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通用能力层清单

文档版本： v2.4
创建日期： 2026-01-14
最后更新： 2026-01-21
文档目的： 列出所有通用能力模块，提供快速调用指南 本次更新： RAG 引擎完整实现（替代 Dify）+ 文档处理引擎增强

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📚 概述

通用能力层是平台的核心基础设施，提供可复用的技术能力，避免业务模块重复开发。

设计原则

1. 高复用性 - 一次开发，多处使用
2. 标准化 - 统一接口，降低学习成本
3. 解耦合 - 业务模块无需关心底层实现
4. 云原生 - 支持多环境部署（本地/阿里云）

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🎯 能力清单

后端通用能力

能力	路径	状态	说明
存储服务	common/storage/	✅	文件存储抽象层（本地/OSS）
日志服务	common/logging/	✅	结构化日志（Pino）
缓存服务	common/cache/	✅	缓存抽象层（内存/Redis/Postgres）
异步任务	common/jobs/	✅	队列服务（Memory/PgBoss）
LLM网关	common/llm/	✅	统一LLM适配器（5个模型）
流式响应	common/streaming/	✅ 🆕	OpenAI Compatible流式输出
🎉RAG引擎	common/rag/	✅ 🆕	完整实现！pgvector+DeepSeek+Rerank
文档处理	extraction_service/	✅ 🆕	pymupdf4llm PDF→Markdown
认证授权	common/auth/	✅	JWT认证 + 权限控制
Prompt管理	common/prompt/	✅	动态Prompt配置
🆕R统计引擎	r-statistics-service/	✅	Docker化R统计服务（plumber）

前端通用能力

能力	路径	状态	说明
Chat组件	shared/components/Chat/	✅ 🆕	AI对话通用组件（V2）
FileCard组件	@ant-design/x	✅ 🆕	文件卡片展示（附件）
认证API	framework/auth/api.ts	✅	Token管理
API Client	common/api/axios.ts	✅	带认证的axios实例
通用布局	shared/layouts/	✅	主布局、侧边栏

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📦 详细文档

1. 流式响应服务（🆕 重点推荐）

路径： backend/src/common/streaming/

功能： 提供 OpenAI Compatible 格式的流式响应，支持深度思考

使用方式：

import { createStreamingService } from '../../../common/streaming';

// 在控制器中
async function handler(request, reply) {
  const service = createStreamingService(reply, {
    model: 'deepseek-v3',
    temperature: 0.7,
    maxTokens: 4096,
    enableDeepThinking: true,
    userId: 'xxx',
    conversationId: 'xxx',
  });

  const result = await service.streamGenerate(messages, {
    onContent: (delta) => console.log('内容:', delta),
    onThinking: (delta) => console.log('思考:', delta),
    onComplete: (content, thinking) => {
      // 保存到数据库
    },
  });
}

输出格式：

data: {"id":"chatcmpl-xxx","choices":[{"delta":{"content":"你好"}}]}\n\n
data: {"id":"chatcmpl-xxx","choices":[{"delta":{"reasoning_content":"让我想想"}}]}\n\n
data: [DONE]\n\n

已使用模块：

• ✅ AIA - AI智能问答
• 🔜 PKB - 个人知识库（待迁移）

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2. Prompt 管理服务

路径： backend/src/common/prompt/

功能： 动态 Prompt 配置、灰度预览、版本管理

核心特性：

• 灰度预览（DRAFT/ACTIVE 分发）
• Handlebars 模板渲染
• 变量提取与校验
• 三级容灾（数据库→缓存→兜底）

使用方式：

import { getPromptService } from '../../../common/prompt';
import { prisma } from '../../../config/database';

// 获取 Prompt（支持灰度预览）
const promptService = getPromptService(prisma);
const { content, isDraft, version } = await promptService.get(
  'AIA_SCIENTIFIC_QUESTION',  // Prompt Code
  {},                          // 变量（如 { userName: '张三' }）
  { userId }                   // 用于灰度判断
);

if (isDraft) {
  console.log('使用 DRAFT 版本（调试模式）');
}

已集成模块：

• ✅ RVW - 稿件审查（2个 Prompt）
• ✅ AIA - AI智能问答（10个 Prompt）🆕 2026-01-18

AIA 模块 Prompt Code 列表：

Prompt Code	智能体
AIA_SCIENTIFIC_QUESTION	科学问题梳理
AIA_PICO_ANALYSIS	PICO 梳理
AIA_TOPIC_EVALUATION	选题评价
AIA_OUTCOME_DESIGN	观察指标设计
AIA_CRF_DESIGN	病例报告表设计
AIA_SAMPLE_SIZE	样本量计算
AIA_PROTOCOL_WRITING	临床研究方案撰写
AIA_METHODOLOGY_REVIEW	方法学评审智能体
AIA_PAPER_POLISH	论文润色
AIA_PAPER_TRANSLATE	论文翻译

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3. Chat 通用组件（🆕 重点推荐）

路径： frontend-v2/src/shared/components/Chat/

功能： 现代感AI对话组件，支持流式响应、深度思考、会话管理

核心组件：

import { 
  AIStreamChat,        // 流式对话组件（推荐）
  ThinkingBlock,       // 深度思考展示
  ConversationList,    // 会话列表
  useAIStream,         // 流式响应Hook
  useConversations,    // 会话管理Hook
} from '@/shared/components/Chat';

快速使用：

<AIStreamChat
  apiEndpoint="/api/v1/xxx/chat/stream"
  conversationId={conversationId}
  agentId="xxx"
  enableDeepThinking={true}
  welcome={{
    title: '智能助手',
    description: '有什么可以帮您的？',
  }}
/>

已使用模块：

• ✅ AIA - AI智能问答
• ✅ DC Tool C - 科研数据编辑器
• 🔜 PKB - 个人知识库（待迁移）

详细文档： Chat组件README

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4. Ant Design X FileCard 组件（🆕 2026-01-18）

来源： @ant-design/x (Ant Design X 2.1)

功能： 紧凑的文件卡片展示，适用于聊天界面附件显示

安装：

npm install @ant-design/x

使用方式：

import { Attachments } from '@ant-design/x';

const { FileCard } = Attachments;

// 单个文件卡片
<FileCard
  item={{
    uid: 'file-1',
    name: '研究方案.pdf',
    size: 1024000,  // 字节
  }}
/>

// 文件卡片列表（水平排列）
<FileCard.List
  items={[
    { uid: '1', name: '方案.pdf', size: 512000 },
    { uid: '2', name: '数据.xlsx', size: 256000 },
  ]}
/>

在聊天界面中使用：

// 将附件与工具栏放在同一行
<div style={{ display: 'flex', alignItems: 'center', gap: 8 }}>
  <Button icon={<PaperClipOutlined />}>上传附件</Button>
  <Button icon={<BulbOutlined />}>深度思考</Button>
  
  {/* 附件列表 */}
  {attachments.length > 0 && (
    <FileCard.List
      items={attachments.map(att => ({
        uid: att.id,
        name: att.filename,
        size: att.size,
      }))}
    />
  )}
</div>

样式特点：

• 自动识别文件类型图标（PDF/Word/Excel/图片等）
• 自动格式化文件大小（KB/MB）
• 紧凑设计，适合水平排列
• 支持删除回调

已使用模块：

• ✅ AIA - AI智能问答（附件上传预览）

官方文档： https://x.ant.design/components/attachments-cn

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5. LLM 网关

路径： backend/src/common/llm/

功能： 统一LLM调用接口，支持5个主流模型

支持模型：

• DeepSeek-V3（直连）
• Qwen3-72B（阿里云）
• Qwen-Long（1M上下文）
• GPT-5-Pro（CloseAI代理）
• Claude-4.5（CloseAI代理）

使用方式：

import { LLMFactory } from '../../../common/llm/adapters/LLMFactory';

// 获取适配器
const llm = LLMFactory.getAdapter('deepseek-v3');

// 非流式调用
const response = await llm.chat(messages, { temperature: 0.7 });

// 流式调用
const stream = llm.chatStream(messages, { temperature: 0.7 });
for await (const chunk of stream) {
  console.log(chunk.content);
}

已使用模块：

• ✅ AIA - AI智能问答
• ✅ PKB - 个人知识库
• ✅ DC Tool B - 病历结构化
• ✅ DC Tool C - 数据编辑器

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4. 存储服务

路径： backend/src/common/storage/

功能： 文件存储抽象层，零代码切换本地/OSS

使用方式：

import { storage } from '../../../common/storage';

// 上传文件
const url = await storage.upload('path/to/file.pdf', buffer, {
  contentType: 'application/pdf',
});

// 下载文件
const buffer = await storage.download('path/to/file.pdf');

// 删除文件
await storage.delete('path/to/file.pdf');

// 获取签名URL（OSS）
const signedUrl = await storage.getSignedUrl('path/to/file.pdf', 3600);

环境配置：

# 本地开发
STORAGE_PROVIDER=local
UPLOAD_DIR=./uploads

# 生产环境（阿里云OSS）
STORAGE_PROVIDER=oss
OSS_REGION=oss-cn-hangzhou
OSS_BUCKET=your-bucket
OSS_ACCESS_KEY_ID=xxx
OSS_ACCESS_KEY_SECRET=xxx

已使用模块：

• ✅ PKB - 文档上传
• ✅ DC Tool B - 病历文件
• ✅ AIA - 附件上传（待完成）

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5. 异步任务队列

路径： backend/src/common/jobs/

功能： Postgres-Only 异步任务处理，基于 PgBoss

使用方式：

import { JobFactory } from '../../../common/jobs';

// 获取队列实例
const queue = JobFactory.getQueue();

// 创建任务
const jobId = await queue.createJob('extraction-job', {
  taskId: 'xxx',
  fileUrl: 'xxx',
  options: {},
});

// 注册 Worker
queue.registerWorker('extraction-job', async (job) => {
  console.log('处理任务:', job.data);
  // 执行任务逻辑
  return { success: true };
});

// 启动队列
await queue.start();

已使用模块：

• ✅ DC Tool B - 病历批量提取
• ✅ DC Tool C - 数据异步处理

详细文档： Postgres-Only异步任务指南

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6. 缓存服务

路径： backend/src/common/cache/

功能： 缓存抽象层（内存/Redis/Postgres）

使用方式：

import { cache } from '../../../common/cache';

// 设置缓存（TTL: 3600秒）
await cache.set('key', { data: 'value' }, 3600);

// 获取缓存
const value = await cache.get('key');

// 删除缓存
await cache.delete('key');

// 批量删除（支持通配符）
await cache.clear('prefix:*');

已使用模块：

• ✅ AIA - 智能体配置缓存
• ✅ Prompt管理 - 模板缓存

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7. 日志服务

路径： backend/src/common/logging/

功能： 结构化日志，支持多级别输出

使用方式：

import { logger } from '../../../common/logging';

// 不同级别
logger.debug('调试信息', { detail: 'xxx' });
logger.info('普通日志', { userId: 'xxx' });
logger.warn('警告信息', { issue: 'xxx' });
logger.error('错误信息', { error, stack: error.stack });

// 结构化字段
logger.info('[ModuleName] 操作描述', {
  userId: 'xxx',
  conversationId: 'xxx',
  duration: 1234,
});

日志格式：

2026-01-14 18:44:27.500 [aiclinical-backend] info: [AIA:ConversationService] 消息发送完成
  {
    "conversationId": "xxx",
    "tokens": 1234,
    "hasThinking": true
  }

已使用模块： 所有模块

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8. 🎉 RAG 引擎（✅ 2026-01-21 完整实现）

路径： backend/src/common/rag/ + ekb_schema

功能： 完整的 RAG 检索引擎（替代 Dify）

核心组件：

• ✅ EmbeddingService - 文本向量化（text-embedding-v4）
• ✅ ChunkService - 智能文本分块
• ✅ VectorSearchService - 向量检索 + 混合检索
• ✅ RerankService - qwen3-rerank 重排序
• ✅ QueryRewriter - DeepSeek V3 查询理解
• ✅ DocumentIngestService - 文档入库完整流程

技术栈：

PostgreSQL + pgvector (向量存储)
  ↓
text-embedding-v4 1024维 (向量化)
  ↓
DeepSeek V3 (查询理解 + 中英翻译)
  ↓
向量检索 + 关键词检索 → RRF 融合
  ↓
qwen3-rerank (精排序)

Brain-Hand 架构使用方式：

import { getVectorSearchService, QueryRewriter } from '@/common/rag';

// 业务层：查询理解（The Brain）
const rewriter = new QueryRewriter();
const result = await rewriter.rewrite('K药副作用');
const queries = [result.original, ...result.rewritten];
// ["K药副作用", "Keytruda AE", "Pembrolizumab side effects"]

// 引擎层：执行检索（The Hand）
const searchService = getVectorSearchService(prisma);
const results = await searchService.searchWithQueries(queries, {
  topK: 10,
  filter: { kbId: 'your-kb-id' }
});

// Rerank 精排
const final = await searchService.rerank(queries[0], results, { topK: 5 });

性能指标：

• 延迟：2.5秒/次（包含查询理解）
• 成本：¥0.0025/次
• 准确率：+20.5%（跨语言场景）

已使用模块：

• ✅ PKB - 个人知识库（双轨模式：pgvector/dify）
• 🔜 AIA - AI智能问答
• 🔜 ASL - AI智能文献

详细文档：

• 📖 RAG 引擎使用指南 ⭐ 推荐阅读
• 知识库引擎架构设计
• 数据模型设计
• 分阶段实施方案

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9. 🎉 文档处理引擎（✅ 2026-01-21 增强完成）

路径： extraction_service/ (Python 微服务，端口 8000)

功能： 将各类文档统一转换为 LLM 友好的 Markdown 格式

核心 API：

POST http://localhost:8000/api/document/to-markdown
Content-Type: multipart/form-data

参数：file (PDF/Word/Excel/PPT等)
返回：{ success: true, text: "Markdown内容", metadata: {...} }

技术升级：

• ✅ PDF 处理：pymupdf4llm（保留表格、公式、结构）
• ✅ 统一入口：DocumentProcessor 自动检测文件类型
• ✅ 零 OCR：电子版文档专用，扫描件返回友好提示
• ✅ 与 RAG 引擎无缝集成

支持格式：

格式	工具	输出质量	状态
PDF	pymupdf4llm	表格保真	✅
Word	mammoth	结构完整	✅
Excel/CSV	pandas	上下文丰富	✅
PPT	python-pptx	按页拆分	✅
纯文本	直接读取	原样输出	✅

使用方式（Node.js 调用）：

// 在 RAG 引擎入库时自动调用
import { getDocumentIngestService } from '@/common/rag';

const ingestService = getDocumentIngestService(prisma);
const result = await ingestService.ingestDocument(
  { filename: 'paper.pdf', fileBuffer: pdfBuffer },
  { kbId: 'your-kb-id' }
);
// DocumentIngestService 内部会调用 Python 微服务转换

# 转换任意文档为 Markdown
md = processor.to_markdown("research_paper.pdf")
md = processor.to_markdown("report.docx")
md = processor.to_markdown("data.xlsx")

后端调用（TypeScript）：

import { ExtractionClient } from '../../../common/document/ExtractionClient';

const client = new ExtractionClient();

// 提取文本（返回 Markdown）
const markdown = await client.extractText(buffer, 'pdf');

已使用模块：

• ✅ PKB - 文档上传
• ✅ DC Tool B - 病历文本提取
• ✅ ASL - 文献 PDF 提取
• 🔜 AIA - 附件处理

详细文档：

• 📖 文档处理引擎使用指南 ⭐ 推荐阅读
• 文档处理引擎设计方案

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10. 认证授权

路径： backend/src/common/auth/

功能： JWT认证 + 基于角色的访问控制

后端使用：

import { authenticate, requirePermission } from '../../../common/auth/auth.middleware';

// 路由添加认证
fastify.get('/api', { preHandler: [authenticate] }, handler);

// 要求特定权限
fastify.post('/api', { 
  preHandler: [authenticate, requirePermission('module:action')] 
}, handler);

// 控制器获取用户ID
function getUserId(request: FastifyRequest): string {
  const userId = (request as any).user?.userId;
  if (!userId) throw new Error('User not authenticated');
  return userId;
}

前端使用：

import { getAccessToken } from '@/framework/auth/api';

// 方式1: 使用 apiClient（推荐）
import apiClient from '@/common/api/axios';
const response = await apiClient.get('/api/xxx');

// 方式2: 原生 fetch
const response = await fetch('/api/xxx', {
  headers: {
    'Content-Type': 'application/json',
    'Authorization': `Bearer ${getAccessToken()}`,
  },
});

已使用模块： 所有模块

详细文档： 模块认证规范

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11. Prompt 管理系统

路径： backend/src/common/prompt/

功能： 动态Prompt配置、版本管理、A/B测试

使用方式：

import { PromptService } from '../../../common/prompt/prompt.service';

const promptService = new PromptService();

// 获取激活的Prompt
const prompt = await promptService.getActivePrompt('template_code');

// 渲染Prompt（变量替换）
const rendered = promptService.renderPrompt(template.content, {
  userName: '张三',
  context: '研究背景...',
});

已使用模块：

• ✅ DC Tool C - 代码生成Prompt
• 🔜 AIA - 智能体Prompt（待迁移）

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🎨 前端 Chat 组件（V2）

概述

基于 Ant Design X 2.1 构建的现代感AI对话组件，支持流式响应、深度思考、会话管理。

核心组件

1. AIStreamChat - 流式对话组件（推荐）

import { AIStreamChat } from '@/shared/components/Chat';

<AIStreamChat
  apiEndpoint="/api/v1/aia/conversations/xxx/messages/stream"
  conversationId="xxx"
  agentId="TOPIC_01"
  enableDeepThinking={true}
  welcome={{
    title: 'AI 助手',
    description: '有什么可以帮您的？',
  }}
  onMessageSent={(msg) => console.log('发送:', msg)}
  onMessageReceived={(msg) => console.log('接收:', msg)}
/>

特性：

• ✅ 逐字流式显示（打字机效果）
• ✅ 深度思考展示（可折叠）
• ✅ 欢迎页配置
• ✅ 快捷提示
• ✅ 附件上传
• ✅ 现代感设计

2. ThinkingBlock - 深度思考组件

import { ThinkingBlock } from '@/shared/components/Chat';

<ThinkingBlock
  content={thinkingContent}
  isThinking={true}
  duration={2.5}
  defaultExpanded={true}
/>

3. ConversationList - 会话列表

import { ConversationList } from '@/shared/components/Chat';

<ConversationList
  groups={groupedConversations}
  currentId={currentId}
  onSelect={setCurrent}
  onNew={createConversation}
  onDelete={deleteConversation}
/>

Hooks

useAIStream - 流式响应处理

import { useAIStream } from '@/shared/components/Chat';

const {
  content,          // 当前内容
  thinking,         // 思考内容
  status,           // 流式状态
  isStreaming,      // 是否正在流式输出
  isThinking,       // 是否正在思考
  error,            // 错误信息
  sendMessage,      // 发送消息
  abort,            // 中断请求
  reset,            // 重置状态
} = useAIStream({
  apiEndpoint: '/api/v1/aia/chat/stream',
  headers: { Authorization: `Bearer ${token}` },
});

useConversations - 会话管理

import { useConversations } from '@/shared/components/Chat';

const {
  conversations,         // 会话列表
  groupedConversations,  // 分组会话（今天/昨天/更早）
  current,               // 当前会话
  setCurrent,            // 设置当前会话
  addConversation,       // 添加会话
  updateConversation,    // 更新会话
  deleteConversation,    // 删除会话
} = useConversations();

向后兼容

保留了 V1 版本的组件：

• ChatContainer - 传统对话容器（非流式）
• MessageRenderer - 消息渲染器
• CodeBlockRenderer - 代码块渲染器（Tool C专用）

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🔗 能力组合使用

场景1：AI对话模块（如AIA）

前端：

import { AIStreamChat } from '@/shared/components/Chat';

<AIStreamChat
  apiEndpoint="/api/v1/aia/conversations/xxx/messages/stream"
  enableDeepThinking={true}
/>

后端：

import { createStreamingService } from '../../../common/streaming';
import { LLMFactory } from '../../../common/llm/adapters/LLMFactory';

async function sendMessageStream(userId, conversationId, request, reply) {
  const service = createStreamingService(reply);
  await service.streamGenerate(messages);
}

场景2：知识库问答（如PKB）

前端：

<AIStreamChat
  apiEndpoint="/api/v1/pkb/chat/stream"
  enableAttachment={true}  // 支持文档上传
/>

后端：

import { DifyClient } from '../../../common/rag/DifyClient';
import { createStreamingService } from '../../../common/streaming';

// RAG检索 + 流式输出
const ragResults = await dify.retrievalSearch(query, options);
const messages = buildMessagesWithRAG(query, ragResults);
await service.streamGenerate(messages);

场景3：代码生成工具（如Tool C）

前端：

<ChatContainer
  conversationType="tool-c"
  customMessageRenderer={(msg) => (
    <MessageRenderer
      messageInfo={msg}
      onExecuteCode={handleExecute}
    />
  )}
/>

后端：

import { LLMFactory } from '../../../common/llm/adapters/LLMFactory';
import { PromptService } from '../../../common/prompt/prompt.service';

// Prompt管理 + LLM调用
const prompt = await promptService.getActivePrompt('code_gen');
const llm = LLMFactory.getAdapter('deepseek-v3');
const response = await llm.chat(messages);

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📊 使用统计

能力使用矩阵

能力	AIA	PKB	DC-B	DC-C	ASL	RVW
StreamingService	✅	🔜	❌	❌	❌	❌
Chat组件V2	✅	🔜	❌	✅	❌	❌
LLM网关	✅	✅	✅	✅	❌	❌
存储服务	🔜	✅	✅	✅	✅	✅
异步任务	❌	❌	✅	✅	✅	✅
知识库引擎	🔜	✅	❌	❌	🔜	🔜
文档处理	🔜	✅	✅	❌	❌	❌
认证授权	✅	✅	✅	✅	✅	✅
Prompt管理	🔜	❌	❌	✅	❌	❌

图例：✅ 已使用 | 🔜 计划使用 | ❌ 不需要

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🚀 最佳实践

1. 优先使用通用能力

❌ 错误做法：

// 自己实现流式响应
reply.raw.write(`data: ${JSON.stringify(chunk)}\n\n`);

✅ 正确做法：

// 使用 StreamingService
const service = createStreamingService(reply);
await service.streamGenerate(messages);

2. 标准化API格式

❌ 错误做法：

// 自定义SSE格式
event: delta\ndata: {"content":"xxx"}\n\n

✅ 正确做法：

// OpenAI Compatible格式
data: {"choices":[{"delta":{"content":"xxx"}}]}\n\n

3. 云原生设计

❌ 错误做法：

// 直接使用本地文件系统
fs.writeFileSync('/tmp/file.txt', content);

✅ 正确做法：

// 使用存储抽象层
await storage.upload('path/file.txt', buffer);

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📚 学习路径

新手入门

1. 阅读 系统整体设计
2. 阅读 云原生开发规范
3. 参考 AIA 或 DC Tool C 的实现

进阶学习

1. 深入 Chat组件文档
2. 研究 StreamingService 源码
3. 了解 Postgres-Only架构

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🔄 版本历史

V2.0 (2026-01-14) 🎉

通用能力层建设：

• 🆕 StreamingService - OpenAI Compatible流式响应
• 🆕 Chat组件V2 - 现代感UI + 完整功能
• 🆕 useAIStream Hook - 流式响应处理
• 🆕 ThinkingBlock - 深度思考展示

已应用模块：

• ✅ AIA - 首个使用者
• 🔜 PKB - 计划迁移
• 🔜 其他AI对话场景

V1.0 (历史版本)

• 基础LLM网关
• 简单Chat组件
• 各模块独立实现

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📞 获取帮助

• 通用能力层问题： 查看本文档或各子模块README
• 业务模块问题： 查看对应模块的状态文档
• 架构设计问题： 查看系统总体设计文档

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维护说明： 新增通用能力时，请及时更新本文档。