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# AIclinicalresearch 系统当前状态与开发指南

> **文档版本：** v3.8  
> **创建日期：** 2025-11-28  
> **维护者：** 开发团队  
> **最后更新：** 2026-01-19  
> **重大进展：** 🎉 **pgvector 向量数据库集成完成！PKB RAG 基础设施就绪！**  
> - 🆕 pgvector 0.8.1 已安装，支持 HNSW/IVFFlat 索引  
> - ✅ 与阿里云 RDS pgvector 0.8.0 完全兼容  
> - ✅ PKB 模块 RAG 检索功能基础设施已就绪  
> **部署状态：** ✅ 生产环境运行中 | 公网地址：http://8.140.53.236/  
> **文档目的：** 快速了解系统当前状态，为新AI助手提供上下文

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## 📋 快速导航

**🎯 如果您是新的AI助手**，请优先阅读：
1. **本文档**（5分钟） - 了解系统当前状态
2. [前后端模块化架构设计-V2.md](./前后端模块化架构设计-V2.md)（15分钟） - 了解技术架构
3. [[AI对接] 快速上下文.md](./%5BAI对接%5D%20快速上下文.md)（10分钟） - 快速上手指南

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## 🎯 项目概述

### 项目名称
**壹证循科技 - AI临床研究平台**

### 核心定位
一个覆盖临床科研全生命周期、AI驱动的一站式智能科研平台

### 目标用户
- **主要用户**：临床医生、研究人员（三甲医院）
- **次要用户**：医院科研管理科室、信息中心
- **商业模式**：云端SaaS + 私有化部署 + 单机版

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## 📊 业务模块概览（8大核心功能）

| 模块代号 | 模块名称 | 核心功能 | 商业价值 | 当前状态 | 优先级 |
|---------|---------|---------|---------|---------|--------|
| **AIA** | AI智能问答 | 12个智能体（选题→方案→评审→写作） | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **V2.1完成（90%）** - Prompt管理集成 | **P0** |
| **PKB** | 个人知识库 | RAG问答、私人文献库 | ⭐⭐⭐ | ✅ **核心功能完成（90%）** | P1 |
| **ASL** | AI智能文献 | 文献筛选、Meta分析、证据图谱 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **智能检索MVP完成（60%）** - DeepSearch集成 | **P0** |
| **DC** | 数据清洗整理 | ETL + 医学NER（百万行级数据） | ⭐⭐⭐⭐⭐ | ✅ **Tool B完成 + Tool C 99%（异步架构+性能优化-99%+多指标转换+7大功能）** | **P0** |
| **IIT** | IIT Manager Agent | AI驱动IIT研究助手 - 智能质控+REDCap集成 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **Phase 1.5完成（60%）- AI对话+REDCap数据集成** | **P0** |
| **SSA** | 智能统计分析 | 队列/预测模型/RCT分析 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 📋 规划中 | P2 |
| **ST** | 统计分析工具 | 100+轻量化统计工具 | ⭐⭐⭐⭐ | 📋 规划中 | P2 |
| **RVW** | 稿件审查系统 | 方法学评估、审稿流程、Word导出 | ⭐⭐⭐⭐ | ✅ **开发完成（95%）** | P3 |
| **ADMIN** | 运营管理端 | Prompt管理、租户管理、用户管理 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **Phase 4.1完成（75%）** - 用户管理+模块权限系统 | **P0** |

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## 🏗️ 技术架构（三层设计）

### 架构总览
```
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│              业务模块层 (Product Layer)                    │
│  AIA | PKB | ASL | DC | IIT | SSA | ST | RVW            │
│  ✅    ✅    🚧   🚧   🚀   📋   📋   📋                   │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
                      ↓ 依赖
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│             通用能力层 (Capability Layer)                 │
│  后端：LLM网关 | 流式响应服务🆕 | 文档处理 | RAG引擎 | Prompt管理│
│       ✅       ✅ OpenAI Compatible  ✅       ✅       ✅        │
│  前端：Chat组件V2（Ant Design X）🆕 ✅                   │
│       AIStreamChat | ThinkingBlock | useAIStream Hook   │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
                      ↓ 依赖
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│              平台基础层 (Platform Layer)                  │
│  🏆 **Postgres-Only架构**（新）                          │
│  ├── 统一缓存：platform_schema.app_cache        ✅       │
│  ├── 统一队列：platform_schema.job (pg-boss)    ✅       │
│  ├── 任务管理：job.data 统一存储                ✅       │
│  └── 断点续传：CheckpointService 通用化         ✅       │
│                                                          │
│  存储 | 日志 | 缓存 | 任务 | 健康检查 | 监控 | 连接池     │
│  ✅    ✅    ✅    ✅    ✅        ✅    ✅                │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
```

### 技术栈

**前端**：
- React 19 + TypeScript 5 + Vite 7
- **Ant Design 6.0** + **Ant Design X 2.1** ✨ 新增！
- TailwindCSS 3 + React Query v5 + React Router DOM v7
- 架构：frontend-v2（模块化，顶部导航）
- **通用能力层**：shared/components/Chat（基于 Ant Design X）✅

**后端**：
- Fastify v4 (Node.js 22)
- Prisma 6 (10个Schema隔离)
- LLM：DeepSeek-V3, Qwen-Max, GPT-5-Pro, Claude-4.5
- 架构：增量演进（legacy + common + modules）

**数据库**：
- PostgreSQL 15 （Docker: pgvector/pgvector:pg15）
- **pgvector 0.8.1** ✅ 2026-01-19 新增（向量数据库扩展，支持 RAG）
- 12个Schema隔离（platform/aia/pkb/asl/dc/iit/ssa/st/rvw/admin/common/capability ✅新增）

**云原生部署**：
- 阿里云 SAE (Serverless 应用引擎)
  - ✅ Python微服务（v1.0）- 内网：172.17.173.66:8000
  - ✅ Node.js后端（v1.3）- 内网：172.17.173.73:3001
  - ✅ 前端Nginx（v1.0）- 内网：172.17.173.72:80
  - ✅ CLB负载均衡 - 公网：http://8.140.53.236/
- RDS PostgreSQL 15（生产环境运行中）
- OSS对象存储（已配置）
- ACR容器镜像仓库（已推送3个镜像）
- 阿里云 ACR (容器镜像服务) ✅ 已推送3个镜像（Frontend、Backend、Python）
- 阿里云 RDS (PostgreSQL 15) ✅ 已迁移数据
- RDS PostgreSQL 15 + OSS (对象存储) + NAT网关
- ACR (容器镜像服务 - 个人版免费)
- **部署状态**：🚀 **进行中**（PostgreSQL✅、Python微服务✅、前端镜像✅、Node.js后端⏳）

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## 🚀 当前开发状态（2026-01-19）

### 🏆 最新进展：pgvector 向量数据库集成（2026-01-19）

#### ✅ pgvector 0.8.1 安装成功

**背景**：
- PKB 模块需要实现 RAG 检索功能
- 原计划依赖 Dify 知识库，现改为 PostgreSQL 原生 pgvector 方案
- 与 Postgres-Only 架构理念一致，减少外部依赖

**完成工作**：
- ✅ Docker 镜像迁移：`postgres:15-alpine` → `pgvector/pgvector:pg15`
- ✅ pgvector 扩展安装：版本 0.8.1
- ✅ 数据安全：执行双重备份（SQL dump + Volume tarball）
- ✅ 功能验证：前后端服务重启后功能全部正常
- ✅ 数据完整性：用户数据、pg-boss 队列函数全部正常

**技术细节**：
| 项目 | 说明 |
|------|------|
| Docker 镜像 | `pgvector/pgvector:pg15` |
| pgvector 版本 | 0.8.1 |
| 支持索引类型 | HNSW、IVFFlat |
| 最大向量维度 | 16000 维 |
| 阿里云 RDS 兼容性 | ✅ 完全兼容（RDS 为 0.8.0） |

**版本兼容性说明**：
- 开发环境：pgvector 0.8.1
- 生产环境（阿里云 RDS）：pgvector 0.8.0
- 兼容性：0.8.x 系列向后兼容，数据格式和 API 一致

**文件变更**：
- `docker-compose.yml`：更新 postgres 服务镜像
- `Dockerfile.postgres-pgvector`：自定义构建文件（备用）
- `backup_before_pgvector_20260119.sql`：迁移前备份
- `postgres_volume_backup_20260119.tar`：Volume 备份

**下一步**：
- 设计 `pkb_schema.document_embeddings` 向量表
- 集成 Embedding 服务（OpenAI/智谱）
- 实现 RAG 检索 API

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### 🏆 历史进展：AIA V2.1 Prompt管理集成（2026-01-18）

#### ✅ AIA 模块 Prompt 管理系统集成

**功能：**
- ✅ 10 个智能体 Prompt 迁移到数据库（`capability_schema.prompt_templates`）
- ✅ 管理端可在线编辑和调试提示词
- ✅ 灰度预览（调试者看 DRAFT，普通用户看 ACTIVE）
- ✅ 三级容灾（数据库 → 缓存 → 兜底）
- ✅ 版本管理和回滚

**Prompt Code 列表：**

| Prompt Code | 智能体 |
|-------------|--------|
| `AIA_SCIENTIFIC_QUESTION` | 科学问题梳理 |
| `AIA_PICO_ANALYSIS` | PICO 梳理 |
| `AIA_TOPIC_EVALUATION` | 选题评价 |
| `AIA_OUTCOME_DESIGN` | 观察指标设计 |
| `AIA_CRF_DESIGN` | 病例报告表设计 |
| `AIA_SAMPLE_SIZE` | 样本量计算 |
| `AIA_PROTOCOL_WRITING` | 临床研究方案撰写 |
| `AIA_METHODOLOGY_REVIEW` | 方法学评审智能体 |
| `AIA_PAPER_POLISH` | 论文润色 |
| `AIA_PAPER_TRANSLATE` | 论文翻译 |

**修改文件：**
- `backend/scripts/migrate-aia-prompts.ts` - 迁移脚本
- `backend/src/common/prompt/prompt.fallbacks.ts` - 兜底 Prompt
- `backend/src/modules/aia/services/agentService.ts` - 集成 PromptService
- `backend/src/modules/aia/services/conversationService.ts` - 传递 userId

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### 🆕 ASL 智能文献检索 DeepSearch MVP（2026-01-18）

#### ✅ 功能完成

**核心功能：**
- ✅ 集成 unifuncs DeepSearch API（OpenAI 兼容协议）
- ✅ 自然语言输入研究问题，AI 自动生成 PubMed 检索策略
- ✅ SSE 实时流式显示 AI 思考过程
- ✅ 提取并展示 PubMed 文献链接
- ✅ 数据库存储任务记录

**技术实现：**
- 后端：`researchService.ts` + `researchController.ts`（SSE 流式接口）
- 前端：`ResearchSearch.tsx`（统一内容流展示）
- 数据库：`asl_schema.asl_research_tasks`

**API 端点：**
| 方法 | 路径 | 说明 |
|------|------|------|
| POST | `/api/v1/asl/research/stream` | SSE 流式检索 |
| POST | `/api/v1/asl/research/tasks` | 异步任务（备用） |
| GET | `/api/v1/asl/research/tasks/:taskId/status` | 任务状态 |

**前端入口：**
- 路由：`/literature/research/search`
- 菜单：AI智能文献 → 2. 智能文献检索

**已知限制：**
- ⚠️ SSE 模式，离开页面任务中断
- ⚠️ 每次检索成本约 0.3 元（unifuncs API）

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### 🏆 历史进展：通用能力层重大升级 + AIA V2.0（2026-01-14）

#### ✅ Phase 1: 通用流式响应服务（OpenAI Compatible）

**后端能力：**
- ✅ 创建 `common/streaming/` 模块（4个文件，~400行）
- ✅ `OpenAIStreamAdapter` - SSE适配器
- ✅ `StreamingService` - 流式响应服务
- ✅ 支持 `content` 和 `reasoning_content` 双流
- ✅ 深度思考标签处理（`<think>...</think>`）
- ✅ Token统计和错误处理

**输出格式：**
```
data: {"id":"chatcmpl-xxx","choices":[{"delta":{"content":"你好"}}]}\n\n
data: {"id":"chatcmpl-xxx","choices":[{"delta":{"reasoning_content":"思考..."}}]}\n\n
data: [DONE]\n\n
```

#### ✅ Phase 2: Chat通用组件V2（Ant Design X深度集成）

**前端能力：**
- ✅ 升级 `shared/components/Chat/`（12个文件，~2000行）
- ✅ `AIStreamChat` - 流式对话组件（现代感设计）
- ✅ `ThinkingBlock` - 深度思考展示组件
- ✅ `ConversationList` - 会话列表组件
- ✅ `useAIStream` Hook - 流式响应处理
- ✅ `useConversations` Hook - 会话管理
- ✅ 现代感样式（Ultramodern风格）

**核心特性：**
- 逐字流式显示（打字机效果）
- 深度思考可折叠展示
- 会话列表分组（今天/昨天/更早）
- 欢迎页配置
- 快捷提示
- 附件上传（UI完成，后端待实现）

#### ✅ Phase 3: AIA模块V2.0完整实现

**前端开发：**
- ✅ `AgentHub` - 智能体大厅（100%还原原型图V11）
  - 12个智能体卡片
  - 时间轴设计（5个阶段）
  - 主题色区分（蓝/黄/青/紫）
  - 序号水印
  - 悬停动画效果
- ✅ `ChatWorkspace` - 对话工作台
  - 全屏沉浸式体验
  - 左侧会话列表（256px）
  - 欢迎语（左上角单行）
  - 流式响应集成
  - 深度思考展示
  - 自动创建对话

**后端开发：**
- ✅ `agentService` - 12个智能体配置
- ✅ `conversationService` - 重构使用 StreamingService
- ✅ `attachmentService` - 附件处理骨架
- ✅ API端点（12个）
- ✅ 认证授权（符合规范）
- ✅ 流式响应测试通过

**代码统计：**
- 前端业务：~1,500行（10个文件）
- 后端业务：~900行（9个文件）
- 通用能力（前端）：~2,000行（12个文件）
- 通用能力（后端）：~400行（4个文件）
- **总计：~4,800行**

**测试结果：**
- ✅ 智能体大厅展示正常
- ✅ 卡片点击进入对话
- ✅ 自动创建对话
- ✅ 流式响应测试通过（HTTP 200）
- ✅ 深度思考展示正常
- ✅ 认证授权正常

**待完成功能：**
- 🔜 附件上传API实现
- 🔜 历史消息加载
- 🔜 知识库集成（RAG）
- 🔜 Prompt管理系统对接

**技术创新：**
- 🏆 **OpenAI Compatible标准化** - 业界主流格式
- 🏆 **通用能力抽象** - 前后端Chat能力可复用
- 🏆 **现代感设计** - Ant Design X Ultramodern风格

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### 🎉 历史进展：ADMIN 运营管理端（2026-01-11）

#### ✅ Phase 3.5.1-3.5.4 已完成（83%）

**Phase 3.5.1: 基础设施搭建**
- ✅ 创建 `capability_schema`
- ✅ 添加 `prompt_templates` 和 `prompt_versions` 表
- ✅ 添加 `prompt:view/edit/debug/publish` 权限
- ✅ 迁移 RVW Prompt 到数据库（2个：RVW_EDITORIAL, RVW_METHODOLOGY）

**Phase 3.5.2: PromptService 核心服务**
- ✅ 灰度预览逻辑（调试者看 DRAFT，用户看 ACTIVE）
- ✅ 模块级调试控制（`setDebugMode(userId, ['RVW'], true)`）
- ✅ Handlebars 模板渲染
- ✅ 变量提取与校验（自动从 `{{xxx}}` 提取）
- ✅ 三级容灾（数据库→缓存→兜底 hardcoded）

**Phase 3.5.3: 管理 API**
- ✅ 8个 RESTful 接口（`/api/admin/prompts/*`）
- ✅ 权限控制（PROMPT_ENGINEER 只能编辑，SUPER_ADMIN 才能发布）

**Phase 3.5.4: 前端管理界面**
- ✅ 管理端基础架构（AdminLayout, OrgLayout）
- ✅ 路由系统（`/admin/*`, `/org/*`）
- ✅ 头像下拉菜单切换入口
- ✅ PromptListPage（筛选、搜索、调试开关）
- ✅ PromptEditor（CodeMirror 6 简化版，中文友好，15px字体）
- ✅ PromptEditorPage（编辑、保存、发布、测试、版本历史）

**⏳ Phase 3.5.5 待完成**
- [ ] 改造 RVW 服务使用 `promptService.get()`（替代文件读取）
- [ ] 端到端测试

**📄 相关文档**
- 详细计划：`docs/03-业务模块/ADMIN-运营管理端/04-开发计划/02-Prompt管理系统开发计划.md`
- TODO清单：`docs/03-业务模块/ADMIN-运营管理端/04-开发计划/01-TODO清单（可追踪）.md`

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### ✅ 已完成模块

#### 1. 平台基础层 🏆 **Postgres-Only 架构完成！**（2025-12-13）

**核心架构：Platform-Only 模式**
- ✅ **统一缓存**：`PostgresCacheAdapter` → `platform_schema.app_cache`
- ✅ **统一队列**：`PgBossQueue` → `platform_schema.job` (pg-boss)
- ✅ **任务管理**：所有任务信息存储在 `job.data` (JSONB)
- ✅ **断点续传**：`CheckpointService` 通用化（操作 job.data）
- ✅ **智能阈值**：小任务直接处理，大任务队列处理（THRESHOLD=50）

**原有能力：**
- ✅ 存储服务（LocalAdapter ↔ OSSAdapter）
- ✅ 日志系统（Winston + 结构化JSON）
- ✅ 健康检查（Liveness + Readiness）
- ✅ 监控指标（数据库连接/内存/API）
- ✅ 数据库连接池（Serverless优化）

**测试覆盖：**
- ✅ 单元测试：8个全部通过
- ✅ 集成测试：2个全部通过
- ✅ 架构验证：Platform-Only 验证通过

**技术债务：**
- ⚠️ Phase 8 全面测试（断点续传压力测试、1000篇文献完整流程）
- ⚠️ Phase 9 SAE 部署验证

#### 2. AIA模块 - AI智能问答 🎉 **V2.0 重构完成！**（2026-01-14）

**重大升级：**
- 🆕 **通用能力层架构**：StreamingService + Chat组件V2
- 🆕 **OpenAI Compatible**：标准流式格式 + 深度思考支持
- 🎨 **现代感UI**：100%还原原型图V11
- ✨ **12个智能体**：覆盖选题→方案→评审→统计→写作全流程

**5个阶段，12个智能体：**
1. **选题优化**（3个）：科学问题梳理、PICO梳理、选题评价
2. **方案设计**（4个）：观察指标、CRF设计、样本量计算、方案撰写
3. **方案预评审**（1个）：方法学评审
4. **数据与统计**（2个）：数据预处理、统计分析（工具类，跳转DC）
5. **写作助手**（2个）：论文润色、论文翻译

**技术栈：**
- 前端：React 19 + Ant Design X 2.1 + Lucide Icons
- 后端：Fastify + Prisma + OpenAI Compatible API
- 通用能力：StreamingService + AIStreamChat + ThinkingBlock

**当前状态：**
- ✅ 前端AgentHub（100%还原原型图）
- ✅ 前端ChatWorkspace（流式对话 + 深度思考）
- ✅ 后端API（12个端点）
- ✅ 流式响应测试通过
- 🔜 附件上传（待完成）
- 🔜 历史消息加载（待完成）

**完成度：85%** - 核心功能完成，附件和历史功能待开发

**详细文档：** [AIA模块状态与开发指南](../../03-业务模块/AIA-AI智能问答/00-模块当前状态与开发指南.md)

#### 3. PKB模块 - 个人知识库 🎉 **pgvector RAG基础设施就绪！**

**开发进度**：
- ✅ **后端API**：100%完成（v1 + v2双路由运行）
- ✅ **前端Dashboard**：90%完成（基于知识库仪表盘V5原型）
- ✅ **前端Workspace**：85%完成（基于工作台V3原型）
- ✅ **全文阅读模式**：90%完成（Chat组件集成）
- ✅ **逐篇精读模式**：85%完成（文档选择+对话）
- 🔧 **批处理模式**：70%完成（UI完成，API待调试）
- 🟡 **RAG检索模式**：基础设施就绪（pgvector 0.8.1 已安装），业务逻辑待实现

**核心功能**：
- 知识库CRUD + 文档管理
- 3种工作模式（全文阅读、逐篇精读、批处理）
- Ant Design X Chat组件集成
- 响应式全屏布局

**技术亮点**：
- ✅ 模块化架构迁移（/modules/pkb）
- ✅ Zustand状态管理
- ✅ 复用shared/components/Chat通用组件
- ✅ 单层Header + 紧凑工作模式栏设计
- ✅ **pgvector 0.8.1 已集成**（2026-01-19）

**待解决问题**：
- 🔧 批处理API执行待调试
- 🔧 知识资产页面导航条待完善
- 🔧 RAG 检索业务逻辑待实现（向量表设计、Embedding服务）

**详细文档**：[PKB模块当前状态](../03-业务模块/PKB-个人知识库/00-模块当前状态与开发指南.md)

### 🚧 正在开发模块

#### 4. ASL模块 - AI智能文献 🏆 **Postgres-Only 架构改造完成！**

**开发进度**：
- ✅ **标题摘要初筛MVP**：完整流程（设置→启动→审核→结果→导出）
- ✅ **全文复筛后端**：LLM服务、数据库、批处理、API
- ✅ **🏆 Postgres-Only 架构改造**：智能阈值、任务拆分、断点续传（Phase 6完成）
- 🚧 **全文复筛前端UI**：4个核心页面（待开发）

**核心功能**：
- 双模型并行筛选（DeepSeek-V3 + Qwen-Max）
- PICOS标准判断
- 12字段结构化提取（全文复筛）
- 医学逻辑验证 + 证据链验证
- Excel批量导出

**🚀 Postgres-Only 架构亮点**：
- ✅ **智能双模式**：<50篇直接处理，≥50篇队列处理
- ✅ **任务拆分**：1000篇 → 20个批次，每批50篇
- ✅ **断点续传**：支持2-24小时长任务，实例重启可恢复
- ✅ **Platform层统一**：任务管理信息存储在 `job.data`，不在业务表中
- ✅ **零额外成本**：使用 pg-boss，无需 Redis
- ✅ **高可靠性**：自动重试3次，6小时过期保护

**技术实现**：
- `screeningService.ts`：智能阈值判断，推送批次任务
- `screeningWorker.ts`：批次处理，断点续传
- `CheckpointService`：操作 job.data，所有模块通用

**详细文档**：[ASL模块当前状态](../03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md)

#### 5. DC模块 - 数据清洗整理 🏆 **Tool C MVP + Postgres-Only 架构改造完成！**

**开发进度**：
- ✅ **Tool B后端**：100%完成（1,658行代码）
  - 4个核心服务（HealthCheck、Template、DualModel、Conflict）
  - 1个控制器（6个API端点）
  - 路由集成（/api/v1/dc/tool-b）
  - Prisma Schema（4个表）
  - 100%云原生（复用平台能力）
  - ✅ **🏆 Postgres-Only 架构改造**：智能阈值、任务拆分、断点续传（Phase 7完成）
- ❌ **Tool B前端**：0%（有V4原型设计，未实现）

- ✅ **Tool C（数据编辑器）**：**MVP + NA处理 + Pivot优化 + UX重大改进完成** ✅
  - ✅ Python微服务（~1800行）- Day 1 + NA处理优化 + 全量数据处理
  - ✅ Node.js后端（~3500行）- Day 2-3, Day 5-8增强 + 全量返回
  - ✅ 前端界面（~4000行）- Day 4-8, 筛选/行号/滚动条/全量加载
  - ✅ 通用 Chat 组件（~968行）- Day 5
  - ✅ 7个功能按钮（筛选、映射、分箱、条件、删NA、计算、Pivot）
  - ✅ NA处理优化（4个功能支持空值处理）
  - ✅ Pivot优化（保留未选列+原始列顺序）
  - ✅ 计算列方案B（安全列名映射，支持特殊字符 + 全角字符转换）
  - ✅ **UX重大改进**（Day 8）：
    - 列头筛选（Excel风格，Community版本，中文本地化）
    - 行号列（固定左侧，灰色背景）
    - 滚动条修复（修改MainLayout，整个页面无滚动条）
    - 全量数据（不再限制50行，筛选精确）
    - 删除预览提示条
  - **总计：~13068行** | **完成度：98%**

- ❌ **Tool A**：未开发
- ✅ **Portal**：已完成（Tool B + Tool C 入口）

**核心功能（Tool C，2025-12-10最新）**：
- 7个功能按钮：高级筛选、数值映射、生成分类变量、条件生成列、删除缺失值、计算列、Pivot转换
- NA处理支持：数值映射（保持/映射/删除）、分箱（保持/标记/分配）、条件（为空/不为空）
- Pivot优化：保留未选择的列、保持原始列顺序
- 计算列方案B：安全列名映射，支持中文括号等特殊字符 + 全角字符自动转换
- **UX重大改进**：
  - 列头筛选（Excel风格，Community版本，中文本地化，显示值计数）
  - 行号列（固定左侧，灰色背景，#列头）
  - 滚动条修复（修改MainLayout，整个页面无滚动条，只有表格内部滚动）
  - 全量数据（不再限制50行，筛选精确，所有操作全量返回）

**核心功能（Tool B）**：
- 双模型并发提取（DeepSeek-V3 + Qwen-Max）
- 自动冲突检测（字段级对比）
- Excel健康检查（空值率、Token估算、拦截策略）
- 预设模板系统（肺癌、糖尿病、高血压）

**🚀 Postgres-Only 架构亮点**：
- ✅ **智能双模式**：<50条直接处理，≥50条队列处理
- ✅ **任务拆分**：1000条 → 20个批次，每批50条
- ✅ **断点续传**：支持长时间提取任务，实例重启可恢复
- ✅ **Platform层统一**：与 ASL 共用 CheckpointService
- ✅ **零额外成本**：使用 pg-boss，无需 Redis

**技术实现**：
- `ExtractionController.ts`：智能阈值判断，推送批次任务
- `extractionWorker.ts`：批次处理，断点续传
- `CheckpointService`：操作 job.data，所有模块通用

**技术亮点**：
- ✅ Excel内存处理（零落盘，云原生）
- ✅ 双模型交叉验证（减少AI幻觉）
- ✅ 3层JSON解析（容错机制）
- ✅ 复用LLMFactory、storage、cache、jobQueue
- ✅ 预写Python函数架构（稳定、安全、高性能）
- ✅ 安全列名映射（支持特殊字符列名）

**待开发功能**：
- ⏳ 缺失值填补（均值/中位数/众数/固定值）
- ⏳ 多重插补（MICE）- 高优先级

**详细文档**：[DC模块当前状态](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/00-模块当前状态与开发指南.md)

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### 🚀 IIT Manager Agent（代号：IIT，2025-12-31启动）

**定位**：AI驱动的IIT（研究者发起的临床研究）智能助手

**核心价值**：
- 🎯 **主动工作的AI Agent** - 不是被动工具，而是24/7主动监控的智能助手
- 🎯 **REDCap深度集成** - 与医院现有EDC系统无缝对接
- 🎯 **影子状态机制** - AI建议+人类确权，符合医疗合规要求（FDA 21 CFR Part 11）
- 🎯 **企业微信实时通知** - 质控预警秒级推送，移动端查看

**MVP目标**（2周冲刺）：
- ✅ 打通 REDCap → AI质控 → 企微通知 完整闭环
- ✅ 实现智能数据质控（基于Protocol的入排标准检查）
- ✅ 支持历史数据全量扫描
- ✅ PC Workbench复核界面

**Day 1 完成情况**（2025-12-31）：✅ **100%**
- ✅ **数据库Schema**：5个表（IitProject, IitPendingAction, IitTaskRun, IitUserMapping, IitAuditLog）
- ✅ **模块结构**：controllers/services/agents/adapters/routes/types/workers
- ✅ **类型系统**：223行完整TypeScript类型定义
- ✅ **系统集成**：健康检查端点正常（`/api/v1/iit/health`）
- ✅ **企业微信配置**：Access Token获取成功（核心验证通过）
- ✅ **企业微信可信域名**：iit.xunzhengyixue.com（网页授权+JS-SDK授权）
- ✅ **Prisma Schema**：含V1.1新增字段（cachedRules, lastSyncAt, miniProgramOpenId）

**REDCap环境就绪**（2026-01-02）：✅ **100%**
- ✅ **REDCap本地部署**：15.8.0版本，Docker Compose（3容器架构）
- ✅ **测试项目创建**：test0102 (PID 16)，已录入测试数据
- ✅ **DET功能验证**：Data Entry Trigger真实存在（源码验证通过）
- ✅ **技术调研完成**：源码分析 + External Module文档研究
- ✅ **对接方案确定**：DET（实时触发） + REST API（数据读写）
- ✅ **技术方案文档**：《REDCap对接技术方案与实施指南》（1070行完整文档）
- ✅ **代码设计完成**：RedcapAdapter、WebhookController、SyncManager
- ✅ **REDCap文档体系**：部署手册、问题排查、API对接指南

**Day 1 技术验证**：
```bash
# 数据库CRUD测试 - 全部通过 ✅
✅ IIT项目创建成功
✅ 影子状态记录创建成功
✅ 任务运行记录创建成功
✅ 用户映射创建成功
✅ 审计日志创建成功
✅ 关联查询成功

# 企业微信API测试 - Access Token获取成功 ✅
✅ CorpID: ww6ab493470ab4f377
✅ AgentID: 1000002
✅ Access Token获取成功（核心验证通过）
```

**技术架构**（REDCap对接方案V1.0）：
- ✅ **DET实时触发**：Data Entry Trigger（REDCap原生，0秒延迟）
- ✅ **REST API集成**：exportRecords（数据拉取）+ importRecords（数据回写）
- ✅ **双保险机制**：Webhook（主，95%） + 定时轮询（补充，30分钟）
- ✅ **Postgres-Only架构**：复用平台缓存（app_cache）和队列（pg-boss）
- ✅ **Dify RAG集成**：Protocol知识检索 + 规则预缓存（性能优化）
- ✅ **影子状态机制**：PROPOSED → APPROVED → EXECUTED 状态流转
- ✅ **前端技术栈**：Taro 4.x（React语法，支持小程序+H5双端）

**核心创新**：
- 🔥 **DET实时触发**：CRC保存数据→5秒内收到企微质控通知（实时性100%）
- 🔥 **零侵入性**：只用REDCap原生API和DET，无需修改源码（维护成本<10%）
- 🔥 **双保险机制**：Webhook幂等性 + 轮询补充，数据不丢失（可靠性99.9%）
- 🔥 **历史数据扫描**：BulkScanService支持存量数据质控（智能阈值+断点续传）
- 🔥 **规则预缓存**：Protocol上传时提取关键规则，简单检查<100ms

**开发进度**：
- Day 1/14：✅ 基础架构就位（数据库、模块结构、企微配置）
- REDCap准备：✅ 本地环境部署 + 对接方案确定 + 技术方案文档
- Day 2：✅ REDCap API Adapter + WebhookController + SyncManager完成
- Day 3：✅ 企微推送 + 端到端测试通过（REDCap → Node.js → 企微）
- **Phase 1.5：✅ AI对话集成完成（2026-01-03）**
  - ✅ ChatService + SessionMemory + REDCap数据查询
  - ✅ 意图识别 + 数据注入LLM + 解决LLM幻觉
  - ✅ 测试通过（查询ID 7，10条记录统计）
- Phase 2：待开始 - Function Calling + Dify知识库
- Day 6-9：影子状态管理 + 历史数据扫描
- Day 10-14：PC Workbench前端 + 端到端测试 + Demo录制

**已创建文件**（Day 1 + REDCap准备）：
```
backend/prisma/schema.prisma               # 新增iit_schema（5个表）
backend/src/modules/iit-manager/          # 模块目录结构
├── types/index.ts                        # 223行类型定义
├── routes/index.ts                       # 路由骨架
├── test-iit-database.ts                  # 数据库测试（通过）
└── test-wechat-push.ts                   # 企微测试（Access Token成功）
backend/src/config/env.ts                 # 新增企微配置
backend/src/index.ts                      # IIT模块集成

redcap-docker-dev/                        # REDCap Docker环境（新增）
├── docker-compose.yml                    # 开发环境配置
├── docker-compose.prod.yml               # 生产环境配置
├── Dockerfile.redcap                     # REDCap镜像
├── docker-entrypoint.sh                  # 容器启动脚本
├── config/
│   ├── apache/redcap.conf               # Apache配置
│   ├── php/php.ini                      # PHP配置
│   └── database.php                     # REDCap数据库配置
└── scripts/                             # 管理脚本（setup/start/stop/logs/clean）

docs/03-业务模块/IIT Manager Agent/        # 完整文档架构
├── 00-系统设计/                          # 技术架构白皮书、实施战略
├── 02-技术设计/                          # 完整技术开发方案（V1.1，2170行）
├── 04-开发计划/
│   ├── MVP开发任务清单.md               # 开发任务清单
│   ├── 企业微信注册指南.md              # 企微配置指南
│   └── REDCap对接技术方案与实施指南.md   # ⭐ 1070行完整方案（新增）
└── 06-开发记录/                          # V1.1更新完成报告

docs/03-业务模块/Redcap/                   # REDCap文档体系（新增）
├── 00-模块概览/                          # REDCap文档导航
├── 01-部署与配置/                        # Docker部署手册、问题排查
└── 03-API对接与开发/                     # 二次开发指南、API对接
```

**下一步**（Day 2）：
- 🔄 **RedcapAdapter开发**（exportRecords/exportMetadata/importRecords）
- 🔄 **WebhookController开发**（DET接收器、<100ms响应、异步处理）
- 🔄 **SyncManager开发**（定时轮询、增量同步、幂等性保护）
- 🔄 **集成测试**（DET配置、API测试、端到端验证）

**详细文档**：
- ⭐ [REDCap对接技术方案与实施指南](../03-业务模块/IIT%20Manager%20Agent/04-开发计划/REDCap对接技术方案与实施指南.md) - **Day 2核心参考**
- [IIT Manager Agent 完整技术开发方案 (V1.1)](../03-业务模块/IIT%20Manager%20Agent/02-技术设计/IIT%20Manager%20Agent%20完整技术开发方案%20(V1.1).md)
- [IIT Manager Agent 模块当前状态与开发指南](../03-业务模块/IIT%20Manager%20Agent/00-模块当前状态与开发指南.md)
- [MVP开发任务清单](../03-业务模块/IIT%20Manager%20Agent/04-开发计划/MVP开发任务清单.md)
- [企业微信注册指南](../03-业务模块/IIT%20Manager%20Agent/04-开发计划/企业微信注册指南.md)
- [REDCap Docker部署操作手册](../03-业务模块/Redcap/01-部署与配置/10-REDCap_Docker部署操作手册.md)
- [REDCap二次开发深度指南](../03-业务模块/Redcap/03-API对接与开发/33-REDCap二次开发深度指南.md)

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## 🚀 阿里云生产环境部署状态（2025-12-24）

### ✅ 已完成部署

#### 1. 基础设施层
- ✅ **VPC网络**：`vpc-2ze055cptkew9c38w4r06`（172.17.0.0/16）
- ✅ **NAT网关**：`ngw-2zeec9ulzgw7ywvx1pst6`（公网IP: 182.92.176.14）
- ✅ **安全组**：`sg-2zedk6fi8sgmmcwdu7tu`
- ✅ **交换机**：2个（可用区F + 可用区A）
- ✅ **SAE命名空间**：`cn-beijing:test-airesearch`

#### 2. 数据存储层
- ✅ **RDS PostgreSQL 15**
  - 实例ID: `pgm-2zex1m2y3r23hdn5`
  - 规格: 2核4GB
  - 内网地址: `pgm-2zex1m2y3r23hdn5.pg.rds.aliyuncs.com:5432`
  - 数据库: `ai_clinical_research`
  - **数据迁移**: ✅ 完成（90MB SQL文件，约12秒导入）
  - **Schema验证**: ✅ 11个Schema全部迁移成功
  - **数据验证**: ✅ 用户3条、项目2条、文献1204条
  - **部署时间**: 2025-12-24
  
- ✅ **OSS对象存储**
  - Bucket: `ai-clinical-research`
  - 存储类型: 标准存储（同城冗余）
  - 内网域名: `ai-clinical-research.oss-cn-beijing-internal.aliyuncs.com`
  - RAM用户: `oss-bucket-put-object@1991407246109125.onaliyun.com`
  - AccessKey: 已配置（不公开）

#### 3. 容器镜像服务（ACR）
- ✅ **命名空间**: `ai-clinical`
- ✅ **Registry**: `crpi-cd5ij4pjt65mweeo.cn-beijing.personal.cr.aliyuncs.com`
- ✅ **已推送镜像**:
  - **前端Nginx**: `ai-clinical_frontend-nginx:v1.0`（约50MB）
    - 构建时间: 2025-12-24
    - 基础镜像: `nginx:alpine`
    - 功能: React SPA + Nginx反向代理 + 动态环境变量
    - 配置文件: `frontend-v2/Dockerfile`, `nginx.conf`, `.dockerignore`
  
  - **Python微服务**: `python-extraction:v1.0`（1.12GB）
    - 构建时间: 2025-12-24
    - 基础镜像: `python:3-slim`
    - 功能: PDF提取（PyMuPDF）+ 数据清洗（pandas/numpy/polars）
    - 特性: 移除Nougat（减小1.5GB）、使用阿里云Debian源
    - 配置文件: `extraction_service/Dockerfile`, `requirements-prod.txt`, `.dockerignore`
  
  - **Node.js后端**: `backend-service:v1.0`（838MB，压缩后~186MB）✨ 新增！
    - 构建时间: 2025-12-24（约5分钟）
    - 基础镜像: `node:alpine`
    - 构建策略: 改进版方案B（本地编译+Docker打包）
    - 技术突破: 修复200+TypeScript错误、手动补全30+Prisma关系字段
    - 架构特性: Postgres-Only（pg-boss队列+PostgreSQL缓存）
    - 配置文件: `backend/Dockerfile`, `backend/.dockerignore`, `backend/prisma/schema.prisma`

### 🚧 进行中

#### 4. SAE应用部署
- ✅ **Python微服务**: 已成功部署到SAE轻量版
  - 应用名称: `python-extraction-test`
  - 规格: 1核2GB
  - 内网地址: `http://172.17.173.66:8000`
  - 状态: 运行中 ✅

- ⏳ **Node.js后端**: 镜像已推送，待部署到SAE
  - 目标规格: 1核2GB（测试环境）
  - 端口: 8000
  - 健康检查: `/api/health`
  
- ⏳ **Node.js后端**: Docker镜像待构建
  - 目标规格: 2核4GB
  - 端口: 3001
  - 依赖: RDS PostgreSQL
  
- ⏳ **前端Nginx**: 镜像已推送，待部署到SAE
  - 目标规格: 1核2GB
  - 端口: 80
  - 需配置: 后端API内网地址

### 📋 待完成

- [ ] Python微服务部署到SAE
- [ ] Node.js后端Docker镜像构建
- [ ] Node.js后端部署到SAE
- [ ] 前端Nginx部署到SAE
- [ ] 配置服务间内网通信
- [ ] 全链路验证测试
- [ ] Dify AI服务部署（可选）

### 📊 部署文档

**部署进度总览**：
- [00-部署进度总览.md](../05-部署文档/00-部署进度总览.md) - 🎯 **一站式部署状态查看**

**操作手册**：
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](../05-部署文档/07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md)
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](../05-部署文档/08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md)
- Python微服务SAE部署操作手册（待创建）

**技术指南**：
- [01-快速部署SOP-零基础版.md](../05-部署文档/01-快速部署SOP-零基础版.md) - 完整部署流程
- [04-Python微服务-SAE容器部署指南.md](../05-部署文档/04-Python微服务-SAE容器部署指南.md)
- [06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md](../05-部署文档/06-前端Nginx-SAE容器部署指南.md)

### 🎯 部署关键成就

1. **PostgreSQL数据迁移** ✅
   - 采用`pg_dump`全量导出/导入方案
   - 11个Schema完整迁移
   - 数据一致性验证通过
   - 安全加固（外网访问已关闭）

2. **前端Nginx镜像优化** ✅
   - 解决Docker Hub网络问题（使用通用标签）
   - 修复30个TypeScript编译错误
   - 多阶段构建优化
   - 健康检查通过

3. **Python微服务镜像优化** ✅
   - 移除Nougat OCR（减小1.5GB）
   - 使用阿里云Debian镜像源（解决apt-get网络问题）
   - 保留数据清洗功能（pandas/numpy/polars）
   - 运行时依赖优化（libgl1、libglib2.0）

4. **镜像配置文件Git管理** ✅
   - Dockerfile: ✅ 已提交Git（构建蓝图）
   - .dockerignore: ✅ 已提交Git（优化构建）
   - 依赖文件: ✅ 已提交Git（可复现）
   - 敏感信息: ❌ 禁止提交（.env等）

### 💰 当前运行成本估算

| 服务 | 规格 | 月成本 | 状态 |
|------|------|-------|------|
| RDS PostgreSQL | 2核4GB | ¥260 | ✅ 运行中 |
| OSS存储 | 10GB | ¥2 | ✅ 运行中 |
| NAT网关 | 小型 | ¥60 | ✅ 运行中 |
| EIP流量 | 5Mbps | ¥40 | ✅ 运行中 |
| ACR镜像仓库 | 个人版 | ¥0（免费） | ✅ 运行中 |
| SAE - Python | 1核2GB×1 | ¥60 | ⏳ 待部署 |
| SAE - Node.js | 2核4GB×1 | ¥120 | ⏳ 待部署 |
| SAE - Frontend | 1核2GB×1 | ¥60 | ⏳ 待部署 |
| **总计** | - | **¥602/月** | 部署中 |

---

## 📁 项目结构概览

```
AIclinicalresearch/
├── frontend-v2/              # 🌐 前端（React 19 + TS）
│   └── src/
│       ├── framework/        # 框架层（布局、路由、权限）
│       ├── modules/          # 业务模块
│       │   ├── asl/          # ✅ AI智能文献
│       │   ├── aia/          # 🎉 AI智能问答 V2.0（12个智能体）
│       │   ├── pkb/          # ✅ 个人知识库
│       │   ├── dc/           # ✅ 数据清洗（Tool C 完成）
│       │   └── ...
│       └── shared/           # 共享组件和工具
│           └── components/   # ✨ 通用能力层
│               └── Chat/     # ✅ Chat 通用组件 V2（Ant Design X）
│                   ├── AIStreamChat.tsx      # 🆕 流式对话（推荐）
│                   ├── ThinkingBlock.tsx     # 🆕 深度思考展示
│                   ├── ConversationList.tsx  # 🆕 会话列表
│                   └── hooks/useAIStream.ts  # 🆕 流式响应Hook
│
├── backend/                  # ⚙️ 后端（Fastify + Prisma）
│   └── src/
│       ├── common/           # ⭐ 平台基础设施（云原生）
│       │   ├── storage/      # 存储抽象层
│       │   ├── logging/      # 日志系统
│       │   ├── cache/        # 缓存服务
│       │   ├── jobs/         # 异步任务
│       │   ├── llm/          # LLM 适配器层（5个模型）
│       │   ├── streaming/    # 🆕 流式响应服务（OpenAI Compatible）
│       │   ├── rag/          # RAG 引擎（Dify集成）
│       │   ├── document/     # 文档处理引擎
│       │   ├── prompt/       # Prompt 管理系统
│       │   └── ...
│       ├── legacy/           # 🔸 现有业务代码（稳定）
│       └── modules/          # 🌟 新架构模块
│           ├── asl/          # ✅ AI智能文献
│           └── dc/           # 🚧 数据清洗（开发中）
│
├── docs/                     # 📚 文档体系
│   ├── 00-系统总体设计/      # 架构设计
│   ├── 01-平台基础层/        # 平台能力
│   ├── 02-通用能力层/        # LLM、RAG等
│   ├── 03-业务模块/          # 各模块文档
│   ├── 04-开发规范/          # 云原生规范等
│   └── 08-项目管理/          # 计划和进度
│
└── prisma/
    └── schema.prisma         # 10个Schema定义
```

---

## 🎯 核心设计原则

### 1. 云原生架构 ☁️
- **无状态应用**：不依赖本地文件系统
- **存储抽象层**：适配器模式，零代码环境切换
- **异步任务**：避免Serverless超时（30秒）
- **数据库连接池**：防止连接数耗尽
- **详细规范**：[云原生开发规范](../04-开发规范/08-云原生开发规范.md) ⭐ **必读**

### 2. 模块化与独立部署 🔧
- **前后端分离**：每个模块前后端完全独立
- **Schema隔离**：数据库层面模块隔离（10个Schema）
- **路由独立**：每个模块有独立的API路由前缀
- **支持独立销售**：任何模块都可独立打包

### 3. 商业模式灵活性 💰
- **4种部署形态**：云端SaaS、私有化部署、单机版、混合部署
- **多版本支持**：专业版/高级版/旗舰版（Feature Flag控制）
- **AI成本可控**：动态切换LLM模型
- **模块化售卖**：任何模块都可独立销售

### 4. 渐进式演进 📈
- **新旧并存**：Frontend-v2（新）+ Frontend（旧保留）
- **增量改造**：Legacy模块保持稳定，新模块标准化
- **Just-in-time**：聚焦当前，架构预留，避免过度设计

---

## 📅 开发时间线

| 时间 | 阶段 | 主要成果 |
|------|------|---------|
| **2025-11-12** | Week 1 | ✅ 数据库Schema隔离（10个Schema） |
| **2025-11-13~14** | Week 2 | ✅ 前端模块化架构 + 后端分层 |
| **2025-11-17** | Week 2+ | ✅ 平台基础设施（8个核心模块） |
| **2025-11-18~21** | Week 3~4 | ✅ ASL标题摘要初筛MVP |
| **2025-11-22~23** | ASL Day 2-5 | ✅ ASL全文复筛后端完成 |
| **2025-11-26~27** | DC Day 2-3 | ✅ DC工具B健康检查+模板管理 |
| **2025-11-28** | DC Day 4-8 | ✅ DC Tool C MVP + UX重大改进完成 |
| **2025-12-13** | 架构优化 | ✅ Postgres-Only架构改造完成 |
| **2025-12-24 上午** | **部署启动** 🚀 | ✅ PostgreSQL数据迁移 + 前端/Python镜像推送ACR |
| **2025-12-24 下午** | **后端镜像构建** 🎉 | ✅ Node.js后端镜像构建成功（修复200+TS错误） |
| **2025-12-31** | **IIT Agent启动** 🎯 | ✅ Day 1完成（数据库+企微配置+模块骨架） |
| **2026-01-01** | **企微可信域名** 🌐 | ✅ iit.xunzhengyixue.com域名验证完成 |
| **2026-01-02** | **REDCap对接方案** 🏆 | ✅ REDCap环境部署 + DET+REST API方案确定 |
| **2026-01-07 上午** | **PKB前端V3** 🎉 | ✅ PKB模块前端V3设计实现完成（Dashboard+Workspace+3种工作模式） |
| **2026-01-07 下午** | **PKB批处理完善** 🏆 | ✅ 批处理完整流程调试通过（执行+进度+结果导出）+ 文档上传功能 + UI优化 |
| **2026-01-19** | **pgvector集成** 🎉 | ✅ pgvector 0.8.1 安装成功，PKB RAG基础设施就绪 |
| **当前** | **PKB模块生产可用** | ✅ 核心功能全部实现（90%），pgvector已集成，RAG业务逻辑待开发 |
| **2026-01-07 晚** | **RVW模块开发完成** 🎉 | ✅ Phase 1-3完成（后端迁移+数据库扩展+前端重构） |

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## 🎯 下一步计划

### 🔥 最高优先级（当前）- 部署到生产环境
1. ✅ **Python微服务部署到SAE** - 已完成
   - ✅ 创建SAE应用（轻量版）
   - ✅ 配置环境变量（OSS、数据库）
   - ✅ 健康检查验证
   - ✅ 获取内网地址：`http://172.17.173.66:8000`
   
2. ✅ **Node.js后端Docker镜像构建** - 已完成
   - ✅ Prisma反向同步（32个模型）
   - ✅ 手动补全Prisma关系字段（30+个）
   - ✅ 修复TypeScript编译错误（200+ → 0）
   - ✅ 创建Dockerfile（改进版方案B）
   - ✅ 构建并推送到ACR（838MB镜像）
   
3. ⏳ **Node.js后端部署到SAE** - 待执行
   - [ ] 创建SAE应用（1核2GB，测试环境）
   - [ ] 配置ACR镜像拉取认证
   - [ ] 配置环境变量（数据库、Python服务、OSS、LLM API）
   - [ ] 健康检查验证
   - [ ] 获取内网地址
   
3. **Node.js后端部署到SAE**
   - 创建SAE应用（2核4GB）
   - 配置环境变量（DATABASE_URL、OSS等）
   - 配置Python微服务内网地址
   - 健康检查验证

4. **前端Nginx部署到SAE**
   - 创建SAE应用（1核2GB）
   - 配置后端API内网地址
   - 公网域名绑定
   - SSL证书配置

5. **全链路验证测试**
   - 前端→Node.js后端→Python微服务→RDS
   - ASL文献筛选完整流程
   - DC数据清洗完整流程
   - 性能和稳定性测试

### 短期（1-2周）- 功能完善
6. **ASL全文复筛前端**（Day 6-8）
   - 4个核心页面：设置、进度、工作台、结果
   - PDF上传和预览功能
   - 双模型判断对比UI
   - 实时进度监控

7. **DC工具B前端开发**
   - 健康检查界面
   - 模板管理界面
   - 批量提取界面
   - 冲突解决界面

### 中期（1-2月）- 模块完善
8. DC模块完整实现（工具A、Portal优化）
9. ASL模块优化（Prompt优化、并发处理）
10. 监控和告警系统配置
11. CI/CD流程建立

### 长期（3月+）- 新模块开发
12. SSA模块（智能统计分析）
13. ST模块（统计分析工具）
14. RVW模块（稿件审查系统）

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## 📚 重要文档索引

### 🎯 必读文档（新AI助手）
1. ⭐⭐⭐ **本文档** - 系统当前状态
2. ⭐⭐⭐ [前后端模块化架构设计-V2.md](./前后端模块化架构设计-V2.md) - 架构总纲
3. ⭐⭐⭐ [云原生开发规范.md](../04-开发规范/08-云原生开发规范.md) - 开发规范（必读）
4. 🔴⭐⭐⭐ [数据库开发规范.md](../04-开发规范/09-数据库开发规范.md) - **数据库操作安全（必读！）**
5. ⭐⭐ [01-系统架构分层设计.md](./01-系统架构分层设计.md) - 三层架构详解
6. ⭐⭐ [09-总体需求文档(PRD).md](./09-总体需求文档\(PRD\).md) - 产品需求

### 🚀 当前开发相关
- [ASL模块当前状态](../03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md)
- [DC模块README](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/README.md)
- [DC Day3完成总结](../03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/Day3完成总结.md)

### 🚀 部署文档（新增）
- ⭐ [00-部署进度总览.md](../05-部署文档/00-部署进度总览.md) - **一站式部署状态查看**
- [01-快速部署SOP-零基础版.md](../05-部署文档/01-快速部署SOP-零基础版.md) - 完整部署流程
- [07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md](../05-部署文档/07-前端Nginx-SAE部署操作手册.md)
- [08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md](../05-部署文档/08-PostgreSQL数据库部署操作手册.md)

### 🏗️ 架构设计
- [平台基础设施规划](../09-架构实施/04-平台基础设施规划.md)
- [云原生部署架构指南](../09-架构实施/03-云原生部署架构指南.md)
- [数据库设计规范](../04-开发规范/01-数据库设计规范.md)

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## 🔧 开发环境

### 环境要求
```
Node.js: v22.18.0+
PostgreSQL: 15+（当前使用15.14，Docker镜像: pgvector/pgvector:pg15）
pgvector: 0.8.1（向量数据库扩展）
npm: 10+
```

### 快速启动

**后端**：
```bash
cd backend
npm install
npx prisma generate
npm run dev  # http://localhost:3001
```

**前端**：
```bash
cd frontend-v2
npm install
npm run dev  # http://localhost:3000
```

### 环境变量配置
参考：[环境配置指南](../07-运维文档/01-环境配置指南.md)

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## ⚠️ 重要注意事项

### 对新AI助手
1. ✅ **优先阅读云原生开发规范**：所有代码必须遵守
2. ✅ **使用平台基础设施**：不要重复实现存储、日志、缓存等
3. ✅ **遵循Schema隔离**：每个模块的表必须在对应的Schema中
4. ✅ **查看最新开发记录**：了解当前开发状态和已知问题

### 常见陷阱
1. ❌ **不要在业务模块中自己实现存储**：使用 `import { storage } from '@/common/storage'`
2. ❌ **不要硬编码配置**：使用环境变量
3. ❌ **不要依赖本地文件系统**：使用OSS或内存处理
4. ❌ **不要创建新的Prisma实例**：使用全局 `prisma` 实例

### 🔴 数据库操作安全（2026-01-11 事故教训）

> ⚠️ **严重警告**：2026-01-11 因误用 `prisma db push --force-reset` 导致数据库事故，详见 [事故总结报告](../08-项目管理/2026-01-11-数据库事故总结.md)

**禁止使用的危险命令：**
| 命令 | 危险等级 | 说明 |
|------|----------|------|
| `prisma db push --force-reset` | 🔴 **极高** | 会删除所有数据和非Prisma管理的对象 |
| `prisma migrate reset` | 🔴 **极高** | 重置整个数据库 |

**必须遵守的规范：**
1. ✅ **操作前必须备份**：`docker exec ai-clinical-postgres pg_dump -U postgres -d ai_clinical_research > backup.sql`
2. ✅ **使用安全命令**：`prisma migrate dev`（开发）或 `prisma migrate deploy`（生产）
3. ✅ **了解 Prisma 管理边界**：pg-boss 的 `job_common` 表和函数不由 Prisma 管理

**Prisma 不管理的对象（需手动恢复）：**
- `platform_schema.job_common` 表 → 恢复脚本：`restore_job_common.sql`
- `platform_schema.create_queue()` 函数 → 恢复脚本：`restore_pgboss_functions.sql`
- `platform_schema.delete_queue()` 函数

📚 **完整规范**：[数据库开发规范](../04-开发规范/09-数据库开发规范.md)

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## 📊 项目统计

### 代码量
- **前端**：约 15,000 行（TypeScript + TSX）
- **后端**：约 20,000 行（TypeScript）
- **文档**：约 50,000 行（Markdown）
- **总计**：约 85,000 行

### 模块完成度
- ✅ **已完成**：AIA V2.0（85%，核心功能完成）、平台基础层（100%）、RVW（95%）、通用能力层升级（100%）
- 🚧 **开发中**：PKB（90%，核心功能完成）、ASL（80%）、DC（Tool C 98%，Tool B后端100%，Tool B前端0%）、IIT（60%，Phase 1.5完成）
- 📋 **未开始**：SSA、ST

### 部署完成度
- ✅ **基础设施**：VPC（100%）、NAT网关（100%）、安全组（100%）
- ✅ **数据存储**：RDS PostgreSQL（100%）、OSS（100%）
- ✅ **容器镜像**：前端Nginx（100%）、Python微服务（100%）、Node.js后端（100%）✨ 新增！
- ✅ **SAE应用**：Python微服务（100%，已运行）、Node.js后端（镜像已推送，待部署）、前端Nginx（待部署）
- 📋 **验证测试**：全链路测试（待进行）

### 测试覆盖率
- **平台基础层**：100%（8/8模块全部通过）
- **通用能力层**：100%（StreamingService + Chat组件V2）
- **AIA模块 V2.0**：流式响应测试通过 ✅
- **PKB模块**：手动测试通过
- **ASL模块**：部分自动化测试（31个REST Client测试用例）
- **DC模块**：开发中

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## 🏆 Postgres-Only 架构（2025-12-13 重大创新）

### 核心理念

**Platform-Only 模式**：所有平台级功能（缓存、队列、任务管理）统一在 Platform 层实现，业务层只关注业务逻辑。

### 架构演进

```
改造前：
  业务层 (分散)
  ├── ASL: 任务管理字段 (6个)
  └── DC:  任务管理字段 (6个)
      ❌ 代码重复
      ❌ 维护困难

改造后（Platform-Only）：
  平台层 (统一)
  ├── platform_schema.job.data  (pg-boss)
  │   └── 所有任务管理信息
  └── CheckpointService (通用)
      └── 操作 job.data，所有模块复用
  
  业务层 (简洁)
  ├── ASL: 只存储业务信息
  └── DC:  只存储业务信息
      ✅ 无重复
      ✅ 易维护
      ✅ 符合3层架构
```

### 核心组件

| 组件 | 位置 | 功能 | 通用性 |
|------|------|------|--------|
| **PostgresCacheAdapter** | `common/cache/` | Postgres 缓存 | ✅ 所有模块 |
| **PgBossQueue** | `common/jobs/` | pg-boss 队列封装 | ✅ 所有模块 |
| **CheckpointService** | `common/jobs/` | 操作 job.data | ✅ 所有模块 |
| **任务拆分工具** | `common/jobs/utils.ts` | 智能拆分批次 | ✅ 所有模块 |

### 智能双模式处理

```typescript
const QUEUE_THRESHOLD = 50;

if (items.length >= 50) {
  // 队列模式：可靠性优先
  - 任务拆分（50条/批）
  - 断点续传（每10条保存）
  - 自动重试（3次）
  - 支持24小时长任务
} else {
  // 直接模式：性能优先
  - 快速响应（<1分钟）
  - 无队列延迟
  - 适合小任务
}
```

### 技术亮点

1. **Platform-Only 模式**（首创）
   - 利用 pg-boss 的 `job.data` 字段统一管理
   - 业务表保持简洁，只存储业务信息
   - CheckpointService 真正做到平台级通用

2. **智能阈值判断**
   - 根据数据量自动选择处理模式
   - 性能与可靠性的完美平衡
   - 用户体验优化

3. **零额外成本**
   - 不引入 Redis（年省￥8400）
   - 使用已有 Postgres 实现缓存和队列
   - 适合小团队快速迭代

4. **企业级可靠性**
   - 断点续传：任务中断后可恢复
   - 自动重试：失败任务重试3次
   - 并发处理：支持多实例并行
   - 长任务支持：可运行24小时

### 适用模块

- ✅ ASL 筛选服务（已改造）
- ✅ DC 提取服务（已改造）
- 📋 SSA 统计分析（未来）
- 📋 RVW 文献综述（未来）

### 详细文档

- [Postgres-Only 改造实施计划](../07-运维文档/09-Postgres-Only改造实施计划(完整版).md)
- [Postgres-Only 全能架构解决方案](../07-运维文档/08-Postgres-Only 全能架构解决方案.md)
- [工作总结（2025-12-13）](../08-项目管理/03-每周计划/2025-12-13-Postgres-Only架构改造完成.md)

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## 🌟 技术亮点

1. ✅ **Platform-Only 架构**：统一任务管理，零代码重复 🏆
2. ✅ **智能双模式处理**：小任务快速响应，大任务可靠执行 🏆
3. ✅ **pgvector 向量数据库**：PostgreSQL 原生 RAG 支持 🏆 **2026-01-19 新增！**
4. ✅ **适配器模式**：存储/缓存/日志支持本地↔云端零代码切换
5. ✅ **12个Schema隔离**：架构一次到位
6. ✅ **Prisma自动路由**：Schema迁移后，代码无需修改
7. ✅ **4个LLM集成**：DeepSeek、Qwen、GPT、Claude
8. ✅ **增量演进**：新旧并存，降低风险
9. ✅ **云原生就绪**：为SAE部署做好准备

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## 📞 联系方式

- **项目负责人**：技术架构师
- **文档维护**：开发团队
- **问题反馈**：GitHub Issues

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**文档版本**：v3.8  
**最后更新**：2026-01-19  
**下次更新**：PKB RAG检索功能实现 或 生产环境pgvector部署

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**🎉 祝新的AI助手工作顺利！所有信息已梳理完毕，可以无缝衔接！**

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## 📝 最新更新（2026-01-07）

**PKB模块核心功能全部实现 🎉**：

### 上午：前端V3设计实现
1. ✅ **后端模块迁移**：迁移到 /modules/pkb，v2 API路由注册
2. ✅ **Dashboard页面**：基于知识库仪表盘V5原型实现
3. ✅ **Workspace页面**：基于工作台V3原型实现

### 下午：批处理完整流程验证通过
4. ✅ **三种工作模式**：全文阅读、逐篇精读、批处理全部实现
5. ✅ **批处理功能**：
   - 模板选择（临床研究信息提取，8个字段）
   - 文档选择（3-50篇）
   - 实时进度显示
   - 结果表格（多行显示+Tooltip）
   - CSV导出
6. ✅ **Chat组件集成**：Ant Design X，支持流式响应和自定义渲染
7. ✅ **文档上传功能**：拖拽上传 + 进度显示 + Modal弹窗
8. ✅ **UI优化**：参考文献格式化、表格多行显示、输入框清除、自动滚动

### 技术亮点
- **问题解决**：修复10+个技术问题（API路径、字段映射、状态同步等）
- **性能优化**：批处理3篇文档~17-28秒
- **用户体验**：严格按照原型图实现，界面美观易用

### 里程碑意义
**PKB模块已具备生产环境可用性**，为后续功能扩展奠定坚实基础！
4. ✅ **3种工作模式**：全文阅读、逐篇精读、批处理
5. ✅ **Chat组件集成**：复用Ant Design X通用Chat组件
6. ✅ **响应式布局**：单层Header + 紧凑工作模式栏 + 最大化聊天区域

**技术亮点**：
- 🔥 **模块化架构**：前后端完整迁移到新架构
- 🔥 **复用通用组件**：shared/components/Chat
- 🔥 **Zustand状态管理**：轻量级状态管理
- 🔥 **双路由兼容**：v1 + v2 API同时运行

**待解决问题**：
- 🔧 批处理API执行待调试
- 🔧 知识资产页面导航条待完善
- 🔧 UI与原型图精细化对比

**模块进度**：75%完成

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**IIT Manager Agent Phase 1.5 完成（2026-01-03）**：
- ✅ AI对话集成完成：ChatService + SessionMemory
- ✅ REDCap数据查询集成：意图识别 + 数据注入LLM
- ✅ 解决LLM幻觉问题：AI基于真实数据回答
- ✅ 测试通过：查询test0102项目，ID 7患者详细信息

**模块进度**：60%完成（Phase 1.5）

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**RVW稿件审查模块开发完成（2026-01-07 ~ 2026-01-10）**：

### Phase 1：后端模块迁移与扩展
- ✅ 创建 `backend/src/modules/rvw/` 模块结构
- ✅ 迁移 reviewService、editorialService、methodologyService
- ✅ 实现智能体选择（selectedAgents）
- ✅ 实现批量运行API（batchRunReviewTasks）
- ✅ 替换 console.log 为 logger 服务
- ✅ 注册 v2 API路由（/api/v2/rvw）
- ✅ 实现 pg-boss 异步任务处理（reviewWorker）

### Phase 2：数据库字段扩展
- ✅ 添加 selectedAgents、editorialScore、methodologyScore、methodologyStatus 字段
- ✅ 添加 picoExtract、isArchived、archivedAt 字段
- ✅ 使用 prisma db push 同步到数据库

### Phase 3：前端重构（frontend-v2）
- ✅ 创建 `frontend-v2/src/modules/rvw/` 完整模块目录结构
- ✅ 实现 Dashboard 页面（任务列表、筛选、批量操作）
- ✅ 实现 TaskDetail 组件（审稿进度条、实时状态轮询）
- ✅ 实现 EditorialReport/MethodologyReport 组件
- ✅ 实现 AgentModal 组件（智能体选择弹窗）
- ✅ 注册到 moduleRegistry.ts

### Phase 4：集成测试与Bug修复（2026-01-10）
- ✅ 修复方法学分数不显示问题
- ✅ 修复只选方法学时详情页不显示报告问题
- ✅ 完整测试单智能体和双智能体审稿流程

### Phase 5：报告导出（2026-01-10）
- ✅ 安装 docx 和 file-saver 库
- ✅ 实现 Word 文档导出功能
- ✅ 支持结构化报告（标题、基本信息、稿约规范性、方法学评估）

### Phase 6：Schema隔离迁移（2026-01-10）
- ✅ 将 review_tasks 表从 public 迁移到 rvw_schema
- ✅ 更新 Prisma schema 中的 @@schema 指令
- ✅ 重新生成 Prisma Client
- ✅ 验证所有查询和关联正常工作

**技术亮点**：
- 🔥 **新旧API兼容**：v1 + v2 API同时运行
- 🔥 **智能体可选**：用户可选择运行稿约规范性/方法学/两者
- 🔥 **异步任务处理**：使用 pg-boss 队列处理长时间审稿任务
- 🔥 **Word导出**：使用 docx 库生成专业格式的审稿报告
- 🔥 **Schema隔离**：数据库表已迁移到独立的 rvw_schema
- 🔥 **云原生改造**：使用 logger 服务，遵循开发规范

**模块进度**：95%完成（Phase 1-6）