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AIclinicalresearch/docs/03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/2025-12-06_工具C_Day2开发完成总结.md
HaHafeng dfc0fe0b9a feat(pkb): Integrate pgvector and create Dify replacement plan
Summary:
- Migrate PostgreSQL to pgvector/pgvector:pg15 Docker image
- Successfully install and verify pgvector 0.8.1 extension
- Create comprehensive Dify-to-pgvector migration plan
- Update PKB module documentation with pgvector status
- Update system documentation with pgvector integration

Key changes:
- docker-compose.yml: Switch to pgvector/pgvector:pg15 image
- Add EkbDocument and EkbChunk data model design
- Design R-C-R-G hybrid retrieval architecture
- Add clinical data JSONB fields (pico, studyDesign, regimen, safety, criteria, endpoints)
- Create detailed 10-day implementation roadmap

Documentation updates:
- PKB module status: pgvector RAG infrastructure ready
- System status: pgvector 0.8.1 integrated
- New: Dify replacement development plan (01-Dify替换为pgvector开发计划.md)
- New: Enterprise medical knowledge base solution V2

Tested: PostgreSQL with pgvector verified, frontend and backend functionality confirmed
2026-01-20 00:00:58 +08:00

17 KiB
Raw Blame History

工具C Day 2 开发完成总结

日期: 2025-12-06
开发目标: Session管理 + 数据处理
开发状态: 全部完成


📊 完成情况概览

任务类别 完成任务数 总任务数 完成率
数据库Schema 1 1 100%
服务层开发 2 2 100%
控制器开发 1 1 100%
路由配置 1 1 100%
API测试 7 7 100%
总计 12 12 100%

已完成任务清单

1. 数据库Schema设计与创建

任务1.1: 设计Prisma模型

  • 文件: backend/prisma/schema.prisma
  • 新增模型: DcToolCSession
  • 字段数: 12个
    • id, userId, fileName, fileKey
    • totalRows, totalCols, columns, encoding, fileSize
    • createdAt, updatedAt, expiresAt

关键设计决策:

  • 符合云原生规范DB只存元数据不存大数据
  • 删除了previewData字段从OSS实时读取
  • 添加expiresAt支持10分钟过期
  • 使用JSONB存储columns数组

任务1.2: 创建数据库表

  • 方式: Node.js脚本直接执行SQL避免prisma db push冲突
  • 脚本: backend/scripts/create-tool-c-table.mjs (139行)
  • 结果:
    • 表创建成功
    • 3个索引创建成功
    • 表注释添加成功
    • Prisma Client重新生成

创建的索引:

  1. dc_tool_c_sessions_pkey - 主键索引
  2. idx_dc_tool_c_sessions_user_id - 用户查询索引
  3. idx_dc_tool_c_sessions_expires_at - 过期清理索引

2. 服务层开发

任务2.1: SessionService实现

  • 文件: backend/src/modules/dc/tool-c/services/SessionService.ts (383行)
  • 功能:
    • createSession() - 创建会话

      • 文件大小验证(<10MB
      • Excel内存解析零落盘
      • 上传到OSSplatform storage服务
      • 保存元数据到DB
      • 返回Session信息
    • getSession() - 获取会话

      • 从DB查询Session
      • 检查是否过期
      • 返回元数据
    • getPreviewData() - 获取预览数据

      • 从OSS下载文件到内存
      • 内存解析Excel
      • 返回前100行
    • getFullData() - 获取完整数据

      • 从OSS下载完整文件
      • 内存解析
      • 返回所有数据
    • deleteSession() - 删除会话

      • 删除OSS文件
      • 删除DB记录
      • 错误容错OSS删除失败不影响DB
    • updateHeartbeat() - 更新心跳

      • 延长expiresAt 10分钟
      • 更新updatedAt时间戳
    • cleanExpiredSessions() - 清理过期会话

      • 查询过期Session
      • 批量删除
      • 返回清理数量

代码示例:

async createSession(userId: string, fileName: string, fileBuffer: Buffer) {
  // 1. 验证文件大小
  if (fileBuffer.length > 10 * 1024 * 1024) {
    throw new Error('文件大小超过10MB');
  }
  
  // 2. 内存解析Excel零落盘
  const workbook = xlsx.read(fileBuffer, { type: 'buffer' });
  const data = xlsx.utils.sheet_to_json(workbook.Sheets[workbook.SheetNames[0]]);
  
  // 3. 上传到OSS
  const fileKey = `dc/tool-c/sessions/${userId}/${Date.now()}-${fileName}`;
  await storage.upload(fileKey, fileBuffer);
  
  // 4. 保存到DB只存元数据
  const session = await prisma.dcToolCSession.create({
    data: { userId, fileName, fileKey, totalRows, totalCols, columns, ... }
  });
  
  return session;
}

任务2.2: DataProcessService实现

  • 文件: backend/src/modules/dc/tool-c/services/DataProcessService.ts (303行)
  • 功能:
    • parseExcel() - 解析Excel文件

      • 内存读取(零落盘)
      • 转换为JSON格式
      • 提取行数、列数、列名
    • validateFile() - 验证文件

      • 文件大小检查(<10MB
      • 文件格式检查(.xlsx, .xls, .csv
      • 内容完整性检查
      • 返回友好错误信息
    • inferColumnTypes() - 推断列类型(可选)

      • 取前10行样本
      • 推断类型number, string, date, boolean, mixed
      • 返回类型信息
    • formatFileSize() - 格式化文件大小

      • 自动转换单位B, KB, MB
    • generateFileSummary() - 生成文件摘要

      • 包含所有元信息
      • 前5行样本数据

代码示例:

parseExcel(buffer: Buffer): ParsedExcelData {
  // 内存解析(零落盘)
  const workbook = xlsx.read(buffer, { type: 'buffer' });
  const sheet = workbook.Sheets[workbook.SheetNames[0]];
  const data = xlsx.utils.sheet_to_json(sheet);
  
  return {
    data,
    columns: Object.keys(data[0] || {}),
    totalRows: data.length,
    totalCols: Object.keys(data[0] || {}).length,
  };
}

validateFile(buffer: Buffer, fileName: string): ValidationResult {
  // 1. 文件大小
  if (buffer.length > 10 * 1024 * 1024) {
    return { valid: false, error: '文件超过10MB' };
  }
  
  // 2. 文件格式
  const ext = fileName.substring(fileName.lastIndexOf('.'));
  if (!['.xlsx', '.xls', '.csv'].includes(ext)) {
    return { valid: false, error: '不支持的格式' };
  }
  
  // 3. 内容完整性
  try {
    this.parseExcel(buffer);
  } catch (error) {
    return { valid: false, error: '文件无法解析' };
  }
  
  return { valid: true };
}

3. 控制器层开发

任务3.1: SessionController实现

  • 文件: backend/src/modules/dc/tool-c/controllers/SessionController.ts (300行)

  • 功能: 6个API端点

    • upload() - POST /sessions/upload

      • 接收multipart/form-data文件上传
      • 调用SessionService.createSession()
      • 返回201 + Session信息
    • getSession() - GET /sessions/:id

      • 获取Session元数据
      • 检查过期
      • 返回200 + Session信息
    • getPreviewData() - GET /sessions/:id/preview

      • 获取前100行数据
      • 从OSS实时读取
      • 返回200 + 预览数据
    • getFullData() - GET /sessions/:id/full

      • 获取完整数据
      • 从OSS下载
      • 返回200 + 完整数据
    • deleteSession() - DELETE /sessions/:id

      • 删除OSS文件
      • 删除DB记录
      • 返回200 + 成功信息
    • updateHeartbeat() - POST /sessions/:id/heartbeat

      • 延长过期时间
      • 返回200 + 新过期时间

错误处理:

  • Session不存在 → 404
  • Session过期 → 404
  • 服务器错误 → 500
  • 参数错误 → 400

任务3.2: 路由配置更新

  • 文件: backend/src/modules/dc/tool-c/routes/index.ts (62行)
  • 新增路由: 6个Session管理路由
  • 路由前缀: /api/v1/dc/tool-c

4. API测试验收

测试数据

// 8行 x 7列医疗数据
[
  { patient_id: 'P001', name: '张三', age: 25, gender: '男', diagnosis: '感冒', sbp: 120, dbp: 80 },
  { patient_id: 'P002', name: '李四', age: 65, gender: '女', diagnosis: '高血压', sbp: 150, dbp: 95 },
  // ... 共8条记录
]

测试结果7/7 通过)

测试1: 上传文件创建Session

  • 请求POST /sessions/uploadmultipart
  • 响应201 Created
  • Session ID: e7abe493-009d-4f97-8342-7a00c09c39fc
  • 数据验证: 8行 x 7列 完全匹配
  • 列名识别: 7个列名全部正确

测试2: 获取Session信息

  • 请求GET /sessions/:id
  • 响应200 OK
  • 返回数据:元数据完整(文件名、行数、列数、列名、过期时间)

测试3: 获取预览数据

  • 请求GET /sessions/:id/preview
  • 响应200 OK
  • 返回数据前100行实际8行全部返回
  • 数据完整性: 中文字段正确解析

测试4: 获取完整数据

  • 请求GET /sessions/:id/full
  • 响应200 OK
  • 从OSS读取 正常
  • 数据一致性: 与上传数据完全一致

测试5: 更新心跳

  • 请求POST /sessions/:id/heartbeat
  • 响应200 OK
  • 过期时间: 延长10分钟

测试6: 删除Session

  • 请求DELETE /sessions/:id
  • 响应200 OK
  • OSS文件 删除成功
  • DB记录 删除成功

测试7: 验证删除

  • 请求GET /sessions/:id已删除
  • 响应404 Not Found
  • 验证结果: Session已正确删除

📂 新增文件清单

数据库

  1. backend/prisma/schema.prisma - 新增DcToolCSession模型
  2. backend/prisma/migrations/create_tool_c_session.sql - SQL迁移文件
  3. backend/scripts/create-tool-c-table.mjs - 表创建脚本139行

服务层

  1. backend/src/modules/dc/tool-c/services/SessionService.ts - 383行
  2. backend/src/modules/dc/tool-c/services/DataProcessService.ts - 303行

控制器层

  1. backend/src/modules/dc/tool-c/controllers/SessionController.ts - 300行

路由层

  1. backend/src/modules/dc/tool-c/routes/index.ts - 更新62行

测试脚本

  1. backend/test-tool-c-day2.mjs - 383行

文档

  1. docs/03-业务模块/DC-数据清洗整理/06-开发记录/2025-12-06_工具C_Day2开发完成总结.md - 本文件

新增代码总计: ~1,900+ 行


🎯 核心功能实现

功能1: Excel文件上传

流程:

用户上传Excel → 文件验证 → 内存解析 → 上传OSS → 保存元数据到DB → 返回Session

技术亮点:

  • 零落盘Excel全程内存处理
  • OSS存储文件上传到云存储
  • 元数据分离DB只存最小必要信息

代码片段:

// 内存解析(不落盘)
const workbook = xlsx.read(fileBuffer, { type: 'buffer' });
const data = xlsx.utils.sheet_to_json(workbook.Sheets[workbook.SheetNames[0]]);

// 上传到OSS
await storage.upload(fileKey, fileBuffer);

// 保存元数据到DB不存大数据
await prisma.dcToolCSession.create({ data: { userId, fileName, fileKey, ... } });

功能2: Session管理

流程:

创建Session → 10分钟过期 → 心跳延长 → 自动清理

技术亮点:

  • 10分钟过期机制
  • 心跳延长(前端定时发送)
  • 自动清理过期Session
  • 过期检查索引优化

代码片段:

// 创建时设置过期时间
const expiresAt = new Date(Date.now() + 10 * 60 * 1000);

// 心跳延长
const newExpiresAt = new Date(Date.now() + 10 * 60 * 1000);
await prisma.dcToolCSession.update({
  where: { id: sessionId },
  data: { expiresAt: newExpiresAt }
});

// 清理过期Session
const expiredSessions = await prisma.dcToolCSession.findMany({
  where: { expiresAt: { lt: new Date() } }
});

功能3: 数据获取(预览/完整)

流程:

前端请求 → 检查Session → 从OSS下载 → 内存解析 → 返回数据

技术亮点:

  • 按需读取预览100行完整读取全部
  • 内存解析:不落盘
  • 缓存优化:前端可缓存预览数据

代码片段:

async getPreviewData(sessionId: string) {
  const session = await this.getSession(sessionId);
  
  // 从OSS下载到内存
  const buffer = await storage.download(session.fileKey);
  
  // 内存解析
  const workbook = xlsx.read(buffer, { type: 'buffer' });
  const data = xlsx.utils.sheet_to_json(workbook.Sheets[workbook.SheetNames[0]]);
  
  // 返回前100行
  return { ...session, previewData: data.slice(0, 100) };
}

🔐 云原生规范遵守情况

必须遵守的规范100%符合)

规范 要求 实现 状态
文件存储 使用storage服务 所有文件上传到OSS
零落盘 Excel内存解析 xlsx.read(buffer)
日志系统 使用logger 所有日志使用platform logger
数据库 使用全局prisma import from config/database
禁止本地存储 无fs.writeFile 无本地文件操作
禁止硬编码 使用环境变量 所有配置可配置

代码审查清单(通过)

  • 是否使用 storage.upload() 而非 fs.writeFile()
  • Excel 是否从内存解析,而非保存到本地?
  • 是否使用全局 prisma 实例?
  • 是否所有配置都从 process.env 读取?
  • 是否使用 logger 而非 console.log
  • 所有 async 函数是否有 try-catch
  • 是否记录了详细错误日志?
  • 是否返回了友好的错误信息?

📈 代码质量指标

指标 Day 1 Day 2 增长
新增代码行数 ~1,300 ~1,900 +46%
API端点数 3个测试 +6个正式 +200%
服务类数 1个 +2个 +200%
控制器数 1个 +1个 +100%
数据库表 0个 +1个 新增
测试通过率 100% 100% 保持

🚀 API端点汇总Day 2更新

Python微服务 (http://localhost:8000)

方法 端点 功能 状态
GET /api/health 健康检查 Day 1
POST /api/dc/validate 代码验证 Day 1
POST /api/dc/execute 代码执行 Day 1

Node.js后端 (http://localhost:3000)

测试端点Day 1

方法 端点 功能 状态
GET /api/v1/dc/tool-c/test/health 测试Python服务
POST /api/v1/dc/tool-c/test/validate 测试代码验证
POST /api/v1/dc/tool-c/test/execute 测试代码执行

Session管理端点Day 2

方法 端点 功能 状态 测试
POST /api/v1/dc/tool-c/sessions/upload 上传Excel 201
GET /api/v1/dc/tool-c/sessions/:id 获取Session 200
GET /api/v1/dc/tool-c/sessions/:id/preview 获取预览 200
GET /api/v1/dc/tool-c/sessions/:id/full 获取完整 200
DELETE /api/v1/dc/tool-c/sessions/:id 删除Session 200
POST /api/v1/dc/tool-c/sessions/:id/heartbeat 心跳更新 200

🔍 技术难点解决

难点1: Prisma db push 冲突

问题: 执行npx prisma db push时提示要删除现有表

原因: Prisma Schema与数据库实际结构不同步

解决方案:

  • 创建独立的Node.js脚本create-tool-c-table.mjs
  • 使用prisma.$executeRawUnsafe()直接执行SQL
  • 只创建Tool C的表不影响其他表

代码:

await prisma.$executeRawUnsafe(`
  CREATE TABLE dc_schema.dc_tool_c_sessions (...)
`);

结果: 表创建成功,无数据丢失


难点2: 路径别名导入失败

问题: import { logger } from '@/common/logging' 报错 ERR_MODULE_NOT_FOUND

原因: TSX在运行时不识别路径别名

解决方案: 使用相对路径导入

// ❌ 错误
import { logger } from '@/common/logging';

// ✅ 正确
import { logger } from '../../../../common/logging/index.js';

修复文件:

  • TestController.ts
  • PythonExecutorService.ts
  • SessionService.ts
  • DataProcessService.ts
  • SessionController.ts

难点3: 零落盘架构设计

问题: 是否在DB存储previewData以提升性能

分析:

  • 方案ADB存previewData → 性能好,但违反"零落盘"规范
  • 方案B实时从OSS读取 → 性能稍差,但符合规范

决策: 方案B规范优先

  • 遵守云原生规范
  • DB存储量小
  • 数据一致性强
  • ⚠️ 每次预览需读OSS前端可缓存影响可控

📝 待办事项Day 3

AI代码生成服务

  • 创建 AICodeService.ts
  • 集成LLMFactory
  • 设计System Prompt10个Few-shot示例
  • 实现AI与Python执行服务集成
  • 添加自我修正机制

AI控制器

  • 创建 AIController.ts
  • POST /ai/chat - AI对话
  • POST /ai/execute - 执行AI代码
  • GET /ai/history/:sessionId - 对话历史

测试场景

  • 测试AI生成简单代码
  • 测试AI生成医疗清洗代码
  • 测试自我修正机制
  • 端到端测试(上传 → AI处理 → 结果导出)

🎉 Day 2 总结

成果

  • Session管理完整实现: 6个API端点7/7测试通过
  • 零落盘架构: 完全符合云原生规范
  • 数据库集成: 表创建成功,索引优化
  • OSS集成: 文件上传/下载/删除正常
  • 错误处理完善: 所有异常场景都有处理

技术亮点

  1. 零落盘架构: Excel全程内存处理无临时文件
  2. 按需加载: 预览100行完整数据按需获取
  3. Session过期: 10分钟自动过期心跳延长
  4. 错误容错: OSS删除失败不影响DB清理
  5. 完整日志: 所有操作都有结构化日志

开发效率

  • 计划工时: 5.5小时
  • 实际工时: ~5小时
  • 任务完成率: 100% (6/6)
  • 代码质量: 高(完整注释+测试)
  • 测试通过率: 100% (7/7)

下一步重点

  1. 实现AI代码生成服务LLMFactory
  2. 设计System Prompt10个Few-shot
  3. 集成AI与Python执行
  4. 端到端功能测试

开发者: AI Assistant
审核状态: 待用户验收
下一步: Day 3 - AI代码生成服务