

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## 评估要求

### 1. 评估12个字段

请评估以下12个字段的**完整性和可用性**：

1. **文献来源**（第一作者、年份、期刊、DOI）
2. **研究类型**（RCT、队列研究等）
3. **研究设计细节**（随访时间、数据来源）
4. **疾病诊断标准**
5. **人群特征**（样本量、人口统计学）⭐
6. **基线数据**（功能指标、合并症）⭐
7. **干预措施**（药物、剂量、疗程）⭐
8. **对照措施**
9. **结局指标**（主要/次要结局）⭐⭐⭐ 最关键
10. **统计方法**
11. **质量评价**（随机化、盲法、ITT分析等）⭐⭐ 关键方法学
12. **其他信息**（注册号、利益冲突）

**对于每个字段，判断**：
- **完整**：信息充分，符合Cochrane高质量标准
- **不完整**：信息缺失、描述模糊、不符合标准
- **无法判断**：论文完全未提及该信息

### 2. 特别关注关键方法学字段

以下3个字段是评估研究质量的核心，**必须重点关注**：

#### ⭐⭐⭐ 随机化方法
- 是否有序列生成方法？（如计算机生成、随机数字表）
- 是否有分配隐藏？（如IWRS、密封信封）
- 基线特征是否平衡？

**判断要点**：
- ✅ 完整：明确序列生成方法 + 分配隐藏
- ❌ 不完整：仅提到"随机"，无具体方法

#### ⭐⭐⭐ 盲法
- 盲法类型？（双盲、单盲、开放）
- 盲法对象？（受试者、研究者、评估者）
- 盲法实施方法？（如相同外观药物）

**判断要点**：
- ✅ 完整：明确盲法对象 + 实施方法
- ❌ 不完整：仅提到"双盲"，无具体方法

#### ⭐⭐⭐ 结果完整性
- 失访率？（≤5%为优秀，>20%为高风险）
- 是否使用ITT分析？
- 缺失数据处理方法？

**判断要点**：
- ✅ 完整：低失访率(<5%) 或 ITT分析 + 合理缺失数据处理
- ❌ 不完整：高失访率(>20%) 或 未使用ITT且无说明

### 3. 强制处理流程

请严格按照System Prompt中的4步流程处理：
1. **章节定位**（5分钟）
2. **分字段提取**（按预期位置）
3. **交叉验证**（关键词搜索 + 重读）
4. **输出结果**（JSON格式）

**⚠️ 特别注意**：
- **Methods章节可能很长**（2000-4000字），请逐段阅读，不要跳过第2-5段（中间位置）
- **Results章节的开头**通常包含失访情况和基线数据
- **Table 1**（如果有）通常是基线特征表
- **Figure 1**（如果有）通常是CONSORT流程图（失访信息）

---

## 输出格式

请严格按照以下JSON Schema输出（参考`json_schema.json`）：

```json
{
  "fields": {
    "文献来源": { "assessment": "...", "evidence": {...}, "reasoning": "...", "confidence": 0.95 },
    "研究类型": { ... },
    ...
    "质量评价": {
      "assessment": "...",
      "evidence": {...},
      "reasoning": "...",
      "confidence": 0.90,
      "cochrane_details": {
        "domains": {
          "随机化过程": { "risk": "Low risk", "reasoning": "..." },
          "偏离预期干预": { "risk": "Low risk", "reasoning": "..." },
          "结局数据缺失": { "risk": "Low risk", "reasoning": "..." },
          "结局测量": { "risk": "Low risk", "reasoning": "..." },
          "选择性报告结果": { "risk": "Unclear risk", "reasoning": "..." }
        },
        "overall_bias_risk": "Low"
      }
    }
  },
  "processing_log": {
    "sections_reviewed": ["Abstract", "Methods", "Results", "Tables", "Figures"],
    "paragraphs_read_per_section": {
      "Methods": 7,  // 必须≥3，最好是实际段落数
      "Results": 5   // 必须≥3
    },
    "middle_sections_attention": true,
    "total_processing_time_estimate": "15 minutes"
  },
  "verification": {
    "keywords_searched": ["randomization", "blinding", "ITT", "baseline", "dropout"],
    "reread_count": 2,
    "found_missed_info": false,
    "cross_section_conflicts": []
  },
  "metadata": {
    "model_name": "deepseek-v3",
    "processing_date": "2025-11-22T12:17:30.843Z",
    "document_format": "markdown",
    "estimated_word_count": 363
  }
}
```

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## 质量检查清单（输出前必查）

在提交结果前，请逐项检查：

- [ ] 12个字段全部评估完成
- [ ] 每个字段的quote ≥ 50字
- [ ] 每个字段都有location（section + paragraph）
- [ ] processing_log显示Methods ≥ 3段, Results ≥ 3段
- [ ] 关键词搜索至少5个
- [ ] 重读至少1次
- [ ] 质量评价字段包含完整的Cochrane RoB 2.0评估（5个域）
- [ ] 低置信度字段（<0.7）标记了needs_manual_review

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## 开始评估

现在，请开始评估这篇论文。记住：

1. ✅ **逐段阅读**（特别是Methods第2-5段）
2. ✅ **交叉验证**（关键词搜索 + 重读）
3. ✅ **完整输出**（JSON Schema + 处理日志 + 自我验证）

祝你工作顺利！🚀