Completed: - Phase 1: DB schema (execution_mode + ssa_agent_executions), ModeToggle component, Session PATCH API - Phase 2: AgentPlannerService + AgentCoderService (streaming) + CodeRunnerService + R Docker /execute-code endpoint - Phase 3: AgentCodePanel (3-step confirmation UI), SSE event handling (7 agent events), streaming code display - Three-step confirmation pipeline: plan -> user confirm -> stream code -> user confirm -> execute R code -> results - R Docker sandbox /execute-code endpoint with 120s timeout + block_helpers preloaded - E2E dual-channel test script (8 tests) - Updated R engine architecture doc (v1.5) and SSA module status doc (v4.0) Technical details: - AgentCoderService uses LLM streaming (chatStream) for real-time code generation feedback - ReviewerAgent temporarily disabled, prioritizing Plan -> Code -> Execute flow - CodeRunnerService wraps user code with auto data loading (df variable injection) - Frontend handles agent_planning, agent_plan_ready, code_generating, code_generated, code_executing, code_result events - ask_user mechanism used for plan and code confirmation steps Files: 24 files (4 new services, 2 new components, 1 migration, 1 E2E test, 16 modified) Made-with: Cursor
AI临床研究平台 - 后端服务
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快速开始
1. 环境要求
- Node.js >= 18
- PostgreSQL 15+
- Redis 7+
2. 安装依赖
npm install
3. 配置环境变量
复制.env.example到.env并配置:
cp .env.example .env
4. 初始化数据库
# 生成Prisma Client
npm run prisma:generate
# 执行数据库迁移
npm run prisma:migrate
# (可选)打开Prisma Studio查看数据
npm run prisma:studio
5. 启动开发服务器
npm run dev
服务器将在 http://localhost:3001 启动
6. 验证服务
访问以下端点验证服务是否正常:
- 健康检查: http://localhost:3001/health
- API入口: http://localhost:3001/api/v1
项目结构
backend/
├── prisma/
│ └── schema.prisma # 数据库模型定义
├── src/
│ ├── config/
│ │ ├── env.ts # 环境变量配置
│ │ └── database.ts # 数据库连接
│ ├── controllers/ # 控制器层
│ ├── services/ # 业务逻辑层
│ ├── routes/ # 路由定义
│ ├── types/ # TypeScript类型定义
│ ├── utils/ # 工具函数
│ └── index.ts # 应用入口
├── .env # 环境变量(不提交到Git)
├── .env.example # 环境变量模板
├── package.json # 项目配置
└── tsconfig.json # TypeScript配置
NPM Scripts
npm run dev- 启动开发服务器(hot reload)npm run build- 构建生产版本npm run start- 启动生产服务器npm run prisma:generate- 生成Prisma Clientnpm run prisma:migrate- 执行数据库迁移npm run prisma:studio- 打开Prisma Studio
数据库设计
详见:../docs/01-设计文档/数据库设计文档.md
API文档
详见:../docs/01-设计文档/API设计规范.md
技术栈
- 框架: Fastify
- ORM: Prisma
- 数据库: PostgreSQL
- 缓存: Redis
- 语言: TypeScript
- 日志: Pino
Day 5 完成情况
✅ 初始化后端项目(Node.js + TypeScript) ✅ 配置Fastify框架 ✅ 配置Prisma ORM ✅ 创建数据库表(执行迁移) ✅ 数据库连接测试通过
所有核心功能已完成!🎉