feat(aia): Implement Protocol Agent MVP with reusable Agent framework

Sprint 1-3 Completed (Backend + Frontend):

Backend (Sprint 1-2):
- Implement 5-layer Agent framework (Query->Planner->Executor->Tools->Reflection)
- Create agent_schema with 6 tables (agent_definitions, stages, prompts, sessions, traces, reflexion_rules)
- Create protocol_schema with 2 tables (protocol_contexts, protocol_generations)
- Implement Protocol Agent core services (Orchestrator, ContextService, PromptBuilder)
- Integrate LLM service adapter (DeepSeek/Qwen/GPT-5/Claude)
- 6 API endpoints with full authentication
- 10/10 API tests passed

Frontend (Sprint 3):
- Add Protocol Agent entry in AgentHub (indigo theme card)
- Implement ProtocolAgentPage with 3-column layout
- Collapsible sidebar (Gemini style, 48px <-> 280px)
- StatePanel with 5 stage cards (scientific_question, pico, study_design, sample_size, endpoints)
- ChatArea with sync button and action cards integration
- 100% prototype design restoration (608 lines CSS)
- Detailed endpoints structure: baseline, exposure, outcomes, confounders

Features:
- 5-stage dialogue flow for research protocol design
- Conversation-driven interaction with sync-to-protocol button
- Real-time context state management
- One-click protocol generation button (UI ready, backend pending)

Database:
- agent_schema: 6 tables for reusable Agent framework
- protocol_schema: 2 tables for Protocol Agent
- Seed data: 1 agent + 5 stages + 9 prompts + 4 reflexion rules

Code Stats:
- Backend: 13 files, 4338 lines
- Frontend: 14 files, 2071 lines
- Total: 27 files, 6409 lines

Status: MVP core functionality completed, pending frontend-backend integration testing

Next: Sprint 4 - One-click protocol generation + Word export
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2026-01-24 17:29:24 +08:00
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@@ -0,0 +1,183 @@
# Protocol Agent 开发计划总览
> 版本v1.0
> 创建日期2026-01-24
> 状态:待开发
---
## 一、项目背景
Protocol Agent研究方案制定助手是AIA模块的第13个智能体入口旨在通过多轮对话引导用户完成临床研究方案的核心要素制定。
### 1.1 核心价值
- **统一入口**整合样本量计算、PICO提取等7个工具的能力
- **长期记忆**ProtocolContext持久化存储研究方案要素
- **专业引导**:基于临床研究方法学的思维链引导
- **平台基础**为后续统计分析Agent、数据清洗Agent等提供可复用框架
### 1.2 设计哲学
```
Code as Skeleton, Data as Brain
代码是骨架(确定性流程),数据是大脑(灵活配置)
```
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## 二、决策确认记录
| 决策项 | 选择 | 说明 |
|--------|------|------|
| **入口方式** | B - 第13个入口 | Protocol Agent作为独立入口12个现有智能体保留 |
| **状态流转** | **对话驱动** | 用户在对话中说"继续"或点击"同步"按钮,自然推进阶段 |
| **数据同步** | **内嵌同步按钮** | AI整理好数据后在回复中显示"同步到方案"按钮 |
| **Action Card** | B - 规则触发 | 基于阶段和条件规则触发非LLM决定 |
| **Reflexion** | B - Prompt-based | 使用Prompt模板进行质量检查P2优先级 |
| **MVP范围** | 渐进式演进 | Phase 1聚焦核心流程后续迭代增强 |
| **阶段数量** | **5个阶段** | 科学问题→PICO→研究设计→样本量→观察指标 |
| **完成功能** | **一键生成** | 5阶段完成后支持一键生成研究方案并下载Word |
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## 三、文档索引
本开发计划包含以下文档:
| 序号 | 文档名称 | 内容说明 |
|------|----------|----------|
| 00 | 开发计划总览.md | 本文档,项目概述与决策记录 |
| 01 | 架构设计.md | 五层Agent架构、组件职责、执行流程 |
| 02 | 数据库设计.md | 完整Prisma Schema定义 |
| 03 | 代码结构设计.md | 目录结构、核心接口、类型定义 |
| 04 | 分阶段实施计划.md | Sprint划分、任务列表、里程碑 |
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## 四、核心架构概览
### 4.1 核心交互模式:对话驱动
```
┌─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┐
│ 对话驱动交互模式 │
├─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┤
│ │
│ 【用户与AI对话】 │
│ ↓ │
│ 【AI收集信息整理数据】 │
│ ↓ │
│ 【AI回复中显示 "✅ 同步到方案" 按钮】 │
│ ↓ │
│ 【用户点击同步】→ 数据写入Context → State Panel更新 │
│ ↓ │
│ 【AI询问继续下一阶段吗】 │
│ ↓ │
│ 【用户说"继续"】→ AI识别意图 → 自动进入下一阶段 │
│ │
└─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
```
### 4.2 五层架构
```
┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│ 1. Query Layer 意图识别、实体提取、上下文消歧 │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│ 2. Planner Layer 状态机、策略选择、任务分解 │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│ 3. Executor Layer LLM调用、工具调用、响应构建 │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│ 4. Tools Layer 内部工具、外部工具、RAG、Deep Link │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│ 5. Reflection Layer 质量检查、一致性校验、恢复处理 │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘
```
### 4.3 三层职责划分
| 层次 | 职责 | 实现方式 |
|------|------|----------|
| **代码层** | 状态流转、数据存储、API调用、错误处理 | TypeScript代码 |
| **Prompt层** | 意图识别、对话生成、信息提取、质量检查 | Prompt模板 + LLM |
| **工具层** | Deep Link、外部API、知识库检索 | 工具注册 + 调用 |
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## 五、阶段规划
### Phase 1MVP完整功能4周
**目标**完成Agent框架 + 5阶段对话 + 一键生成研究方案
- ✅ 通用Agent框架搭建
- ✅ 5个核心阶段科学问题→PICO→研究设计→样本量→观察指标
- ✅ 对话驱动 + 同步按钮交互模式
- ✅ ProtocolContext持久化
- ✅ State Panel前端展示
-**一键生成研究方案**
-**Word文档导出**
### Phase 2知识增强3周
**目标**:集成专家知识库,提升专业深度
- 🔲 EKB知识库建设
- 🔲 RAG检索集成
- 🔲 Function Calling工具调用
- 🔲 高级Reflexion质量检查
### Phase 3平台化2周
**目标**配置化、可观测性、多Agent支持
- 🔲 后台配置管理界面
- 🔲 Prompt在线调试
- 🔲 完整Trace分析
- 🔲 统计分析Agent接入准备
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## 六、技术栈
| 类别 | 技术选型 | 说明 |
|------|----------|------|
| **后端框架** | Fastify v4 + TypeScript | 现有架构 |
| **数据库** | PostgreSQL 15 + Prisma 6 | 现有架构 |
| **LLM** | DeepSeek-V3 (主) / GPT-4 (备) | 通过LLM Gateway |
| **前端框架** | React 19 + Ant Design 6 | 现有架构 |
| **状态管理** | Zustand | 轻量级状态管理 |
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## 七、风险与缓解
| 风险 | 影响 | 缓解措施 |
|------|------|----------|
| LLM幻觉 | 生成不准确的医学信息 | Reflexion检查 + 知识库约束 |
| 上下文丢失 | 长对话信息遗忘 | ProtocolContext持久化 + 摘要策略 |
| 提取不准确 | Context数据错误 | 置信度标记 + 用户确认 |
| Prompt调优耗时 | 延迟交付 | 预留充足调优时间 |
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## 八、成功标准
### Phase 1 交付标准
1. **功能完整性**用户可完成5阶段研究方案要素制定
2. **数据准确性**Context提取准确率 > 85%
3. **用户体验**:单阶段平均对话轮数 < 5轮
4. **系统稳定性**API响应成功率 > 99%
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## 九、相关文档
- [Protocol Agent PRD v1.0](../00-系统设计/Protocol_Agent_PRD_v1.0.md)
- [MVP简化指南](../00-系统设计/Protocol_Agent_Development_Simplification_Guide.md)
- [架构设计V3](../02-技术设计/Protocol_Agent_Architecture_Design_V3.md)
- [技术实现V3](../02-技术设计/Protocol_Agent_Technical_Implementation_V3.md)
- [后端配置设计](../02-技术设计/Protocol_Agent_Backend_Config_Design.md)