HaHafeng
f729699510
Summary: - Implement 7 quick action functions (filter, recode, binning, conditional, dropna, compute, pivot) - Refactor to pre-written Python functions architecture (stable and secure) - Add 7 Python operations modules with full type hints - Add 7 frontend Dialog components with user-friendly UI - Fix NaN serialization issues and auto type conversion - Update all related documentation Technical Details: - Python: operations/ module (filter.py, recode.py, binning.py, conditional.py, dropna.py, compute.py, pivot.py) - Backend: QuickActionService.ts with 7 execute methods - Frontend: 7 Dialog components with complete validation - Toolbar: Enable 7 quick action buttons Status: Phase 1-2 completed, basic testing passed, ready for further testing
422 lines
16 KiB
Markdown
422 lines
16 KiB
Markdown
# AIclinicalresearch 系统当前状态与开发指南
|
||
|
||
> **文档版本：** v1.6
|
||
> **创建日期：** 2025-11-28
|
||
> **维护者：** 开发团队
|
||
> **最后更新：** 2025-12-08
|
||
> **重大进展：** ✨ DC模块Tool C功能按钮Phase 1-2完成（7个功能上线）
|
||
> **文档目的：** 快速了解系统当前状态，为新AI助手提供上下文
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📋 快速导航
|
||
|
||
**🎯 如果您是新的AI助手**，请优先阅读：
|
||
1. **本文档**（5分钟） - 了解系统当前状态
|
||
2. [前后端模块化架构设计-V2.md](./前后端模块化架构设计-V2.md)（15分钟） - 了解技术架构
|
||
3. [[AI对接] 快速上下文.md](./%5BAI对接%5D%20快速上下文.md)（10分钟） - 快速上手指南
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🎯 项目概述
|
||
|
||
### 项目名称
|
||
**壹证循科技 - AI临床研究平台**
|
||
|
||
### 核心定位
|
||
一个覆盖临床科研全生命周期、AI驱动的一站式智能科研平台
|
||
|
||
### 目标用户
|
||
- **主要用户**：临床医生、研究人员（三甲医院）
|
||
- **次要用户**：医院科研管理科室、信息中心
|
||
- **商业模式**：云端SaaS + 私有化部署 + 单机版
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📊 业务模块概览（7大核心功能）
|
||
|
||
| 模块代号 | 模块名称 | 核心功能 | 商业价值 | 当前状态 | 优先级 |
|
||
|---------|---------|---------|---------|---------|--------|
|
||
| **AIA** | AI智能问答 | 10+专业智能体（选题评价、PICO梳理等） | ⭐⭐⭐⭐ | ✅ 已完成 | P1 |
|
||
| **PKB** | 个人知识库 | RAG问答、私人文献库 | ⭐⭐⭐ | ✅ 已完成 | P1 |
|
||
| **ASL** | AI智能文献 | 文献筛选、Meta分析、证据图谱 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🚧 **正在开发** | **P0** |
|
||
| **DC** | 数据清洗整理 | ETL + 医学NER（百万行级数据） | ⭐⭐⭐⭐⭐ | ✅ **Tool B完成 + Tool C MVP + 7个功能按钮完成** | **P0** |
|
||
| **SSA** | 智能统计分析 | 队列/预测模型/RCT分析 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 📋 规划中 | P2 |
|
||
| **ST** | 统计分析工具 | 100+轻量化统计工具 | ⭐⭐⭐⭐ | 📋 规划中 | P2 |
|
||
| **RVW** | 稿件审查系统 | 方法学评估、审稿流程 | ⭐⭐⭐⭐ | 📋 规划中 | P3 |
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🏗️ 技术架构（三层设计）
|
||
|
||
### 架构总览
|
||
```
|
||
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
|
||
│ 业务模块层 (Product Layer) │
|
||
│ AIA | PKB | ASL | DC | SSA | ST | RVW │
|
||
│ ✅ ✅ 🚧 🚧 📋 📋 📋 │
|
||
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
|
||
↓ 依赖
|
||
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
|
||
│ 通用能力层 (Capability Layer) │
|
||
│ 后端：LLM网关 | 文档处理 | RAG引擎 | ETL引擎 | 医学NLP │
|
||
│ ✅ ✅ ✅ 🚧 📋 │
|
||
│ 前端：Chat组件（Ant Design X）✅ 🎉 新增！ │
|
||
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
|
||
↓ 依赖
|
||
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
|
||
│ 平台基础层 (Platform Layer) │
|
||
│ 存储 | 日志 | 缓存 | 任务 | 健康检查 | 监控 | 数据库连接池 │
|
||
│ ✅ ✅ ✅ ✅ ✅ ✅ ✅ │
|
||
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
|
||
```
|
||
|
||
### 技术栈
|
||
|
||
**前端**：
|
||
- React 19 + TypeScript 5 + Vite 6
|
||
- **Ant Design 6.0** + **Ant Design X 2.1** ✨ 新增！
|
||
- TailwindCSS 3 + React Query v5 + React Router DOM v6
|
||
- 架构：frontend-v2（模块化，顶部导航）
|
||
- **通用能力层**：shared/components/Chat（基于 Ant Design X）✅
|
||
|
||
**后端**：
|
||
- Fastify v4 (Node.js 22)
|
||
- Prisma 6 (10个Schema隔离)
|
||
- LLM：DeepSeek-V3, Qwen-Max, GPT-5-Pro, Claude-4.5
|
||
- 架构：增量演进（legacy + common + modules）
|
||
|
||
**数据库**：
|
||
- PostgreSQL 16
|
||
- 10个Schema隔离（platform/aia/pkb/asl/dc/ssa/st/rvw/admin/common）
|
||
|
||
**云原生部署**：
|
||
- 阿里云 SAE (Serverless 应用引擎)
|
||
- RDS (PostgreSQL) + OSS (对象存储) + Redis (可选)
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🚀 当前开发状态（2025-12-03）
|
||
|
||
### ✅ 已完成模块
|
||
|
||
#### 1. 平台基础层（2025-11-17完成）
|
||
- ✅ 存储服务（LocalAdapter ↔ OSSAdapter）
|
||
- ✅ 日志系统（Winston + 结构化JSON）
|
||
- ✅ 缓存服务（Memory ↔ Redis）
|
||
- ✅ 异步任务（MemoryQueue ↔ DatabaseQueue）
|
||
- ✅ 健康检查（Liveness + Readiness）
|
||
- ✅ 监控指标（数据库连接/内存/API）
|
||
- ✅ 数据库连接池（Serverless优化）
|
||
- ✅ **100%测试通过**
|
||
|
||
#### 2. AIA模块 - AI智能问答（已完成）
|
||
- ✅ 10个专业智能体
|
||
- ✅ 流式对话 + 非流式对话
|
||
- ✅ 知识库模式（RAG检索）
|
||
- ✅ 批处理模式
|
||
- **状态**：生产就绪
|
||
|
||
#### 3. PKB模块 - 个人知识库（已完成）
|
||
- ✅ 知识库CRUD
|
||
- ✅ 文档上传（PDF/Word/TXT/MD）
|
||
- ✅ RAG问答
|
||
- ✅ 批处理任务
|
||
- **状态**：生产就绪
|
||
|
||
### 🚧 正在开发模块
|
||
|
||
#### 4. ASL模块 - AI智能文献（正在开发）
|
||
**开发进度**：
|
||
- ✅ **标题摘要初筛MVP**：完整流程（设置→启动→审核→结果→导出）
|
||
- ✅ **全文复筛后端**：LLM服务、数据库、批处理、API（Day 2-5完成）
|
||
- 🚧 **全文复筛前端UI**：4个核心页面（Day 6-8，预计2.5天）
|
||
|
||
**核心功能**：
|
||
- 双模型并行筛选（DeepSeek-V3 + Qwen-Max）
|
||
- PICOS标准判断
|
||
- 12字段结构化提取（全文复筛）
|
||
- 医学逻辑验证 + 证据链验证
|
||
- Excel批量导出
|
||
|
||
**技术亮点**：
|
||
- Nougat优先 + PyMuPDF降级（PDF提取）
|
||
- 3层JSON解析（容错机制）
|
||
- 冲突检测与人工复核
|
||
- 云原生存储（零文件落盘）
|
||
|
||
**详细文档**：[ASL模块当前状态](../03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md)
|
||
|
||
#### 5. DC模块 - 数据清洗整理 ✅ **Tool C MVP 完成！**
|
||
|
||
**开发进度**：
|
||
- ✅ **Tool B后端**：100%完成（1,658行代码）
|
||
- 4个核心服务（HealthCheck、Template、DualModel、Conflict）
|
||
- 1个控制器（6个API端点）
|
||
- 路由集成（/api/v1/dc/tool-b）
|
||
- Prisma Schema（4个表）
|
||
- 100%云原生（复用平台能力）
|
||
- ❌ **Tool B前端**：0%（有V4原型设计，未实现）
|
||
|
||
- ✅ **Tool C（数据编辑器）**：**MVP 完成** ✅
|
||
- ✅ Python微服务（~430行）- Day 1
|
||
- ✅ Node.js后端（~2720行）- Day 2-3
|
||
- ✅ 前端界面（~1300行）- Day 4-5
|
||
- ✅ 通用 Chat 组件（~968行）- Day 5
|
||
- ✅ 端到端测试通过
|
||
- ✅ UI 优化完成
|
||
- **总计：~5418行**
|
||
|
||
- ❌ **Tool A**：未开发
|
||
- ✅ **Portal**：已完成（Tool B + Tool C 入口）
|
||
|
||
**核心功能（Tool B）**：
|
||
- 双模型并发提取（DeepSeek-V3 + Qwen-Max）
|
||
- 自动冲突检测（字段级对比）
|
||
- Excel健康检查（空值率、Token估算、拦截策略）
|
||
- 预设模板系统（肺癌、糖尿病、高血压）
|
||
|
||
**技术亮点**：
|
||
- ✅ Excel内存处理（零落盘，云原生）
|
||
- ✅ 双模型交叉验证（减少AI幻觉）
|
||
- ✅ 3层JSON解析（容错机制）
|
||
- ✅ 复用LLMFactory、storage、cache、jobQueue
|
||
|
||
**当前问题**：
|
||
- 🔴 数据库表未确认存在（测试前必须执行db push）
|
||
- 🔴 前端完全未开发（预计2-3天工作量）
|
||
- 🟡 后端未经真实API测试
|
||
|
||
**详细文档**：[DC模块当前状态](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/00-模块当前状态与开发指南.md)
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📁 项目结构概览
|
||
|
||
```
|
||
AIclinicalresearch/
|
||
├── frontend-v2/ # 🌐 前端（React 19 + TS）
|
||
│ └── src/
|
||
│ ├── framework/ # 框架层（布局、路由、权限）
|
||
│ ├── modules/ # 业务模块
|
||
│ │ ├── asl/ # ✅ AI智能文献
|
||
│ │ ├── aia/ # ✅ AI智能问答
|
||
│ │ ├── pkb/ # ✅ 个人知识库
|
||
│ │ ├── dc/ # ✅ 数据清洗（Tool C 完成）
|
||
│ │ └── ...
|
||
│ └── shared/ # 共享组件和工具
|
||
│ └── components/ # ✨ 通用能力层
|
||
│ └── Chat/ # ✅ Chat 通用组件（Ant Design X）
|
||
│
|
||
├── backend/ # ⚙️ 后端（Fastify + Prisma）
|
||
│ └── src/
|
||
│ ├── common/ # ⭐ 平台基础设施（云原生）
|
||
│ │ ├── storage/ # 存储抽象层
|
||
│ │ ├── logging/ # 日志系统
|
||
│ │ ├── cache/ # 缓存服务
|
||
│ │ ├── jobs/ # 异步任务
|
||
│ │ └── ...
|
||
│ ├── legacy/ # 🔸 现有业务代码（稳定）
|
||
│ └── modules/ # 🌟 新架构模块
|
||
│ ├── asl/ # ✅ AI智能文献
|
||
│ └── dc/ # 🚧 数据清洗（开发中）
|
||
│
|
||
├── docs/ # 📚 文档体系
|
||
│ ├── 00-系统总体设计/ # 架构设计
|
||
│ ├── 01-平台基础层/ # 平台能力
|
||
│ ├── 02-通用能力层/ # LLM、RAG等
|
||
│ ├── 03-业务模块/ # 各模块文档
|
||
│ ├── 04-开发规范/ # 云原生规范等
|
||
│ └── 08-项目管理/ # 计划和进度
|
||
│
|
||
└── prisma/
|
||
└── schema.prisma # 10个Schema定义
|
||
```
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🎯 核心设计原则
|
||
|
||
### 1. 云原生架构 ☁️
|
||
- **无状态应用**：不依赖本地文件系统
|
||
- **存储抽象层**：适配器模式，零代码环境切换
|
||
- **异步任务**：避免Serverless超时（30秒）
|
||
- **数据库连接池**：防止连接数耗尽
|
||
- **详细规范**：[云原生开发规范](../04-开发规范/08-云原生开发规范.md) ⭐ **必读**
|
||
|
||
### 2. 模块化与独立部署 🔧
|
||
- **前后端分离**：每个模块前后端完全独立
|
||
- **Schema隔离**：数据库层面模块隔离（10个Schema）
|
||
- **路由独立**：每个模块有独立的API路由前缀
|
||
- **支持独立销售**：任何模块都可独立打包
|
||
|
||
### 3. 商业模式灵活性 💰
|
||
- **4种部署形态**：云端SaaS、私有化部署、单机版、混合部署
|
||
- **多版本支持**：专业版/高级版/旗舰版（Feature Flag控制）
|
||
- **AI成本可控**：动态切换LLM模型
|
||
- **模块化售卖**：任何模块都可独立销售
|
||
|
||
### 4. 渐进式演进 📈
|
||
- **新旧并存**：Frontend-v2（新）+ Frontend（旧保留）
|
||
- **增量改造**：Legacy模块保持稳定，新模块标准化
|
||
- **Just-in-time**：聚焦当前，架构预留，避免过度设计
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📅 开发时间线
|
||
|
||
| 时间 | 阶段 | 主要成果 |
|
||
|------|------|---------|
|
||
| **2025-11-12** | Week 1 | ✅ 数据库Schema隔离（10个Schema） |
|
||
| **2025-11-13~14** | Week 2 | ✅ 前端模块化架构 + 后端分层 |
|
||
| **2025-11-17** | Week 2+ | ✅ 平台基础设施（8个核心模块） |
|
||
| **2025-11-18~21** | Week 3~4 | ✅ ASL标题摘要初筛MVP |
|
||
| **2025-11-22~23** | ASL Day 2-5 | ✅ ASL全文复筛后端完成 |
|
||
| **2025-11-26~27** | DC Day 2-3 | ✅ DC工具B健康检查+模板管理 |
|
||
| **2025-11-28** | 当前 | 🚧 ASL全文复筛前端 + DC工具B开发 |
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🎯 下一步计划
|
||
|
||
### 短期（1-2周）
|
||
1. **ASL全文复筛前端**（Day 6-8）
|
||
- 4个核心页面：设置、进度、工作台、结果
|
||
- PDF上传和预览功能
|
||
- 双模型判断对比UI
|
||
- 实时进度监控
|
||
|
||
2. **DC工具B完成**（Day 4-7）
|
||
- ExtractionService实现
|
||
- 批量提取API
|
||
- 前端集成和测试
|
||
|
||
### 中期（1-2月）
|
||
3. DC模块完整实现（工具A、工具C、Portal）
|
||
4. ASL模块优化（Prompt优化、并发处理）
|
||
5. LLM网关统一抽取
|
||
|
||
### 长期（3月+）
|
||
6. SSA模块（智能统计分析）
|
||
7. ST模块（统计分析工具）
|
||
8. RVW模块（稿件审查系统）
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📚 重要文档索引
|
||
|
||
### 🎯 必读文档（新AI助手）
|
||
1. ⭐⭐⭐ **本文档** - 系统当前状态
|
||
2. ⭐⭐⭐ [前后端模块化架构设计-V2.md](./前后端模块化架构设计-V2.md) - 架构总纲
|
||
3. ⭐⭐⭐ [云原生开发规范.md](../04-开发规范/08-云原生开发规范.md) - 开发规范（必读）
|
||
4. ⭐⭐ [01-系统架构分层设计.md](./01-系统架构分层设计.md) - 三层架构详解
|
||
5. ⭐⭐ [09-总体需求文档(PRD).md](./09-总体需求文档\(PRD\).md) - 产品需求
|
||
|
||
### 🚀 当前开发相关
|
||
- [ASL模块当前状态](../03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md)
|
||
- [DC模块README](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/README.md)
|
||
- [DC Day3完成总结](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/Day3完成总结.md)
|
||
|
||
### 🏗️ 架构设计
|
||
- [平台基础设施规划](../09-架构实施/04-平台基础设施规划.md)
|
||
- [云原生部署架构指南](../09-架构实施/03-云原生部署架构指南.md)
|
||
- [数据库设计规范](../04-开发规范/01-数据库设计规范.md)
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🔧 开发环境
|
||
|
||
### 环境要求
|
||
```
|
||
Node.js: v22.18.0+
|
||
PostgreSQL: 16+
|
||
npm: 10+
|
||
```
|
||
|
||
### 快速启动
|
||
|
||
**后端**：
|
||
```bash
|
||
cd backend
|
||
npm install
|
||
npx prisma generate
|
||
npm run dev # http://localhost:3001
|
||
```
|
||
|
||
**前端**：
|
||
```bash
|
||
cd frontend-v2
|
||
npm install
|
||
npm run dev # http://localhost:3000
|
||
```
|
||
|
||
### 环境变量配置
|
||
参考：[环境配置指南](../07-运维文档/01-环境配置指南.md)
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## ⚠️ 重要注意事项
|
||
|
||
### 对新AI助手
|
||
1. ✅ **优先阅读云原生开发规范**：所有代码必须遵守
|
||
2. ✅ **使用平台基础设施**：不要重复实现存储、日志、缓存等
|
||
3. ✅ **遵循Schema隔离**：每个模块的表必须在对应的Schema中
|
||
4. ✅ **查看最新开发记录**：了解当前开发状态和已知问题
|
||
|
||
### 常见陷阱
|
||
1. ❌ **不要在业务模块中自己实现存储**：使用 `import { storage } from '@/common/storage'`
|
||
2. ❌ **不要硬编码配置**：使用环境变量
|
||
3. ❌ **不要依赖本地文件系统**：使用OSS或内存处理
|
||
4. ❌ **不要创建新的Prisma实例**：使用全局 `prisma` 实例
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📊 项目统计
|
||
|
||
### 代码量
|
||
- **前端**：约 15,000 行（TypeScript + TSX）
|
||
- **后端**：约 20,000 行（TypeScript）
|
||
- **文档**：约 50,000 行（Markdown）
|
||
- **总计**：约 85,000 行
|
||
|
||
### 模块完成度
|
||
- ✅ **已完成**：AIA（100%）、PKB（100%）、平台基础层（100%）
|
||
- 🚧 **开发中**：ASL（80%）、DC（30%）
|
||
- 📋 **未开始**：SSA、ST、RVW
|
||
|
||
### 测试覆盖率
|
||
- **平台基础层**：100%（8/8模块全部通过）
|
||
- **AIA模块**：手动测试通过
|
||
- **PKB模块**：手动测试通过
|
||
- **ASL模块**：部分自动化测试（31个REST Client测试用例）
|
||
- **DC模块**：开发中
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 🌟 技术亮点
|
||
|
||
1. ✅ **适配器模式**：存储/缓存/日志支持本地↔云端零代码切换
|
||
2. ✅ **10个Schema一次性完成**：架构一次到位
|
||
3. ✅ **Prisma自动路由**：Schema迁移后，代码无需修改
|
||
4. ✅ **4个LLM集成**：DeepSeek、Qwen、GPT、Claude
|
||
5. ✅ **增量演进**：新旧并存，降低风险
|
||
6. ✅ **云原生就绪**：为SAE部署做好准备
|
||
|
||
---
|
||
|
||
## 📞 联系方式
|
||
|
||
- **项目负责人**：技术架构师
|
||
- **文档维护**：开发团队
|
||
- **问题反馈**：GitHub Issues
|
||
|
||
---
|
||
|
||
**文档版本**：v1.0
|
||
**最后更新**：2025-11-28
|
||
**下次更新**：ASL全文复筛前端完成 或 DC工具B完成
|
||
|
||
---
|
||
|
||
**🎉 祝新的AI助手工作顺利！所有信息已梳理完毕，可以无缝衔接！**
|