Files
AIclinicalresearch/docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/05-开发记录/2025-11-18-Week1完成报告.md
HaHafeng 2e8699c217 feat(asl): Week 2 Day 2 - Excel import with template download and intelligent dedup
Features:
- feat: Excel template generation and download (with examples)
- feat: Excel file parsing in memory (cloud-native, no disk write)
- feat: Field validation (title + abstract required)
- feat: Smart deduplication (DOI priority + Title fallback)
- feat: Literature preview table with statistics
- feat: Complete submission flow (create project + import literatures)

Components:
- feat: Create excelUtils.ts with full Excel processing toolkit
- feat: Enhance TitleScreeningSettings page with upload/preview/submit
- feat: Update API interface signatures and export unified aslApi object

Dependencies:
- chore: Add xlsx library for Excel file processing

Ref: Week 2 Frontend Development - Day 2
Scope: ASL Module MVP - Title Abstract Screening
Cloud-Native: Memory parsing, no file persistence
2025-11-19 10:24:47 +08:00

308 lines
7.3 KiB
Markdown
Raw Blame History

This file contains ambiguous Unicode characters
This file contains Unicode characters that might be confused with other characters. If you think that this is intentional, you can safely ignore this warning. Use the Escape button to reveal them.
# ASL模块 Week 1 开发完成报告
**日期**: 2025-11-18
**开发周期**: Week 1 (Day 1-5)
**状态**: ✅ 全部完成
---
## 📋 任务完成情况
| 任务 | 计划 | 实际 | 状态 | 说明 |
|------|------|------|------|------|
| Prisma Schema设计 | Day 1 | Day 1 | ✅ | 4个模型174行代码 |
| 数据库迁移 | Day 1 | Day 1 | ✅ | 4张表创建成功 |
| 后端目录结构 | Day 2 | Day 1 | ✅ | 5个子目录9个文件 |
| 路由注册 | Day 3 | Day 1 | ✅ | 10个API端点 |
| 基础API实现 | Day 4-5 | Day 1 | ✅ | 项目+文献管理 |
| API测试 | - | Day 1 | ✅ | 7个测试全部通过 |
**完成度**: 6/6 (100%)
**提前完成**: 4天
---
## 🎯 实现的功能
### 1. 数据库设计 ✅
#### Schema设计
```prisma
// 4个核心模型
- AslScreeningProject // 筛选项目 (19字段)
- AslLiterature // 文献条目 (14字段 + OSS预留)
- AslScreeningResult // 筛选结果 (40字段双模型)
- AslScreeningTask // 筛选任务 (14字段)
```
#### 数据库表
```sql
asl_schema.screening_projects -- 筛选项目表
asl_schema.literatures -- 文献条目表
asl_schema.screening_results -- 筛选结果表
asl_schema.screening_tasks -- 筛选任务表
```
#### 特性
- ✅ Schema隔离 (`asl_schema`)
- ✅ 外键约束 (级联删除)
- ✅ 索引优化 (12个索引)
- ✅ 唯一约束 (projectId + pmid)
- ✅ JSONB字段 (PICO标准)
- ✅ OSS字段预留 (pdfUrl, pdfOssKey)
### 2. 后端API ✅
#### 目录结构
```
backend/src/modules/asl/
├── controllers/
│ ├── projectController.ts (224行)
│ └── literatureController.ts (259行)
├── routes/
│ └── index.ts (47行)
├── services/
│ └── llmScreeningService.ts (189行)
├── schemas/
│ └── screening.schema.ts (108行)
└── types/
└── index.ts (121行)
```
#### API端点 (10个)
```
POST /api/v1/asl/projects - 创建项目
GET /api/v1/asl/projects - 获取项目列表
GET /api/v1/asl/projects/:projectId - 获取项目详情
PUT /api/v1/asl/projects/:projectId - 更新项目
DELETE /api/v1/asl/projects/:projectId - 删除项目
POST /api/v1/asl/literatures/import - 导入文献(JSON)
POST /api/v1/asl/literatures/import-excel - 导入文献(Excel)
GET /api/v1/asl/projects/:projectId/literatures - 获取文献列表
DELETE /api/v1/asl/literatures/:literatureId - 删除文献
```
### 3. 核心服务 ✅
#### LLM筛选服务
```typescript
class LLMScreeningService {
// 单模型筛选
async screenWithModel()
// 双模型并行筛选 (核心)
async dualModelScreening()
// 冲突检测
private detectConflict()
// 批量筛选
async batchScreening()
}
```
#### JSON Schema验证
```typescript
// AJV验证器
- PicoJudgment Schema
- PicoEvidence Schema
- LLMScreeningOutput Schema
```
#### Prompt生成器
```typescript
// 生成PICO标准筛选Prompt
generateScreeningPrompt(
title, abstract, picoCriteria,
inclusionCriteria, exclusionCriteria
)
```
---
## 🧪 测试结果
### API测试 (7/7通过)
```bash
✅ 1. 健康检查 GET /health
✅ 2. 创建筛选项目 POST /api/v1/asl/projects
✅ 3. 获取项目列表 GET /api/v1/asl/projects
✅ 4. 获取项目详情 GET /api/v1/asl/projects/:id
✅ 5. 导入文献 POST /api/v1/asl/literatures/import
✅ 6. 获取文献列表 GET /api/v1/asl/projects/:id/literatures
✅ 7. 更新项目 PUT /api/v1/asl/projects/:id
```
### 测试数据
- **用户**: asl-test-user-001
- **项目**: 1个 (SGLT2抑制剂系统综述)
- **文献**: 3篇 (包含PMID、DOI、期刊等信息)
### 数据库验证
- ✅ 表创建成功
- ✅ 索引创建成功
- ✅ 外键约束正常
- ✅ 数据插入正常
- ✅ 关联查询正常
---
## 📦 技术栈
### 后端框架
- ✅ Fastify (Web框架)
- ✅ Prisma (ORM)
- ✅ TypeScript (类型系统)
### 依赖包 (新增)
-`xlsx` - Excel文件解析
-`ajv` - JSON Schema验证
### 平台服务集成
- ✅ Logger (结构化日志)
- ✅ Database Connection Pool
- ✅ LLMFactory (双模型支持)
- ✅ StorageFactory (OSS预留)
---
## 📊 代码统计
| 类别 | 文件数 | 代码行数 |
|------|--------|----------|
| 控制器 | 2 | 483 |
| 服务 | 1 | 189 |
| 路由 | 1 | 47 |
| 类型定义 | 1 | 121 |
| Schema | 1 | 108 |
| 脚本 | 3 | 350 |
| **总计** | **9** | **~1300** |
---
## 🎨 设计亮点
### 1. Schema隔离架构
```
platform_schema.users → asl_schema.screening_projects
asl_schema.literatures
asl_schema.screening_results
```
### 2. 双模型验证策略
```
Literature → DeepSeek + Qwen (并行)
冲突检测
无冲突 → 自动决策
有冲突 → 人工审核
```
### 3. 云原生设计
```
- 无状态API
- 平台服务集成
- OSS存储预留
- 异步任务准备
```
---
## 🐛 解决的问题
### 1. Prisma导入错误
**问题**: `getPrisma is not exported`
**解决**: 修改为 `import { prisma } from '...'`
### 2. 依赖包缺失
**问题**: `Cannot find package 'xlsx'`
**解决**: 安装 `npm install xlsx ajv`
### 3. 认证问题
**问题**: API需要userId但无JWT中间件
**解决**: 添加测试模式默认使用测试用户ID
### 4. 数据库表重复
**问题**: `prisma db push`检测到public schema重复表
**解决**: 创建手动SQL脚本只创建ASL表
---
## 📝 文档产出
1.`backend/ASL-API-测试报告.md`
2.`docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/05-开发记录/2025-11-18-Week1完成报告.md`
3.`scripts/test-asl-api.ts` (API测试脚本)
4.`scripts/create-asl-tables.ts` (数据库创建脚本)
5.`scripts/create-test-user-for-asl.ts` (测试用户脚本)
---
## 🚀 下一步计划 (Week 2)
### Day 1-2: 筛选任务控制器
- [ ] 创建 `screeningController.ts`
- [ ] 实现 `startScreening` (启动筛选任务)
- [ ] 实现 `getProgress` (获取进度)
- [ ] 实现 `getResults` (获取结果)
- [ ] 集成异步任务队列 (JobFactory)
### Day 3-4: LLM筛选功能
- [ ] 测试双模型筛选服务
- [ ] 优化Prompt生成
- [ ] 实现批量筛选
- [ ] 添加进度回调
### Day 5: 冲突审核
- [ ] 实现 `reviewConflicts` API
- [ ] 批量审核功能
- [ ] 审核历史记录
---
## ✅ 验收标准
### Week 1 目标 (全部完成)
- ✅ Prisma Schema设计完成
- ✅ 4张数据库表创建
- ✅ 后端目录结构创建
- ✅ 10个API端点实现
- ✅ API测试全部通过
- ✅ 平台服务集成
### 质量标准
- ✅ 代码符合TypeScript规范
- ✅ 使用平台基础设施服务
- ✅ Schema隔离架构
- ✅ 云原生设计原则
- ✅ 错误处理完善
- ✅ 日志记录完整
---
## 🎉 总结
ASL模块Week 1开发任务**全部完成**提前4天完成原定5天的开发计划。
**核心成果**:
- ✅ 完整的数据库设计和表结构
- ✅ 10个RESTful API端点
- ✅ LLM筛选服务框架
- ✅ 100%测试通过率
- ✅ 完善的代码文档
**技术亮点**:
- Schema隔离架构
- 双模型验证策略
- 云原生设计
- 模块化结构
为后续LLM筛选功能和前端开发奠定了坚实的基础🚀