Files
AIclinicalresearch/Git提交准备清单.md
HaHafeng a666649fd4 feat(iit): harden QC pipeline consistency and release artifacts
Implement IIT quality workflow hardening across eQuery deduplication, guard metadata validation, timeline/readability improvements, and chat evidence fallbacks, then synchronize release and development documentation for deployment handoff.

Includes migration/scripts for open eQuery dedupe guards, orchestration/status semantics, report/tool readability fixes, and updated module status plus deployment checklist.

Made-with: Cursor
2026-03-08 21:54:35 +08:00

13 KiB
Raw Permalink Blame History

Git 提交准备清单

创建时间: 2025-11-15
目的: 整理未被 Git 管理的文件,准备提交到远程仓库


📊 未追踪文件统计

类别 数量 操作建议
应该提交的文件 ~350 个 需要添加
⚠️ 需要确认的文件 ~30 个 人工判断
不应提交的文件 ~20 个 忽略或删除

第一类:应该提交的文件(高优先级)

1. 配置文件2 个)

.editorconfig           ← 编辑器统一配置UTF-8
.gitattributes          ← Git 行尾配置

理由:防止中文乱码,统一团队开发规范

2. 后端核心代码(~60 个文件)

backend/src/common/            ← 通用能力层(新架构)
├── document/ExtractionClient.ts
├── llm/adapters/
│   ├── DeepSeekAdapter.ts
│   ├── QwenAdapter.ts
│   ├── LLMFactory.ts
│   └── types.ts
├── middleware/validateProject.ts
├── rag/DifyClient.ts
└── utils/jsonParser.ts

backend/src/legacy/            ← 业务代码(新架构)
├── controllers/  (8 个文件)
├── routes/       (7 个文件)
├── services/     (8 个文件)
└── templates/    (1 个文件)

理由Task 19 后端架构重构的核心成果

3. 前端新架构frontend-v2~30 个文件)

frontend-v2/                   ← 新前端架构React 19
├── package.json
├── src/framework/             ← 模块注册、权限、路由
│   ├── modules/               ← 模块注册机制
│   ├── permission/            ← 权限管理
│   └── router/                ← 路由守卫
├── src/modules/               ← 6 个业务模块占位符
│   ├── aia/
│   ├── asl/
│   ├── pkb/
│   ├── dc/
│   ├── ssa/
│   └── st/
└── src/pages/HomePage.tsx

理由Task 17 前端模块注册机制的成果

4. 前端扩展功能(~40 个文件)

frontend/src/api/
├── batchApi.ts               ← 批量处理 API
└── reviewApi.ts              ← 稿件审查 API

frontend/src/components/chat/
├── BatchMode.tsx             ← 批量处理模式
├── DeepReadMode.tsx          ← 深度阅读模式
├── FullTextMode.tsx          ← 全文模式
├── DocumentSelector.tsx      ← 文档选择器
└── ...(共 20+ 个组件)

frontend/src/components/review/
├── EditorialReview.tsx       ← 编辑规范评估
├── MethodologyReview.tsx     ← 方法学评估
└── ScoreCard.tsx

frontend/src/pages/
├── ReviewPage.tsx            ← 稿件审查页面
├── ChatPage.backup.tsx       ← 备份文件(可删除)
└── ChatPage.new.tsx          ← 备份文件(可删除)

理由Phase 2-3 的重要功能扩展

5. 文档体系(~250 个文件)

docs/00-系统总体设计/         ← 系统架构文档12 个文件)
docs/00-项目概述/             ← PRD 和白皮书6 个文件)
docs/01-平台基础层/           ← 平台层文档10 个文件)
docs/02-通用能力层/           ← 通用能力文档9 个文件)
docs/03-业务模块/             ← 业务模块文档(~150 个文件)
├── ASL-AI智能文献/           ← 新增的 ASL 模块文档 ⭐
│   ├── 01-需求分析/
│   ├── 02-技术设计/
│   │   ├── 06-质量保障与可追溯策略.md
│   │   └── 07-文献处理技术选型.md
│   ├── 03-UI设计/
│   ├── 04-开发计划/
│   └── 05-测试文档/
│       └── 03-测试数据/
│           ├── README.md
│           ├── Test Cases.xlsx
│           └── 测试案例的PICOS、纳入标准、排除标准.txt
docs/04-开发规范/             ← 开发规范6 个文件)
docs/05-部署文档/             ← 部署文档2 个文件)
docs/06-测试文档/
docs/07-运维文档/             ← 运维文档3 个文件)
docs/08-项目管理/             ← 项目管理文档14 个文件)
docs/09-架构实施/             ← 架构实施文档21 个文件)
docs/_templates/              ← 文档模板5 个文件)

理由:完整的文档体系,团队协作必需

6. 后端配置和脚本(~15 个文件)

backend/CLOSEAI-CONFIG.md
backend/check-api-config.js
backend/database-validation-simple.sql
backend/database-validation.sql
backend/prisma/migrations/20251012124747_add_batch_processing_module/
backend/prisma/migrations/20251014120128_add_review_tasks/
backend/prisma/seed.ts
backend/prompts/
├── review_editorial_system.txt
└── review_methodology_system.txt
backend/update-env-closeai.ps1
backend/初始化测试用户.bat
backend/测试用户说明.md

理由:数据库迁移、配置脚本、提示词模板

7. 项目根目录文档(~15 个文件)

START-HERE-FOR-AI.md           ← AI 上手指南
PHASE1-测试指南.md
Phase2-UI优化总结.md
Phase2-全文阅读模式-真实实现.md
Phase2-快速测试清单.md
Phase2-测试指南.md
Phase3-快速参考.md
Phase3-最终收尾-测试指南.md
README-Phase2测试.md
README-里程碑1.5完成.md
如何测试Phase2.md
智能引用功能-测试指南.md
检查测试环境.bat
稿件审查功能-最终完成报告.md
测试记录/

理由:阶段性成果总结和测试指南


⚠️ 第二类:需要确认的文件

1. 测试脚本(可选)

backend/test-batch-api.js      ← 批量处理测试
backend/test-review-api.js     ← 审查 API 测试
backend/temp-migration/        ← 临时迁移脚本

建议:如果还需要,可以提交;如果是一次性测试,可以删除

2. 前端备份文件

frontend/src/pages/ChatPage.backup.tsx
frontend/src/pages/ChatPage.new.tsx

建议删除(已有正式的 ChatPage.tsx

3. Phase 测试文档(根目录)

PHASE1-测试指南.md
Phase2-*.md
Phase3-*.md
README-Phase2测试.md

建议:考虑是否移到 docs/06-测试文档/docs/08-项目管理/,然后提交


第三类:不应提交的文件(应该被忽略)

1. 乱码文件夹(手动删除)

docs/03-涓氬姟妯″潡/       ← 已确认是 "03-业务模块" 的乱码版本

操作手动删除(您已确认)

2. 停止服务脚本(根目录)

stop-all-services.bat         ← 重复文件(已有正式版本)

建议:检查是否与其他启动脚本重复,如重复则删除


🎯 提交策略建议

方案 A一次性全部提交快速但风险较高

# 添加所有应该提交的文件
git add .editorconfig .gitattributes
git add backend/src/common/ backend/src/legacy/
git add backend/prisma/migrations/ backend/prisma/seed.ts
git add backend/prompts/ backend/CLOSEAI-CONFIG.md
git add frontend-v2/
git add frontend/src/api/batchApi.ts frontend/src/api/reviewApi.ts
git add frontend/src/components/chat/ frontend/src/components/review/
git add frontend/src/pages/ReviewPage.tsx
git add "docs/00-系统总体设计/" "docs/03-业务模块/"
git add START-HERE-FOR-AI.md

# 一次性提交
git commit -m "feat: 提交 Week 2 完整成果

- ✅ 后端架构重构legacy + common 分层)
- ✅ 前端模块注册机制frontend-v2
- ✅ 批量处理和稿件审查功能
- ✅ 完整文档体系250+ 文档)
- ✅ ASL 模块设计文档
- ✅ 编码规范配置(.editorconfig, .gitattributes
"

方案 B分批提交推荐更清晰

批次 1配置文件和编码规范

git add .editorconfig .gitattributes
git commit -m "chore: 添加编码规范配置,防止中文乱码"

批次 2后端架构重构

git add backend/src/common/ backend/src/legacy/
git add backend/prisma/schema.prisma backend/src/index.ts
git commit -m "refactor(backend): 后端架构增量演进Task 19

- 新增 common/ 通用能力层
- 新增 legacy/ 业务代码层
- 更新 index.ts 路由注册
- 保持系统正常运行"

批次 3数据库迁移和配置

git add backend/prisma/migrations/
git add backend/prisma/seed.ts
git add backend/prompts/
git add backend/CLOSEAI-CONFIG.md
git commit -m "feat(backend): 添加批量处理和稿件审查模块

- Prisma 迁移:批量处理表
- Prisma 迁移:稿件审查表
- 新增提示词模板
- CloseAI 配置文档"

批次 4前端新架构frontend-v2

git add frontend-v2/
git commit -m "feat(frontend): 新增 frontend-v2 模块化架构Task 17

- React 19 + TypeScript + Vite
- 模块注册机制
- 权限管理系统
- 路由守卫
- 6 个业务模块占位符AIA/ASL/PKB/DC/SSA/ST"

批次 5前端功能扩展

git add frontend/src/api/batchApi.ts
git add frontend/src/api/reviewApi.ts
git add frontend/src/components/chat/
git add frontend/src/components/review/
git add frontend/src/pages/ReviewPage.tsx
git add frontend/src/hooks/
git add frontend/src/types/chat.ts
git commit -m "feat(frontend): 添加批量处理和稿件审查功能

- 批量处理模式BatchMode
- 深度阅读模式DeepReadMode
- 全文模式FullTextMode
- 稿件审查页面ReviewPage
- 文档选择器组件"

批次 6文档体系

git add "docs/00-系统总体设计/"
git add "docs/00-项目概述/"
git add "docs/01-平台基础层/"
git add "docs/02-通用能力层/"
git add "docs/03-业务模块/"
git add "docs/04-开发规范/"
git add "docs/05-部署文档/"
git add "docs/06-测试文档/"
git add "docs/07-运维文档/"
git add "docs/08-项目管理/"
git add "docs/09-架构实施/"
git add "docs/_templates/"
git commit -m "docs: 完善文档体系250+ 文档)

- 系统总体设计12 个文档)
- 业务模块文档ASL/AIA/PKB/RVW 等)
- ASL 模块完整设计(质量保障策略、技术选型)
- 架构实施报告
- 项目管理文档
- 开发规范和模板"

批次 7测试和指南文档

git add START-HERE-FOR-AI.md
git add PHASE1-测试指南.md
git add Phase2*.md Phase3*.md
git add README-*.md
git add 如何测试Phase2.md
git add 智能引用功能-测试指南.md
git add 检查测试环境.bat
git add 稿件审查功能-最终完成报告.md
git add 测试记录/
git commit -m "docs: 添加测试指南和阶段性总结文档

- AI 快速上手指南
- Phase 1-3 测试指南和总结
- 功能测试文档
- 检查脚本"

批次 8清理和最终检查

# 删除备份文件
git rm frontend/src/pages/ChatPage.backup.tsx
git rm frontend/src/pages/ChatPage.new.tsx

# 删除临时脚本(如果不需要)
git rm backend/test-batch-api.js
git rm backend/test-review-api.js
git rm -r backend/temp-migration/

git commit -m "chore: 清理备份文件和临时测试脚本"

📋 执行前检查清单

在提交前,请确认:

必做项

  • 删除乱码文件夹docs/03-涓氬姟妯″潡/
  • 确认 .env 文件未被追踪(包含敏感信息)
  • 确认 node_modules/ 未被追踪
  • 确认 venv/ 未被追踪
  • 后端服务正常运行
  • 前端服务正常运行
  • 数据库连接正常

⚠️ 建议项

  • 删除前端备份文件:ChatPage.backup.tsx, ChatPage.new.tsx
  • 整理根目录测试文档:考虑移到 docs/ 目录
  • 检查是否有个人配置文件(如 .vscode/settings.json
  • 运行一次完整测试

🚀 推荐执行步骤

步骤 1清理不需要的文件

# 1. 手动删除乱码文件夹
删除D:\MyCursor\AIclinicalresearch\docs\03-涓氬姟妯″潡

# 2. 删除前端备份文件(可选)
cd D:\MyCursor\AIclinicalresearch\frontend\src\pages
del ChatPage.backup.tsx
del ChatPage.new.tsx

# 3. 删除临时测试脚本(可选)
cd D:\MyCursor\AIclinicalresearch\backend
del test-batch-api.js
del test-review-api.js

步骤 2验证系统正常运行

# 启动后端
cd backend
npm run dev

# 启动前端(新窗口)
cd frontend-v2
npm run dev

# 测试几个核心功能

步骤 3分批提交按方案 B 执行)

# 按照上面"方案 B"的 7 个批次依次执行
# 每个批次提交后,检查 git log 确认无误

步骤 4推送到远程仓库

# 查看所有提交
git log --oneline -10

# 推送到远程
git push origin master

📊 预期结果

提交完成后,远程仓库将包含:

项目 数量 状态
后端代码 ~60 个文件 新架构
前端代码v2 ~30 个文件 模块化
前端扩展功能 ~40 个文件 批量/审查
文档 ~250 个文件 完整体系
配置文件 2 个 编码规范
数据库迁移 2 个 新表结构
测试数据 2 个 ASL 测试

总计:约 400 个文件


⚠️ 注意事项

  1. 不要一次性 git add .

    • 可能会误提交 .envnode_modules/ 等敏感/大文件
  2. 分批提交的好处

    • 提交历史清晰
    • 易于回滚
    • 代码审查方便
    • 便于追踪问题
  3. 推送前确认

    • 检查是否有敏感信息API Key、密码
    • 确认 .gitignore 已生效
    • 运行一次完整测试

准备好后请告诉我您想使用哪种方案A 或 B我来帮您执行 🚀