feat(asl): Complete Deep Research V2.0 core development

Backend:
- Add SSE streaming client (unifuncsSseClient) replacing async polling
- Add paragraph-based reasoning parser with mergeConsecutiveThinking
- Add requirement expansion service (DeepSeek-V3 PICOS+MeSH)
- Add Word export service with Pandoc, inline hyperlinks, reference link expansion
- Add deep research V2 worker with 2s log flush and Chinese source prompt
- Add 5 curated data sources config (PubMed/ClinicalTrials/Cochrane/CNKI/MedJournals)
- Add 4 API endpoints (generate-requirement/tasks/task-status/export-word)
- Update Prisma schema with 6 new V2.0 fields on AslResearchTask
- Add DB migration for V2.0 fields
- Simplify ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION prompt (remove strategy section)

Frontend:
- Add waterfall-flow DeepResearchPage (phase 0-4 progressive reveal)
- Add LandingView, SetupPanel, StrategyConfirm, AgentTerminal, ResultsView
- Add react-markdown + remark-gfm for report rendering
- Add custom link component showing visible URLs after references
- Add useDeepResearchTask polling hook
- Add deep research TypeScript types

Tests:
- Add E2E test, smoke test, and Chinese data source test scripts

Docs:
- Update ASL module status (v2.0 - core features complete)
- Update system status (v6.1 - ASL V2.0 milestone)
- Update Unifuncs DeepSearch API guide (v2.0 - SSE mode + Chinese source results)
- Update module auth specification (test script guidelines)
- Update V2.0 development plan

Co-authored-by: Cursor <cursoragent@cursor.com>
This commit is contained in:
2026-02-23 13:21:52 +08:00
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39 changed files with 5605 additions and 417 deletions

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@@ -1,11 +1,11 @@
# AIclinicalresearch 系统当前状态与开发指南
> **文档版本:** v6.0
> **文档版本:** v6.1
> **创建日期:** 2025-11-28
> **维护者:** 开发团队
> **最后更新:** 2026-02-22
> **最后更新:** 2026-02-23
> **🎉 重大里程碑:**
> - **🆕 2026-02-22ASL Deep Research V2.0 开发计划确认 + Unifuncs API 网站覆盖测试完成!** 18站点实测9个一级可用ClinicalTrials.gov 专项验证通过
> - **🆕 2026-02-23ASL Deep Research V2.0 核心功能完成!** SSE 实时流 + 段落化思考 + 瀑布流 UI + Markdown 渲染 + 引用链接可见 + Word 导出 + 中文数据源
> - **🆕 2026-02-22SSA Phase I-IV 开发完成!** Session 黑板 + 对话层 LLM + 方法咨询 + 对话驱动分析E2E 107/107 通过
> - **2026-02-21SSA QPER 智能化主线闭环完成!** Q→P→E→R 四层架构全部开发完成,端到端 40/40 测试通过
> - **2026-02-20SSA Phase 2A 前端集成完成!** 多步骤工作流端到端 + V11 UI联调 + Block-based 架构共识
@@ -26,11 +26,12 @@
> - **2026-01-24Protocol Agent 框架完成!** 可复用Agent框架+5阶段对话流程
> - **2026-01-22OSS 存储集成完成!** 阿里云 OSS 正式接入平台基础层
>
> **🆕 最新进展ASL V2.0 + SSA Phase I-IV 2026-02-22**
> - ✅ **🎉 ASL Deep Research V2.0 开发计划确认** — 四步瀑布流 + 异步模式 + HITL + 多站点搜索 + Word 导出
> - ✅ **Unifuncs API 网站覆盖测试完成** — 18 站点实测9 个一级可用PubMed/ClinicalTrials/NCBI/Scholar/Cochrane/CNKI/SinoMed/GeenMedical/维普)
> - ✅ **ClinicalTrials.gov 专项验证通过** — 英文查询 + max_depth≥10120s 获取 38 个 NCT 编号链接
> - ✅ **DeepSearch 通用能力指南发布** — `docs/02-通用能力层/04-DeepResearch引擎/`
> **🆕 最新进展ASL V2.0 核心完成 2026-02-23**
> - ✅ **🎉 ASL Deep Research V2.0 核心功能完成** — SSE 流式架构 + 瀑布流 UI + HITL + 5 精选数据源 + Word 导出
> - ✅ **SSE 流式替代轮询** — 实时推送 AI 思考过程reasoning_content段落化日志聚合
> - ✅ **Markdown 渲染 + 引用链接可见化** — react-markdown 正确渲染报告,`[6]` 后显示完整 URL
> - ✅ **中文数据源专项测试** — CNKI/中华医学期刊网 domain_scope 有效,混合源建议分批搜索
> - ✅ **DeepSearch 通用能力指南 v2.0** — `docs/02-通用能力层/04-DeepResearch引擎/`
> - ✅ **🎉 SSA Phase I-IV 全部开发完成** — Session 黑板 + 意图路由器 + 对话层 LLM + 方法咨询 + AskUser 标准化 + 对话驱动分析 + QPER 集成
> - ✅ **SSA E2E 测试全部通过** — Phase I 31/31 + Phase II 38/38 + Phase III 13/13 + Phase IV 25/25 = 共 107 项
>
@@ -70,7 +71,7 @@
|---------|---------|---------|---------|---------|--------|
| **AIA** | AI智能问答 | 12个智能体 + Protocol Agent全流程方案 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **V3.1 MVP完整交付90%** - 一键生成+Word导出 | **P0** |
| **PKB** | 个人知识库 | RAG问答、私人文献库 | ⭐⭐⭐ | 🎉 **Dify已替换自研RAG上线95%** | P1 |
| **ASL** | AI智能文献 | 文献筛选、Deep Research、证据图谱 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🚀 **V2.0 计划确认65%** - Unifuncs 18站实测 + 5天开发计划 | **P0** |
| **ASL** | AI智能文献 | 文献筛选、Deep Research、证据图谱 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **V2.0 核心完成80%** - SSE流式+瀑布流UI+HITL+Word导出+中文数据源 | **P0** |
| **DC** | 数据清洗整理 | ETL + 医学NER百万行级数据 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | ✅ **Tool B完成 + Tool C 99%(异步架构+性能优化-99%+多指标转换+7大功能** | **P0** |
| **IIT** | IIT Manager Agent | AI驱动IIT研究助手 - 双脑架构+REDCap集成 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **事件级质控V3.1完成设计100%代码60%** | **P0** |
| **SSA** | 智能统计分析 | **QPER架构** + 四层七工具 + 对话层LLM + 意图路由器 | ⭐⭐⭐⭐⭐ | 🎉 **Phase I-IV 开发完成** — QPER闭环 + Session黑板 + 意图路由 + 对话LLM + 方法咨询 + 对话驱动分析E2E 107/107 | **P1** |
@@ -158,9 +159,39 @@
---
## 🚀 当前开发状态2026-02-22
## 🚀 当前开发状态2026-02-23
### 🎉 最新进展:SSA Phase I-IV 开发完成2026-02-22
### 🎉 最新进展:ASL Deep Research V2.0 核心功能完成2026-02-23
#### ✅ ASL Deep Research V2.0 核心开发完成
**重大里程碑:从 V1.x 单一 PubMed SSE 搜索升级为多数据源、实时流式、段落化思考的完整深度检索系统!**
| 功能 | 技术实现 | 状态 |
|------|---------|------|
| SSE 流式架构 | unifuncsSseClient → OpenAI Compatible SSE替代 create_task/query_task 轮询 | ✅ |
| 段落化思考日志 | reasoningParser 按段落聚合 + mergeConsecutiveThinking200+ 字符批量解析 | ✅ |
| 引用链接可见化 | react-markdown 自定义 `<a>` 组件 + Word 端 expandReferenceLinks() | ✅ |
| 瀑布流 UI | phase 0-4 渐进展开,已完成步骤折叠为摘要卡片 | ✅ |
| LLM 需求扩写 | DeepSeek-V3 PICOS+MeSH 结构化扩写Prompt 管理系统可配置 | ✅ |
| HITL 策略确认 | 用户可编辑/保存/确认检索指令,单列布局 + PICOS 摘要卡片 | ✅ |
| Markdown 报告渲染 | react-markdown + remark-gfm正确渲染标题/链接/列表/加粗 | ✅ |
| Word 导出 | Pandoc 微服务,文献标题内嵌超链接,引用展开为可见 URL | ✅ |
| 中文数据源 | CNKI/中华医学期刊网动态 prompt + 专项测试脚本验证 | ✅ |
| 5 精选数据源 | PubMed/ClinicalTrials.gov/Cochrane/CNKI/中华医学期刊网 | ✅ |
| 数据库扩展 | 6 个新字段targetSources/confirmedRequirement/aiIntentSummary/executionLogs/synthesisReport/resultList | ✅ |
**关键技术决策**
-**SSE 替代轮询**:解决"等很久才一股脑显示"问题reasoning_content 实时推送
-**段落化日志**:从逐行碎片到连贯段落,思考过程可读性大幅提升
-**引用链接可见**`[6]` 后追加完整 URL方便复制分享Web+Word 双端)
**相关文档**
- 模块状态:`docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/00-模块当前状态与开发指南.md`
- 开发计划:`docs/03-业务模块/ASL-AI智能文献/04-开发计划/07-Deep Research V2.0 开发计划.md`
- API 指南:`docs/02-通用能力层/04-DeepResearch引擎/01-Unifuncs DeepSearch API 使用指南.md`
### 🎉 SSA Phase I-IV 开发完成2026-02-22
#### ✅ SSA 智能对话与工具体系 Phase I-IV 全部完成2026-02-22
@@ -1462,7 +1493,7 @@ npm run dev # http://localhost:3000
### 模块完成度
-**已完成**AIA V2.085%核心功能完成、平台基础层100%、RVW95%、通用能力层升级100%)、**PKB95%Dify已替换** 🎉
- 🚧 **开发中****ASL65%V2.0 计划确认 + 18站Unifuncs测试完成**、DCTool C 98%Tool B后端100%Tool B前端0%、IIT60%Phase 1.5完成)、**SSAQPER主线100% + Phase I-IV 全部完成E2E 107/107Phase VI 待启动)** 🎉
- 🚧 **开发中****ASL80%,🎉 V2.0 核心功能完成SSE流式+瀑布流UI+HITL+Word导出+中文数据源**、DCTool C 98%Tool B后端100%Tool B前端0%、IIT60%Phase 1.5完成)、**SSAQPER主线100% + Phase I-IV 全部完成E2E 107/107Phase VI 待启动)** 🎉
- 📋 **未开始**ST
### 部署完成度
@@ -1612,9 +1643,9 @@ if (items.length >= 50) {
---
**文档版本**v5.9
**最后更新**2026-02-22
**本次更新**SSA Phase I-IV 全部开发完成E2E 107/107 通过,开发计划 v1.8
**文档版本**v6.1
**最后更新**2026-02-23
**本次更新**ASL Deep Research V2.0 核心功能完成SSE流式+段落化思考+引用链接可见化+瀑布流UI+Word导出+中文数据源)
---

View File

@@ -1,21 +1,23 @@
# Unifuncs DeepSearch API 使用指南
> **文档版本:** v1.0
> **文档版本:** v2.0
> **创建日期:** 2026-02-22
> **最后更新:** 2026-02-23
> **维护者:** 开发团队
> **文档目的:** 指导业务模块正确使用 Unifuncs DeepSearch API明确可用网站与最佳策略
> **文档目的:** 指导业务模块正确使用 Unifuncs DeepSearch API明确可用网站、调用模式与最佳策略
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## 1. 概述
Unifuncs DeepSearch 是一个 AI 驱动的深度搜索引擎,可以在指定的网站范围内自动搜索、阅读和汇总信息。在本平台中,它作为**通用能力层**的一部分,为文献检索、临床试验查找等场景提供底层搜索能力。
Unifuncs DeepSearch 是一个 AI 驱动的深度搜索引擎,可以在指定的网站范围内自动搜索、阅读和汇总信息。在本平台中,它作为通用能力层的一部分,为文献检索、临床试验查找等场景提供底层搜索能力。
### 核心能力
- 自然语言输入 → AI 自动生成搜索策略
- 多轮迭代搜索(最大深度可配置)
- 自动阅读网页内容并提取关键信息
- 返回结构化结果 + 综合报告
- 支持 SSE 实时流式 + 异步轮询两种调用模式
### API 基础信息
@@ -28,108 +30,92 @@ Unifuncs DeepSearch 是一个 AI 驱动的深度搜索引擎,可以在指定
---
## 2. 网站覆盖能力2026-02-22 实测)
## 2. 两种调用模式
### 2.1 测试条件
### 2.1 SSE 流式模式V2.0 采用,推荐)
- **查询**他汀类药物预防心血管疾病的随机对照试验和Meta分析近5年高质量研究
- **配置**max_depth=5异步模式create_task + query_task
- **ClinicalTrials.gov 专项**4 种策略对比测试max_depth=5~15
### 2.2 可用性分级
#### 一级:确认可搜索(返回站内直接链接)
| 站点 | 域名 | 类型 | 站内链接数 | 搜索/阅读 | 最佳策略 |
|------|------|------|-----------|-----------|---------|
| **PubMed** | pubmed.ncbi.nlm.nih.gov | 英文 | 28 | 9/29 | 中/英文查询均可,效果最佳 |
| **NCBI/PMC** | www.ncbi.nlm.nih.gov | 英文 | 18 | 24/19 | 含 PMC 全文链接 |
| **ClinicalTrials.gov** | clinicaltrials.gov | 英文 | 38 | 6/24 | **必须英文查询**max_depth≥10 |
| **Google Scholar** | scholar.google.com | 英文 | 10 | 22/26 | 跨库聚合搜索 |
| **CBM/SinoMed** | www.sinomed.ac.cn | 中文 | 9 | 17/12 | 中文生物医学文献数据库 |
| **中国知网 CNKI** | www.cnki.net | 中文 | 7 | 40/6 | 中文核心期刊 |
| **GeenMedical** | www.geenmedical.com | 英文 | 5 | 38/3 | 医学搜索聚合引擎 |
| **Cochrane Library** | www.cochranelibrary.com | 英文 | 4 | 38/12 | 系统综述金标准 |
| **维普 VIP** | www.cqvip.com | 中文 | 1 | 33/3 | 可用但链接较少 |
#### 二级:可到达但链接间接(搜索到内容,但返回链接不指向该站点域名)
| 站点 | 域名 | 类型 | 其他链接数 | 说明 |
|------|------|------|-----------|------|
| 中华医学期刊网 | medjournals.cn | 中文 | 12 | 搜索活跃41次内容丰富但链接跳转 |
| 万方数据 | www.wanfangdata.com.cn | 中文 | 7 | 搜索活跃42次链接可能转跳 |
| 中国临床试验注册中心 | www.chictr.org.cn | 中文 | 7 | 有内容产出,链接指向其他站 |
| 中国中医药数据库 | cintmed.cintcm.cn | 中文 | 22 | 内容最丰富8631字链接非直达 |
| Scopus | www.scopus.com | 英文 | 15 | 付费墙限制,内容来自外部引用 |
| Embase | www.embase.com | 英文 | 14 | 需机构登录 |
| Web of Science | www.webofscience.com | 英文 | 6 | 付费墙限制 |
#### 三级:不可用或受限
| 站点 | 域名 | 说明 |
|------|------|------|
| Ovid | ovidsp.ovid.com | 仅搜索未读取内容,需机构登录 |
| NSTL | www.nstl.gov.cn | 搜索到但无有效内容和链接 |
### 2.3 关键发现
1. **付费库无法穿透**Unifuncs 只能访问公开可达的网页内容不支持传入用户名密码。Web of Science、Embase、Scopus、Ovid 等需要机构 IP 或账号登录的库无法直接搜索。
2. **ClinicalTrials.gov 必须用英文**:该站点为纯英文网站,中文查询效率极低。使用英文查询 + max_depth≥10 时,可稳定返回 30+ 个 NCT 编号和链接。
3. **中文库表现不一**CNKI 和 SinoMed 效果较好,能直接返回站内链接;万方和中华医学期刊网可到达但链接不直达。
---
## 3. 两种调用模式
### 3.1 OpenAI 兼容协议(流式,适合实时展示)
通过 OpenAI 兼容协议的 `POST /chat/completions` 端点,设置 `stream: true`,以 SSE 事件流实时返回 AI 思考过程和最终结果。
```typescript
import OpenAI from 'openai';
const client = new OpenAI({
baseURL: 'https://api.unifuncs.com/deepsearch/v1',
apiKey: process.env.UNIFUNCS_API_KEY,
const response = await fetch('https://api.unifuncs.com/deepsearch/v1/chat/completions', {
method: 'POST',
headers: {
'Authorization': `Bearer ${UNIFUNCS_API_KEY}`,
'Content-Type': 'application/json',
'Accept': 'text/event-stream',
},
body: JSON.stringify({
model: 's2',
messages: [{ role: 'user', content: query }],
stream: true,
introduction: '你是一名专业的临床研究文献检索专家',
max_depth: 25,
domain_scope: ['https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/'],
reference_style: 'link',
output_prompt: '请输出结构化报告和文献列表',
}),
});
const stream = await client.chat.completions.create({
model: 's2',
messages: [{ role: 'user', content: query }],
stream: true,
introduction: '你是一名专业的临床研究文献检索专家',
max_depth: 15,
domain_scope: ['https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/'],
domain_blacklist: [],
reference_style: 'link',
} as any);
// 解析 SSE 事件流
const reader = response.body.getReader();
const decoder = new TextDecoder();
let buffer = '';
for await (const chunk of stream) {
const delta = chunk.choices[0]?.delta;
if ((delta as any)?.reasoning_content) {
// AI 思考过程(逐字流式)
}
if (delta?.content) {
// 最终结果内容(逐字流式)
while (true) {
const { done, value } = await reader.read();
if (done) break;
buffer += decoder.decode(value, { stream: true });
const lines = buffer.split('\n');
buffer = lines.pop() || '';
for (const line of lines) {
const trimmed = line.trim();
if (trimmed.startsWith('data: ')) {
const data = trimmed.slice(6);
if (data === '[DONE]') return;
const json = JSON.parse(data);
const delta = json.choices?.[0]?.delta;
if (delta?.reasoning_content) {
// AI 思考过程(逐字流式,实时展示)
}
if (delta?.content) {
// 最终结果内容(逐字流式)
}
}
}
}
```
**优点:** 实时展示 AI 思考过程,用户体验好
**缺点:** 连接不稳定,离开页面任务丢失,长任务容易超时
**SSE 流的数据特征2026-02-23 实测):**
### 3.2 异步模式(推荐用于 V2.0
| 指标 | 典型值 |
|------|--------|
| reasoning chunks | 2000~4000+ 个(实时逐条返回) |
| content chunks | 500~1600+ 个 |
| reasoning 总字符数 | 10000~13000 字符 |
| content 总字符数 | 8000~14000 字符 |
| 总耗时 | 4~6 分钟max_depth=25 |
#### 创建任务
**优点:**
- reasoning_content 实时逐 chunk 返回,可立即展示 AI 思考过程
- 用户体验优秀:搜索、阅读、分析过程实时可见
- 无需轮询,数据推送式
**缺点:**
- 长连接可能因网络中断而失败
- 不返回 statisticsiterations、search_count 等)
### 2.2 异步模式V1.x 曾使用,仅用于备选)
#### 创建任务 POST /v1/create_task
```typescript
const payload = {
model: 's2',
messages: [{ role: 'user', content: query }],
introduction: '你是一名专业的临床研究文献检索专家',
max_depth: 15,
max_depth: 25,
domain_scope: ['https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/'],
domain_blacklist: [],
reference_style: 'link',
generate_summary: true,
output_prompt: '请输出结构化报告和文献列表',
@@ -148,7 +134,7 @@ const { data } = await res.json();
// data.task_id → 保存到数据库
```
#### 轮询任务
#### 轮询任务 GET /v1/query_task
```typescript
const params = new URLSearchParams({ task_id: taskId });
@@ -158,15 +144,110 @@ const res = await fetch(
);
const { data } = await res.json();
// data.status: pending / processing / completed / failed
// data.status: pending / running / completed / failed
// data.result.content: 最终结果
// data.result.reasoning_content: AI 思考过程(增量
// data.result.reasoning_content: AI 思考过程(仅在接近完成时才有数据
// data.progress: { current, total, message }
// data.statistics: { iterations, search_count, read_count, token_usage }
```
**优点:** 任务持久化,离开页面不中断,可恢复,适合长任务
**缺点:** 非实时,需要轮询获取进度
**优点:** 任务持久化,离开页面不中断,返回 statistics
**缺点:** reasoning_content 不实时 — 实测中在 12 分钟内仅返回 25%/50%/90% 进度,最后才一次性返回全部思考内容,用户体验差
### 2.3 模式选择建议
| 场景 | 推荐模式 | 原因 |
|------|---------|------|
| 用户在线等待、需要实时反馈 | SSE 流式 | reasoning 实时展示 |
| 后台批量任务、无人值守 | 异步 | 任务持久化、可恢复 |
| V2.0 Deep Research | SSE 流式 | Worker 消费 SSE 流 + DB 持久化 |
---
## 3. 网站覆盖能力
### 3.1 V2.0 精选数据源(前端可选)
| 站点 | 域名 | 类型 | 默认 | 搜索效果 |
|------|------|------|------|----------|
| PubMed | pubmed.ncbi.nlm.nih.gov | 英文 | 默认勾选 | 效果最佳,核心数据源 |
| ClinicalTrials.gov | clinicaltrials.gov | 英文 | 可选 | 英文查询效果好 |
| Cochrane Library | www.cochranelibrary.com | 英文 | 可选 | 系统综述金标准 |
| 中国知网 CNKI | www.cnki.net | 中文 | 可选 | 中文核心期刊 |
| 中华医学期刊网 | medjournals.cn | 中文 | 可选 | 中文医学期刊,效果优秀 |
### 3.2 中文数据源专项测试2026-02-23 实测)
测试条件SSE 流式模式max_depth=10domain_scope 仅包含 CNKI + 中华医学期刊网
**测试 12型糖尿病患者SGLT2抑制剂的肾脏保护作用**
| 指标 | 结果 |
|------|------|
| 耗时 | 268.3s |
| reasoning chunks | 4071 个12555 字符) |
| content chunks | 1671 个8055 字符) |
| 中文字符数 | 2398 |
| 中华医学期刊网链接 | 46 个 |
| CNKI 链接 | 有 |
| PubMed 链接 | 0 个 |
**测试 2非小细胞肺癌免疫治疗的中国临床研究进展**
| 指标 | 结果 |
|------|------|
| 耗时 | 316.4s |
| reasoning chunks | 2675 个9985 字符) |
| content chunks | 3151 个14291 字符) |
| 中文字符数 | 3536 |
| 中华医学期刊网链接 | 94 个 |
| PubMed 链接 | 0 个 |
**测试 3他汀类药物一级预防混合源PubMed + CNKI + 中华医学期刊网)**
| 指标 | 结果 |
|------|------|
| 中文字符数 | 3676 |
| PubMed 链接 | 96 个 |
| 中文源链接 | 0 个 |
### 3.3 关键发现
1. 纯中文 domain_scope 效果好:当仅限定 CNKI + 中华医学期刊网时API 能有效检索中文文献,返回的链接全部指向中文站点。中华医学期刊网效果尤其突出。
2. 混合模式存在偏向性:同时包含 PubMed + 中文源时AI 明显倾向于 PubMed中文文献被忽略。如果用户需要中文文献建议仅选择中文数据库或在 Prompt 中强调中文检索需求。
3. 付费库无法穿透Unifuncs 只能访问公开可达的网页内容不支持传入用户名密码。Web of Science、Embase、Scopus 等需要机构登录的库无法直接搜索。
4. SSE 模式实时性优于异步模式SSE 流的 reasoning_content 真正逐 chunk 实时返回,而异步模式的 query_task 轮询中 reasoning_content 直到接近完成才有数据。
### 3.4 全站覆盖测试2026-02-22 实测,异步模式)
#### 一级:确认可搜索(返回站内直接链接)
| 站点 | 域名 | 类型 | 站内链接数 | 搜索/阅读 | 最佳策略 |
|------|------|------|-----------|-----------|---------|
| PubMed | pubmed.ncbi.nlm.nih.gov | 英文 | 28 | 9/29 | 中/英文查询均可 |
| NCBI/PMC | www.ncbi.nlm.nih.gov | 英文 | 18 | 24/19 | 含 PMC 全文链接 |
| ClinicalTrials.gov | clinicaltrials.gov | 英文 | 38 | 6/24 | 英文查询max_depth≥10 |
| Google Scholar | scholar.google.com | 英文 | 10 | 22/26 | 跨库聚合搜索 |
| CBM/SinoMed | www.sinomed.ac.cn | 中文 | 9 | 17/12 | 中文生物医学文献 |
| 中国知网 CNKI | www.cnki.net | 中文 | 7 | 40/6 | 中文核心期刊 |
| GeenMedical | www.geenmedical.com | 英文 | 5 | 38/3 | 医学搜索聚合引擎 |
| Cochrane Library | www.cochranelibrary.com | 英文 | 4 | 38/12 | 系统综述金标准 |
| 维普 VIP | www.cqvip.com | 中文 | 1 | 33/3 | 可用但链接较少 |
#### 二级:可到达但链接间接
| 站点 | 域名 | 类型 | 其他链接数 | 说明 |
|------|------|------|-----------|------|
| 中华医学期刊网 | medjournals.cn | 中文 | 12 | 搜索活跃,专项测试效果优秀 |
| 万方数据 | www.wanfangdata.com.cn | 中文 | 7 | 搜索活跃,链接可能转跳 |
| 中国临床试验注册中心 | www.chictr.org.cn | 中文 | 7 | 有内容产出 |
| 中国中医药数据库 | cintmed.cintcm.cn | 中文 | 22 | 内容丰富 |
| Scopus | www.scopus.com | 英文 | 15 | 付费墙限制 |
| Embase | www.embase.com | 英文 | 14 | 需机构登录 |
| Web of Science | www.webofscience.com | 英文 | 6 | 付费墙限制 |
---
@@ -175,92 +256,76 @@ const { data } = await res.json();
| 参数 | 类型 | 推荐值 | 说明 |
|------|------|--------|------|
| `model` | string | `"s2"` | 固定值 |
| `max_depth` | number | 10~25 | 搜索深度。测试用 5生产用 15~25。越大越全但越慢 |
| `domain_scope` | string[] | 按需配置 | 限定搜索范围。留空则不限 |
| `stream` | boolean | `true` | SSE 流式模式 |
| `max_depth` | number | 10~25 | 搜索深度。测试用 10生产用 25 |
| `domain_scope` | string[] | 按需配置 | 限定搜索范围,留空则不限 |
| `domain_blacklist` | string[] | `[]` | 排除特定站点 |
| `introduction` | string | 见下方 | 设定 AI 角色和搜索指导 |
| `reference_style` | string | `"link"` | 引用格式,`link``character` |
| `output_prompt` | string | 可选 | 自定义输出格式提示词 |
| `generate_summary` | boolean | `true` | 异步模式完成后自动生成摘要 |
| `generate_summary` | boolean | `true` | 异步模式有效 |
### 推荐的 introduction 模板
```
你是一名专业的临床研究文献检索专家。
请根据用户的研究需求,在指定数据库中系统性地检索相关文献
检索要求:
1. 优先检索高质量研究系统综述、Meta分析、RCT
2. 关注 PICOS 要素(人群、干预、对照、结局、研究设计)
3. 优先近 5 年的研究
4. 返回每篇文献的完整元数据(标题、作者、期刊、年份、链接)
输出要求:
1. 按研究类型分组
2. 每篇文献附带直接链接
3. 最后给出综合性研究概述
你是一名专业的临床研究文献检索专家,擅长从多个学术数据库中检索高质量的医学文献
请根据用户的检索需求,系统性地搜索并返回相关文献的详细信息
```
### domain_scope 使用策略
| 场景 | domain_scope 配置 | 说明 |
|------|-------------------|------|
| 英文文献检索 | `["https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/"]` | 核心数据源 |
| 中文文献检索 | `["https://www.cnki.net/", "https://medjournals.cn/"]` | 仅中文源,避免被英文库稀释 |
| 临床试验检索 | `["https://clinicaltrials.gov/"]` | 必须英文查询 |
| 系统综述 | `["https://www.cochranelibrary.com/"]` | Cochrane 专用 |
| 全面检索 | `["https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/", "https://www.cochranelibrary.com/"]` | 多英文源组合 |
注意:不建议中英文数据源混合,测试表明混合时 AI 偏向英文源,中文文献会被忽略。如需同时检索中英文,建议分两次独立搜索。
---
## 5. 最佳策略指南
### 5.1 针对不同站点的策略
| 目标站点 | 查询语言 | max_depth | 特殊说明 |
|---------|---------|-----------|---------|
| PubMed / NCBI | 中文或英文均可 | 15~25 | 效果最好,核心数据源 |
| ClinicalTrials.gov | **必须英文** | 10~15 | 中文查询极慢甚至超时 |
| Cochrane Library | 英文优先 | 10~15 | 系统综述专用 |
| Google Scholar | 中文或英文 | 10~15 | 跨库聚合,可能有重复 |
| CNKI / SinoMed | 中文 | 10~15 | 中文文献首选 |
| GeenMedical | 英文优先 | 5~10 | 聚合搜索,速度快 |
### 5.2 多站点组合搜索
```typescript
// V2.0 推荐:用户选择多个数据源,合并到 domain_scope
const domainScope = [
'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/',
'https://www.cochranelibrary.com/',
'https://scholar.google.com/',
];
// 如果包含 ClinicalTrials.gov需求扩写时自动翻译为英文
```
### 5.3 性能预期
## 5. 性能预期
| max_depth | 预计耗时 | 搜索/阅读量 | 适用场景 |
|-----------|---------|------------|---------|
| 5 | 1~3 分钟 | 10~40 / 0~20 | 快速探索 |
| 10 | 2~5 分钟 | 20~50 / 10~30 | 常规检索 |
| 10 | 2~5 分钟 | 20~50 / 10~30 | 常规检索、中文源测试 |
| 15 | 3~8 分钟 | 30~80 / 20~50 | 深度检索 |
| 25 | 5~15 分钟 | 50~150 / 30~80 | 全面研究 |
| 25 | 5~15 分钟 | 50~150 / 30~80 | 全面研究V2.0 生产配置) |
### 5.4 成本估算
### 成本估算
- 单次搜索 Token 消耗5万~30万 tokens取决于深度和站点数量
- 估算成本:约 ¥0.1~0.5/次(按 unifuncs 定价)
---
## 6. 平台集成方式
## 6. 平台集成架构
### 当前使用V1.x - ASL 模块
### V2.0 SSE + 异步 Worker 混合架构(当前
```
researchService.ts → OpenAI SDK → SSE 流式
researchWorker.ts → pg-boss → 异步执行
前端 DeepResearchPage
→ API: PUT /research/tasks/:taskId/execute
→ pg-boss Job Queue: asl_deep_research_v2
→ deepResearchV2Worker.ts
→ unifuncsSseClient.ts (SSE 流式)
→ 实时解析 reasoning_content → executionLogs → 写入 DB每2s刷写
→ 累积 content → 完成后解析为 synthesisReport + resultList
→ 前端 3s 轮询 DB → AgentTerminal 实时展示日志
```
### 计划升级V2.0 - ASL Deep Research
### 核心文件
```
requirementExpansionService.ts → DeepSeek-V3 需求扩写
unifuncsAsyncClient.ts → create_task / query_task 异步模式
deepResearchV2Worker.ts → pg-boss Worker → 轮询 + 日志解析
```
| 文件 | 说明 |
|------|------|
| `unifuncsSseClient.ts` | SSE 流式客户端AsyncGenerator 逐 chunk 返回 |
| `unifuncsAsyncClient.ts` | 异步客户端备选create_task / query_task |
| `deepResearchV2Worker.ts` | pg-boss Worker消费 SSE 流并实时写 DB |
| `reasoningParser.ts` | 将 reasoning_content 文本解析为结构化日志 |
| `resultParser.ts` | 将 content 解析为 synthesisReport + resultList |
### 其他模块可复用场景
@@ -275,21 +340,28 @@ deepResearchV2Worker.ts → pg-boss Worker → 轮询 + 日志解析
## 7. 测试脚本
项目中已提供两个测试脚本:
| 脚本 | 路径 | 用途 |
|------|------|------|
| 中文数据源专项测试 | `backend/src/modules/asl/__tests__/deep-research-chinese-sources.ts` | SSE 流式模式测试 CNKI + 中华医学期刊网 |
| 全站覆盖测试 | `backend/scripts/test-unifuncs-site-coverage.ts` | 并行测试 18 个医学网站的搜索能力 |
| ClinicalTrials 专项 | `backend/scripts/test-unifuncs-clinicaltrials.ts` | 4 种策略对比测试 ClinicalTrials.gov |
| 快速验证 | `backend/scripts/test-unifuncs-deepsearch.ts` | 单站点 SSE 流式快速测试 |
| E2E 集成测试 | `backend/src/modules/asl/__tests__/deep-research-v2-e2e.ts` | V2.0 全流程端到端测试 |
| Smoke 测试 | `backend/src/modules/asl/__tests__/deep-research-v2-smoke.ts` | V2.0 API 连通性快速验证 |
```bash
# 中文数据源专项测试SSE 流式,约 10~15 分钟)
cd backend
npx tsx src/modules/asl/__tests__/deep-research-chinese-sources.ts
# 全站覆盖测试
npx tsx scripts/test-unifuncs-site-coverage.ts
npx tsx scripts/test-unifuncs-clinicaltrials.ts
# E2E 集成测试(需先启动后端服务)
npx tsx src/modules/asl/__tests__/deep-research-v2-e2e.ts
```
---
**维护者:** 开发团队
**最后更新:** 2026-02-22
**最后更新:** 2026-02-23

View File

@@ -1,12 +1,13 @@
# AI智能文献模块 - 当前状态与开发指南
> **文档版本:** v1.6
> **文档版本:** v2.0
> **创建日期:** 2025-11-21
> **维护者:** AI智能文献开发团队
> **最后更新:** 2026-02-22 🆕 **Deep Research V2.0 开发计划确认 + Unifuncs API 网站覆盖测试完成**
> **最后更新:** 2026-02-23 🆕 **Deep Research V2.0 核心功能开发完成SSE 实时流 + 瀑布流 UI + 中文数据源 + Word 导出**
> **重大进展:**
> - 🆕 2026-02-22V2.0 开发计划确认!四步瀑布流 + 异步模式 + HITL 需求确认 + 务实结果展示
> - 🆕 2026-02-22Unifuncs API 网站覆盖测试完成18 站点实测9 个一级可用ClinicalTrials.gov 专项验证通过
> - 🆕 2026-02-23V2.0 核心功能完成SSE 流式架构 + 段落化思考日志 + 引用链接可见化
> - 🆕 2026-02-22V2.0 前后端联调完成!瀑布流 UI + Markdown 渲染 + Word 导出 + 中文数据源测试
> - 🆕 2026-02-22V2.0 开发计划确认 + Unifuncs API 网站覆盖测试完成
> - 2026-01-18智能文献检索DeepSearchMVP完成 - unifuncs API 集成
> **文档目的:** 反映模块真实状态,帮助新开发人员快速上手
@@ -30,46 +31,96 @@
AI智能文献模块是一个基于大语言模型LLM的文献筛选系统用于帮助研究人员根据PICOS标准自动筛选文献。
### 当前状态
- **开发阶段**🚧 V1.x 完成,V2.0 Deep Research 开发计划已确认,即将启动
- **开发阶段**🎉 V2.0 Deep Research 核心功能开发完成
- **已完成功能**
- ✅ 标题摘要初筛Title & Abstract Screening- 完整流程
- ✅ 全文复筛后端Day 2-5- LLM服务 + API + Excel导出
-**智能文献检索DeepSearchV1.x MVP** - unifuncs API 集成SSE 实时流式
-**智能文献检索DeepSearchV1.x MVP** - unifuncs API 集成
-**Unifuncs API 网站覆盖测试** - 18 站点实测9 个一级可用
-**Deep Research V2.0 开发计划** - 完整技术方案、API 契约、5 天分阶段计划
- **V2.0 开发中**
- 🚧 Deep Research V2.0 — 四步瀑布流Landing→配置→HITL→终端→结果
- 🚧 异步模式改造SSE → Unifuncs create_task/query_task
- 🚧 需求扩写 + HITL 确认 + Agent 终端 + 简洁结果展示 + Word 导出
- **模型支持**DeepSeek-V3需求扩写 + unifuncs s2深度搜索 + Qwen-Max筛选
-**🎉 Deep Research V2.0 核心功能** — SSE 流式架构 + 瀑布流 UI + HITL + Word 导出
- **V2.0 已完成**
- **SSE 流式架构**:从 create_task/query_task 轮询改为 OpenAI Compatible SSE 流,实时推送 AI 思考过程
- **LLM 需求扩写**DeepSeek-V3 将粗略输入扩写为结构化检索指令书PICOS + MeSH
- **HITL 策略确认**:用户可编辑、保存、确认 AI 生成的检索指令
- **瀑布流 UI**Landing → 配置 → HITL → Agent 终端 → 结果,已完成步骤折叠为摘要卡片
-**段落化思考日志**reasoning_content 按段落聚合,连续思考合并为一段(非逐行碎片)
-**Markdown 渲染**react-markdown + remark-gfm 正确渲染报告中的标题、链接、列表
-**引用链接可见化**:报告中 `[6]` 引用后显示完整 URL方便复制分享
-**Word 导出**Pandoc 微服务,文献标题内嵌超链接,引用展开为可见 URL
-**中文数据源支持**CNKI/中华医学期刊网动态 prompt 增强 + 专项测试验证
-**5 个精选数据源**PubMed默认、ClinicalTrials.gov、Cochrane Library、CNKI、中华医学期刊网
- **模型支持**DeepSeek-V3需求扩写 + unifuncs s2深度搜索SSE 流式) + Qwen-Max筛选
- **部署状态**:✅ 本地开发环境运行正常
### 🆕 Deep Research V2.02026-02-22 开发计划确认
### 🎉 Deep Research V2.02026-02-23 核心功能完成
**V2.0 核心升级**
- 四步瀑布流Landing → 配置 → HITL 策略确认 → Agent 终端 → 结果展示
- LLM 需求扩写DeepSeek-V3粗略输入 → 结构化自然语言检索指令书
- Human-in-the-Loop用户可编辑修改 AI 生成的检索需求
- **异步模式**SSE → Unifuncs create_task/query_task + pg-boss 队列(离开页面不中断)
- Agent 终端:暗色主题 + 分类结构化日志(每 3-5s 弹出一条)
- 简洁结果展示AI 综合报告Markdown+ 文献清单表格 + Word 导出
- **多站点搜索**9 个一级可用站点,用户可在前端选择数据源
**V2.0 架构与功能**
**V2.0 确认可用数据源2026-02-22 实测):**
| 层级 | 组件 | 说明 | 状态 |
|------|------|------|------|
| 前端 | 瀑布流页面 | Landing→配置→HITL→终端→结果折叠式摘要 | ✅ |
| 前端 | react-markdown | 综合报告 Markdown 正确渲染 + 引用链接可见化 | ✅ |
| 后端 | SSE 流式客户端 | OpenAI Compatible SSE实时推送 reasoning_content | ✅ |
| 后端 | 段落化解析器 | 连续思考行合并为段落,搜索/阅读/分析独立成条 | ✅ |
| 后端 | 需求扩写服务 | DeepSeek-V3 PICOS+MeSH 结构化扩写 | ✅ |
| 后端 | Word 导出 | Pandoc 微服务,内嵌超链接 + 引用展开 | ✅ |
| 后端 | pg-boss 队列 | 异步任务,离开页面不中断 | ✅ |
| 数据库 | 6 个新字段 | targetSources/confirmedRequirement/aiIntentSummary/executionLogs/synthesisReport/resultList | ✅ |
| 站点 | 站内链接数 | 说明 |
|------|-----------|------|
| PubMed | 28 | 核心数据源,效果最佳 |
| ClinicalTrials.gov | 38 | 必须英文查询max_depth≥10 |
| NCBI/PMC | 18 | 含 PMC 全文链接 |
| Google Scholar | 10 | 跨库聚合 |
| CBM/SinoMed | 9 | 中文生物医学 |
| CNKI | 7 | 中文核心期刊 |
| GeenMedical | 5 | 医学搜索引擎 |
| Cochrane Library | 4 | 系统综述金标准 |
| 维普 | 1 | 中文库 |
**V2.0 核心技术决策:**
1. **SSE 流式替代轮询**:从 create_task/query_task 轮询改为 OpenAI Compatible SSE 流。解决了"等很久才一股脑显示思考过程"的体验问题reasoning_content 实时推送、每 2 秒刷写 DB。
2. **段落化思考日志**reasoning_content 按 `\n\n` 段落拆分,同段落内连续思考行用空格合并为一条,搜索/阅读/分析动作独立。Worker 每 200+ 字符批量解析,写入前再合并连续同类条目。
3. **引用链接可见化**Web 端通过 react-markdown 自定义 `<a>` 组件在链接后追加灰色 URLWord 端通过 `expandReferenceLinks()``[[N]](url)` 展开为 `[N](url) (url)`
4. **中文数据源策略**纯中文源CNKI/中华医学期刊网)单独搜索效果好;混合中英文源时 PubMed 主导,建议分批搜索。
**开发计划**5 天分阶段交付,详见 `04-开发计划/07-Deep Research V2.0 开发计划.md`
**V2.0 选定数据源5 个精选):**
| 数据源 | 类型 | 默认选中 | 说明 |
|--------|------|----------|------|
| PubMed | 英文 | ✅ | 核心数据源,效果最佳 |
| ClinicalTrials.gov | 英文 | - | 临床试验注册库 |
| Cochrane Library | 英文 | - | 系统综述金标准 |
| 中国知网 CNKI | 中文 | - | 中文核心期刊 |
| 中华医学期刊网 | 中文 | - | 中华医学会官方期刊 |
**V2.0 API 端点:**
```http
POST /api/v1/asl/deep-research/generate-requirement # LLM
POST /api/v1/asl/deep-research/tasks # pg-boss
GET /api/v1/asl/deep-research/tasks/:taskId # ++
GET /api/v1/asl/deep-research/tasks/:taskId/export-word # Word
```
**V2.0 关键文件:**
```
backend/src/modules/asl/
├── services/unifuncsSseClient.ts # SSE 流式客户端AsyncGenerator
├── services/requirementExpansionService.ts # LLM 需求扩写
├── services/wordExportService.ts # Word 导出Pandoc + 引用展开)
├── workers/deepResearchV2Worker.ts # SSE Worker段落解析 + 2s 刷写)
├── utils/reasoningParser.ts # 段落化解析器 + mergeConsecutiveThinking
├── utils/resultParser.ts # content 解析(报告 + JSON 文献列表)
├── controllers/deepResearchController.ts # 4 个 API 端点
├── config/dataSources.ts # 5 个精选数据源配置
└── __tests__/
├── deep-research-v2-e2e.ts # 端到端测试
├── deep-research-v2-smoke.ts # 冒烟测试
└── deep-research-chinese-sources.ts # 中文数据源专项测试
frontend-v2/src/modules/asl/
├── pages/DeepResearchPage.tsx # 瀑布流主页面phase 0-4
├── components/deep-research/
│ ├── LandingView.tsx # 搜索入口
│ ├── SetupPanel.tsx # 数据源+过滤器配置(可折叠)
│ ├── StrategyConfirm.tsx # HITL 策略确认(可折叠)
│ ├── AgentTerminal.tsx # 暗色终端日志展示
│ └── ResultsView.tsx # Markdown 报告 + 文献表格 + Word 导出
├── hooks/useDeepResearchTask.ts # React Query 轮询 Hook
├── types/deepResearch.ts # TypeScript 类型
└── api/index.ts # 4 个 V2.0 API 函数
```
**开发计划**:详见 `04-开发计划/07-Deep Research V2.0 开发计划.md`
**通用能力指南**`docs/02-通用能力层/04-DeepResearch引擎/01-Unifuncs DeepSearch API 使用指南.md`
@@ -1319,28 +1370,28 @@ Drawer打开: <50ms
## 🎯 下一步开发计划
### 当前Sprint全文复筛MVP
1. 🚧 **全文复筛 Day 4**:批处理任务服务(进行中
2.**全文复筛 Day 5**前端UI开发待开始
3.**全文复筛 Day 6**API集成与联调待开始
### 当前Deep Research V2.0 优化
1. **端到端回归测试**:完整流程测试(创建→扩写→确认→执行→结果→导出
2.**用户体验打磨**:加载动画、错误提示、边界情况处理
3.**中文检索优化**:中英文混合检索策略调优(建议分批搜索
4.**导出格式完善**Word 模板美化、更多导出格式
### 短期优化(标题摘要初筛)
1. ⏳ Prompt优化提升准确率到85%+
2.添加任务暂停/取消功能
3.实现并发处理3-5个并发
4.添加估计剩余时间显示
### 短期优化
1. ⏳ Prompt 优化(需求扩写质量提升)
2.搜索历史管理(历史任务列表、重新搜索)
3.全文复筛前端 UI 开发
4.标题摘要初筛 Prompt 优化(准确率 60% → 85%+
### 中期Month 2
1. 🚧 全文复筛功能(开发中)
2.全文数据提取功能
3. ⏳ 用户自定义边界情况
4.WebSocket实时推送
1. 全文复筛功能完善
2.证据图谱可视化
3. ⏳ 用户自定义数据源
4.生产环境部署
### 长期Month 3+
1. ⏳ 多用户支持(真实认证)
2.消息队列Bull/RabbitMQ
3.分布式处理
4. ⏳ 成本控制和监控
1. ⏳ 多语言检索策略自动优化
2.批量文献检索
3.成本控制和监控
---
@@ -1350,15 +1401,14 @@ Drawer打开: <50ms
---
**最后更新**2025-11-22全文复筛 Day 2-3完成)
**最后更新**2026-02-23Deep Research V2.0 核心功能完成)
**文档状态**:✅ 反映真实状态
**下次更新时机**全文复筛MVP完成 或 标题摘要Prompt优化完成
**下次更新时机**V2.0 端到端回归测试完成 或 全文复筛前端开发启动
**本次更新内容**v1.1
- ✅ 更新当前状态(新增全文复筛开发进度
-更新关键里程碑Day 2-3完成
- ✅ 新增后端代码结构common层 + fulltext-screening层
-新增开发记录链接Day 2-3工作总结
- ✅ 更新下一步开发计划当前Sprint
**本次更新内容**v2.0
- ✅ 更新当前状态V2.0 核心功能开发完成SSE 流式 + 瀑布流 UI + Word 导出
-新增 V2.0 完整架构表、技术决策、API 端点、关键文件列表
- ✅ 新增 5 个精选数据源配置(替代 9 站全量展示
-更新下一步开发计划V2.0 优化 + 短期/中期/长期

View File

@@ -1,11 +1,12 @@
# Deep Research V2.0 开发计划
> **文档版本:** v1.0
> **文档版本:** v1.1
> **创建日期:** 2026-02-22
> **维护者:** 开发团队
> **前置文档:** PRD V4.1 / 原型图 V4.2 / 技术设计 V4.1
> **预计工期:** 5 天
> **核心理念:** 单页瀑布流 + 自然语言需求扩写 + 异步执行 + 务实结果展示
> **核心理念:** 单页瀑布流 + 自然语言需求扩写 + 异步执行 + 务实结果展示
> **v1.1 更新:** 融入审查建议Worker 重试、JSON 防崩溃、条件滚动、MeSH 扩展、Prompt 管理、数据源精简)
---
@@ -30,6 +31,9 @@
| 异步下的实时性 | **Worker 5s 轮询 + 前端 3s 轮询** | 用户每 3-5s 看到一条新日志,对分钟级 Agent 任务来说体验自然,比逐字流更适合终端 UI |
| 结果展示复杂度 | **报告 + 表格,不做图表看板** | 研究人员要的是内容本身(综合报告 + 文献清单图表是锦上添花非刚需MVP 不做 |
| Word 导出 | **复用 Pandoc** | Protocol Agent 已验证 Pandoc → Word 方案,零额外依赖 |
| 需求扩写 Prompt | **Prompt 管理服务(运营端可配)** | 使用 `ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION`,运营管理端可在线调优,代码中写兜底 Fallback |
| 数据源范围 | **精简为 5 个3英文+2中文** | 基于 18 站实测结果精选PubMed 默认勾选ClinicalTrials 标记需英文查询 |
| 状态管理 | **React Query + useState** | 服务端状态用 useQuery 轮询(自带缓存+去重),页面步骤用 useState不引入 Zustand |
---
@@ -135,9 +139,82 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
---
## 4. API 契约
## 4. 需求扩写 Prompt 设计
### 4.1 需求扩写(同步)
### 4.1 设计原则
需求扩写 Prompt 通过 **Prompt 管理服务**`ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION`)进行管理,运营端可在线调优,代码内置 Fallback 兜底。
| 原则 | 说明 |
|------|------|
| PICOS 结构化 | 引导 LLM 按 Population-Intervention-Comparison-Outcome-Study Design 拆解用户模糊需求 |
| MeSH 同义词扩展 | 自动补充专业 MeSH 术语(如 "他汀" → "Statins, Hydroxymethylglutaryl-CoA Reductase Inhibitors" |
| 默认高质量研究设计 | 若用户未指定,默认偏向 RCT、SR/MA、Cohort Study |
| 自然语言对话风格 | 输出"像资深医学信息官写给检索助手的一封邮件",方便 HITL 编辑 |
| 数据源感知 | Prompt 接收用户选择的数据源列表ClinicalTrials.gov 时自动生成英文指令段 |
| 不硬编码约束 | 不强制 Open Access / 不排除非英文文献 — 这些由用户在配置面板自主选择 |
### 4.2 Prompt 模板结构Fallback
```typescript
// backend/src/common/prompt/prompt.fallbacks.ts新增
const ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION = `
你是一位经验丰富的医学信息官Medical Information Officer
擅长将研究者的模糊想法转化为精准的文献检索需求指令。
## 任务
根据用户输入的粗略研究想法,生成一份结构化的深度文献检索指令书。
## 输出规则
1. **自然语言风格**:像写邮件一样,口语化但专业,方便研究者阅读和编辑
2. **PICOS 拆解**:明确 Population / Intervention / Comparison / Outcome / Study Design
3. **MeSH 扩展**:为关键术语补充 MeSH 同义词(用括号标注英文 MeSH 术语)
4. **研究设计偏好**:若用户未指定,默认优先 RCT、Systematic Review/Meta-Analysis、Cohort Study
5. **数据源适配**:根据用户选择的数据源列表调整语言和策略
- 若包含 ClinicalTrials.gov → 追加一段英文检索指令
- 若包含中文数据源CNKI/中华医学期刊网)→ 保留中文检索关键词
6. **不得自行添加约束**:不要擅自限定"仅开放获取"或"仅英文文献"
## 用户输入
- 研究想法:{{originalQuery}}
- 选择的数据源:{{targetSources}}
- 时间范围:{{yearRange}}
- 目标数量:{{targetCount}}
## 输出格式
请同时输出两部分:
### Part 1: 自然语言检索指令书
(可编辑的完整检索需求描述)
### Part 2: 结构化摘要JSON
\`\`\`json
{
"objective": "...",
"population": "...",
"intervention": "...",
"comparison": "...",
"outcome": "...",
"studyDesign": ["RCT", "Meta-analysis", ...],
"meshTerms": ["term1", "term2", ...],
"condition": "..."
}
\`\`\`
`;
```
### 4.3 Prompt 管理集成
| 层级 | 说明 |
|------|------|
| **运营端** | Prompt 管理界面 → `ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION` → 可在线编辑、版本管理、A/B 测试 |
| **代码 Fallback** | `prompt.fallbacks.ts` 写入默认模板,数据库无记录时自动使用 |
| **调用方式** | `promptService.getPrompt('ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION')` → 填充变量 → LLMFactory 调用 |
---
## 5. API 契约
### 5.1 需求扩写(同步)
**POST /api/v1/asl/research/generate-requirement**
@@ -145,7 +222,7 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
// 请求
{
originalQuery: string, // "他汀预防心血管疾病要能下载PDF的"
targetSources: string[], // ["pubmed.ncbi.nlm.nih.gov", "bmjopen.bmj.com"]
targetSources: string[], // 从精选数据源列表中选择(见 5.1.1
filters: {
yearRange?: string, // "2010至今" | "过去5年" | "不限"
targetCount?: string, // "~100篇" | "全面检索"
@@ -159,22 +236,40 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
data: {
taskId: "uuid", // 已创建DB记录status=draft
generatedRequirement: "请帮我执行一次深度的医学文献检索...", // LLM扩写结果
intentSummary: { // 结构化摘要
intentSummary: { // PICOS + MeSH 结构化摘要
objective: "为Meta分析构建测试语料库",
intervention: "他汀类药物 (Statins)",
condition: "心血管疾病 (CVD)",
literatureStandard: "高质量临床研究PDF全文可下载"
population: "心血管疾病高危患者",
intervention: "他汀类药物 (Statins, HMG-CoA Reductase Inhibitors)",
comparison: "安慰剂/未使用他汀",
outcome: "主要不良心血管事件 (MACE) 发生率",
studyDesign: ["RCT", "Meta-analysis", "Cohort"],
meshTerms: ["Hydroxymethylglutaryl-CoA Reductase Inhibitors", "Cardiovascular Diseases", "Primary Prevention"],
condition: "心血管疾病 (CVD)"
}
}
}
```
**实现要点:**
- 调用 `LLMFactory.getAdapter('deepseek-v3')` 进行需求扩写
- System Prompt 要求 LLM 输出结构化自然语言指令(非布尔检索式)
- 同时创建 DB 记录status = `draft`
#### 5.1.1 精选数据源配置
### 4.2 启动执行(进入异步队列)
基于 Unifuncs API 18 站实测结果精选的 5 个数据源:
| 类别 | 数据源 | domain_scope 值 | 默认 | 备注 |
|------|--------|-----------------|------|------|
| 🌍 英文 | **PubMed** | `https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/` | ✅ 默认勾选 | 一级可用,核心数据源 |
| 🌍 英文 | **ClinicalTrials.gov** | `https://clinicaltrials.gov/` | ☐ 可选 | ⚠️ 前端提示"需英文查询" |
| 🌍 英文 | **Cochrane Library** | `https://www.cochranelibrary.com/` | ☐ 可选 | 一级可用,系统综述金标准 |
| 🇨🇳 中文 | **中国知网 CNKI** | `https://www.cnki.net/` | ☐ 可选 | 二级可达,中文文献 |
| 🇨🇳 中文 | **中华医学期刊网** | `https://medjournals.cn/` | ☐ 可选 | 二级可达,中文文献 |
**实现要点:**
- 调用 `promptService.getPrompt('ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION')` 获取 Prompt无数据库记录时走 Fallback
- 填充变量 `{{originalQuery}}``{{targetSources}}``{{yearRange}}``{{targetCount}}`
- 调用 `LLMFactory.getAdapter('deepseek-v3')` 执行扩写
- 解析 LLM 输出Part 1 → `generatedRequirement`Part 2 JSON → `intentSummary`
- 创建 DB 记录status = `draft`
### 5.2 启动执行(进入异步队列)
**PUT /api/v1/asl/research/tasks/:id/execute**
@@ -193,7 +288,7 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
- `jobQueue.push('asl_deep_research_v2', { taskId })` 推入 pg-boss
- status 更新为 `pending`
### 4.3 任务状态与日志轮询
### 5.3 任务状态与日志轮询
**GET /api/v1/asl/research/tasks/:id**
@@ -221,7 +316,7 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
}
```
### 4.4 Word 导出
### 5.4 Word 导出
**GET /api/v1/asl/research/tasks/:id/export-word**
@@ -230,7 +325,7 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
- 调用 Pandoc 转 Word
- 返回 `.docx` 文件流
### 4.5 路由汇总
### 5.5 路由汇总
| 方法 | 路径 | 说明 | 新增/改造 |
|------|------|------|----------|
@@ -243,9 +338,9 @@ npx prisma migrate dev --name add_deep_research_v2_fields
---
## 5. 后台 Worker 逻辑
## 6. 后台 Worker 逻辑
### 5.1 核心流程(伪代码)
### 6.1 核心流程(伪代码)
```typescript
// backend/src/modules/asl/workers/deepResearchV2Worker.ts
@@ -278,14 +373,33 @@ export async function processDeepResearchV2(job: Job) {
data: { externalTaskId: unifuncsTaskId, status: 'running' }
});
// 2. 轮询 Unifuncs 直到完成
// 2. 轮询 Unifuncs 直到完成(含指数退避重试)
let previousReasoning = '';
const MAX_POLLS = 180; // 最多 15 分钟180 × 5s
const MAX_POLLS = 180; // 最多 15 分钟180 × 5s
let consecutiveErrors = 0; // 连续错误计数
const MAX_CONSECUTIVE_ERRORS = 5;
for (let i = 0; i < MAX_POLLS; i++) {
await sleep(5000);
const queryRes = await unifuncsClient.queryTask(unifuncsTaskId);
const data = queryRes.data;
let data: any;
try {
const queryRes = await unifuncsClient.queryTask(unifuncsTaskId);
data = queryRes.data;
consecutiveErrors = 0; // 成功后重置
} catch (err) {
consecutiveErrors++;
logger.warn(`Unifuncs query_task 第 ${consecutiveErrors} 次失败`, { taskId, error: err.message });
if (consecutiveErrors >= MAX_CONSECUTIVE_ERRORS) {
throw new Error(`Unifuncs 连续 ${MAX_CONSECUTIVE_ERRORS} 次查询失败: ${err.message}`);
}
// 指数退避2s → 4s → 8s → 16s → 32s
const backoffMs = Math.min(2000 * Math.pow(2, consecutiveErrors - 1), 32000);
await sleep(backoffMs);
continue;
}
// 解析增量日志
const currentReasoning = data.result?.reasoning_content || '';
@@ -306,7 +420,7 @@ export async function processDeepResearchV2(job: Job) {
const content = data.result?.content || '';
const report = extractSection(content, 'REPORT_SECTION');
const jsonList = extractSection(content, 'JSON_LIST_SECTION');
const parsedList = safeParseJsonList(jsonList);
const parsedList = safeParseJsonList(jsonList); // 防崩溃 JSON 解析,见 6.4
await prisma.aslResearchTask.update({
where: { id: taskId },
@@ -336,7 +450,15 @@ export async function processDeepResearchV2(job: Job) {
}
```
### 5.2 日志解析逻辑
**v1.1 新增 — 轮询韧性设计:**
| 机制 | 策略 | 说明 |
|------|------|------|
| 瞬态失败重试 | 指数退避 2s → 4s → 8s → 16s → 32s | 网络抖动、Unifuncs 临时不可用时自动恢复 |
| 连续失败阈值 | `MAX_CONSECUTIVE_ERRORS = 5` | 连续 5 次查询全失败才标记任务 failed |
| 成功后重置 | `consecutiveErrors = 0` | 中间穿插成功不累计 |
### 6.2 日志解析逻辑
```typescript
function parseReasoningToLogs(increment: string): LogEntry[] {
@@ -360,7 +482,7 @@ function parseReasoningToLogs(increment: string): LogEntry[] {
}
```
### 5.3 output_prompt 设计
### 6.3 output_prompt 设计
```typescript
function buildOutputPrompt(): string {
@@ -381,11 +503,55 @@ function buildOutputPrompt(): string {
}
```
### 6.4 JSON 解析防崩溃v1.1 新增)
LLM 输出的 JSON 常携带 ` ```json ` 代码围栏或尾部逗号,直接 `JSON.parse` 会崩溃。
```typescript
function safeParseJsonList(raw: string | null): any[] | null {
if (!raw) return null;
// Step 1: 去除 Markdown 代码围栏
let cleaned = raw.replace(/```json\s*/gi, '').replace(/```\s*/g, '');
// Step 2: 去除尾部逗号(数组/对象末尾的 ,] 或 ,}
cleaned = cleaned.replace(/,\s*([}\]])/g, '$1');
// Step 3: 尝试解析
try {
const parsed = JSON.parse(cleaned);
return Array.isArray(parsed) ? parsed : [parsed];
} catch (e) {
logger.warn('JSON 解析失败,尝试正则提取', { error: e.message });
// Step 4: 降级 — 尝试逐行提取 JSON 对象
const objects: any[] = [];
const regex = /\{[^{}]*\}/g;
let match;
while ((match = regex.exec(cleaned)) !== null) {
try {
objects.push(JSON.parse(match[0]));
} catch { /* 跳过无法解析的单条 */ }
}
return objects.length > 0 ? objects : null;
}
}
```
**防崩溃策略总结:**
| 层级 | 处理 | 覆盖场景 |
|------|------|---------|
| L1 | 去除 ` ```json ` 围栏 | LLM 习惯性包裹代码块 |
| L2 | 去除尾部逗号 | `[{...}, {...},]``[{...}, {...}]` |
| L3 | 标准 JSON.parse | 正常路径 |
| L4 | 正则逐条提取 | JSON 结构被破坏但单条仍有效 |
| L5 | 返回 null | 彻底无法解析,前端降级展示报告 |
---
## 6. 前端组件设计
## 7. 前端组件设计
### 6.1 页面结构
### 7.1 页面结构
```
frontend-v2/src/modules/asl/pages/
@@ -400,10 +566,18 @@ frontend-v2/src/modules/asl/components/
│ └── ResultsView.tsx # Step 4: 结果展示(报告+表格)
```
### 6.2 状态管理
### 7.2 状态管理
**设计决策:** React Query + useState不引入 Zustandv1.1 确认)
| 状态类型 | 工具 | 理由 |
|---------|------|------|
| 服务端数据(任务状态、日志、结果) | `@tanstack/react-query` | 自带缓存、去重、条件轮询refetchInterval完美匹配轮询场景 |
| 页面步骤流转 | `useState` | 仅 5 个步骤的 FSM组件树内部流转无需全局状态 |
| 组件间共享(如 taskId | `props drilling` / `React.memo` | 组件层级仅 2-3 层prop 传递足够,不需要 Context/Zustand |
```typescript
// 页面级状态useState 即可,无需 Zustand
// 页面级状态useState 即可,不引入 Zustand
interface DeepResearchState {
currentStep: 'landing' | 'setup' | 'strategy' | 'terminal' | 'results';
taskId: string | null;
@@ -412,29 +586,55 @@ interface DeepResearchState {
intentSummary: IntentSummary | null;
isGenerating: boolean; // 需求扩写中
}
// PICOS + MeSH 结构化摘要v1.1 新增)
interface IntentSummary {
objective: string;
population: string;
intervention: string;
comparison: string;
outcome: string;
studyDesign: string[];
meshTerms: string[];
condition: string;
}
```
### 6.3 各组件核心逻辑
### 7.3 各组件核心逻辑
**LandingViewLanding 大搜索框)**
- 居中大输入框 + "开始研究"按钮 + 推荐预置词
- 点击后携带输入值,平滑过渡到 SetupPanel
- 参考原型图 V4.2 的 `#landing-view` 部分
**SetupPanelStep 1: 配置)**
**SetupPanelStep 1: 配置)** *(v1.1 数据源更新)*
- 继承 Landing 输入值到 textarea
- 数据源 CheckboxPubMed/PMC, BMJ Open, Cochrane
- 高级过滤年份下拉、目标数量、OA 强制)
- 数据源 Checkbox基于实测精选 5 个,见 5.1.1
- 🌍 **英文数据源**
- [x] PubMed默认勾选不可取消
- [ ] ClinicalTrials.gov — ⚠️ 旁标橙色提示:"该站点需要英文查询,系统将自动为此数据源生成英文检索指令"
- [ ] Cochrane Library
- 🇨🇳 **中文数据源**
- [ ] 中国知网 CNKI
- [ ] 中华医学期刊网
- 高级过滤年份下拉、目标数量、OA 偏好 — 注意是偏好非强制)
- 点击"解析并生成检索需求书" → POST /generate-requirement
- Loading 后平滑展开 Step 2
**StrategyConfirmStep 2: HITL 确认)**
- 左侧 1/3AI 意图提炼卡片(只读,来自 `intentSummary`
- 右侧 2/3可编辑 textarea内容为 `generatedRequirement`
- 提示文案:"您可以像写邮件一样在这里补充任何大白话要求"
**StrategyConfirmStep 2: HITL 确认)** *(v1.1 PICOS + MeSH)*
- 左侧 1/3AI 意图提炼卡片(只读,PICOS 结构化展示
- 🎯 研究目标:`objective`
- 👥 研究人群:`population`
- 💊 干预措施:`intervention`(含 MeSH 英文术语)
- ⚖️ 对照组:`comparison`
- 📊 结局指标:`outcome`
- 📋 研究设计:`studyDesign` Tag 列表
- 🏷️ MeSH 术语:`meshTerms` 小标签展示
- 右侧 2/3可编辑 textarea内容为 `generatedRequirement`,自然语言对话风格)
- 提示文案:"这是 AI 以医学信息官的视角为您扩写的检索需求,您可以像写邮件一样直接编辑修改"
- 点击"确认需求,启动 Deep Research" → PUT /execute
**AgentTerminalStep 3: 暗黑终端)**
**AgentTerminalStep 3: 暗黑终端)** *(v1.1 条件滚动)*
- 暗色背景bg-slate-900固定高度 550px内部滚动
- 顶部状态栏:红/黄/绿圆点 + "Running" 脉冲指示灯
- 日志渲染:
@@ -443,7 +643,10 @@ interface DeepResearchState {
- `done` → 绿色 + ✅ 图标
- `summary` → 黄色 + 📋 图标
- 轮询逻辑:`useQuery` + refetchInterval: 3000running 时启用)
- 新日志出现时 auto-scroll 到底部
- **条件自动滚动**v1.1 新增):
- 用户**未手动上滚**时 → 新日志自动滚到底部
- 用户**已手动上滚**查看历史 → 停止自动滚动,避免打断阅读
- 实现:`onScroll` 检测 `scrollTop + clientHeight < scrollHeight - threshold``userScrolled` flag
- 完成后状态灯变灰 "Finished",终端可折叠
**ResultsViewStep 4: 结果)**
@@ -454,8 +657,9 @@ interface DeepResearchState {
- 列:标题(可点击跳转 PubMed、期刊、年份、类型 Tag、PDF 状态
- 支持简单搜索过滤
- 分页(前端分页即可,数据量 ~100 条)
- **降级展示**:若 `resultList` 为 nullJSON 解析失败),隐藏表格,仅展示综合报告
### 6.4 轮询 Hook
### 7.4 轮询 Hook
```typescript
// hooks/useDeepResearchTask.ts
@@ -474,94 +678,105 @@ function useDeepResearchTask(taskId: string | null) {
---
## 7. 复用清单(不重复造轮子)
## 8. 复用清单(不重复造轮子)
| 能力 | 来源 | 用法 |
|------|------|------|
| LLM 调用 | `common/llm/LLMFactory` | DeepSeek-V3 需求扩写 |
| **Prompt 管理** | `common/prompt/promptService` | `ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION` Prompt 获取(运营端可配 + 代码 Fallback |
| pg-boss 队列 | `common/jobs/jobQueue` | Worker 注册与任务推送 |
| 日志服务 | `common/logging/logger` | 全程结构化日志 |
| 认证中间件 | `common/auth/authenticate` | 所有 API 路由 |
| Prisma 全局实例 | `config/database` | 数据库操作 |
| Word 导出 | PandocPython 微服务) | 复用 Protocol Agent 验证的方案 |
| DeepResearch 引擎 | `common/deepresearch/` | Unifuncs API 封装create_task / query_task |
| 前端 API Client | `common/api/axios` | 带认证的请求 |
| 前端布局 | `ASLLayout.tsx` | 左侧导航 |
---
## 8. 分阶段开发计划
## 9. 分阶段开发计划
### Phase 1: 数据库 + 需求扩写Day 1
### Phase 1: 数据库 + Prompt 管理 + 需求扩写Day 1
**目标:** 用户输入粗略想法 → AI 扩写为结构化指令书 → 用户可编辑修改
**目标:** 用户输入粗略想法 → AI 按 PICOS 框架扩写为结构化指令书 → 用户可编辑修改
| 任务 | 文件 | 说明 |
|------|------|------|
| Schema 迁移 | `prisma/schema.prisma` | 新增 6 个字段,`prisma migrate dev` |
| 需求扩写 Prompt | `services/requirementExpansionService.ts` | 新建服务,调用 DeepSeek-V3 扩写 |
| **Prompt Fallback** | `common/prompt/prompt.fallbacks.ts` | 新增 `ASL_DEEP_RESEARCH_EXPANSION` 兜底模板PICOS + MeSH |
| 需求扩写服务 | `services/requirementExpansionService.ts` | 新建,调用 promptService → LLMFactory → 解析 Part 1/Part 2 输出 |
| 扩写 API | `controllers/researchController.ts` | 新增 `POST /generate-requirement` |
| 启动 API | `controllers/researchController.ts` | 新增 `PUT /tasks/:id/execute` |
| 状态 API 改造 | `controllers/researchController.ts` | 改造 `GET /tasks/:id`,返回新字段 |
| 状态 API 改造 | `controllers/researchController.ts` | 改造 `GET /tasks/:id`,返回新字段(含 PICOS intentSummary |
| **数据源配置** | `config/dataSources.ts` | 新建,定义 5 个精选数据源常量domain、label、默认状态、备注 |
| 路由注册 | `routes/index.ts` | 注册新端点 |
**验收标准:**
- [ ] `POST /generate-requirement` 返回扩写后的指令书
- [ ] `POST /generate-requirement` 返回 PICOS 结构化摘要 + 自然语言指令书
- [ ] Prompt 从数据库加载,无记录时自动走 Fallback
- [ ] `PUT /tasks/:id/execute` 成功推入 pg-boss 队列
- [ ] `GET /tasks/:id` 返回含新字段的完整数据
- [ ] 选择 ClinicalTrials.gov 时,扩写结果包含英文检索指令段
### Phase 2: Worker 改造 — Unifuncs 异步模式Day 2
**目标:** Worker 使用 create_task + query_task 轮询,增量日志写入 DB
**目标:** Worker 使用 create_task + query_task 轮询(含指数退避),增量日志写入 DB
| 任务 | 文件 | 说明 |
|------|------|------|
| Unifuncs 异步客户端 | `services/unifuncsAsyncClient.ts` | 新建,封装 create_task / query_task |
| V2 Worker | `workers/deepResearchV2Worker.ts` | 新建,轮询 + 日志解析 + 结果切割 |
| V2 Worker | `workers/deepResearchV2Worker.ts` | 新建,轮询 + 指数退避重试 + 日志解析 + 结果切割 |
| 日志解析器 | `utils/reasoningParser.ts` | 新建reasoning_content → 结构化日志 |
| 结果解析器 | `utils/resultParser.ts` | 新建XML 标签切割报告与 JSON 列表 |
| **结果解析器** | `utils/resultParser.ts` | 新建XML 标签切割 + `safeParseJsonList` 防崩溃解析 |
| Worker 注册 | `workers/researchWorker.ts` | 注册新 Worker `asl_deep_research_v2` |
**验收标准:**
- [ ] Worker 成功调用 unifuncs create_task
- [ ] 轮询期间 execution_logs 持续增量更新
- [ ] 完成后 synthesis_report 和 result_list 正确入库
- [ ] **韧性测试**:模拟单次 query_task 失败 → 指数退避后自动恢复
- [ ] **JSON 防崩溃**LLM 输出带 ` ```json ` 围栏 → safeParseJsonList 正确解析
- [ ] 超时保护15 分钟)和错误处理正常
### Phase 3: 前端 — Landing + 配置 + HITL 确认Day 3
**目标:** 完成 Step 1-2 的前端交互,瀑布流渐进展开
**目标:** 完成 Step 1-2 的前端交互,瀑布流渐进展开PICOS 结构化展示
| 任务 | 文件 | 说明 |
|------|------|------|
| 主页面骨架 | `pages/DeepResearchPage.tsx` | 新建,管理瀑布流状态 |
| 主页面骨架 | `pages/DeepResearchPage.tsx` | 新建,useState 管理瀑布流步骤 |
| Landing 组件 | `components/deep-research/LandingView.tsx` | 大搜索框 + 推荐预置词 |
| 配置面板 | `components/deep-research/SetupPanel.tsx` | 数据源 + 高级过滤 + 生成按钮 |
| HITL 确认 | `components/deep-research/StrategyConfirm.tsx` | 左右分栏 + 可编辑 textarea |
| **配置面板** | `components/deep-research/SetupPanel.tsx` | **精选 5 数据源 Checkbox**(含 ClinicalTrials.gov 英文提示)+ 高级过滤 |
| **HITL 确认** | `components/deep-research/StrategyConfirm.tsx` | 左**PICOS + MeSH 卡片** + 右侧可编辑 textarea |
| API 函数 | `api/index.ts` | 新增 generateRequirement / executeTask |
| 路由注册 | `pages/index.tsx` | 新增 V2 路由 |
**验收标准:**
- [ ] Landing 输入 → Step 1 配置面板流畅过渡
- [ ] 数据源显示 5 个选项PubMed 默认勾选ClinicalTrials.gov 标注英文提示
- [ ] 点击"生成需求书" → Loading → Step 2 展开
- [ ] Step 2 左侧摘要卡片正确展示,右侧 textarea 可编辑
- [ ] Step 2 左侧 PICOS 结构化摘要 + MeSH 术语标签正确展示
- [ ] Step 2 右侧 textarea 显示自然语言对话风格的检索指令书,可编辑
- [ ] 点击"启动 Deep Research" → 进入 Step 3
### Phase 4: 前端 — 终端 + 结果展示Day 4
**目标:** 完成 Step 3-4终端实时日志 + 结果报告/表格
**目标:** 完成 Step 3-4终端实时日志(条件滚动)+ 结果报告/表格(含降级)
| 任务 | 文件 | 说明 |
|------|------|------|
| 暗黑终端 | `components/deep-research/AgentTerminal.tsx` | 日志渲染 + auto-scroll + 状态灯 |
| 结果视图 | `components/deep-research/ResultsView.tsx` | 横幅 + 报告 + 文献表格 |
| 轮询 Hook | `hooks/useDeepResearchTask.ts` | 3s 轮询running 时启用 |
| **暗黑终端** | `components/deep-research/AgentTerminal.tsx` | 日志渲染 + **条件 auto-scroll** + 状态灯 |
| 结果视图 | `components/deep-research/ResultsView.tsx` | 横幅 + 报告 + 文献表格 + **降级展示** |
| 轮询 Hook | `hooks/useDeepResearchTask.ts` | React Query 3s 轮询running 时启用 |
| 终端样式 | CSS / Tailwind | 暗色主题 + 日志类型着色 |
**验收标准:**
- [ ] 终端日志按类型着色,新日志 auto-scroll
- [ ] 终端日志按类型着色,未手动滚动时 auto-scroll,手动上滚时暂停
- [ ] 完成后终端折叠,结果区展开
- [ ] 综合报告 Markdown 渲染正确
- [ ] 文献清单表格展示(标题可点击跳转 PubMed
- [ ] **降级验证**resultList 为 null 时,隐藏表格仅展示报告
- [ ] 全流程端到端联调通过
### Phase 5: Word 导出 + 收尾Day 5
@@ -585,7 +800,7 @@ function useDeepResearchTask(taskId: string | null) {
---
## 9. 验收标准总览
## 10. 验收标准总览
### 功能验收
@@ -608,17 +823,36 @@ function useDeepResearchTask(taskId: string | null) {
---
## 10. 风险与应对
## 11. 风险与应对
| 风险 | 概率 | 影响 | 应对措施 |
|------|------|------|---------|
| Unifuncs 异步模式下 reasoning_content 不增量更新 | 低 | 终端日志为空 | 降级方案:只显示 progress.message |
| output_prompt XML 标签分割不可靠 | 中 | 报告和列表无法分离 | 降级方案:整体作为报告展示,文献从 PubMed 链接提取 |
| **LLM 输出 JSON 格式不规范** | 中 | 文献列表解析失败 | `safeParseJsonList` 四层防崩溃(围栏清理 → 尾逗号 → 标准解析 → 正则逐条),见 6.4 |
| **Unifuncs query_task 瞬态失败** | 中 | 轮询中断 | 指数退避重试2s→32s连续 5 次失败才标记 failed见 6.1 |
| Unifuncs 长任务超时 | 低 | 任务失败 | MAX_POLLS=18015分钟超时标记 failed用户可重试 |
| **ClinicalTrials.gov 中文查询失败** | 高 | 临床试验检索无结果 | Prompt 自动为该数据源生成英文检索指令段,前端标注提示 |
| Pandoc Word 导出在 SAE 不可用 | 低 | 导出失败 | 降级方案:导出为 Markdown 文件 |
| **Prompt 管理服务不可用** | 低 | 需求扩写失败 | 代码内置 Fallback 模板,数据库无记录时自动使用 |
---
## 附录v1.1 更新变更记录
| 变更项 | 章节 | 说明 |
|--------|------|------|
| Prompt 管理集成 | §4新增 | 需求扩写 Prompt 通过 Prompt 管理服务配置,含 PICOS + MeSH 扩展 |
| 精选数据源 | §5.1.1(新增) | 基于 18 站实测精选 5 个数据源3英文+2中文 |
| 指数退避重试 | §6.1(更新) | Worker 轮询增加瞬态失败指数退避2s→32s |
| JSON 防崩溃 | §6.4(新增) | safeParseJsonList 四层解析策略 |
| PICOS 摘要 | §7.2, §7.3(更新) | IntentSummary 扩展为 PICOS + MeSH 结构 |
| 条件自动滚动 | §7.3(更新) | AgentTerminal 手动上滚时暂停 auto-scroll |
| 状态管理确认 | §1.2, §7.2(更新) | 确认 React Query + useState不引入 Zustand |
| 降级展示 | §7.3(更新) | ResultsView 在 resultList=null 时仅展示报告 |
---
**文档维护者:** 开发团队
**最后更新:** 2026-02-22
**文档状态:**方案确认,待开发启动
**文档状态:**v1.1 方案确认(含审查建议),待开发启动

View File

@@ -0,0 +1,72 @@
# **Deep Research V2.0 开发计划审查与优化建议书**
**审查对象:** 07-Deep Research V2.0 开发计划.md
**审查基准:** V4.1 PRD、Unifuncs API 官方文档、系统高可用性架构标准
**审查结论:** 整体架构设计pg-boss \+ 异步轮询 \+ 单页瀑布流)非常优秀。但在**容错机制、数据解析提取、前端状态管理、以及终端 UX 细节**上存在明显隐患,需进行针对性修正。
## **🔴 一、 核心高危风险与修正建议 (Critical Risks & Fixes)**
### **1\. Unifuncs 轮询逻辑的“脆弱性” (Worker 改造部分)**
* **原计划缺陷:** 在 deepResearchV2Worker.ts 的伪代码中,轮询逻辑简单地使用了 await unifuncsClient.queryTask()。如果在长达 15 分钟的轮询中,发生了一次短暂的网络抖动或 Unifuncs 网关返回了 502/504整个 try-catch 就会抛出异常,导致这个耗费了大量时间的长任务直接 failed。
* **修正方案:**
在 Worker 的 while 循环内部,**必须包裹 try-catch 并引入重试机制Exponential Backoff**。遇到网络请求失败时,不能直接退出,而是应该记录 warning 并 continue 等待下一次 5s 后的轮询,连续失败超过 5 次才判定任务崩溃。
### **2\. 输出解析的“幻觉陷阱” (JSON Parsing)**
* **原计划缺陷:** 计划中提到使用 extractSection 提取 \<JSON\_LIST\_SECTION\> 后,直接调用 safeParseJsonList。但在实际的大模型输出中即便你规定了 XML 标签,模型极大概率会在标签内输出 Markdown 代码块,例如:
\<JSON\_LIST\_SECTION\>
\`\`\`json
\[{"title": "..."}\]
\</JSON\_LIST\_SECTION\>
如果直接 \`JSON.parse()\` 必定报错崩溃。
* **修正方案:**
utils/resultParser.ts 中的 safeParseJsonList 方法**必须**包含预处理逻辑:
1. 使用正则清洗掉可能存在的 json\` 和 首尾包裹符。
2. 增加**兜底方案 (Fallback)**:如果正则和清洗均宣告失败,调用一次系统自带的 DeepSeek-V3传入提取出的坏字符串要求其强制吐出标准 JSON Array利用 response\_format: { type: "json\_object" }),确保 Step 4 的表格必定能渲染。
## **🟡 二、 前端架构与交互体验优化 (Frontend UX/Architecture)**
### **1\. 终端日志自动滚动的“反人类”交互 (AgentTerminal)**
* **原计划缺陷:** 计划中提到“新日志出现时 auto-scroll 到底部”。如果用户在长达 5 分钟的执行过程中,向上滚动滚轮想查看之前的思考日志,此时新日志一推过来,页面又被强制拉回到底部,这种体验非常“反人类”。
* **修正方案:**
修改 Auto-scroll 触发逻辑:前端通过 ref 判断当前滚动条位置,**只有当用户处于滚动条最底部(或距离底部 \< 50px收到新日志才自动滚动到底部**。如果用户已经向上滚动阅读历史,则只在容器内部静默追加日志,不改变视口位置(可浮现一个“↓ 有新日志”的提示小红点)。
### **2\. 前端状态管理的“螺旋地狱” (State Management)**
* **原计划缺陷:** 计划在 6.2 节中明确写道“页面级状态useState 即可,无需 Zustand”。
这是一个有 4 个复杂步骤Landing \-\> Setup \-\> HITL \-\> Terminal \-\> Results的单页应用。如果将 taskId、query、logs、step 全塞在父组件的 useState 里,会导致极其严重的**属性透传Prop Drilling和父组件频繁全量重渲染**。
* **修正方案:**
坚决反对在此场景下仅使用 useState。建议使用现有的 @tanstack/react-query 缓存状态,或者引入极其轻量的 Context API / Zustand。特别是终端日志Logs频繁追加时不能让整个大页面跟着一起重绘终端组件应当是局部渲染的。
## **🟢 三、 业务细节与数据闭环补充 (Business Details)**
### **1\. Word 导出功能的缺失逻辑 (Word Export)**
* **原计划缺陷:** 提到“报告 \+ 文献表格 → 完整 Markdown → Pandoc 转 Word”。但 result\_list 存的是 JSON ArrayPandoc 不认识 JSON。
* **修正方案:**
在 services/wordExportService.ts 中,需要明确增加一步\*\*“JSON to Markdown Table”\*\*的转化方法。
即把 JSON 数组转化为:
| 文献标题 | 期刊 | 发表年份 | 链接 |
|---|---|---|---|
| Efficacy of... | Lancet | 2023 | \[PubMed\](...) |
再将这个生成的 Markdown Table 拼接到 synthesis\_report 的末尾,最后统一送给 Pandoc 渲染。
### **2\. 第一步“需求扩写”的成本追踪漏洞**
* **原计划缺陷:**
数据库 Schema 只增加了 Unifuncs 任务的 tokenUsage 记录。但 Step 1 中,调用本地 DeepSeek-V3 把一句话扩写成几百字的“自然语言指令书”,也是要消耗 Token 的。
* **修正方案:**
在 AslResearchTask 模型中,应将 tokenUsage 分离或扩展为能够记录两次消耗的结构。例如internal\_token\_usage (记录扩写的成本) 和 external\_token\_usage (记录 Unifuncs 成本),以实现精细化的财务核算。
## **📝 最终评审结论**
请开发团队长仔细阅读上述 6 条修正建议,并同步更新到研发 Task 列表中。
特别是在\*\*【JSON解析防崩溃】**和**【终端条件自动滚动】\*\*这两点上,直接决定了本次 V2.0 交付的“工业级质感”。只要把控好这几个细节,原有的技术路线完全可以跑通,且效果会非常惊艳!

View File

@@ -0,0 +1,114 @@
# **Deep Research 需求扩写 Prompt 设计与检索维度指南**
**设计者:** 医学信息官 (MIO)
**应用场景:** ASL Deep Research V2.0 (MVP) \- Step 1 需求转化阶段
**底层引擎:** 本地 DeepSeek-V3 / Qwen-Max (负责扩写) \-\> Unifuncs (负责执行)
## **一、 文献检索维度的解构 (MIO 视角)**
要把用户的“一句话”扩写成一份严谨的检索指令书LLM 必须脑补并结构化以下维度。这些维度将直接决定 Unifuncs 引擎去哪些网页、抓取什么关键词、过滤什么条件。
### **🚨 1\. 必须项 (Mandatory Fields \- 决定检索成败)**
如果用户没提LLM 必须根据医学常识自动补齐其合理范围;如果补不齐,应设置默认的最优标准。
1. **核心疾病/目标人群 (Population):** 必须明确适应症。*(例如用户说“他汀”LLM必须根据常识扩写出可能针对的“高脂血症”或“心血管疾病预防”人群)*。
2. **核心干预措施 (Intervention):** 具体的药物、疗法或器械。
3. **目标文献类型 (Study Design \- 极度重要):** 在循证医学中文献类型决定了证据等级。如果用户没说LLM 默认必须限定为:**高质量的随机对照试验 (RCT)、前瞻性队列研究、系统综述与 Meta 分析**。绝不能让引擎去抓取个案报道 (Case Report) 或动物实验。
4. **获取约束 (Access Rule):** 这是我们系统的硬杠杠。必须强制要求:**仅限开放获取 (Open Access) 且包含完整 PDF 链接的文献**。
### **💡 2\. 可选项 (Optional Fields \- 提升查准率)**
用户如果有提及要强化如果没提及LLM 可以适当发散或留白。
1. **对照组 (Comparison):** 安慰剂 (Placebo) 还是标准疗法 (Standard of Care)。
2. **特定结局指标 (Outcomes):** 比如 OS (总生存期)、MACE (主要心血管不良事件)、AEs (不良反应)。
3. **同义词与 MeSH 词扩展 (Synonyms Expansion):** 这是体现“专业性”的核心!用户可能只输入了 "心衰"LLM 必须在指令书里附带提供 "Heart Failure", "HFrEF", "HFpEF" 等检索词,供 Unifuncs 扩大查全率。
## **二、 核心 System Prompt 设计 (可以直接写入代码)**
请将以下 Prompt 部署到 services/requirementExpansionService.ts 中。
\# Role
你是一名受过严谨训练的“临床医学信息专家Medical Information Officer”与循证医学图书管理员。
\# Task
用户的输入往往是口语化且不完整的临床检索诉求。你的任务是将用户简短的一句话,扩写、翻译并结构化为一份《深度检索指令书》。
这份指令书将直接发送给另一个拥有自主上网能力的 AI 深搜引擎Agent去执行。因此你的语言必须清晰、专业、逻辑严密并利用你的医学知识为用户补全隐含的专业要求。
\# Instructions & Rules
1\. \*\*理解与补全 (PICOS)\*\* 基于用户的输入,识别 P (人群)、I (干预)、C (对照)、O (结局)、S (研究类型)。
2\. \*\*强制文献质量过滤:\*\* 如果用户没有指定文献类型,你必须强制添加:“优先获取 随机对照试验(RCT)、前瞻性队列研究、系统综述与Meta分析排除动物实验、体外研究、个案报道及非英文文献”。
3\. \*\*强制数据可及性:\*\* 必须在指令中强调:“只提取开放获取 (Open Access) 且附带有效 PDF 全文下载链接的文献”。
4\. \*\*扩展专业检索词 (MeSH)\*\* 利用你的医学知识,将用户的中文或俗称,扩展为标准的英文医学主题词 (MeSH) 和常见缩写,写在【扩展检索词库】中,指导深搜引擎扩大召回率。
\# Output Format (严格遵循以下 Markdown 结构,不要输出额外废话)
请帮我执行一次深度的医学文献检索。以下是具体的检索要求:
【核心检索主题】
(一句话总结用户意图例如评估XXX在YYY中的疗效与安全性)
【目标人群与干预措施】
\- 人群 (Population)(详细描述疾病阶段、特征,如无明确要求则合理推断)
\- 干预 (Intervention / Comparison)(具体的药物、疗法及可能的对照)
【关注的结局指标 (Outcomes)】
(列出该领域常见的核心指标,如 OS, PFS, 并发症发生率等。如果用户指定了则用用户的)
【目标文献类型与质量要求】
\- 必须是:随机对照试验 (RCT)、队列研究、系统综述与 Meta 分析。
\- 强制排除:动物实验、体外细胞研究、个案报道。
\- 强制获取要求:必须是开放获取 (Open Access) 的文献,且必须能获取 PDF 全文或完整 XML 数据。对于需要付费墙 (Paywall) 的文献请予以忽略。
【扩展检索词库 (供搜索引擎参考)】
(列出 5-8 个核心的英文专业词汇、MeSH词或缩写用逗号分隔。例如Hydroxymethylglutaryl-CoA Reductase Inhibitors, Heart Failure, MACE...)
## **三、 效果演示 (Before vs After)**
你可以看到,经过这个 Prompt 处理后,原本干瘪的需求变得极其丰满,且直接指导了 Unifuncs 引擎该怎么做。
### **🧑‍⚕️ 医生的粗略输入 (前端传入)**
"替雷利珠单抗治疗非小细胞肺癌只要带PDF的"
### **🤖 LLM 扩写后的指令书 (前端 Step 2 展示给用户确认)**
请帮我执行一次深度的医学文献检索。以下是具体的检索要求:
**【核心检索主题】**
评估替雷利珠单抗Tislelizumab在治疗非小细胞肺癌NSCLC中的疗效与安全性。
**【目标人群与干预措施】**
* **人群 (Population)** 晚期、局部晚期或转移性非小细胞肺癌患者(可包含一线或二线治疗人群)。
* **干预 (Intervention / Comparison)** 替雷利珠单抗单药或联合化疗,对照组可为标准含铂双药化疗或安慰剂。
**【关注的结局指标 (Outcomes)】**
重点关注总生存期 (OS)、无进展生存期 (PFS)、客观缓解率 (ORR) 以及免疫相关不良事件 (irAEs) 的发生率。最好能提取到 HR 值及 95% CI。
**【目标文献类型与质量要求】**
* 必须是:随机对照试验 (RCT)、前瞻性队列研究、系统综述与 Meta 分析。
* 强制排除:动物实验、体外细胞研究、个案报道。
* 强制获取要求:必须是开放获取 (Open Access) 的文献,且必须能获取 PDF 全文或完整 XML 数据。对于需要付费墙 (Paywall) 的文献请予以忽略。
**【扩展检索词库 (供搜索引擎参考)】**
Tislelizumab, BGB-A317, Non-Small Cell Lung Cancer, NSCLC, Carcinoma, Non-Small-Cell Lung (MeSH), PD-1 Inhibitors, Overall Survival.
## **四、 为什么这种设计对 Unifuncs API 特别有效?**
Unifuncs 是一个基于大模型推理的 Agent。如果你只给它扔一句 "替雷利珠单抗治疗非小细胞肺癌",它会像个无头苍蝇一样在网上随便搜几个百度百科或知乎的新闻来交差。
但当你把上面这篇**充斥着 MeSH词、明确排除了动物实验、明确要求找 RCT、并且要求带有 PDF** 的大白话发给 Unifuncs 的 messages 时:
1. Unifuncs 会直接把 Tislelizumab AND NSCLC AND Randomized Controlled Trial 作为 PubMed 的搜索词。
2. 它在阅读网页时,看到没有 PDF 下载链接的,会自动根据指令里的【强制获取要求】执行 Discard放弃动作。
3. 它在总结时,会自动围绕【关注的结局指标】去撰写你的 synthesis\_report。
这就是大模型时代\*\*“用魔法(本地大模型)打败魔法(搜索大模型)”\*\*的最佳实践!

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@@ -157,9 +157,114 @@ interface DecodedToken {
| IIT | N/A (企业微信) | N/A | ✅ 企业微信userId | ✅ |
| Prompt管理 | ✅ getAuthHeaders | ✅ authenticate | ✅ getUserId | ✅ |
## 5. 常见错误和解决方案
## 5. 测试脚本认证规范
### 5.1 401 Unauthorized
> 编写 API 测试脚本时,需要先通过登录接口获取 Token再携带到后续请求中。
### 5.1 登录接口
```
POST /api/v1/auth/login/password
Content-Type: application/json
{
"phone": "13800000001",
"password": "123456"
}
```
### 5.2 登录响应结构
```json
{
"success": true,
"data": {
"user": { "id": "...", "name": "...", "role": "SUPER_ADMIN" },
"tokens": {
"accessToken": "eyJhbGciOiJIUzI1NiIs...",
"refreshToken": "..."
}
}
}
```
**Token 提取路径**`res.data.data.tokens.accessToken`
### 5.3 测试脚本通用模板
```typescript
const BASE_URL = process.env.TEST_BASE_URL || 'http://localhost:3001';
const API_PREFIX = `${BASE_URL}/api/v1`;
const TEST_PHONE = process.env.TEST_PHONE || '13800000001';
const TEST_PASSWORD = process.env.TEST_PASSWORD || '123456';
let authToken = '';
async function api(path: string, options: RequestInit = {}) {
const res = await fetch(`${API_PREFIX}${path}`, {
...options,
headers: {
'Content-Type': 'application/json',
...(authToken ? { Authorization: `Bearer ${authToken}` } : {}),
...(options.headers || {}),
},
});
const contentType = res.headers.get('content-type') || '';
const data = contentType.includes('json') ? await res.json() : await res.text();
return { status: res.status, data };
}
// 登录获取 Token
async function login() {
const res = await api('/auth/login/password', {
method: 'POST',
body: JSON.stringify({ phone: TEST_PHONE, password: TEST_PASSWORD }),
});
if (res.status !== 200 || !res.data.success) {
throw new Error(`登录失败: ${JSON.stringify(res.data)}`);
}
authToken = res.data.data.tokens.accessToken;
}
```
### 5.4 测试账号说明
| 手机号 | 密码 | 角色 | 说明 |
|--------|------|------|------|
| 13800000001 | 123456 | SUPER_ADMIN | 超级管理员,可访问所有模块 |
| 13800000000 | 123456 | USER | 普通测试用户 |
> **注意**`SUPER_ADMIN` 和 `PROMPT_ENGINEER` 角色在 `requireModule()` 中间件中自动豁免模块权限检查,无需在 `user_modules` 表中分配模块。普通 `USER` 角色需要先在 `platform_schema.user_modules` 中分配对应模块才能访问。
### 5.5 运行测试脚本
```bash
# 前置条件:后端服务运行中 + PostgreSQL 运行中
cd backend
# 方式一:使用默认测试账号
npx tsx src/modules/xxx/__tests__/test-script.ts
# 方式二:通过环境变量指定账号
$env:TEST_PHONE="13800000001"; $env:TEST_PASSWORD="123456"; npx tsx src/modules/xxx/__tests__/test-script.ts
```
### 5.6 用户表说明
用户数据存储在 `platform_schema.users` 表中(**不是** `public.users`。Prisma schema 中的 `User` model 映射到此表。关键字段:
| 字段 | 说明 |
|------|------|
| `phone` | 登录手机号(唯一) |
| `password` | bcrypt 哈希密码 |
| `role` | 角色SUPER_ADMIN / HOSPITAL_ADMIN / DEPARTMENT_ADMIN / PROMPT_ENGINEER / USER 等 |
| `tenant_id` | 租户 ID |
| `status` | active / disabled |
## 6. 常见错误和解决方案
### 6.1 401 Unauthorized
**原因**: 前端没有携带 JWT Token 或 Token 过期
@@ -168,24 +273,38 @@ interface DecodedToken {
2. 检查 localStorage 中是否有 `accessToken`
3. 如果 Token 过期,尝试刷新或重新登录
### 5.2 User not authenticated
### 6.2 User not authenticated
**原因**: 后端路由没有添加 `authenticate` 中间件
**解决**: 在路由定义中添加 `preHandler: [authenticate]`
### 5.3 TypeError: Cannot read property 'userId' of undefined
### 6.3 TypeError: Cannot read property 'userId' of undefined
**原因**: 使用了错误的属性名(`request.user.id` 而非 `request.user.userId`
**解决**: 使用 `(request as any).user?.userId`
## 6. 参考文件
### 6.4 测试脚本 Token 为 NULL
**原因**: 登录返回的 Token 路径不对
**解决**: Token 位于 `res.data.data.tokens.accessToken`,不是 `res.data.data.accessToken``res.data.data.token`
### 6.5 测试脚本登录成功但 API 返回 401
**排查步骤**:
1. 确认 Token 提取路径:`res.data.data.tokens.accessToken`
2. 确认 Authorization header 格式:`Bearer <token>`(注意空格)
3. 确认后端服务使用的 JWT_SECRET 与签发时一致
## 7. 参考文件
- 前端 axios 实例: `frontend-v2/src/common/api/axios.ts`
- 前端 Token 管理: `frontend-v2/src/framework/auth/api.ts`
- 后端认证中间件: `backend/src/common/auth/auth.middleware.ts`
- 后端 JWT 服务: `backend/src/common/auth/jwt.service.ts`
- 测试脚本示例: `backend/src/modules/asl/__tests__/deep-research-v2-smoke.ts`