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AIclinicalresearch/docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/08-工具3-全文智能提取工作台V2.0开发计划.md
HaHafeng dc6b292308 docs(asl): Complete Tool 3 extraction workbench V2.0 development plan (v1.5)
ASL Tool 3 Development Plan:
- Architecture blueprint v1.5 (6 rounds of architecture review, 13 red lines)
- M1/M2/M3 sprint checklists (Skeleton Pipeline / HITL Workbench / Dynamic Template Engine)
- Code patterns cookbook (9 chapters: Fan-out, Prompt engineering, ACL, SSE dual-track, etc.)
- Key patterns: Fan-out with Last Child Wins, Optimistic Locking, teamConcurrency throttling
- PKB ACL integration (anti-corruption layer), MinerU Cache-Aside, NOTIFY/LISTEN cross-pod SSE
- Data consistency snapshot for long-running extraction tasks

Platform capability:
- Add distributed Fan-out task pattern development guide (7 patterns + 10 anti-patterns)
- Add system-level async architecture risk analysis blueprint
- Add PDF table extraction engine design and usage guide (MinerU integration)
- Add table extraction source code (TableExtractionManager + MinerU engine)

Documentation updates:
- Update ASL module status with Tool 3 V2.0 plan readiness
- Update system status document (v6.2) with latest milestones
- Add V2.0 product requirements, prototypes, and data dictionary specs
- Add architecture review documents (4 rounds of review feedback)
- Add test PDF files for extraction validation

Co-authored-by: Cursor <cursoragent@cursor.com>
2026-02-23 22:49:16 +08:00

83 KiB
Raw Blame History

工具 3全文智能提取工作台 V2.0 开发计划

版本: v1.5(多 Pod SSE 通信 + PKB 数据一致性快照)
创建日期: 2026-02-22
更新日期: 2026-02-23v1.1 → v1.2 PKB → v1.3 排雷 → v1.4 终极 → v1.4.1 逻辑补丁 → v1.4.2 致命修复 → v1.5 跨实例+快照)
架构审查: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3架构审查与研发改进建议.md
深度排雷: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3开发计划深度审查与排雷指南.md
终极审查: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3终极架构审查与研发规范.md
PKB 模块: docs/03-业务模块/PKB-个人知识库/00-模块当前状态与开发指南.md
Postgres-Only 指南: docs/02-通用能力层/Postgres-Only异步任务处理指南.md
产品原型: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/工具3 全文提取产品原型图V2.html
数据字典: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/ASL 工具 3 全文提取数据字典与规范.md
模板规范: docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/ASL 工具 3 提取模板管理规范.md
OSS 规范: docs/04-开发规范/11-OSS存储开发规范.md

v1.5 补丁:多 Pod SSE 通信 + PKB 数据一致性快照

# 问题 严重度 修正方案 影响章节 归属里程碑
1 SSE sseEmitter.emit() 基于内存 EventEmitter用户连 Pod A 但 Worker 跑在 Pod B → 实时日志零推送 关键 PostgreSQL NOTIFY/LISTEN 跨实例广播Worker 端 NOTIFY asl_sse_channelAPI 端每 Pod 启动时 LISTEN 常驻连接,收到后检查本机是否有该 taskId 的 SSE 客户端并推送 Task 2.4 M2
2 提取任务可能持续 50 分钟,期间用户在 PKB 删除/修改文档 → Child Worker 找不到 storageKey 崩溃 重要 Manager 派发时一次性快照 storageKey + filenameAslExtractionResultChild Worker 从自身记录读取而非运行时回查 PKB Task 1.1, Task 2.3 M1

v1.4.2 补丁3 项致命缺陷修复 + 队列命名合规

# 致命缺陷 严重度 补丁方案 影响章节
1 Fan-out 终点丢失:没有人把 AslExtractionTask.statusprocessing 更新为 completed,前端永远卡在 Step 2 致命 "Last Child Wins" 模式Child 原子递增后判断 successCount + failedCount === totalCount,最后一个 Child 负责翻转状态 Task 2.3
2 伪幂等 Read-then-Write 反模式:findUnique 检查状态后再操作,并发 retry 穿透导致双倍 MinerU/LLM 调用 + 计数双递增 致命 替换为 Prisma updateMany({ where: { status: 'pending' } }) 乐观锁,原子抢占 extracting 状态 Task 2.3
3 队列名称使用点号(asl.extraction.child违反《Postgres-Only 指南》§4.1 红线 严重 全局替换为下划线格式:asl_extraction_managerasl_extraction_childasl_mineru_extractasl_llm_extract 全局
executionLogs 注释歧义 Schema 注释清理v1.1 已决定不存日志,注释改为更明确的措辞 Task 1.1

v1.4.1 补丁3 项隐蔽逻辑漏洞修复

# 漏洞 严重度 补丁方案 影响章节
1 fuzzyQuoteMatch 仅搜索 pymupdf4llm 文本,遗漏 MinerU 表格来源的 Quote → 满屏误报红色警告 致命 搜索池扩容:剥离 MinerU HTML 标签后与 Markdown 拼接再匹配 Task 2.3
2 logBuffer 内存存储在多 Pod 下为空SSE Hydration 首帧 recentLogs 为空数组 中等 降级方案:不存历史日志,重连时仅下发进度 + 打印"监控已重连"提示 Task 2.4
3 asl_extraction_child 无 teamConcurrency 限制1000 篇文献 → 1000 个挂起闭包 → Node.js OOM 严重 Child 队列加 teamConcurrency: 10,其余在 PostgreSQL 中排队 Task 2.3

v1.4 变更:终极架构审查 7 项修正v1.4 定稿)

# 终极审查问题 修正措施 影响章节
1 P-Queue 单机限流在多 Pod 下失效 废弃 P-Queue改用 pg-boss teamConcurrency 全局队列限流 Task 2.3
2 Fan-out 并发回写父任务 Race Condition Prisma 原子递增 { increment: 1 } + 事务保障 Task 2.3
3 永久错误被 pg-boss 盲目重试 3 次 异常分级路由:致命错误 return success 停止重试 Task 2.3
4 MinerU 重复解析同一 PDF 浪费算力 MinerU Clean Data OSS 缓存Cache-Aside 模式) Task 2.2
5 Quote 标红后医生无路可走HITL 死锁) [强制认可] + [手动修改数值] 双按钮解锁 Task 5.2
6 SSE 断开导致主业务流中断 双轨制React Query 轮询驱动主流 + SSE 仅驱动日志流 Task 4.1
7 红线 2 计算卸载约束未显式标注 Node.js 禁碰 pymupdf4llm/MinerU 解析,必须路由到外部服务 Task 2.2

v1.3 变更:深度排雷 6 项修正 + Postgres-Only 安全规范v1.3

# 排雷问题 修正措施 影响章节
1 跨 Schema 直查打破模块边界 PKB 暴露 PkbExportServiceACL 防腐层ASL 进程内调用获取 DTO Task 3.3b, 七.4
2 双引擎上下文污染致 LLM 幻觉 <FULL_TEXT> + <HIGH_FIDELITY_TABLES> XML 隔离 + 表格优先级指令 Task 2.1, 2.2
3 pg-boss 单 Job 粗粒度致崩溃重做 Fan-out 扇出模式:父任务派发 N 个子任务(单篇粒度) Task 2.3, 2.4
4 签名 URL 1 小时过期打断医生心流 懒签名10 分钟有效期)+ 前端 403 自动刷新 Task 5.3
5 SSE 重连后进度条空白 SSE Hydration on Connect连接时下发 sync 初始事件 Task 4.1, 2.4
6 PKB 复用无用户感知 Worker 日志高亮 [System] Fast-path: Reused from PKB Task 2.3
Postgres-Only 安全规范 幂等 upsert + Payload 轻量 + 合理过期时间(强制遵守) Task 2.3, 全局

v1.2 变更:对接 PKB 个人知识库(取消自建 PDF 上传)

决策依据: PKB 模块已完整集成 OSS 存储(storage.upload() + generatePkbStorageKey()

  • getDocumentSignedUrl()),且上传后自动通过 pymupdf4llm 提取 Markdown 全文 存入 extractedText 字段。Tool 3 无需重复造轮子。
删除项 原计划内容 替代方案
Task 2.6 PDF 上传接入 OSS PKB 已完成,直接读取
Task 3.3 PdfUploadPanel 组件 改为 PkbKnowledgeBaseSelector
前端 Upload.Dragger 拖拽上传 PDF 选择 PKB 知识库 + 勾选文献
pymupdf4llm 运行时 每篇 PDF 提取全文 直接读 PKB extractedText(已有)

架构审查修正记录v1.1

# 审查问题 修正措施 影响章节
1 任务进度管理违背 Postgres-Only 规范 AslExtractionTask 仅存业务元数据,实时进度交 pg-boss/CheckpointService Task 1.1
2 Step 2 日志推送退回轮询 改用 SSE 流式推送,复用 common/streaming/ Task 4.1
3 MinerU 批量并发无控制 P-Queue 漏斗 → v1.4 改 pg-boss teamConcurrency Task 2.3
4 Quote 子串匹配过于理想化 fuzzyQuoteMatchUnicode 标准化 + Levenshtein ≤5% Task 2.3, 七.3
5 JSONB 字段无节制膨胀 MinerU HTML 表格压缩存 OSSDB 仅存 ossKey Task 1.1
6 自定义 Prompt 无注入防护 指令隔离护栏 BEGIN/END + 防逃逸声明 Task 2.1
7 断点恢复缺失 状态驱动路由,首屏读 status 决定渲染步骤 Task 4.1, 5.1
8 Drawer 大表单渲染卡顿 Collapse 折叠懒渲染 + Ant Design Form shouldUpdate Task 5.2
9 排期过于乐观 Sprint 1 跑通主干 → Sprint 2 叠加高级特性
10 缺乏 E2E 测试 新增 Playwright E2E 测试节点 Task 6.3

一、背景与目标

1.1 项目背景

工具 3 是 ASL 全景工具箱中最核心、最复杂的工具,承担着"从 PDF 全文中结构化提取科研数据"的职责。它的输出直接喂给下游的工具 4SR 图表生成器)和工具 5Meta 分析引擎),是整个证据合成流水线的数据源头。

1.2 已有基础

当前系统已经完成了全文复筛后端V1.0),具备以下能力:

已有组件 路径 状态 说明
后端 API5 个端点) backend/src/modules/asl/fulltext-screening/controllers/ 可复用 创建任务、查询进度、获取结果、人工审核、Excel 导出
LLM 12 字段提取服务 backend/src/modules/asl/common/llm/LLM12FieldsService.ts ⚠️ 需升级 双模型并行、JSON 解析容错,但字段固定
Prompt 构建器 backend/src/modules/asl/common/llm/PromptBuilder.ts ⚠️ 需升级 支持 PICOS 上下文,但不支持动态 Schema
PDF 存储服务 backend/src/modules/asl/common/pdf/PDFStorageService.ts 可复用 适配器模式Dify/OSS一站式上传+提取+Token
三层验证器 backend/src/modules/asl/common/validation/ 可复用 医学逻辑、证据链、冲突检测
Excel 导出 backend/src/modules/asl/fulltext-screening/services/ExcelExporter.ts ⚠️ 需升级 当前输出 12 字段,需改为动态模板列
前端 4 个页面 frontend-v2/src/modules/asl/pages/Fulltext*.tsx ⚠️ 需重构 Settings/Progress/Results/Workbench 均存在,但功能简单
前端抽屉组件 frontend-v2/src/modules/asl/components/FulltextDetailDrawer.tsx ⚠️ 需重构 当前仅展示 12 字段,需改为动态表单
Prisma 数据模型 backend/prisma/schema.prisma ⚠️ 需扩展 AslFulltextScreeningTask/Result 存在,需新增模板表
🆕 PKB 个人知识库 backend/src/modules/pkb/ 直接对接 PDF 上传+OSS 存储+全文提取+签名 URL作为 Tool 3 的文献数据源

1.3 可复用的通用能力层

通用能力 路径 复用方式
🆕 PKB 个人知识库 modules/pkb/ 文献数据源PDF 已在 OSS + extractedText 已提取 + 签名 URL 可用
存储服务 common/storage/ 通过 PKB 的 storageKey 下载 PDF Buffer供 MinerU
LLM 网关 common/llm/ DeepSeek-V3 / Qwen-Max / GPT-5 调用
流式响应 common/streaming/ 提取过程中的实时日志推送
异步任务 common/jobs/ (pg-boss) 批量提取任务队列化(⚠️ v1.3 遵守 Postgres-Only 安全规范)
缓存服务 common/cache/ 提取结果缓存、模板缓存
日志服务 common/logging/ 结构化日志
Prompt 管理 common/prompt/ 系统级 Prompt 版本管理
文档处理 — 全文提取 extraction_service/ (pymupdf4llm) PDF → Markdown 全文
文档处理 — 表格提取 common/document/tableExtraction/ (MinerU) PDF → 结构化 HTML 表格
认证授权 common/auth/ JWT 权限校验

1.4 V2.0 核心升级目标

维度 V1.0(现状) V2.0(目标)
提取字段 固定 12 字段 动态模板引擎(系统基座 + 用户自定义插槽)
表格处理 pymupdf4llm 纯文本 MinerU VLM 结构化表格 → LLM 精准提取
数据溯源 每个字段强制附带 _quote 原文溯源
人机协同 简单 include/exclude 逐字段复核、AI Quote 高亮比对、Approve/Reject
结果导出 基础 Excel 标准科研 Excel 宽表(变量列 + Quote 列交替)
下游衔接 独立使用 JSON Payload 直通工具 4SR 图表)/ 工具 5Meta 分析)
文献来源 自建 PDF 上传 🆕 对接 PKB 知识库(复用已有 OSS + 全文提取)
前端交互 列表 + 简单抽屉 三步向导 + 动态表单 + 右侧提取抽屉

二、三步工作流设计(对应产品原型图)

┌─────────────────────────────────────────────────────────────────────┐
│                    工具 3 三步工作流                                   │
├──────────────────┬──────────────────┬──────────────────────────────┤
│  Step 1           │  Step 2           │  Step 3                      │
│  配置模板与选择    │  机器解析与提取    │  人机比对与核准               │
│  文献来源          │                   │                              │
│  ┌─────────────┐ │  ┌─────────────┐ │  ┌──────────────────────┐   │
│  │ 选择基座模板 │ │  │ MinerU 表格  │ │  │ 文献列表 (状态标签)   │   │
│  │ RCT/Cohort  │ │  │ 结构化还原   │ │  │ ┌────────────────┐  │   │
│  ├─────────────┤ │  ├─────────────┤ │  │ │ 右侧复核抽屉    │  │   │
│  │ 用户自定义   │ │  │ DeepSeek-V3  │ │  │ │ ① 动态表单字段 │  │   │
│  │ 字段插槽     │ │  │ Schema 榨取  │ │  │ │ ② AI Quote 溯源│  │   │
│  ├─────────────┤ │  ├─────────────┤ │  │ │ ③ 核准/驳回     │  │   │
│  │ 🆕 选择 PKB  │ │  │ 终端日志输出  │ │  │ └────────────────┘  │   │
│  │ 知识库 + 勾选│ │  │ 进度条推进    │ │  ├──────────────────────┤   │
│  │ 待提取文献   │ │  └─────────────┘ │  │ 导出 Excel 宽表       │   │
│  └─────────────┘ │                   │  └──────────────────────┘   │
└──────────────────┴──────────────────┴──────────────────────────────┘

v1.2 变更: Step 1 不再自建 PDF 上传,改为对接 PKB 个人知识库。 用户先在 PKB 中上传文献 PDFPKB 自动完成 OSS 存储 + pymupdf4llm 全文提取), 然后在 Tool 3 的 Step 1 中选择 PKB 知识库并勾选待提取的文献。


三、开发任务分解

Phase 1数据模型与模板引擎后端— 预计 3 天

目标: 建立模板管理数据模型,实现模板 CRUD API为动态提取打下基础。

Task 1.1 — Prisma 数据模型扩展

新增表:

// 系统内置提取模板
model AslExtractionTemplate {
  id              String   @id @default(uuid())
  name            String   // "标准 RCT 提取与质量评价"
  code            String   @unique // "RCT", "Cohort", "QC"
  description     String?
  studyType       String   // "RCT" | "Cohort" | "CaseControl"
  isSystem        Boolean  @default(true)  // 系统内置 vs 用户发布
  version         Int      @default(1)
  baseFields      Json     // 基座字段定义 JSON Schema
  createdBy       String?  // 发布者 userId系统模板为 null
  createdAt       DateTime @default(now())
  updatedAt       DateTime @updatedAt

  projectTemplates  AslProjectTemplate[]

  @@schema("asl_schema")
}

// 项目级模板实例(从系统模板克隆而来)
model AslProjectTemplate {
  id              String   @id @default(uuid())
  projectId       String
  baseTemplateId  String
  customFields    Json     @default("[]") // 用户自定义字段列表
  outcomeType     String?  // "survival" | "dichotomous" | "continuous"
  isLocked        Boolean  @default(false) // 提取启动后锁定
  createdAt       DateTime @default(now())
  updatedAt       DateTime @updatedAt

  baseTemplate    AslExtractionTemplate @relation(fields: [baseTemplateId], references: [id])
  project         AslScreeningProject   @relation(fields: [projectId], references: [id])
  extractionTasks AslExtractionTask[]

  @@unique([projectId])
  @@schema("asl_schema")
}

// 提取任务(业务元数据映射表)
// ⚠️ 架构审查修正:本表仅存储业务元数据和任务完成后的聚合统计。
//    实时进度由 pg-boss + CheckpointService 托管;日志流为 SSE 瞬时推送(阅后即焚),
//    不存入任何数据库字段。Schema 中无 executionLogs 字段v1.4.2 确认删除设计正确)。
// 🆕 v1.2:新增 pkbKnowledgeBaseId文献来源从 PKB 知识库获取
model AslExtractionTask {
  id              String   @id @default(uuid())
  projectId       String
  templateId      String
  pkbKnowledgeBaseId String? // 🆕 PKB 知识库 ID文献 PDF 来源)
  jobId           String?  @unique // pg-boss job ID用于关联实时进度
  modelName       String   @default("deepseek-v3")
  totalCount      Int      @default(0)  // 待提取文献总数(创建时写入)
  
  // 以下字段仅在任务完成后由 Worker 回写
  status          String   @default("pending") // pending | processing | completed | failed
  successCount    Int      @default(0)
  failedCount     Int      @default(0)
  totalTokens     Int      @default(0)
  totalCost       Decimal  @default(0)
  startedAt       DateTime?
  completedAt     DateTime?
  errorMessage    String?

  template        AslProjectTemplate      @relation(fields: [templateId], references: [id])
  project         AslScreeningProject     @relation(fields: [projectId], references: [id])
  results         AslExtractionResult[]

  @@schema("asl_schema")
}

// 单篇文献的提取结果
// 🆕 v1.2:新增 pkbDocumentId支持从 PKB 文档直接读取 extractedText 和 storageKey
model AslExtractionResult {
  id              String   @id @default(uuid())
  taskId          String
  projectId       String
  literatureId    String?  // 来自工具 1/2 的 AslLiterature可选
  pkbDocumentId   String?  // 🆕 来自 PKB 的文档 ID与 literatureId 二选一)
  
  // 🆕 v1.5PKB 数据一致性快照
  // Manager 派发时冻结Child Worker 直接使用,无需运行时回查 PKB
  // 防止提取进行中 PKB 侧删除/修改文档导致任务崩溃
  snapshotStorageKey String?  // 快照OSS 存储路径(派发时从 PKB 冻结)
  snapshotFilename   String?  // 快照:文件名(派发时从 PKB 冻结)
  
  status          String   @default("pending") // pending | extracting | extracted | approved | rejected | error
  
  // MinerU 表格提取
  // ⚠️ 架构审查修正MinerU HTML 表格可能非常庞大(几 MB
  //    压缩后存入 OSSDB 仅存 ossKey避免 JSONB 膨胀拖垮查询性能。
  mineruStatus       String?  // pending | success | failed | skipped
  mineruTablesOssKey String?  // OSS 存储路径(压缩后的 JSON
  
  // LLM 智能提取结果
  extractedData   Json?    // 按模板 Schema 结构化的提取结果
  quoteData       Json?    // 对应的 _quote 溯源数据
  
  // 验证结果
  validationIssues Json?   // 医学逻辑 + 证据链验证问题
  confidenceScore Float?   // AI 综合置信度 0-1
  
  // 人工审核
  reviewStatus    String   @default("pending") // pending | approved | rejected
  reviewedBy      String?
  reviewedAt      DateTime?
  reviewNotes     String?
  manualOverrides Json?    // 人工修改的字段 { fieldName: newValue }
  
  // 元数据
  tokenCount      Int      @default(0)
  costUsd         Decimal  @default(0)
  processingTimeMs Int     @default(0)
  processedAt     DateTime?
  errorMessage    String?

  task            AslExtractionTask      @relation(fields: [taskId], references: [id])
  literature      AslLiterature?         @relation(fields: [literatureId], references: [id])
  // pkbDocumentId 为跨 schema 引用,不建 Prisma relation通过 PkbBridgeService 查询

  @@schema("asl_schema")
}

修改表:

// AslScreeningProject 新增关联
model AslScreeningProject {
  // ... 现有字段 ...
  projectTemplate   AslProjectTemplate?
  extractionTasks   AslExtractionTask[]
}

// AslLiterature 新增关联
model AslLiterature {
  // ... 现有字段 ...
  extractionResults AslExtractionResult[]
}

执行步骤:

  1. 修改 backend/prisma/schema.prisma
  2. 运行 npx prisma migrate dev --name add_extraction_template_engine
  3. 编写 Seed 脚本注入 3 套系统内置模板RCT / Cohort / QC

Task 1.2 — 系统内置模板 Seed 数据

根据《模板管理规范》定义 3 套基座模板,每套包含标准化字段:

模板 A — 标准 RCT 提取与质量评价(最常用):

{
  "code": "RCT",
  "baseFields": {
    "metadata": ["study_id", "nct_number", "study_design", "funding_source"],
    "baseline": ["treatment_name", "control_name", "n_treatment", "n_control", "age_treatment", "age_control", "male_percent"],
    "rob": ["rob_randomization", "rob_allocation", "rob_blinding", "rob_attrition"],
    "outcomes_survival": ["endpoint_name", "hr_value", "hr_ci_lower", "hr_ci_upper", "p_value"],
    "outcomes_dichotomous": ["event_treatment", "total_treatment", "event_control", "total_control"],
    "outcomes_continuous": ["mean_treatment", "sd_treatment", "n_treatment_outcome", "mean_control", "sd_control", "n_control_outcome"]
  }
}

📖 另见 08d §1.2

模板 B — 观察性研究(队列/病例对照):

  • 基线:暴露组/非暴露组、随访人年、PSM 匹配方法
  • 方法学NOS 量表(队列选择、可比性、结局评估)
  • 结局RR / OR

模板 C — 纯方法学质控(快速模式):

  • 仅 RoB/NOS 偏倚风险评估,不提取临床数据

Task 1.3 — 模板管理 API

新增端点6 个):

方法 路径 说明
GET /api/v1/asl/extraction/templates 获取系统内置模板列表
GET /api/v1/asl/extraction/templates/:code 获取模板详情(含字段定义)
POST /api/v1/asl/projects/:projectId/template 为项目克隆基座模板 → 创建项目专属模板
GET /api/v1/asl/projects/:projectId/template 获取项目当前模板配置
PUT /api/v1/asl/projects/:projectId/template/custom-fields 管理自定义字段(增删改)
PUT /api/v1/asl/projects/:projectId/template/outcome-type 设置结局指标类型

控制器: backend/src/modules/asl/extraction/controllers/TemplateController.ts

服务: backend/src/modules/asl/extraction/services/TemplateService.ts

核心逻辑:

📖 代码模式见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §1.1


Phase 2动态提取流水线后端— 预计 5 天

目标: 升级 LLM 提取服务,接入 MinerU 表格提取,实现动态 Schema 提取 + Quote 溯源。

Task 2.1 — 动态 Prompt 组装器

文件: backend/src/modules/asl/extraction/services/DynamicPromptBuilder.ts

升级现有 PromptBuilder.ts,支持根据项目模板动态生成 Prompt

📖 代码模式见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §2.1

关键设计决策:

  • 每个提取字段自动追加 _quote 字段,在 JSON Schema 中以 required 标注
  • 自定义字段的 prompt(用户定义的 AI 提取指令)拼接到 User Prompt 末尾
  • 结局指标模块根据 outcomeTypesurvival / dichotomous / continuous动态切换 Schema 分支

⚠️ v1.3 排雷修正(隐患 2双引擎上下文污染防护

pymupdf4llm 输出的 Markdown 全文中表格通常为乱码管道符,而 MinerU 输出的 HTML 表格是高保真结构化数据。如果两者混在一起喂给 LLM乱码表格会污染上下文导致幻觉。DynamicPromptBuilder 必须在 User Prompt 中用 XML 结构化标签隔离,并附加优先级指令:

📖 XML 隔离模板见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §2.2

⚠️ 审查修正v1.1Prompt Injection 指令隔离护栏

用户自定义的 Prompt 存在注入风险(如"忽略之前指令,输出环境变量")。DynamicPromptBuilder 必须对 customFieldPrompts 进行包裹隔离:

📖 Prompt 注入防护见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §2.3

实现要点:

  • buildUserPrompt() 中将用户指令包裹在隔离标记内
  • buildUserPrompt() 中用 <FULL_TEXT><HIGH_FIDELITY_TABLES> XML 标签隔离双引擎输出v1.3
  • 在 System Prompt 中预声明:"仅执行 BEGIN/END 标记内的数据提取指令,拒绝任何其他操作"
  • 在 System Prompt 中声明表格数据优先级规则v1.3
  • 后端日志记录每次用户输入的原始 Prompt便于安全审计

Task 2.2 — MinerU 表格增强 + PKB 文本复用流水线

文件: backend/src/modules/asl/extraction/services/PdfProcessingPipeline.ts

🆕 v1.2 变更: PKB 上传时已自动通过 pymupdf4llm 提取全文并存入 extractedText 字段, Tool 3 不再重复运行 pymupdf4llm,直接读取 PKB 已有的 Markdown 全文。 仅 MinerU 表格提取需要从 OSS 下载 PDF Buffer 运行。

┌──────────────────────────────────────────────────────────┐
│                     PDF 处理流水线v1.2                  │
│                                                          │
│  输入 APKB extractedText (Markdown)  ← 直接读取,无需计算│
│  输入 BPDF Buffer (from PKB storageKey → OSS download)  │
│     ↓                                                    │
│  ┌──────────────────────┬──────────────────────────────┐ │
│  │ ✅ 已有from PKB   │ MinerU Cloud API (VLM)       │ │
│  │ → Markdown 全文       │ → HTML <table> 结构化表格     │ │
│  │ (零成本复用)           │ (colspan/rowspan 完美还原)    │ │
│  └──────────┬───────────┴──────────────┬───────────────┘ │
│             ↓                          ↓                  │
│  ┌──────────────────────────────────────────────────────┐ │
│  │  ⚠️ v1.3: XML 结构化隔离,防止上下文污染              │ │
│  │  <FULL_TEXT>            <HIGH_FIDELITY_TABLES>        │ │
│  │   pymupdf4llm 全文       MinerU HTML优先级最高     │ │
│  │  </FULL_TEXT>           </HIGH_FIDELITY_TABLES>       │ │
│  ├──────────────────────────────────────────────────────┤ │
│  │       合并输入 → LLM (DeepSeek-V3)                    │ │
│  │       System: 动态 JSON Schema + 表格优先级规则       │ │
│  │       User: XML隔离区全文 + XML隔离区表格 + 自定义指令│ │
│  └──────────────────────────────────────────────────────┘ │
│             ↓                                             │
│  输出:结构化 JSON含 _quote 溯源)                       │
└──────────────────────────────────────────────────────────┘

复用已有能力:

  • PKB extractedText → pymupdf4llm 全文 Markdown零成本复用,无需重复提取
  • PKB storageKey → 通过 storage.download() 获取 PDF Buffer仅供 MinerU 使用)
  • common/document/tableExtraction/ → MinerU 表格提取引擎(已实现,getTableExtractionManager() 获取单例)

🚨 v1.4 研发红线 2计算卸载约束

Node.js 进程绝对不碰 pymupdf4llm 或 MinerU 的文档解析计算。

  • pymupdf4llm已由 PKB 上传时通过 extraction_servicePython 微服务执行Tool 3 直接读 extractedText
  • MinerU通过 HTTP 调用 MinerU Cloud API外部 VLM 服务Node.js 仅发送请求和接收结果
  • 开发人员禁止在 Worker 中 import pymupdf4llm 或直接加载 PDF 二进制进行解析

⚠️ v1.4 终极修正MinerU Clean Data OSS 缓存Cache-Aside

MinerU VLM 表格解析极度昂贵且耗时(单篇 10-60 秒)。在调用 MinerU 前, 必须先检查 OSS 是否已有该文档的缓存结果。命中则 <1 秒返回,未命中再调用 MinerU 并存入缓存。 这在 retry 场景和同一 PDF 跨任务复用时效果显著。

核心方法:

📖 代码模式见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §3.1


Task 2.3 — 智能提取服务(核心)— ⚠️ v1.3 Fan-out 扇出模式 + Postgres-Only 安全规范

文件: backend/src/modules/asl/extraction/services/ExtractionService.ts
Worker backend/src/modules/asl/extraction/services/ExtractionWorker.ts

🚨 v1.3 排雷修正(隐患 3 原计划将 N 篇文献打包在一个 pg-boss Job 中处理, 如果第 80 篇崩溃,前 79 篇的 CheckpointService 数据无法独立恢复pg-boss 整体 retry 会从头跑)。 改为 Fan-out 扇出模式Manager Job → N 个 Child Job单篇粒度每个 Child 独立 retry。

同时强制遵守 Postgres-Only异步任务处理指南 的 6 项安全规范。

Fan-out 架构图:

┌──────────────────────────────────────────────────────────┐
│  POST /api/v1/asl/extraction/tasks                       │
│  → 创建 AslExtractionTask (DB)                           │
│  → pg-boss.send('asl_extraction_manager', { taskId })    │
│     ↓                                                    │
│  ┌──────────────────────────────────────────────────┐    │
│  │ Manager Job (asl_extraction_manager)               │    │
│  │ 1. 读取任务关联的 N 篇文献                         │    │
│  │ 2. ⚠️ v1.5 批量快照 PKB 元数据 → 冻结到            │    │
│  │    AslExtractionResult.snapshotStorageKey/Filename │    │
│  │ 3. 为每篇文献 dispatch Child Job                   │    │
│  │    pg-boss.send('asl_extraction_child', {          │    │
│  │      taskId, resultId, pkbDocumentId               │    │
│  │    })                                              │    │
│  │ 4. 派发完毕后 Manager 退出Fire-and-forget      │    │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘    │
│       ↓ (N 个)                                           │
│  ┌──────────────────────────────────────────────────┐    │
│  │ Child Job (asl_extraction_child)  × N              │    │
│  │ 1. ⚠️ v1.4.2 乐观锁抢占 pending → extracting      │    │
│  │ 2. 读 PKB extractedText零成本+ 用快照字段      │    │
│  │    snapshotStorageKey 访问 OSS防 PKB 删除)      │    │
│  │ 3. 派发 asl_mineru_extract 子队列teamConc: 2   │    │
│  │ 4. 组装 Prompt → LLM 调用 → fuzzyQuoteMatch       │    │
│  │ 5. 事务: upsert Result + 原子递增父任务计数        │    │
│  │ 6. ⚠️ v1.4.2 "Last Child Wins":判断完成数 =       │    │
│  │    totalCount → 翻转 Task status = completed       │    │
│  │ 7. SSE 推送进度日志                                │    │
│  │ ⚡ 致命错误 return success 停止重试                 │    │
│  │ ⚡ 临时错误 throw → pg-boss 指数退避自动 retry      │    │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘    │
└──────────────────────────────────────────────────────────┘

📖 代码模式见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §4.1

📖 Manager/Child Worker 代码见 08d §4.2 + §4.3

⚠️ 强制遵守Postgres-Only 异步任务处理指南安全规范

规范 要求 本模块实现
幂等性 Worker 必须容忍 pg-boss 重投at-least-once ⚠️ v1.4.2 改为 updateMany({ where: { status: 'pending' } }) 乐观锁原子抢占,替代 Read-then-Write 反模式
Payload 轻量 Job data 不超过数 KB禁止塞 PDF 正文 仅传 { taskId, resultId, pkbDocumentId },不超过 200 bytes。快照数据存在 AslExtractionResult 表中v1.5),不塞 Job
过期时间 必须设置 expireInMinutes,防止僵尸 Job Manager: 60minChild: 30min
错误分级 区分"可重试"和"永久失败" 429/5xx → retrypg-boss 指数退避4xx/解析错误 → 标记 error不 retry
死信处理 超过 retryLimit 的 Job 进入 DLQ pg-boss 内置 onFail handler 标记该篇为 error
进度追踪 不在 Job data 中存大量进度 进度统一走 CheckpointServiceJob data 仅含 ID 引用

⚠️ v1.4 终极修正:废弃 P-Queue改用 pg-boss teamConcurrency 全局限流

旧方案(已废弃): ExtractionService 内部使用 P-Queue({ concurrency: 2 }) 控制 MinerU 并发。 在多实例K8s Pods部署下每个 Pod 各自有一个 P-Queue实际全局并发 = 2 × Pod 数, MinerU API 瞬间 429 熔断 + 重试风暴。

新方案: 把并发控制权交还给数据库。将 MinerU 解析拆为独立 pg-boss 子队列, 配置 teamConcurrency——这是 PostgreSQL 级全局锁,跨所有 Node.js 实例生效。

📖 Worker 注册与三级限流见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §4.4

v1.4.2 三级限流架构(队列名已合规):

asl_extraction_child    (teamConcurrency: 10)  ← 背压阀门,防 OOM
  └─ asl_mineru_extract (teamConcurrency: 2)   ← 昂贵 API 保护
  └─ asl_llm_extract    (teamConcurrency: 5)   ← LLM 并发保护

全部基于 PostgreSQL 行锁实现全局并发控制,跨所有 Node.js 实例生效。 P-Queue 是进程内信号量,多实例下形同虚设——已废弃。

LLM 调用策略:

  • 主模型DeepSeek-V3128K 上下文成本低JSON 输出能力强)
  • 降级模型Qwen-Max72B阿里云低延迟
  • JSON 解析:沿用 3 层容错(正则提取 → jsonrepair → 宽松解析)

⚠️ 审查修正v1.1fuzzyQuoteMatch 替代子串匹配

严格的 String.includes() 在真实 LLM 场景中匹配率极低LLM 会自动修复换行、吞掉空格、替换特殊连字符),导致大量正确 Quote 被误标红。改用模糊匹配。

🚨 v1.4.1 补丁 1致命漏洞搜索范围必须包含 MinerU 文本

漏洞推演: v1.3 的 XML 隔离指令告诉 LLM "表格数据优先从 <HIGH_FIDELITY_TABLES> 提取" 因此 LLM 返回的 _quote 大量引用 MinerU HTML 中的原文(如 "410 (22.4%)")。 但旧版 fuzzyQuoteMatch(pdfMarkdown, llmQuote) 仅在 pymupdf4llm 文本中搜索 而 pymupdf4llm 的表格是乱码管道符(如 "4|10 (22.4|%)")→ 匹配必然失败 → 满屏红色警告。

本质: v1.3 的"上下文污染防护"和"Quote 验证"在逻辑上互相打架。越成功让 LLM 从 MinerU 提取Quote 误报率就越高。不修此漏洞,系统形同虚设。

📖 fuzzyQuoteMatch 算法见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §5.1

  • 匹配成功confidence ≥ 0.95):前端正常展示 Quote
  • 匹配成功但 confidence 0.80-0.95:前端展示 Quote + 黄色"近似匹配"标签
  • 匹配失败confidence < 0.80):前端红色警告图标,提示人工核实

⚠️ v1.3 加分项 2PKB 复用感知日志

Worker 处理每篇文献时,如果从 PKB 成功读到 extractedText,日志中高亮提示用户节省了重新提取的时间成本:

📖 PKB 复用日志见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §3.2


Task 2.4 — 提取任务 API

新增端点7 个):

方法 路径 说明
POST /api/v1/asl/extraction/tasks 创建提取任务(锁定模板 → pg-boss 入队)
GET /api/v1/asl/extraction/tasks/:taskId 获取任务元数据 + 最终状态(用于断点恢复)
GET /api/v1/asl/extraction/tasks/:taskId/stream ⚠️ SSE 端点:实时推送进度 + 日志流
GET /api/v1/asl/extraction/tasks/:taskId/results 获取全部提取结果(分页)
GET /api/v1/asl/extraction/results/:resultId 获取单篇提取详情
PUT /api/v1/asl/extraction/results/:resultId/review 人工审核approve / reject + 字段修正)
GET /api/v1/asl/extraction/tasks/:taskId/export 导出 Excel 宽表

控制器: backend/src/modules/asl/extraction/controllers/ExtractionController.ts

⚠️ 审查修正SSE 流式端点设计

/tasks/:taskId/stream 使用 SSE 协议实时推送,复用 common/streaming/ 基建:

// SSE 事件类型(⚠️ v1.3 新增 sync 事件)
type ExtractionSSEEvent =
  | { type: 'sync'; data: { processed: number; total: number; status: string; recentLogs: LogEntry[] } }  // v1.3 首帧 / v1.4.1 降级: recentLogs 可能为空
  | { type: 'progress'; data: { processed: number; total: number; currentFile: string } }
  | { type: 'log'; data: { source: 'mineru' | 'deepseek' | 'system'; message: string; timestamp: string } }
  | { type: 'complete'; data: { successCount: number; failedCount: number } }
  | { type: 'error'; data: { message: string } };

⚠️ v1.3 加分项 1SSE Hydration on Connect

用户刷新页面或网络断线重连后,前端建立新的 SSE 连接。此时 Worker 可能已经处理到第 5 篇, 但如果 SSE 只推送增量事件,前端进度条和日志区会显示空白。

SSE 端点在客户端首次连接时,立即下发一个 sync 事件,包含当前进度快照:

🚨 v1.4.1 补丁 2logBuffer 多 Pod 降级方案

漏洞: 如果 logBuffer 存在 Node.js 内存中Map/Array多 Pod 部署时用户刷新 被路由到另一个 PodlogBuffer.getRecent() 返回空数组——日志区依然空白。

降级方案(推荐): 不引入 Redis违反 Postgres-Only不存历史日志流。 SSE 重连时仅下发进度状态,前端日志区打印一行提示即可。 在 v1.4 双轨制架构下,进度条由 React Query 驱动,日志流仅为视觉增强,此降级零业务影响。

📖 SSE 端点代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §7.2

📖 前端 sync 降级处理见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §7.4

Worker 中通过 CheckpointService 更新进度SSE 端点监听 checkpoint 变化并推送给前端。

🆕 v1.5SSE 跨实例实时日志通信 — PostgreSQL NOTIFY/LISTEN

物理限制: sseEmitter.emit() 基于内存 EventEmitter用户连 Pod A但 Worker 跑在 Pod B。 Pod B 触发 emitPod A 的 SSE 连接收不到任何实时日志。v1.4.1 仅解决了历史日志logBuffer 降级), 实时日志流本身 在多 Pod 下仍然是断裂的。

解决方案: 使用 PostgreSQL NOTIFY/LISTEN 实现跨实例广播Postgres-Only 合规,不引入 Redis

角色 职责
Worker 发送端Pod B Child Worker 在生成日志时执行 NOTIFY asl_sse_channel, '{taskId, type, data}'
API 接收端(所有 Pod Pod 启动时建立一条独立的长连接(不从连接池借),执行 LISTEN asl_sse_channel,收到消息后检查本机是否有该 taskId 的 SSE 客户端,有则推送

关键约束:

  • NOTIFY payload 上限 8000 bytes(日志消息绰绰有余)
  • LISTEN 连接必须独立于连接池(归还连接后 LISTEN 失效)
  • NOTIFY 是 fire-and-forget无持久化、无重放与 v1.4 双轨制定位完全吻合——日志流本身就是"阅后即焚"的视觉增强
  • 归属 M2M1 不做 SSE 日志流)

📖 NOTIFY/LISTEN 代码模式见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §7.6


Task 2.5 — 升级 Excel 导出

文件: backend/src/modules/asl/extraction/services/ExtractionExcelExporter.ts

升级现有 ExcelExporter.ts,生成标准科研 Excel 数据宽表:

Study_ID NCT treatment_name treatment_name_quote n_treatment n_treatment_quote ... 糖尿病史比例 糖尿病史比例_quote
Gandhi 2018 NCT02578680 Pembrolizumab "Methods: ...pembro..." 410 "A total of 410..." ... 22.4% "Table 1: ...22.4%..."

设计要点:

  • 每个变量字段右侧紧跟一列 _quote 原文
  • 自定义字段追加在标准字段之后,同样带 Quote
  • 仅导出 reviewStatus = approved 的文献
  • 表头双行:第一行中文名,第二行英文 JSON Key

Task 2.6 — PDF 上传接入 OSS🆕 v1.2 删除)

已删除。 PDF 上传、OSS 存储、全文提取均由 PKB 模块承担。 Tool 3 通过 PkbBridgeService 读取 PKB 的 storageKeyOSS 路径)和 extractedTextMarkdown 全文), 无需自建上传流程。详见 Task 2.2 的流水线设计。


Phase 3前端 Step 1 — 配置模板与选择文献来源 — 预计 3 天

目标: 对应产品原型图 View 1实现模板选择、自定义字段管理、🆕 PKB 知识库对接。

Task 3.1 — 重构 FulltextSettings.tsx → ExtractionSetup.tsx

布局(对应原型 5:2 双栏v1.2 右栏改为 PKB 选择器):

┌────────────────────────────────────────────────────────────────┐
│  步骤条:[1.配置模板与选择文献] → [2.机器解析与提取] → [3.人机比对]│
├──────────────────────────────────┬─────────────────────────────┤
│  左 3/5模板配置                │  右 2/5🆕 PKB 文献来源     │
│  ┌────────────────────────────┐ │  ┌───────────────────────┐  │
│  │ 选择系统基座               │ │  │ 选择 PKB 知识库        │  │
│  │ [下拉RCT / Cohort / QC] │ │  │ [下拉:我的知识库列表] │  │
│  ├────────────────────────────┤ │  ├───────────────────────┤  │
│  │ 基座字段展示(只读标签云) │ │  │ 知识库文献列表         │  │
│  │ 🔒 Study_ID  🔒 NCT ...   │ │  │ ☑ Gandhi_2018.pdf     │  │
│  ├────────────────────────────┤ │  │ ☑ Hellmann_2019.pdf   │  │
│  │ 用户自定义字段插槽         │ │  │ ☐ Socinski_2018.pdf   │  │
│  │ [+ 添加自定义字段]         │ │  │ ── 仅显示 PDF 文档 ── │  │
│  │ ┌─────────────────────┐   │ │  │ 已选2 篇             │  │
│  │ │ 糖尿病史比例 (%)     │   │ │  └───────────────────────┘  │
│  │ │ Type: Percentage     │   │ │  ┌───────────────────────┐  │
│  │ │ Prompt: "请在基线..."│   │ │  │ 💡 请先在「个人知识库」│  │
│  │ └─────────────────────┘   │ │  │ 中上传 PDF 文献        │  │
│  └────────────────────────────┘ │  └───────────────────────┘  │
├─────────────────────────────────┴─────────────────────────────┤
│  [确认模板并开始批量提取](需至少选择 1 篇 PKB 文献)           │
└────────────────────────────────────────────────────────────────┘

技术选型:

  • Ant Design Select — 基座模板下拉
  • Ant Design Tag — 基座字段标签(锁定图标 + 灰色)
  • 🆕 Ant Design Select — PKB 知识库下拉选择
  • 🆕 Ant Design Table (带 Checkbox) — PKB 文献列表(仅展示 PDF 类型文档)
  • Ant Design Modal — 添加/编辑自定义字段弹窗
  • Ant Design Steps — 步骤条

API 调用:

  • GET /api/v1/asl/extraction/templates → 加载模板列表
  • POST /api/v1/asl/projects/:projectId/template → 克隆模板
  • PUT /api/v1/asl/projects/:projectId/template/custom-fields → 管理自定义字段
  • 🆕 GET /api/v1/pkb/knowledge-bases → 获取用户的 PKB 知识库列表
  • 🆕 GET /api/v1/pkb/knowledge-bases/:kbId/documents?type=pdf → 获取知识库内 PDF 文档列表

Task 3.2 — 自定义字段管理弹窗

组件: frontend-v2/src/modules/asl/components/extraction/CustomFieldModal.tsx

对应原型中的 Modal 弹窗,表单字段:

  • 字段名称(必填)
  • 期望数据类型String / Number / Percentage / BooleanSelect
  • AI 提取指令 Prompt必填TextArea

支持新增 / 编辑 / 删除操作。


Task 3.3 — PDF 批量上传与列表管理🆕 v1.2 替换)

已删除 PdfUploadPanel。 替换为以下两个组件:

Task 3.3a — PKB 知识库选择器

组件: frontend-v2/src/modules/asl/components/extraction/PkbKnowledgeBaseSelector.tsx

  • 调用 GET /api/v1/pkb/knowledge-bases 获取用户的知识库列表
  • 下拉选择一个知识库
  • 选中后加载该知识库内的 PDF 文档列表(带 Checkbox 多选)
  • 仅展示文件类型为 PDF 的文档(过滤非 PDF
  • 展示信息:文件名、上传时间、文件大小、全文提取状态(extractedText 是否存在)
  • 底部提示:"还没有上传 PDF请先前往「个人知识库」上传文献。" + 跳转链接

Task 3.3b — PKB 桥接服务(后端)— ⚠️ v1.3 ACL 防腐层

🚨 v1.3 排雷修正(隐患 1 禁止跨模块直接查 Prisma Model。 全系统所有模块ASL、PKB、RVW、DC 等)之间零跨模块 import不能开此先例。 改为 ACL 防腐层架构PKB 暴露只读服务接口ASL 进程内调用获取 DTO。

PKB 侧新增(由 PKB 模块维护):

文件: backend/src/modules/pkb/services/PkbExportService.ts

📖 ACL 防腐层代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §6.1 + §6.2

设计要点:

  • ⚠️ v1.3 ACL 防腐层ASL 绝不直接 import { prisma } from ...pkb_schema
  • PKB 模块新增 PkbExportServicePKB 自己的代码管自己的表),返回纯 DTO 对象
  • ASL 的 PkbBridgeService 通过依赖注入拿到 PkbExportService 实例(进程内调用,无网络开销)
  • 未来 PKB 改表结构,只需更新 PkbExportServiceASL 完全无感
  • 仅读取 PKB 数据,不修改 PKB 数据(单向只读依赖

Phase 4前端 Step 2 — 机器解析与提取 — 预计 2 天

目标: 对应产品原型图 View 2展示批量提取的实时进度和终端日志。

Task 4.1 — 重构 FulltextProgress.tsx → ExtractionProgress.tsx

布局:

┌──────────────────────────────────────────────────────────┐
│  ┌──────────────────────────────────────────────────┐   │
│  │              🤖 机器静默提取中...                   │   │
│  │  任务已进入 pg-boss 队列                           │   │
│  │  ▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓░░░░░░░░░░  3/8 篇完成              │   │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘   │
│  ┌──────────────────────────────────────────────────┐   │
│  │ [MinerU] Extracting tables from Gandhi_2018...    │   │
│  │ [MinerU] ✓ 3 tables extracted (2.1s)              │   │
│  │ [DeepSeek] Building Schema: [RCT] + [1 custom]    │   │
│  │ [DeepSeek] Extracting with Quote tracing...       │   │
│  │ [System] 1/8 Documents processed.                 │   │
│  │ ...                                               │   │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘   │
└──────────────────────────────────────────────────────────┘

⚠️ v1.4 终极修正双轨制通信架构React Query 主驱动 + SSE 日志增强)

v1.3 旧方案: SSE 单轨驱动一切(进度条、步骤跳转、日志流)。 SSE 断开时主业务流中断,需要 Hydration 机制补偿。

v1.4 新方案(终极审查调和): 双轨制分离关注点:

  • 主业务流(进度条、步骤跳转、成功/失败)React Query 轮询 /tasks/:taskId3 秒间隔),稳健可靠
  • 视觉增强(终端日志流)SSE 单向通道,仅灌入 <ProcessingTerminal /> 组件。即使 SSE 断开,不影响主线
  • SSE sync 首帧:保留,用于快速填充日志区(比等 3 秒轮询更好的首屏体验)
职责 驱动方式 断开影响
进度条 React Query 轮询 GET /tasks/:taskId 3 秒内自动恢复
步骤跳转 React Query 检测 status 字段变化 3 秒内自动跳转
终端日志流 SSE log 事件 → <ProcessingTerminal /> 仅日志流中断,无业务影响
首屏日志填充 SSE sync 首帧 Hydration 保留,快速填充

技术方案:

📖 双轨制通信代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §7.3 + §7.4 + §7.5

  • 日志区域:深色终端风格 <pre> 容器,不同来源用颜色区分([MinerU] 蓝色、[DeepSeek] 紫色、[System] 绿色)
  • 进度条Ant Design Progress,由 React Query 轮询 驱动(非 SSE
  • 步骤跳转React Query 检测 task.status 变化自动跳转(非 SSE complete 事件)

⚠️ 审查修正:断点恢复(状态水合)

用户关闭浏览器后再次打开,前端必须能恢复到正确步骤:

📖 状态驱动路由见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §8.1

前端进入 /extraction/:taskId 时,首屏调用 GET /tasks/:taskId 读取 status,根据状态决定渲染哪个步骤。processing 状态会重建 SSE 连接从当前进度继续。


Phase 5前端 Step 3 — 人机比对与核准 — 预计 5 天

目标: 对应产品原型图 View 3实现工作台列表 + 右侧智能提取抽屉。这是前端最复杂的部分

Task 5.1 — 重构 FulltextWorkbench.tsx → ExtractionWorkbench.tsx

列表区域:

说明
Study ID / 标题 文献标识,标题可点击打开抽屉
机器解析流 标签显示 MinerU 表格还原 + DeepSeek 榨取状态
复核状态 Badge待核对橙色脉冲 / Approved绿色 / Rejected红色
操作 [复核提单] 按钮 → 打开右侧抽屉

顶部:

  • 提示横幅:"机器提取完毕!共提取 N 篇文献。标记为 Approved 的数据才允许导出。"
  • 右上角:[下载结构化提取结果 (Excel)] 按钮(仅当有 Approved 数据时可用)

Task 5.2 — 智能提取复核抽屉(核心 UI

组件: frontend-v2/src/modules/asl/components/extraction/ExtractionDrawer.tsx

这是 V2.0 交互最复杂的组件,对应原型图中宽 700px 的右侧抽屉。

抽屉结构:

┌─ 抽屉头部 ──────────────────────────────────────────┐
│  [Pending Review] [基于所选模板提取]                   │
│  论文标题(加粗)                                     │
│                                            [✕ 关闭] │
├─ Quote 护栏提示条 ─────────────────────────────────────┤
│  🛡️ 已强制开启 Quote 原文溯源         [查看源 PDF ↗]   │
├─ 可滚动内容区 ────────────────────────────────────────┤
│                                                      │
│  ┌─ 模块 1基础元数据 ─────────────────────────────┐│
│  │  Study_ID: [Gandhi 2018]                         ││
│  │  NCT: [NCT02578680]                              ││
│  │  AI Quote: "Methods: This...NCT02578680..."      ││
│  └──────────────────────────────────────────────────┘│
│                                                      │
│  ┌─ 模块 2基线特征 ──────────────────────────────┐ │
│  │  Intervention_N: [410]   Control_N: [206]        │ │
│  │  AI Quote: "A total of 410 patients..."          │ │
│  │  ── 自定义字段 ──────────────────────────────── │ │
│  │  糖尿病史比例 (%): [22.4%]  [Custom Slot 标签]   │ │
│  │  AI Quote: "Table 1: ...22.4%..."                │ │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘│
│                                                      │
│  ┌─ 模块 3RoB 2.0 ──────────────────────────────┐ │
│  │  随机化: [Low Risk] ✅                           │ │
│  │  AI Quote: "computer-generated random..."        │ │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘│
│                                                      │
│  ┌─ 模块 4结局指标 ─────────────────────────────┐  │
│  │  HR (OS): [0.49]  95% CI: [0.38] - [0.64]      │  │
│  │  AI Quote: "hazard ratio, 0.49; 95% CI..."      │  │
│  └──────────────────────────────────────────────────┘│
│                                                      │
├─ 抽屉底部 ──────────────────────────────────────────┤
│  "请确保所有 Quote 数值已核验"                         │
│                      [取消]  [✓✓ 核准保存]            │
└──────────────────────────────────────────────────────┘

核心技术要点:

  1. 动态表单渲染:根据 extractedData 的 JSON 结构按模块metadata / baseline / rob / outcomes分组渲染 Input / Select 控件
  2. Quote 溯源区块:每个字段下方显示 AI Quote 灰色面板,原文关键数字用黄色 <mark> 高亮
  3. Custom Slot 标识:自定义字段旁显示 Custom Slot 蓝色标签
  4. 字段可编辑:用户可直接修改 AI 提取的值,修改后的字段记录到 manualOverrides
  5. 核准/驳回:点击"核准保存"→ PUT /api/v1/asl/extraction/results/:resultId/review → 更新状态

⚠️ v1.4 终极修正HITL 死锁解套 — Quote 警告处置交互

fuzzyQuoteMatch 匹配失败confidence < 0.80v1.3 仅标红警告, 但如果医生认为 AI 提取的值其实是对的,系统没有"放行"交互, 数据永远卡在 Pending 状态——这是 HITL 死锁

解锁方案:每个红色警告 Quote 旁边必须提供两个处置按钮:

┌─ Quote 警告区域 ──────────────────────────────────────┐
│  ⚠️ AI Quote 匹配失败 (confidence: 0.62)               │
│  AI 引用: "The median PFS was 10.3 months..."          │
│                                                        │
│  [🟢 强制认可]   [✏️ 手动修改数值]                       │
└────────────────────────────────────────────────────────┘
  • [强制认可]:消除红色警告,在 manualOverrides 中标记 { fieldName_quote_force_accepted: true }。表示医生已人工确认该 Quote 无误,后续导出 Excel 时正常输出
  • [手动修改数值]:聚焦到对应的 Input 框,医生直接修改提取值。旧的错误 Quote 显示删除线样式,并追加提示文字:"已转为人工干预,原文引用取消强绑定"
  • 两种操作都会记录到 manualOverrides,审计时可追溯哪些字段经过人工干预
  • 核准按钮前置校验:所有红色警告 Quote 必须被处置(强制认可或手动修改)后,"核准保存"按钮才可点击

⚠️ 审查修正Drawer 性能优化

extractedData 包含几十个字段(基座 + 自定义)时,一次性渲染所有带验证逻辑的控件和大段 Quote Markdown 会导致 Drawer 弹出卡顿。

优化方案:

📖 Collapse 懒渲染代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §8.2

  • 默认仅展开"基础元数据"面板,其余折叠,用户点击展开时才渲染
  • 每个 FieldGroup 组件用 React.memo 包裹,避免跨模块修改触发全量 Re-render
  • 使用 Ant Design FormshouldUpdate 精确控制字段级更新,不引入 react-hook-form(保持技术栈统一)
  • manualOverrides 通过 Form.onValuesChange 差量追踪,仅记录用户实际修改的字段

Task 5.3 — 查看源 PDF 功能 — ⚠️ v1.3 懒签名 + 403 自动刷新

  • 点击"查看源 PDF"按钮 → 通过 PkbBridgeService.getDocumentSignedUrl(storageKey) 获取签名 URL → 新标签页打开 PDF
  • 🆕 v1.2PDF 存储在 PKB 的 OSS 路径下(tenants/{tenantId}/users/{userId}/pkb/{kbId}/{uuid}.pdf),通过 common/storage/ 生成签名 URL

⚠️ v1.3 排雷修正(隐患 4签名 URL 过期打断医生心流

医生审核一篇论文可能耗时 30-60 分钟。如果在列表加载时预签名所有 PDF URL1 小时有效期), 等医生审核到后面的文献时,前面的签名可能已过期,点击"查看源 PDF"会返回 403。

修正方案:懒签名 + 短有效期 + 前端 403 自动刷新

📖 签名 URL 代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §8.3

要点:

  • 不在列表加载时批量预签名,仅在用户点击"查看源 PDF"时按需生成
  • 签名有效期缩短为 10 分钟(足够阅读当篇论文)
  • 前端 <iframe> / <embed> 监听 onerror / HTTP 403自动调用后端重新签名
  • 遵循 OSS 规范使用签名 URL但优化了过期策略

Phase 6集成测试与联调 — 预计 3 天

Task 6.1 — 后端集成测试

测试文件: backend/src/modules/asl/extraction/__tests__/

  • 模板 CRUD 测试
  • 动态 Schema 组装测试
  • MinerU + LLM 端到端提取测试(使用已有 8 篇测试 PDF
  • fuzzyQuoteMatch 验证测试(含边界用例:连字符替换、空格差异、换行吞掉)
  • Prompt Injection 防护测试(验证恶意输入被隔离)
  • Excel 导出格式测试

Task 6.2 — 前端-后端联调

  • Step 1 → Step 2 → Step 3 完整流程走通
  • 验证 SSE 流式日志推送(终端打字机效果)
  • 验证断点恢复(关闭浏览器 → 重新打开 → 正确恢复到当前步骤)
  • 验证动态表单渲染与数据回写
  • 验证 Excel 导出内容正确性

Task 6.3 — ⚠️ 审查修正Playwright E2E 自动化测试

测试文件: frontend-v2/e2e/extraction-workbench.spec.ts

Deep Research V2.0 已有 deep-research-v2-e2e.ts 先例,本模块必须补充 E2E 覆盖核心业务流:

📖 E2E 测试代码见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §9

E2E 测试范围:

  • 🆕 模板选择 + PKB 知识库选择 + 文献勾选 → 提取进度 SSE → 抽屉核准 → Excel 导出
  • 断点恢复:提取中关闭页面 → 重新打开 → 恢复到 Step 2/3
  • 自定义字段:添加字段 → 提取结果中包含自定义字段
  • 🆕 PKB 空知识库:无 PDF 文档时显示引导提示

Phase 7与原有代码对接 — 预计 2 天

Task 7.1 — 路由整合

backend/src/modules/asl/routes/index.ts 中注册新的提取路由:

📖 路由注册见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §8.4

Task 7.2 — 前端路由整合

frontend-v2/src/modules/asl/index.tsx 中添加工具 3 页面路由:

📖 路由注册见 08d-工具3-代码模式与技术规范.md §8.4

Task 7.3 — 与工具 1/2 及 PKB 数据衔接

工具 3 的输入来源有两个渠道(🆕 v1.2 新增 PKB 渠道,删除直接上传渠道):

输入渠道 说明 对接方式
从工具 2 流转 标题摘要初筛通过的文献 AslLiterature 表中 stage = 'fulltext'hasPdf = true 的记录
🆕 从 PKB 知识库 用户跳过工具 1/2在 PKB 中上传 PDF 后对接 通过 PkbBridgeService 读取知识库文献,AslExtractionResult.pkbDocumentId 关联

v1.2 删除: 不再支持"直接上传 PDF"渠道。用户需先在 PKB 中上传文献,再在 Tool 3 中选择。 这确保了 PDF 存储、全文提取的统一管理,避免重复建设。


四、后端目录结构(新增)

backend/src/modules/asl/
├── extraction/                          # 🆕 工具 3 提取模块
│   ├── controllers/
│   │   ├── TemplateController.ts        # 模板管理 API
│   │   └── ExtractionController.ts      # 提取任务 API
│   ├── services/
│   │   ├── TemplateService.ts           # 模板管理服务
│   │   ├── DynamicPromptBuilder.ts      # 动态 Prompt 组装XML 隔离 + 防注入护栏)
│   │   ├── PdfProcessingPipeline.ts     # MinerU 表格增强 + PKB 文本复用
│   │   ├── PkbBridgeService.ts          # PKB 桥接服务(调用 PkbExportService ACL
│   │   ├── ExtractionService.ts         # 核心提取服务teamConcurrency 全局限流)
│   │   ├── ExtractionValidator.ts       # 提取结果验证fuzzyQuoteMatch
│   │   ├── ExtractionExcelExporter.ts   # Excel 宽表导出
│   │   ├── ExtractionManagerWorker.ts   # 🆕 v1.3 Fan-out Manager派发 N 个 Child
│   │   └── ExtractionChildWorker.ts     # 🆕 v1.3 Fan-out Child单篇粒度提取
│   ├── prompts/
│   │   ├── system_prompt_v2.md          # V2 系统提示词
│   │   └── extraction_schema/           # 各模板的 JSON Schema
│   ├── routes/
│   │   └── index.ts                     # 路由注册
│   └── __tests__/
│       ├── template.test.ts
│       ├── extraction.test.ts
│       └── excel-export.test.ts
│
├── fulltext-screening/                  # 现有 V1.0(保留)
│   └── ...
├── common/                              # 现有通用层(复用)
│   ├── llm/                             # LLM12FieldsService
│   ├── pdf/                             # PDFStorageService
│   └── validation/                      # 三层验证器
└── routes/
    └── index.ts                         # 路由注册入口

# 🆕 v1.3 PKB 模块需新增(由 PKB 模块维护)
backend/src/modules/pkb/
├── services/
│   ├── documentService.ts               # 现有
│   └── PkbExportService.ts              # 🆕 ACL 防腐层:只读数据导出服务(返回 DTO
└── ...

五、前端目录结构(新增)

frontend-v2/src/modules/asl/
├── components/
│   ├── extraction/                      # 🆕 工具 3 提取组件
│   │   ├── ExtractionDrawer.tsx         # 核心:复核抽屉(动态表单)
│   │   ├── CustomFieldModal.tsx         # 自定义字段弹窗
│   │   ├── PkbKnowledgeBaseSelector.tsx # 🆕 PKB 知识库选择器(替代 PdfUploadPanel
│   │   ├── TemplateSelector.tsx         # 模板选择器
│   │   ├── BaseFieldsTags.tsx           # 基座字段标签云
│   │   ├── CustomFieldList.tsx          # 自定义字段列表
│   │   ├── ProcessingTerminal.tsx       # 终端日志组件
│   │   ├── QuoteBlock.tsx              # AI Quote 溯源展示块
│   │   └── ExtractionStatusBadge.tsx    # 复核状态标签
│   └── ...
├── pages/
│   ├── ExtractionSetup.tsx              # 🆕 Step 1配置与上传
│   ├── ExtractionProgress.tsx           # 🆕 Step 2提取进度
│   ├── ExtractionWorkbench.tsx          # 🆕 Step 3工作台
│   └── ...
├── hooks/
│   ├── useExtractionTemplates.ts        # 🆕 模板相关 Hook
│   ├── useTaskStatus.ts                 # 🆕 v1.4 React Query 轮询驱动主流(进度+步骤跳转)
│   ├── useExtractionLogs.ts             # 🆕 v1.4 SSE 日志流 Hook纯视觉增强
│   └── useExtractionResults.ts          # 🆕 提取结果 Hook
├── types/
│   └── extraction.ts                    # 🆕 提取相关类型定义
└── api/
    └── extraction.ts                    # 🆕 提取相关 API 函数

六、开发里程碑与排期 → 已拆分为 M1/M2/M3 冲刺清单

⚠️ 母子文档管理模式v1.4.2 拆分)

本文档作为架构总纲,保留 Schema、架构图、代码模式、研发红线、风险表、技术决策。 具体任务分配和验收标准已拆分为 3 个独立的冲刺执行清单:

里程碑 文档 时间 核心交付
M1 骨架管线 08a-工具3-M1-骨架管线冲刺清单.md Week 15-6 天) Fan-out 全链路 + PKB ACL + 纯文本盲提 + 极简前端
M2 HITL 工作台 08b-工具3-M2-HITL工作台冲刺清单.md Week 2-38-9 天) MinerU + 审核抽屉 + SSE 日志 + Excel 导出
M3 动态模板引擎 08c-工具3-M3-动态模板引擎冲刺清单.md Week 45-6 天) 自定义字段 + 安全护栏 + E2E 封版
合计 ~22 天 每周五可独立 Demo

核心思想垂直切片Vertical Slicing M1 防守排除并发死锁M2 进攻让用户惊艳M3 注入灵魂(商业扩展性)。 开发人员在 M1 阶段只需打开 M1 清单,不操心 M3 的动态表单怎么画。

灵活上线策略: 如果项目赶进度M1+M2 即可交付给真实医生试用M3 作为 v2.1 后续迭代。


七、关键技术决策

7.1 为什么新建 extraction/ 模块而非直接修改 fulltext-screening/

考量 决策
功能定位不同 V1.0 是"筛选"include/excludeV2.0 是"结构化提取"extract fields
向后兼容 保留原有 API 和前端页面,已有数据不受影响
代码复杂度 V2.0 新增模板引擎、动态 Schema、MinerU 集成等,改动量大于 50%
渐进迁移 后期可将 V1.0 筛选功能合并到 V2.0 作为"快速模式"

7.2 MinerU 表格提取策略

场景 策略
PDF < 20 页 并行 pymupdf4llm + MinerU合并结果
PDF > 20 页 仅 pymupdf4llm 全文 + MinerU 表格页
MinerU 失败 降级到 pymupdf4llm 纯文本表格
MinerU 超时(>3min 自动降级

7.3 Quote 溯源实现方案(⚠️ 审查修正)

  1. LLM Prompt 中强制要求 _quote 字段为 PDF 原文
  2. 后端提取完成后,用 fuzzyQuoteMatch 模糊验证 QuoteUnicode NFKC 标准化 → 剥离空白标点 → 纯文本包含 → Levenshtein ≤5% 容错)
  3. 验证结果分三级:
    • confidence ≥ 0.95:完全匹配,正常展示
    • confidence 0.80-0.95:近似匹配,黄色"近似"标签
    • confidence < 0.80:匹配失败,红色警告图标
  4. 前端 QuoteBlock 组件:灰色背景 + 黄色 <mark> 高亮关键数字 + 置信度指示器

7.4 🆕 为什么对接 PKB 而非自建 PDF 上传v1.2 决策)

维度 自建 PDF 上传(已删除) 对接 PKB 知识库(采纳)
用户体验 用户需在 Tool 3 和 PKB 两处管理 PDF容易混乱 统一在 PKB 管理 PDFTool 3 专注提取
开发成本 需开发 Upload API + OSS 集成 + 前端 Dragger 仅需 PkbBridgeService跨 schema 查询)
全文提取 每篇 PDF 运行时调用 pymupdf4llm耗时 5-15s 直接读 PKB extractedText(毫秒级)
OSS 存储 需要独立的 asl/{projectId}/ 路径 复用 PKB 已有的 pkb/{kbId}/ 路径
文件去重 同一 PDF 可能在 PKB 和 ASL 各存一份 只在 PKB 存一份,零冗余
签名 URL 需自建签名 URL 生成逻辑 复用 PKB getDocumentSignedUrl()

PKB 已验证的 OSS 集成代码(代码审查确认):

// documentController.ts — PKB 上传流程
const storageKey = generatePkbStorageKey(tenantId, userId, kbId, filename);
// 路径格式tenants/{tenantId}/users/{userId}/pkb/{kbId}/{uuid16}.pdf
fileUrl = await storage.upload(storageKey, file);  // ✅ 已集成 storage.upload()

⚠️ v1.3 ACL 防腐层跨模块调用方案(替代跨 Schema 直查):

  • PKB 和 ASL 同属一个 PostgreSQL 数据库,PkbBridgeService 直接查 pkb_schema
  • v1.3 修正:当前全系统所有模块之间零跨模块 import(经代码审查确认),不能为 Tool 3 开此先例
  • PKB 模块新增 PkbExportService,封装对 pkb_schema 的查询,返回纯 DTO不暴露 Prisma Model
  • ASL 的 PkbBridgeService 通过依赖注入调用 PkbExportService(进程内调用,零网络开销)
  • 这是单向只读依赖ASL → PKB 只读PKB 不感知 ASL 的存在
  • 未来如需拆分微服务,只需将 PkbExportService 改为 gRPC/HTTP ClientASL 调用方式不变

7.5 数据流转给工具 4/5

工具 3 的 extractedData JSON 直接作为工具 4/5 的输入:

  • 工具 4SR 图表):读取 baseline + rob 模块
  • 工具 5Meta 分析):读取 outcomes 模块,根据 outcomeType 选择分析模型

数据契约通过 AslExtractionResult.extractedData 的 JSON Schema 保证。


八、风险与应对

风险 影响 应对措施
MinerU API 不稳定 表格提取失败 自动降级到 pymupdf4llm + 指数退避重试(审查修正)
MinerU 批量并发 429 / OOM 批量提取阻塞 ⚠️ v1.4 pg-boss teamConcurrency: 2 全局限流(替代 P-Queue
LLM 输出 JSON 格式异常 提取失败 3 层 JSON 解析容错 + jsonrepair
长文献超出上下文窗口 提取不完整 截断策略(保留 Methods + Results + Tables
Quote 子串匹配误标红 用户信任危机 fuzzyQuoteMatch 模糊验证 + 置信度分级(审查修正)
用户自定义 Prompt 注入攻击 系统安全风险 BEGIN/END 指令隔离 + 防逃逸声明 + 日志审计(审查修正)
用户自定义字段 Prompt 质量差 提取准确率低 提供 Prompt 模板示例 + Quote 验证兜底
PDF 格式异常(扫描件、加密) 无法提取 前置 PDF 质量检测,提示用户重新上传
Drawer 大表单渲染卡顿 UI 掉帧 Collapse 懒渲染 + React.memo + Form shouldUpdate审查修正
用户中途关闭浏览器 进度丢失 状态驱动路由,首屏恢复到正确步骤(审查修正)
🆕 PKB 文档 extractedText 为空 无法提供 Markdown 给 LLM PkbBridgeService 前置检查:若 extractedText 为空则降级运行 pymupdf4llm
🆕 PKB 文档被用户删除(提取中) 提取任务中途失败 ⚠️ v1.3 Fan-out Child Job 捕获异常标记该篇为 error不影响其他文献继续
🆕 用户未在 PKB 上传任何 PDF Step 1 无文献可选 前端提示 + 提供跳转 PKB 上传页面的快捷入口
🆕 v1.3 双引擎上下文污染 LLM 被乱码表格误导产生幻觉 XML 结构化隔离 + <HIGH_FIDELITY_TABLES> 优先级指令
🆕 v1.3 跨模块耦合蔓延 未来 PKB 改表导致 ASL 崩溃 ACL 防腐层PkbExportService 返回 DTOASL 不 import PKB 内部类型
🆕 v1.3 签名 URL 过期 403 医生审核中途无法查看 PDF 懒签名10 分钟)+ 前端 403 自动刷新
🆕 v1.3 SSE 重连后进度空白 用户刷新页面看到空白进度条 SSE Hydration on Connect首帧 sync 事件下发当前快照
🆕 v1.3 pg-boss 单 Job 崩溃全重做 N 篇文献因 1 篇崩溃全部重来 Fan-out 扇出模式:每篇独立 Child Job独立 retry
🆕 v1.3 pg-boss retry 产生重复数据 同一篇文献被提取多次 ⚠️ v1.4.2 改为 updateMany 乐观锁抢占 + singletonKey 防重复派发
🆕 v1.4 P-Queue 多实例并发翻倍 K8s 3 Pod → 实际并发 6 导致 429 废弃 P-Queue改 pg-boss teamConcurrencyDB 级全局锁)
🆕 v1.4 Fan-out 并发回写计数丢失 100 子任务并发 +1 产生 Race Condition Prisma 原子递增 { increment: 1 } + 事务保障
🆕 v1.4 永久错误被盲目重试 3 次 PKB 文件删除 → pg-boss 白重试 错误分级路由:致命错误 return success 停止重试
🆕 v1.4 MinerU 重复解析浪费算力 retry / 跨任务同 PDF 重复调用 MinerU Clean Data OSS 缓存Cache-Aside
🆕 v1.4 Quote 标红后 HITL 死锁 医生无法放行正确但低置信度的提取 [强制认可] + [手动修改数值] 双按钮解锁
🆕 v1.4 SSE 断开中断主业务流 进度条停滞、步骤跳转失效 双轨制React Query 轮询驱动主流 + SSE 仅驱动日志
🚨 v1.4.1 Quote 验证搜索范围遗漏 MinerU LLM 引用 MinerU 表格文本但验证仅搜索 pymupdf4llm → 满屏红色误报 buildQuoteSearchScope() 拼接 MinerU 纯文本后再匹配
🚨 v1.4.1 logBuffer 多 Pod 内存不共享 SSE 重连被路由到其他 Pod → 日志区空白 降级方案:不存历史日志,重连时打印"监控已重连"提示
🚨 v1.4.1 Child Worker 无并发限制 OOM 1000 篇文献 → 1000 个挂起闭包 → V8 堆溢出 teamConcurrency: 10 背压限流,其余在 PostgreSQL 排队
🚨 v1.4.2 Fan-out 终点丢失 Manager 退出后无人翻转 Task status → 前端永远卡在 Step 2 processing "Last Child Wins"Child 原子递增后判断 successCount + failedCount >= totalCount 则翻转 completed
🚨 v1.4.2 伪幂等 Read-then-Write 穿透 并发 retry 同时 findUnique 读到 pending → 双倍 MinerU/LLM 调用 + 计数双递增 updateMany({ where: { status: 'pending' } }) 乐观锁原子抢占,count=0 直接退出
🚨 v1.4.2 队列名称点号违规 pg-boss 底层将点号识别为 Schema 分隔符,可能路由截断 全局替换为下划线格式:asl_extraction_managerasl_extraction_childasl_mineru_extractasl_llm_extract
🆕 v1.5 SSE 实时日志跨 Pod 断裂 用户连 Pod AWorker 跑 Pod BsseEmitter.emit() 基于内存 EventEmitter → Pod A 零日志 PostgreSQL NOTIFY/LISTEN 跨实例广播Pod 启动时建立独立长连接 LISTENWorker 端 NOTIFY(归属 M2
🆕 v1.5 PKB 数据提取中被删改 50 分钟提取窗口内用户在 PKB 删除 PDF → Child Worker 找不到 storageKey 批量崩溃 Manager 派发时快照 storageKey + filenameAslExtractionResultChild 从自身记录读取(归属 M1

九、相关文档索引

文档 路径
产品原型图 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/工具3 全文提取产品原型图V2.html
数据字典规范 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/ASL 工具 3 全文提取数据字典与规范.md
模板管理规范 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/ASL 工具 3 提取模板管理规范.md
PRD V5 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-系统设计/证据整合V2.0/ASL全景工具箱与证据合成MVP产品需求文档 V5.md
OSS 存储规范 docs/04-开发规范/11-OSS存储开发规范.md
PDF 表格提取引擎 docs/02-通用能力层/02-文档处理引擎/03-PDF表格提取引擎设计方案.md
PDF 表格提取使用指南 docs/02-通用能力层/02-文档处理引擎/04-PDF表格提取引擎使用指南.md
通用能力层清单 docs/02-通用能力层/00-通用能力层清单.md
模块当前状态 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md
架构审查与改进建议 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3架构审查与研发改进建议.md
🆕 深度审查与排雷指南 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3开发计划深度审查与排雷指南.md
🆕 终极架构审查与研发规范 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3终极架构审查与研发规范.md
🆕 Postgres-Only 异步任务处理指南 docs/02-通用能力层/Postgres-Only异步任务处理指南.md
🆕 PKB 个人知识库状态 docs/03-业务模块/PKB-个人知识库/00-模块当前状态与开发指南.md
🆕 M1 骨架管线冲刺清单 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/08a-工具3-M1-骨架管线冲刺清单.md
🆕 M2 HITL 工作台冲刺清单 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/08b-工具3-M2-HITL工作台冲刺清单.md
🆕 M3 动态模板引擎冲刺清单 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/08c-工具3-M3-动态模板引擎冲刺清单.md
🆕 敏捷拆分与演进路线图 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/06-技术文档/工具3敏捷拆分与演进路线图.md
🆕 代码模式与技术规范 docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/08d-工具3-代码模式与技术规范.md

本文档为架构总纲v1.5)。排期与任务分配已拆分为 M1/M2/M3 三个独立冲刺清单(见第六章)。

M1 启动前全员必须确认以下研发红线: 1. Payload 轻量pg-boss Job Data 仅传 ID禁止塞 PDF 正文或 extractedText 2. 计算卸载Node.js 禁碰 pymupdf4llm/MinerU 解析,必须路由到 Python 微服务或 Cloud API 3. 过期时间Child Job expireInMinutes: 30Manager Job expireInMinutes: 60 4. 三级限流Child teamConcurrency: 10 → MinerU teamConcurrency: 2 → LLM teamConcurrency: 5(全部 pg-boss 全局锁) 5. 原子递增Fan-out Child 完成时必须用 Prisma { increment: 1 } 原子更新父任务计数 6. 错误分级:致命错误 return success 停止重试,临时错误 throw 让 pg-boss 自动退避 7. ACL 防腐层ASL 绝不直接 import PKB 内部类型,统一通过 PkbExportService 获取 DTO 8. Quote 搜索池fuzzyQuoteMatch 必须在 pymupdf4llm 全文 + MinerU 纯文本 中匹配,禁止仅搜索 Markdown 9. Last Child WinsFan-out 模式中最后一个完成的 Child无论成功或失败必须翻转父任务 status = completed,否则前端永远卡在 Step 2 10. 乐观锁抢占Child Worker 禁止使用 findUnique → if check 模式Read-then-Write必须用 updateMany({ where: { status: 'pending' } }) 原子锁 11. 队列命名下划线:所有 pg-boss 队列名使用下划线(asl_extraction_child禁止点号遵守《Postgres-Only 指南》§4.1 12. PKB 快照冻结Manager 派发 Child Job 前必须将 storageKey + filename 快照到 AslExtractionResultChild Worker 从自身记录读取,禁止运行时回查 PKBv1.5 13. SSE 跨 Pod 广播Worker 日志推送必须经 PostgreSQL NOTIFY,禁止依赖内存 EventEmitter 跨实例通信v1.5M2 实施)