feat(aia): Implement Protocol Agent MVP with reusable Agent framework

Sprint 1-3 Completed (Backend + Frontend):

Backend (Sprint 1-2):
- Implement 5-layer Agent framework (Query->Planner->Executor->Tools->Reflection)
- Create agent_schema with 6 tables (agent_definitions, stages, prompts, sessions, traces, reflexion_rules)
- Create protocol_schema with 2 tables (protocol_contexts, protocol_generations)
- Implement Protocol Agent core services (Orchestrator, ContextService, PromptBuilder)
- Integrate LLM service adapter (DeepSeek/Qwen/GPT-5/Claude)
- 6 API endpoints with full authentication
- 10/10 API tests passed

Frontend (Sprint 3):
- Add Protocol Agent entry in AgentHub (indigo theme card)
- Implement ProtocolAgentPage with 3-column layout
- Collapsible sidebar (Gemini style, 48px <-> 280px)
- StatePanel with 5 stage cards (scientific_question, pico, study_design, sample_size, endpoints)
- ChatArea with sync button and action cards integration
- 100% prototype design restoration (608 lines CSS)
- Detailed endpoints structure: baseline, exposure, outcomes, confounders

Features:
- 5-stage dialogue flow for research protocol design
- Conversation-driven interaction with sync-to-protocol button
- Real-time context state management
- One-click protocol generation button (UI ready, backend pending)

Database:
- agent_schema: 6 tables for reusable Agent framework
- protocol_schema: 2 tables for Protocol Agent
- Seed data: 1 agent + 5 stages + 9 prompts + 4 reflexion rules

Code Stats:
- Backend: 13 files, 4338 lines
- Frontend: 14 files, 2071 lines
- Total: 27 files, 6409 lines

Status: MVP core functionality completed, pending frontend-backend integration testing

Next: Sprint 4 - One-click protocol generation + Word export

docs/03-业务模块/AIA-AI智能问答/04-开发计划/04-Protocol_Agent开发计划/README.md

@@ -0,0 +1,79 @@
+# Protocol Agent 开发计划文档
+
+> 创建日期：2026-01-24  
+> 状态：待开发
+
+---
+
+## 📚 文档目录
+
+| 序号 | 文档 | 说明 |
+|:----:|------|------|
+| 00 | [开发计划总览](./00-开发计划总览.md) | 项目背景、决策记录、核心架构概览 |
+| 01 | [架构设计](./01-架构设计.md) | 五层Agent架构、各层详细设计、执行流程 |
+| 02 | [数据库设计](./02-数据库设计.md) | 完整Prisma Schema、ER图、迁移计划 |
+| 03 | [代码结构设计](./03-代码结构设计.md) | 目录结构、核心类型、API设计、前端组件 |
+| 04 | [分阶段实施计划](./04-分阶段实施计划.md) | Sprint划分、任务列表、风险管理、验收标准 |
+
+---
+
+## 🎯 项目概述
+
+Protocol Agent（研究方案制定助手）是AIA模块的第13个智能体入口，通过多轮对话引导用户完成临床研究方案的核心要素制定。
+
+### 核心架构
+
+```
+Query → Planner → Executor → Tools → Reflection
+(意图识别) → (规划) → (执行) → (工具) → (反思)
+```
+
+### 开发周期
+
+- **Phase 1**: MVP完整功能 (4周) - 包含一键生成研究方案
+- **Phase 2**: 知识增强 (3周)  
+- **Phase 3**: 平台化 (2周)
+
+**总周期：9周**
+
+---
+
+## ✅ 已确认决策
+
+| 决策项 | 选择 |
+|--------|------|
+| 入口方式 | B - Protocol Agent作为第13个入口 |
+| 状态流转 | B - 用户按钮确认触发 |
+| 数据提取 | C - 异步提取+LLM结构化 |
+| Action Card | B - 规则触发 |
+| Reflexion | B - Prompt-based |
+
+---
+
+## 📋 快速导航
+
+### 需要了解业务需求？
+→ 查看 [Protocol Agent PRD](../00-系统设计/Protocol_Agent_PRD_v1.0.md)
+
+### 需要了解技术架构？
+→ 查看 [01-架构设计](./01-架构设计.md)
+
+### 需要了解数据库表结构？
+→ 查看 [02-数据库设计](./02-数据库设计.md)
+
+### 需要开始编码？
+→ 查看 [03-代码结构设计](./03-代码结构设计.md)
+
+### 需要了解任务安排？
+→ 查看 [04-分阶段实施计划](./04-分阶段实施计划.md)
+
+---
+
+## 📎 相关文档
+
+- [AIA模块当前状态](../00-模块当前状态与开发指南.md)
+- [Protocol Agent PRD v1.0](../00-系统设计/Protocol_Agent_PRD_v1.0.md)
+- [MVP简化指南](../00-系统设计/Protocol_Agent_Development_Simplification_Guide.md)
+- [架构设计V3](../02-技术设计/Protocol_Agent_Architecture_Design_V3.md)
+- [技术实现V3](../02-技术设计/Protocol_Agent_Technical_Implementation_V3.md)
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