chore: add remaining test docs, scripts and temp files

- Add Git commit preparation checklist
- Add Phase testing guides and issue tracking
- Add utility scripts (env setup, test data initialization)
- Add temp migration SQL files (for reference)
- Update startup scripts and README
- Remove obsolete scripts

PHASE1-测试指南.md

@@ -0,0 +1,148 @@
+# 🧪 Phase 1 测试指南 - 快速参考
+
+**状态**: ✅ 代码优化完成，等待测试  
+**耗时**: 约20分钟  
+**目标**: 验证RAG优化效果，决定是否需要Phase 2
+
+---
+
+## 📊 优化成果
+
+| 参数 | 优化前 | 优化后 | 提升 |
+|------|--------|--------|------|
+| top_k | 3 | 15 | **5倍** |
+| chunk_size | 500 | 1500 | **3倍** |
+| 总覆盖 | 1页 | 15-20页 | **15倍** |
+
+---
+
+## 🚀 立即开始测试（3步）
+
+### Step 1: 重启后端（1分钟）
+
+```bash
+# 在后端目录停止服务（Ctrl+C），然后：
+cd D:\MyCursor\AIclinicalresearch\backend
+npm run dev
+```
+
+等待看到：
+```
+✓ Server listening on http://0.0.0.0:3001
+```
+
+---
+
+### Step 2: 重新上传文档（10-15分钟）
+
+1. **访问**: http://localhost:3000/knowledge
+
+2. **删除旧知识库**
+   - 找到"阿尔兹海默知识库"
+   - 点击删除 → 确认
+
+3. **创建新知识库**
+   - 点击"创建知识库"
+   - 名称：`阿尔兹海默知识库（优化版）`
+   - 点击确定
+
+4. **上传文档**
+   - 进入新知识库
+   - 上传7个PDF文件
+   - **等待处理完成**（每个文件1-2分钟）
+   - ✅ 确认所有文档显示"已就绪"
+
+---
+
+### Step 3: 测试效果（5分钟）
+
+访问"智能问答"：http://localhost:3000/chat
+
+#### 测试1：元数据查询
+```
+@阿尔兹海默知识库（优化版）
+这个知识库有几个文件？请列出文件名。
+```
+
+**预期**：能识别出更多文件（接近7个）
+
+---
+
+#### 测试2：总结问题
+```
+@阿尔兹海默知识库（优化版）
+请总结这7篇文献的核心观点和主要发现。
+```
+
+**预期**：总结更全面，覆盖更多文献
+
+---
+
+#### 测试3：对比问题
+```
+@阿尔兹海默知识库（优化版）
+这些文献在研究方法上有什么异同？请对比分析。
+```
+
+**预期**：对比更深入，分析更准确
+
+---
+
+## 📝 记录测试结果
+
+### 问题1结果
+- 识别出文件数：____/7
+- 回答质量：⭐⭐⭐⭐⭐ (打分)
+
+### 问题2结果
+- 总结完整度：⭐⭐⭐⭐⭐
+- 覆盖文献数：____/7
+
+### 问题3结果
+- 对比深度：⭐⭐⭐⭐⭐
+- 分析维度数：____
+
+---
+
+## 🎯 决策标准
+
+### ✅ **满意** → 停止Phase 2
+- AI能识别大部分文件
+- 总结覆盖70%+文献
+- 对比分析有深度
+- **行动**：进入里程碑2（开发其他智能体）
+
+### ⚠️ **不满意** → 进入Phase 2
+- AI仍遗漏重要信息
+- 总结不够全面
+- 对比有明显缺失
+- **行动**：开发全文精读模式（5-7天）
+
+---
+
+## 💡 提示
+
+- 每个问题都要@知识库
+- 可以选择qwen-long模型测试（更强大）
+- 记录详细的测试结果
+- 截图保存关键回答
+
+---
+
+## 📞 遇到问题？
+
+**文档上传失败**：
+- 检查后端服务是否运行
+- 检查Dify服务是否正常
+- 查看后端控制台错误日志
+
+**AI回答仍不理想**：
+- 确认使用的是新上传的知识库
+- 确认文档已完成处理（✅ 已就绪）
+- 可以尝试增加top_k到20测试
+
+---
+
+**准备好了吗？立即开始测试！** 🚀
+
+