feat(iit): QC deep fix + V3.1 architecture plan + project member management
QC System Deep Fix: - HardRuleEngine: add null tolerance + field availability pre-check (skipped status) - SkillRunner: baseline data merge for follow-up events + field availability check - QcReportService: record-level pass rate calculation + accurate LLM XML report - iitBatchController: legacy log cleanup (eventId=null) + upsert RecordSummary - seed-iit-qc-rules: null/empty string tolerance + applicableEvents config V3.1 Architecture Design (docs only, no code changes): - QC engine V3.1 plan: 5-level data structure (CDISC ODM) + D1-D7 dimensions - Three-batch implementation strategy (A: foundation, B: bubbling, C: new engines) - Architecture team review: 4 whitepapers reviewed + feedback doc + 4 critical suggestions - CRA Agent strategy roadmap + CRA 4-tool explanation doc for clinical experts Project Member Management: - Cross-tenant member search and assignment (remove tenant restriction) - IIT project detail page enhancement with tabbed layout (KB + members) - IitProjectContext for business-side project selection - System-KB route access control adjustment for project operators Frontend: - AdminLayout sidebar menu restructure - IitLayout with project context provider - IitMemberManagePage new component - Business-side pages adapt to project context Prisma: - 2 new migrations (user-project RBAC + is_demo flag) - Schema updates for project member management Made-with: Cursor
This commit is contained in:
@@ -0,0 +1,442 @@
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# CRA Agent V3.0 — 用户权限与多租户三阶段实施计划
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> **版本:** v1.0
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> **日期:** 2026-02-28
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> **状态:** 待实施
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> **前置依赖:** P0 + P1 已完成(质控流水线 + ChatOrchestrator)
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> **关联文档:**
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> - [V3.0 全新开发计划](./V3.0全新开发计划.md)
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> - [统一数字 CRA 质控平台 PRD](./统一数字%20CRA%20质控平台产品需求文档(PRD).md)
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## 1. 问题背景
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### 1.1 当前系统存在的三个核心问题
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**问题 A:业务端 CRA 质控平台无法运行**
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- 所有业务端页面(驾驶舱、eQuery、报告、AI 对话)从 URL 参数 `?projectId=xxx` 获取项目 ID
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- 没有任何机制把登录用户与 IIT 项目关联,导致页面显示"请先选择一个项目"
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- 侧边栏项目信息为硬编码假数据("IIT-2026-001")
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**问题 B:运营管理端 IIT 项目管理定位不当**
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- "IIT 项目管理"与"Prompt 管理""租户管理""用户管理"混在同一菜单中
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- 普通项目运营人员不应看到平台级管理功能
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- 药企/医院客户的项目管理人员不应看到其他企业的项目
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**问题 C:用户-项目关联机制缺失**
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- `IitUserMapping.systemUserId` 存储的是随意字符串(当前值为 `"FengZhiBo"`),未关联平台 `User` 表
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- `IitProject` 没有 `tenantId` 字段,无法实现租户隔离
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- IIT API 路由没有认证中间件,无访问控制
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### 1.2 当前数据库实际状态
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-- iit_schema.projects(1 条记录)
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id: test0102-pd-study | name: test0207 | status: active
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-- iit_schema.user_mappings(1 条记录)
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system_user_id: FengZhiBo | wecom_user_id: FengZhiBo | role: PI
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-- public.users(1 条记录)
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id: user-mock-001 | name: 测试用户 | role: user
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(注:此用户为占位假数据,非真实用户)
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```
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两张表之间没有任何外键关联。
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### 1.3 当前角色体系
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**平台级角色(public.users.role):**
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| 角色 | 说明 | 当前使用 |
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|------|------|---------|
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| SUPER_ADMIN | 平台超级管理员 | 可访问运营管理端全部功能 |
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| PROMPT_ENGINEER | Prompt 工程师 | 可访问运营管理端 |
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| HOSPITAL_ADMIN | 医院管理员 | 已定义,未使用 |
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| PHARMA_ADMIN | 药企管理员 | 已定义,未使用 |
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| DEPARTMENT_ADMIN | 科室管理员 | 已定义,未使用 |
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| USER | 普通用户 | 默认角色 |
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**IIT 项目级角色(iit_schema.user_mappings.role):**
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| 角色 | 说明 | 当前使用 |
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|------|------|---------|
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| PI | 主要研究者 | 已使用 |
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| Sub-I | 次要研究者 | 已定义 |
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| CRC | 临床研究协调员 | 已定义 |
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| CRA | 临床监查员 | 已定义 |
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| DM | 数据管理员 | 已定义 |
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| Statistician | 统计师 | 已定义 |
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| Other | 其他 | 已定义 |
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**缺失的角色:**
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| 角色 | 层级 | 说明 |
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|------|------|------|
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| **PM** | IIT 项目级 | 项目管理员,负责项目配置和管理 |
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| **IIT_OPERATOR** | 平台级 | IIT 项目运营,负责为客户创建和配置项目(Phase 2 实现) |
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## 2. 三阶段实施计划
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Phase 1(立即) Phase 2(近期) Phase 3(中期)
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让业务端能跑 用户-项目关联 多租户隔离
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───────────────── → ──────────────────── → ─────────────────
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自动选中活跃项目 systemUserId 关联 User IitProject 加 tenantId
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Provider 注入上下文 /my-projects API 项目按租户过滤
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管理端侧边栏分组 项目角色权限矩阵 PHARMA_ADMIN 自助管理
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配置功能补全 IIT 路由加认证
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IIT_OPERATOR 平台角色
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```
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## 3. Phase 1:让业务端能跑(预估 0.5 天)
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### 3.1 目标
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- CRA 质控平台业务端页面能正常加载和显示数据
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- 运营管理端 IIT 项目管理菜单位置合理
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- 项目配置功能补全(定时质控、变量清单)
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### 3.2 方案
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#### 3.2.1 创建 IitProjectContext Provider
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**设计原则:** 通用方案,适用于用户关联 0 / 1 / N 个项目的所有场景。
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**核心逻辑:**
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```
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用户进入 /iit → IitProjectProvider 初始化
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→ 调用 GET /api/v1/admin/iit-projects 获取项目列表
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→ 过滤 status = 'active'
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→ 0 个 → 显示空状态页:"暂无关联的 IIT 项目"
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→ 1 个 → 自动选中,不弹选择器
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→ N 个 → 恢复 localStorage 上次选择;若无记录,默认选第一个
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||||
→ 用户可随时通过侧边栏顶部下拉选择器切换项目
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||||
→ 切换后写入 localStorage,子页面自动刷新
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||||
→ 通过 useIitProject() hook 暴露:
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{ projectId, project, projects, loading, switchProject(id) }
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```
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**项目选择器 UI:**
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放在 IitLayout 侧边栏顶部(替换当前硬编码的项目名称),具体表现:
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- 1 个项目:显示项目名称(纯文本,无下拉箭头)
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- N 个项目:显示当前项目名 + 下拉箭头,点击弹出 Select 选择器
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||||
- 选择器选项:项目名称 + 项目编号(如 "原发性痛经队列研究 / IIT-2026-001")
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||||
- 切换项目后,所有子页面通过 Context 自动获取新 projectId 并刷新数据
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||||
**改动文件:**
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| 文件 | 改动 |
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|------|------|
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| `frontend-v2/src/modules/iit/context/IitProjectContext.tsx` | 新建 Context + Provider + useIitProject hook |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/IitLayout.tsx` | 集成 Provider,侧边栏顶部改为项目选择器 |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/DashboardPage.tsx` | 删除 URL 参数读取,改用 `useIitProject()` |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/EQueryPage.tsx` | 同上 |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/ReportsPage.tsx` | 同上 |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/AiStreamPage.tsx` | 同上 |
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||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/AiChatPage.tsx` | 同上 |
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#### 3.2.2 管理端侧边栏三区重组(方案 B:逻辑拆分)
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**决策背景:** 概念上存在三种管理职能(平台管理、项目运营、商务运营),但当前阶段团队规模小,同一人可能跨职能操作。采用**方案 B(逻辑拆分)**:保留单一 `/admin` 入口,侧边栏按职能分为三个带标题的菜单组,通过 RBAC 控制每个角色看到哪些组。未来用户群体分化后可平滑升级为物理拆分(独立路由 + 独立 Layout)。
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||||
**侧边栏结构(SUPER_ADMIN 视角,看到全部):**
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```
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||||
┌─ 平台管理 ─────────────┐
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||||
│ 运营概览 │
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│ Prompt 管理 │
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||||
│ 系统知识库 │
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||||
│ LLM 配置 │
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||||
│ 系统设置 │
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||||
├─ 项目运营 ─────────────┤
|
||||
│ IIT 项目管理 │
|
||||
├─ 商务运营 ─────────────┤
|
||||
│ 租户管理 │
|
||||
│ 用户管理 │
|
||||
└────────────────────────┘
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||||
```
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||||
|
||||
**各角色可见性:**
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||||
| 菜单组 | SUPER_ADMIN | PROMPT_ENGINEER | IIT_OPERATOR | PHARMA_ADMIN |
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||||
|--------|:-----------:|:---------------:|:------------:|:------------:|
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||||
| 平台管理 | 全部 | Prompt 管理 + 系统知识库 | - | - |
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||||
| 项目运营 | 全部项目 | - | 全部项目 | 本租户项目 |
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||||
| 商务运营 | 全部 | - | - | - |
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||||
**改动文件:** `frontend-v2/src/framework/layout/AdminLayout.tsx`
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#### 3.2.3 项目配置功能补全
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**A. 定时质控配置 UI**
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数据库 `iit_schema.projects` 已有 `cron_enabled` 和 `cron_expression` 字段,前端未暴露。
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||||
在 `IitProjectDetailPage.tsx` 的"REDCap 配置"Tab 中增加:
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||||
- 定时质控开关(Switch,绑定 `cronEnabled`)
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||||
- Cron 表达式输入(Input + 预设选项:"每天 8:00" / "每周一 9:00" / 自定义)
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||||
**B. 变量清单 Tab**
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||||
后端 `GET /:id/field-metadata` API 已存在。在 `IitProjectDetailPage.tsx` 新增第 5 个 Tab"变量清单",展示 REDCap 变量表格。
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||||
**C. PM 角色新增**
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||||
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||||
在 `iitUserMappingService.ts` 的 `getRoleOptions()` 中添加:
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||||
```
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||||
{ value: 'PM', label: '项目管理员 (PM)' }
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```
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### 3.3 Phase 1 不做的事
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||||
- 不改数据库 Schema
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- 不做用户-项目关联(systemUserId 改造)
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- 不加认证中间件
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||||
- 不做租户隔离
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---
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## 4. Phase 2:用户-项目关联 + 角色权限(预估 2 天)
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### 4.1 目标
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||||
- 登录用户自动看到自己关联的 IIT 项目
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||||
- IIT 项目角色对应明确的权限
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||||
- IIT API 路由有认证保护
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||||
- 运营管理端按角色控制菜单可见性
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||||
- 新增 IIT_OPERATOR 平台角色,使项目运营人员无需 SUPER_ADMIN 权限即可创建和配置 IIT 项目
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||||
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||||
### 4.2 数据模型改动
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||||
#### 4.2.1 IitUserMapping 增强
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||||
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||||
```prisma
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||||
model IitUserMapping {
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||||
// ... 现有字段 ...
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||||
systemUserId String @map("system_user_id") // 改为必须是 User.id
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||||
// 新增:
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||||
userId String? @map("user_id") // 平台 User 表外键(可选,渐进式关联)
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||||
|
||||
// 新增关联
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||||
user User? @relation(fields: [userId], references: [id])
|
||||
}
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||||
```
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||||
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||||
**迁移策略:**
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||||
- 新增 `userId` 字段(nullable),不破坏现有数据
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||||
- 新建用户映射时要求填写真实 `userId`
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||||
- 旧数据逐步补齐
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||||
#### 4.2.2 IitProject 增强(为 Phase 3 预留)
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||||
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||||
```prisma
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||||
model IitProject {
|
||||
// ... 现有字段 ...
|
||||
// 新增:
|
||||
tenantId String? @map("tenant_id") // 租户归属(Phase 3 正式启用)
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
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||||
### 4.3 API 改动
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||||
#### 4.3.1 新增接口
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||||
```
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||||
GET /api/v1/iit/my-projects
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||||
```
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逻辑:
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1. 从 JWT Token 获取当前用户 `userId`
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2. 查询 `IitUserMapping WHERE userId = :userId`
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||||
3. 返回关联的项目列表 + 用户在每个项目中的角色
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||||
响应示例:
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```json
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||||
{
|
||||
"projects": [
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||||
{
|
||||
"id": "test0102-pd-study",
|
||||
"name": "test0207",
|
||||
"status": "active",
|
||||
"myRole": "PI",
|
||||
"description": "原发性痛经队列研究"
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### 4.3.2 IIT 路由加认证
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||||
|
||||
所有 `/api/v1/admin/iit-projects` 路由添加 `authenticate` 中间件。
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||||
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||||
#### 4.3.3 项目级权限检查
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||||
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||||
```
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||||
中间件:requireProjectRole(projectId, allowedRoles)
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||||
→ 查 IitUserMapping WHERE projectId AND userId
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||||
→ 检查 role 是否在 allowedRoles 中
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```
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### 4.4 项目角色权限矩阵
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||||
| 功能 | PM | PI | CRA | CRC | DM | Sub-I | Statistician |
|
||||
|------|----|----|-----|-----|----|-------|-------------|
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||||
| 查看驾驶舱 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 |
|
||||
| 查看/处理 eQuery | 读写 | 读 | 读写 | 读写 | 读 | 读 | - |
|
||||
| 查看报告 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 |
|
||||
| AI 对话 | 是 | 是 | 是 | 是 | 是 | 是 | 是 |
|
||||
| 项目配置(REDCap/规则/通知/知识库) | 读写 | - | - | - | - | - | - |
|
||||
| 查看变量清单 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 | 读 |
|
||||
| 管理质控规则 | 读写 | - | 读 | - | 读 | - | - |
|
||||
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||||
### 4.5 管理端菜单权限(承接 Phase 1 三区分组)
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||||
Phase 1 已完成侧边栏三区分组的 UI 结构,Phase 2 加入真正的 RBAC 控制:
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||||
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||||
| 角色 | 可进入 /admin | 平台管理 | 项目运营 | 商务运营 |
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||||
|------|:------------:|:-------:|:-------:|:-------:|
|
||||
| SUPER_ADMIN | 是 | 全部 | 全部项目 | 全部 |
|
||||
| PROMPT_ENGINEER | 是 | Prompt + 知识库 | - | - |
|
||||
| IIT_OPERATOR(本阶段新增) | 是 | - | 全部项目 | - |
|
||||
| PHARMA_ADMIN | 是 | - | 本租户项目 | - |
|
||||
| HOSPITAL_ADMIN | 是 | - | 本租户项目 | - |
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||||
| USER | 否 | - | - | - |
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||||
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||||
**实现方式:**
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||||
- 路由守卫:`/admin` 入口检查 `user.role` 是否在允许列表中
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||||
- 侧边栏渲染:根据 `user.role` 过滤 `menuItems`,角色看不到的组直接不渲染
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||||
- API 层:每个管理端 API 添加 `authenticate` + `requireRole(allowedRoles)` 中间件
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||||
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### 4.6 前端改动
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||||
- `IitProjectContext` 改为调用 `/api/v1/iit/my-projects`
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||||
- 根据 `myRole` 控制业务端 Tab 可见性(PM 看到更多设置入口)
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||||
- `AdminLayout.tsx` 按 `user.role` 过滤侧边栏菜单组可见性(Phase 1 已分组,此处加权限判断)
|
||||
- `/admin` 路由入口添加角色守卫
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||||
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||||
---
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||||
## 5. Phase 3:多租户隔离(预估 1.5 天)
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||||
### 5.1 目标
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||||
- IIT 项目按租户隔离,药企只能看到自己的项目
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||||
- PHARMA_ADMIN 可在运营管理端管理自己租户的 IIT 项目
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||||
- SUPER_ADMIN 可跨租户查看所有项目
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||||
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||||
### 5.2 数据模型
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||||
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||||
启用 Phase 2 预留的 `tenantId` 字段,设为必填:
|
||||
|
||||
```prisma
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||||
model IitProject {
|
||||
tenantId String @map("tenant_id")
|
||||
tenant Tenant @relation(fields: [tenantId], references: [id])
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 5.3 API 改动
|
||||
|
||||
所有项目查询接口添加租户过滤:
|
||||
|
||||
```sql
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||||
-- 非 SUPER_ADMIN:
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||||
SELECT * FROM iit_schema.projects WHERE tenant_id = :currentUserTenantId
|
||||
|
||||
-- SUPER_ADMIN:
|
||||
SELECT * FROM iit_schema.projects -- 无限制
|
||||
```
|
||||
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||||
### 5.4 项目创建流程
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||||
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||||
```
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||||
Phase 2 完成后:
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||||
SUPER_ADMIN 或 IIT_OPERATOR 创建项目 → 手动指定 tenantId(选择为哪个客户创建)
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||||
Phase 3 完成后(客户自助):
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||||
PHARMA_ADMIN 创建项目 → 自动绑定自己的 tenantId
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||||
```
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||||
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||||
### 5.5 前端改动
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||||
- 运营管理端项目列表:SUPER_ADMIN 看到全部 + 租户筛选器;PHARMA_ADMIN 只看到自己的
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||||
- 项目创建表单:SUPER_ADMIN 需选择租户;PHARMA_ADMIN 自动绑定
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|
||||
---
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||||
## 6. 实施优先级总结
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| 阶段 | 核心内容 | 预估工时 | 数据库改动 | 前置条件 |
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|------|---------|---------|-----------|---------|
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| **Phase 1** | Provider + 管理端分组 + 配置补全 | 0.5 天 | 无 | 无 |
|
||||
| **Phase 2** | userId 关联 + /my-projects + 角色权限 + 认证 + IIT_OPERATOR 角色 | 2 天 | 新增 userId 列、tenantId 列、IIT_OPERATOR 角色枚举 | Phase 1 |
|
||||
| **Phase 3** | 租户隔离 + PHARMA_ADMIN 自助 | 1.5 天 | tenantId 改为必填 | Phase 2 |
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||||
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||||
### Phase 1 立即可执行的原因
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||||
- 0 数据库改动
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- 只改前端代码
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||||
- 当前只有 1 个活跃项目 + 1 个测试用户,自动选中即可
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||||
- 让业务端立即可演示
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### Phase 2 的触发条件
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||||
- 有真实用户需要登录系统
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- 需要区分不同用户看到不同项目
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||||
- 需要保护 API 安全
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### Phase 3 的触发条件
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||||
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||||
- 有多个客户(药企/医院)同时使用系统
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||||
- 需要租户级别的数据隔离
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||||
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||||
---
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||||
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## 7. 附录:改动文件清单
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||||
### Phase 1
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||||
| 文件 | 类型 | 说明 |
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|------|------|------|
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| `frontend-v2/src/modules/iit/context/IitProjectContext.tsx` | 新建 | 项目上下文 Provider |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/IitLayout.tsx` | 修改 | 集成 Provider + 真实项目信息 |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/DashboardPage.tsx` | 修改 | 改用 useIitProject() |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/EQueryPage.tsx` | 修改 | 改用 useIitProject() |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/ReportsPage.tsx` | 修改 | 改用 useIitProject() |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/AiStreamPage.tsx` | 修改 | 改用 useIitProject() |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/pages/AiChatPage.tsx` | 修改 | 改用 useIitProject() |
|
||||
| `frontend-v2/src/framework/layout/AdminLayout.tsx` | 修改 | 侧边栏分组 |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/admin/pages/IitProjectDetailPage.tsx` | 修改 | 定时质控配置 + 变量清单 Tab |
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||||
| `backend/src/modules/admin/iit-projects/iitUserMappingService.ts` | 修改 | 添加 PM 角色 |
|
||||
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||||
### Phase 2
|
||||
|
||||
| 文件 | 类型 | 说明 |
|
||||
|------|------|------|
|
||||
| `backend/prisma/schema.prisma` | 修改 | IitUserMapping 加 userId、IitProject 加 tenantId |
|
||||
| `backend/src/modules/iit-manager/routes/index.ts` | 修改 | 加 /my-projects 路由 + authenticate 中间件 |
|
||||
| `backend/src/common/auth/auth.middleware.ts` | 修改 | 新增 requireProjectRole 中间件 |
|
||||
| `backend/prisma/schema.prisma` (Role enum) | 修改 | 新增 IIT_OPERATOR 角色枚举值 |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/iit/context/IitProjectContext.tsx` | 修改 | 改调 /my-projects |
|
||||
| `frontend-v2/src/framework/layout/AdminLayout.tsx` | 修改 | 按角色控制菜单组可见性(IIT_OPERATOR 只看项目运营) |
|
||||
|
||||
### Phase 3
|
||||
|
||||
| 文件 | 类型 | 说明 |
|
||||
|------|------|------|
|
||||
| `backend/prisma/schema.prisma` | 修改 | tenantId 改为必填 |
|
||||
| `backend/src/modules/admin/iit-projects/iitProjectService.ts` | 修改 | 查询加租户过滤 |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/admin/pages/IitProjectListPage.tsx` | 修改 | 租户筛选器 |
|
||||
| `frontend-v2/src/modules/admin/pages/IitProjectDetailPage.tsx` | 修改 | 创建时选择租户 |
|
||||
@@ -0,0 +1,920 @@
|
||||
# 质控引擎 V3.1 架构升级 — 五级数据结构与多维报告开发计划
|
||||
|
||||
> **版本**:V1.1(合并架构团队二次评审 4 条关键建议)
|
||||
> **日期**:2026-03-01
|
||||
> **定位**:基于架构团队评审意见,在 V3.0 三级数据结构基础上升级为 CDISC ODM 五级结构,分三批次落地
|
||||
> **前置文档**:
|
||||
> - [五层数据架构方案评审反馈](../../09-技术评审报告/五层数据架构方案评审反馈.md)(采纳/暂缓清单)
|
||||
> - [CRA Agent 质控体系全景技术路径(策略评审稿)](../../00-系统设计/CRA%20Agent%20质控体系全景技术路径(策略评审稿).md)
|
||||
> - [V3.0 三级数据结构技术设计](./质控引擎架构升级-三级数据结构与多模式触发技术设计.md)(历史版本,供参考)
|
||||
> - 架构团队:核心数据架构与业务落地白皮书 / 核心转换机制白皮书 / Skill 化配置架构技术设计 / CRA 质控报告自动化生成与 LLM 友好型设计规范
|
||||
>
|
||||
> **V1.1 变更记录**:
|
||||
> - 新增 3.3 节:状态优先级与 SKIPPED 处理
|
||||
> - 新增 3.8 节:Record-Level Context(跨表单质控上下文全拉取)
|
||||
> - 新增 3.9 节:eQuery 自动闭环(State Transition Hook)
|
||||
> - 修正 6.3 节:D2 缺失率增加 Event-Aware 时序过滤
|
||||
> - 修正 3.4 节:聚合防抖粒度从项目级细化为受试者级
|
||||
|
||||
---
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||||
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||||
## 1. V3.0 → V3.1 升级概要
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### 1.1 为什么从三级升到五级
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||||
V3.0 设计的三级结构是 Record → Event → Field,足以覆盖常规表单。但架构团队指出了一个关键盲区:**REDCap 重复表单(Repeating Instruments)**。
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||||
|
||||
一个患者可以在同一个访视下填写多条 AE(不良事件)、多次合并用药。没有 Form 层和 Instance 层,就无法精确定位"3 号受试者 → 随访 2 → AE 表 → 第 2 条 AE → 事件名称字段"。
|
||||
|
||||
### 1.2 五级坐标体系
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||||
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||||
```
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||||
Record(受试者)
|
||||
└── Event(访视/事件)
|
||||
└── Form(表单) ← 新增
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||||
└── Instance(实例) ← 新增(核心突破)
|
||||
└── Field(变量/字段)
|
||||
```
|
||||
|
||||
每一个质控状态、每一条 eQuery,都必须绑定在这个五维坐标上,坐标不完整不落盘。
|
||||
|
||||
### 1.3 与 V3.0 的主要差异
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||||
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||||
| 维度 | V3.0 | V3.1 |
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||||
|------|------|------|
|
||||
| 数据层级 | 3 级(Record → Event → Field) | 5 级(+ Form + Instance) |
|
||||
| `qc_field_status` 唯一键 | project × record × event × field | project × record × event × form × instance × field |
|
||||
| 规则分类 | `inclusion`/`exclusion`/`lab_values`/`logic_check` | D1-D7 七大维度 |
|
||||
| 字段语义化 | 无 | `IitFieldMapping.semanticLabel`(反向映射) |
|
||||
| 冒泡机制 | 应用层逐级 UPDATE | 异步防抖聚合(避免并发死锁) |
|
||||
| 报告结构 | 扁平单章 | 按 D1-D7 分章节 |
|
||||
| REDCap InstanceID | 未处理 | `RedcapAdapter` 层强制标准化 |
|
||||
|
||||
---
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||||
|
||||
## 2. 数据库设计
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||||
|
||||
### 2.1 新增表:`qc_field_status`(变量级质控状态 — 五级坐标)
|
||||
|
||||
每个 **project × record × event × form × instance × field** 唯一一行,反映最新质控状态。
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
CREATE TABLE iit_schema.qc_field_status (
|
||||
id TEXT PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
|
||||
project_id TEXT NOT NULL,
|
||||
record_id TEXT NOT NULL,
|
||||
event_id TEXT NOT NULL,
|
||||
form_name TEXT NOT NULL, -- 表单名(如 ae_log, conmed_log)
|
||||
instance_id INT NOT NULL DEFAULT 1, -- 实例编号(非重复表单 = 1)
|
||||
field_name TEXT NOT NULL,
|
||||
|
||||
-- 质控结果
|
||||
status TEXT NOT NULL, -- 'PASS' | 'FAIL' | 'WARNING'
|
||||
rule_id TEXT,
|
||||
rule_name TEXT,
|
||||
rule_category TEXT, -- 'D1' | 'D2' | 'D3' | 'D5' | 'D6' | 'D7'
|
||||
severity TEXT, -- 'critical' | 'warning' | 'info'
|
||||
message TEXT,
|
||||
actual_value TEXT,
|
||||
expected_value TEXT,
|
||||
|
||||
-- 溯源
|
||||
source_qc_log_id TEXT,
|
||||
triggered_by TEXT NOT NULL, -- 'webhook' | 'cron' | 'manual'
|
||||
last_qc_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
|
||||
-- 唯一约束:五级坐标
|
||||
CONSTRAINT uq_field_status
|
||||
UNIQUE (project_id, record_id, event_id, form_name, instance_id, field_name),
|
||||
|
||||
created_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
updated_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW()
|
||||
);
|
||||
|
||||
-- 高频查询索引
|
||||
CREATE INDEX idx_fs_record ON iit_schema.qc_field_status (project_id, record_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_fs_event ON iit_schema.qc_field_status (project_id, record_id, event_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_fs_fail ON iit_schema.qc_field_status (project_id, status) WHERE status IN ('FAIL', 'WARNING');
|
||||
CREATE INDEX idx_fs_cat ON iit_schema.qc_field_status (project_id, rule_category);
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 2.2 新增表:`qc_event_status`(事件级质控状态)
|
||||
|
||||
每个 **project × record × event** 唯一一行,由 `qc_field_status` 聚合。
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
CREATE TABLE iit_schema.qc_event_status (
|
||||
id TEXT PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
|
||||
project_id TEXT NOT NULL,
|
||||
record_id TEXT NOT NULL,
|
||||
event_id TEXT NOT NULL,
|
||||
event_label TEXT,
|
||||
|
||||
-- 聚合状态
|
||||
status TEXT NOT NULL, -- 最严重的子级状态
|
||||
fields_total INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_passed INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_failed INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_warning INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
|
||||
-- 维度计数(方便多维报告直接读取)
|
||||
d1_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
d2_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
d3_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
d5_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
d6_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
d7_issues INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
|
||||
-- 表单级摘要
|
||||
forms_checked TEXT[] DEFAULT '{}',
|
||||
top_issues JSONB DEFAULT '[]',
|
||||
|
||||
triggered_by TEXT NOT NULL,
|
||||
last_qc_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
|
||||
CONSTRAINT uq_event_status
|
||||
UNIQUE (project_id, record_id, event_id),
|
||||
|
||||
created_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
updated_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW()
|
||||
);
|
||||
|
||||
CREATE INDEX idx_es_record ON iit_schema.qc_event_status (project_id, record_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_es_fail ON iit_schema.qc_event_status (project_id, status) WHERE status IN ('FAIL', 'WARNING');
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 2.3 改造表:`record_summary`
|
||||
|
||||
在现有 `IitRecordSummary` 上新增聚合字段:
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
ALTER TABLE iit_schema.record_summary
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_total INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_passed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_failed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_warning INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_total INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_passed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_failed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d1_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d2_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d3_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d5_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d6_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS d7_issues INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS top_issues JSONB DEFAULT '[]';
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 2.4 改造表:`IitQcLog` + `IitEquery` 增加 Instance 层
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
ALTER TABLE iit_schema.qc_logs
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS form_name TEXT,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS instance_id INT DEFAULT 1;
|
||||
|
||||
ALTER TABLE iit_schema.iit_equeries
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS instance_id INT DEFAULT 1;
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 2.5 改造表:`IitFieldMapping` 增加反向语义标签
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
ALTER TABLE iit_schema.field_mapping
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS semantic_label TEXT, -- 中文语义标签(如"谷丙转氨酶(ALT)")
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS form_name TEXT, -- 所属表单
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS rule_category TEXT; -- 所属维度 D1-D7
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 2.6 保留不变:`qc_logs`(审计日志)
|
||||
|
||||
继续作为追加型审计日志,每次质控执行新增一行,永不删改。新增 `form_name` 和 `instance_id` 字段后,日志也具备完整的五级坐标。
|
||||
|
||||
### 2.7 完整数据模型
|
||||
|
||||
```
|
||||
REDCap 原始数据(5 层结构)
|
||||
│
|
||||
│ 质控引擎执行
|
||||
▼
|
||||
┌─────────────┐ ┌──────────────────┐
|
||||
│ qc_logs │ │ qc_field_status │
|
||||
│ (审计日志) │←ref─│ (变量级, 5层坐标) │
|
||||
│ 追加型 │ │ + rule_category │
|
||||
└─────────────┘ └────────┬─────────┘
|
||||
│ 异步防抖聚合
|
||||
┌────────▼─────────┐
|
||||
│ qc_event_status │
|
||||
│ (事件级) │
|
||||
│ + d1..d7_issues │
|
||||
└────────┬─────────┘
|
||||
│ 异步防抖聚合
|
||||
┌────────▼─────────┐
|
||||
│ record_summary │
|
||||
│ (记录级) │
|
||||
│ + d1..d7_issues │
|
||||
└────────┬─────────┘
|
||||
│ 聚合
|
||||
┌────────▼─────────┐ ┌──────────────┐
|
||||
│ qc_project_stats │────►│ qc_reports │
|
||||
│ (项目级) │ 生成 │ (LLM 报告) │
|
||||
└──────────────────┘ └──────────────┘
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 3. 关键工程设计
|
||||
|
||||
### 3.1 REDCap InstanceID 标准化(RedcapAdapter 层洗线)
|
||||
|
||||
**问题**:REDCap API 对 `redcap_repeat_instance` 的返回值不一致:
|
||||
- 非重复表单:字段不存在或为空字符串
|
||||
- 重复表单第一行:有时为空字符串,有时为 `"1"`
|
||||
- 重复表单后续行:`"2"`, `"3"`, ...
|
||||
|
||||
**解法**:在 `RedcapAdapter` 返回数据之前,强制标准化所有记录:
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
// RedcapAdapter.ts — 新增 normalizeInstance() 方法
|
||||
|
||||
private normalizeInstances(records: RedcapRecord[]): NormalizedRecord[] {
|
||||
return records.map(record => {
|
||||
const formName = record.redcap_repeat_instrument || this.inferFormName(record);
|
||||
let instanceId: number;
|
||||
|
||||
if (!record.redcap_repeat_instrument) {
|
||||
// 非重复表单:强制 instanceId = 1
|
||||
instanceId = 1;
|
||||
} else {
|
||||
// 重复表单:空或无效值强制为 1,否则取实际值
|
||||
const raw = record.redcap_repeat_instance;
|
||||
instanceId = (raw && !isNaN(Number(raw)) && Number(raw) > 0)
|
||||
? Number(raw)
|
||||
: 1;
|
||||
}
|
||||
|
||||
return {
|
||||
...record,
|
||||
_normalized: {
|
||||
recordId: String(record.record_id),
|
||||
eventId: record.redcap_event_name || 'default',
|
||||
formName,
|
||||
instanceId,
|
||||
},
|
||||
};
|
||||
});
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**原则**:`RedcapAdapter` 之后的所有下游(引擎、状态表、报告)都使用标准化后的五级坐标,无需二次处理。
|
||||
|
||||
### 3.2 QcExecutor 重构(统一执行入口)
|
||||
|
||||
将分散在 `SkillRunner`、`iitBatchController`、`QcReportService` 中的执行逻辑统一收归:
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
class QcExecutor {
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 单记录单事件质控(实时触发 / AI 调用)
|
||||
*/
|
||||
async executeSingle(
|
||||
projectId: string,
|
||||
recordId: string,
|
||||
eventId: string,
|
||||
options?: { triggeredBy: 'webhook' | 'manual' }
|
||||
): Promise<void> {
|
||||
// 1. RedcapAdapter 拉取并标准化(含 InstanceID 洗线)
|
||||
// 2. 加载适用规则(按 applicableEvents + applicableForms 过滤)
|
||||
// 3. 逐 Form × Instance × Field 执行规则
|
||||
// 4. 写入 qc_logs(追加审计)
|
||||
// 5. upsert qc_field_status(五级坐标)
|
||||
// 6. 标记需聚合(推入防抖队列,不立即冒泡)
|
||||
}
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 批量质控(定时 / 手动 / 一键全量)
|
||||
*/
|
||||
async executeBatch(
|
||||
projectId: string,
|
||||
options?: { triggeredBy: 'cron' | 'manual' }
|
||||
): Promise<BatchResult> {
|
||||
// 1. RedcapAdapter 拉取全量并标准化
|
||||
// 2. 基线数据合并
|
||||
// 3. 逐 record × event 复用 executeSingle 核心逻辑
|
||||
// 4. 批量完成后触发一次聚合(而非逐条)
|
||||
// 5. 刷新 qc_reports
|
||||
}
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 异步防抖聚合(解决冒泡并发死锁问题)
|
||||
*/
|
||||
async aggregateDeferred(projectId: string): Promise<void> {
|
||||
// 详见 3.3 节
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 3.3 状态优先级与 SKIPPED 处理
|
||||
|
||||
聚合时始终取"最严重的状态":
|
||||
|
||||
```
|
||||
FAIL (3) > WARNING (2) > UNCERTAIN (1) > PASS (0)
|
||||
```
|
||||
|
||||
- **事件状态** = 其下所有变量状态中最严重的
|
||||
- **记录状态** = 其下所有事件状态中最严重的
|
||||
|
||||
**SKIPPED 处理**:当某个变量在某个事件中不存在时(如随访期没有 age 字段),**不写入 `qc_field_status`**,不参与聚合计算。只有被规则实际检查过的变量才写入。
|
||||
|
||||
### 3.4 状态冒泡:异步防抖聚合方案
|
||||
|
||||
**问题**:如果批量执行 1000 条规则,每次 Field 变更都同步 UPDATE 上级,会导致数据库行锁冲突甚至死锁。
|
||||
|
||||
**解法**:冒泡不做同步级联,改为"批量完成后统一聚合"。
|
||||
|
||||
```
|
||||
执行阶段(高频写入,无锁竞争):
|
||||
HardRuleEngine 执行 1000 条规则
|
||||
↓ 逐条 upsert
|
||||
qc_field_status(各自独立行,无锁冲突)
|
||||
|
||||
聚合阶段(受试者级防抖,避免项目级锁竞争):
|
||||
executeSingle 完成后
|
||||
↓ 推入 pg-boss 防抖队列
|
||||
singletonKey: `aggregate_${projectId}_${recordId}`
|
||||
↓ 只重算该受试者的 event_status 和 record_summary
|
||||
|
||||
executeBatch 完成后
|
||||
↓ 直接调用 aggregateDeferred(projectId)
|
||||
↓ 一次性 SQL 聚合全项目
|
||||
|
||||
项目级统计(qc_project_stats)
|
||||
↓ 由独立的低频定时任务刷新(如每 5 分钟)
|
||||
↓ 或在 aggregateDeferred 末尾追加一次
|
||||
```
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
async aggregateDeferred(projectId: string): Promise<void> {
|
||||
// 1. 事件级聚合:一条 SQL 搞定
|
||||
await prisma.$executeRaw`
|
||||
INSERT INTO iit_schema.qc_event_status
|
||||
(id, project_id, record_id, event_id, status,
|
||||
fields_total, fields_passed, fields_failed, fields_warning,
|
||||
d1_issues, d2_issues, d3_issues, d5_issues, d6_issues, d7_issues,
|
||||
triggered_by, last_qc_at, created_at, updated_at)
|
||||
SELECT
|
||||
gen_random_uuid(),
|
||||
fs.project_id, fs.record_id, fs.event_id,
|
||||
-- 最严重状态
|
||||
CASE
|
||||
WHEN COUNT(*) FILTER (WHERE fs.status = 'FAIL') > 0 THEN 'FAIL'
|
||||
WHEN COUNT(*) FILTER (WHERE fs.status = 'WARNING') > 0 THEN 'WARNING'
|
||||
ELSE 'PASS'
|
||||
END,
|
||||
COUNT(*),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.status = 'PASS'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.status = 'WARNING'),
|
||||
-- 维度计数
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D1' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D2' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D3' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D5' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D6' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
COUNT(*) FILTER (WHERE fs.rule_category = 'D7' AND fs.status = 'FAIL'),
|
||||
'manual', NOW(), NOW(), NOW()
|
||||
FROM iit_schema.qc_field_status fs
|
||||
WHERE fs.project_id = ${projectId}
|
||||
GROUP BY fs.project_id, fs.record_id, fs.event_id
|
||||
ON CONFLICT (project_id, record_id, event_id)
|
||||
DO UPDATE SET
|
||||
status = EXCLUDED.status,
|
||||
fields_total = EXCLUDED.fields_total,
|
||||
fields_passed = EXCLUDED.fields_passed,
|
||||
fields_failed = EXCLUDED.fields_failed,
|
||||
fields_warning = EXCLUDED.fields_warning,
|
||||
d1_issues = EXCLUDED.d1_issues,
|
||||
d2_issues = EXCLUDED.d2_issues,
|
||||
d3_issues = EXCLUDED.d3_issues,
|
||||
d5_issues = EXCLUDED.d5_issues,
|
||||
d6_issues = EXCLUDED.d6_issues,
|
||||
d7_issues = EXCLUDED.d7_issues,
|
||||
updated_at = NOW()
|
||||
`;
|
||||
|
||||
// 2. 记录级聚合:同理从 qc_event_status 聚合到 record_summary
|
||||
// 3. 项目级聚合:从 record_summary 聚合到 qc_project_stats
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**核心优势**:
|
||||
- 执行阶段只写 `qc_field_status`,各行互不冲突,可高并发
|
||||
- 聚合阶段用 SQL `INSERT ... ON CONFLICT` 一次性完成,无应用层循环
|
||||
- 实时触发用受试者级防抖(`singletonKey: aggregate_${projectId}_${recordId}`),多 CRC 同时录入不同受试者时互不干扰
|
||||
- 项目级统计(`qc_project_stats`)独立刷新,避免单行频繁锁竞争
|
||||
|
||||
### 3.5 规则分类体系(D1-D7 维度枚举)
|
||||
|
||||
扩展 `QCRule.category` 和 `IitSkill.skillType`:
|
||||
|
||||
| 维度代码 | 含义 | 对应规则类型 | 当前状态 |
|
||||
|---------|------|------------|---------|
|
||||
| `D1` | 入排合规性 | HardRule | 已有 `inclusion`/`exclusion`,需重新标注 |
|
||||
| `D2` | 数据完整性 | CompletenessEngine(批次 C) | 未实现 |
|
||||
| `D3` | 变量准确性 | HardRule | 已有 `lab_values`/`logic_check`,需重新标注 |
|
||||
| `D4` | 数据质疑管理 | 状态机(eQuery 流转) | 已有 eQuery 表 |
|
||||
| `D5` | 安全性监测 | HardRule + SoftRule(批次 C) | SoftRuleEngine 已有框架 |
|
||||
| `D6` | 方案偏离 | HardRule + SoftRule(批次 C) | 未实现 |
|
||||
| `D7` | 药物管理 | HardRule(批次 C) | 未实现 |
|
||||
|
||||
**改造点**:
|
||||
- `QCRule` 接口的 `category` 字段从 4 种值改为 D1-D7
|
||||
- 种子规则 `seed-iit-qc-rules.ts` 重新标注所有现有规则的维度
|
||||
- `qc_field_status.rule_category` 存储维度代码,支持按维度聚合
|
||||
|
||||
### 3.6 字段语义化(IitFieldMapping 反向增强)
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||||
|
||||
当前 `IitFieldMapping` 只用于 LLM 输入方向(alias→actual)。增强为双向:
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||||
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||||
```
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||||
LLM 输入方向(已有): "年龄" → age (LLM 对话中说"年龄",系统查 age)
|
||||
LLM 输出方向(新增): age → "年龄(岁)" (报告中展示"年龄(岁)"而非 age)
|
||||
```
|
||||
|
||||
**数据来源**:REDCap Data Dictionary 的 `field_label` 字段天然就是中文语义标签。项目初始化时自动同步:
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||||
|
||||
```typescript
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||||
async function syncSemanticLabels(projectId: string) {
|
||||
const metadata = await redcapAdapter.exportMetadata();
|
||||
for (const field of metadata) {
|
||||
await prisma.iitFieldMapping.upsert({
|
||||
where: { projectId_aliasName: { projectId, aliasName: field.field_name } },
|
||||
update: { semanticLabel: field.field_label, formName: field.form_name },
|
||||
create: {
|
||||
projectId,
|
||||
aliasName: field.field_name,
|
||||
actualName: field.field_name,
|
||||
semanticLabel: field.field_label,
|
||||
formName: field.form_name,
|
||||
fieldType: field.field_type,
|
||||
},
|
||||
});
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**使用场景**:`QcReportService` 生成 LLM XML 时,用 `semanticLabel` 替代物理字段名。
|
||||
|
||||
### 3.7 LLM 三不原则(正式化为设计规范)
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||||
|
||||
所有 LLM-facing 输出必须遵循:
|
||||
|
||||
| 原则 | 含义 | 实现方式 |
|
||||
|------|------|---------|
|
||||
| **不喂全量** | 只传 FAIL/WARNING 的切片 | `QcReportService` 从 `qc_field_status` WHERE status IN ('FAIL','WARNING') |
|
||||
| **不喂物理字段** | 字段名用中文语义 | 查 `IitFieldMapping.semanticLabel` 替换 |
|
||||
| **不让 LLM 算数** | 百分比、天数差等由 Node.js 预算 | 所有数值结论以"标签"形式传入(如"超窗 5 天"而非让 LLM 算日期差) |
|
||||
|
||||
### 3.8 Record-Level Context:跨表单质控上下文全拉取
|
||||
|
||||
**问题**:REDCap DET Webhook 推送的 payload 只包含**当前保存的表单**数据。如果 CRC 保存了"实验室检查表",Webhook 只带这一个表单。但 D5 规则(如"ALT 异常但没报 AE")需要同时查看 AE 表的数据——拿不到就会误判。
|
||||
|
||||
**设计原则**:在 IIT 场景下,单个患者的全量数据通常只有几十到几百行(几 KB),不存在性能问题。因此,**不论 Webhook 传来了什么表单,`QcExecutor` 一律拉取该患者的全量数据**。
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
// QcExecutor.executeSingle() 中的数据拉取逻辑
|
||||
async executeSingle(projectId: string, recordId: string, eventId: string, ...) {
|
||||
// ⚠️ 关键:不论 Webhook 传来的 instrument 是什么,都拉全量
|
||||
// 这样跨表单规则(D5 AE 漏报、D6 合并用药禁忌)才能正确执行
|
||||
const allRecords = await redcapAdapter.exportRecords({ records: [recordId] });
|
||||
|
||||
// 标准化五级坐标(含 InstanceID 洗线)
|
||||
const normalized = redcapAdapter.normalizeInstances(allRecords);
|
||||
|
||||
// 按 event 分组,但在内存中保持全量,供跨表单规则访问
|
||||
const patientContext = this.buildPatientContext(normalized);
|
||||
|
||||
// 执行规则时传入完整上下文
|
||||
for (const rule of applicableRules) {
|
||||
const result = engine.executeRule(rule, patientContext);
|
||||
// ...
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**关键区别**:
|
||||
- 旧设计(V3.0):`getRecordById()` 拉全量但 **merge 成扁平对象**,丢失五级结构
|
||||
- 新设计(V3.1):`exportRecords()` 拉全量且 **保持原始多行结构**,每行 = 一个 event × form × instance
|
||||
|
||||
### 3.9 eQuery 自动闭环:State Transition Hook
|
||||
|
||||
**问题**:当质控发现 Field 为 FAIL 时会生成 eQuery。但当 CRC 修正数据后,Webhook 再次触发质控,Field 变回 PASS——此时**没有任何机制自动关闭之前的 eQuery**。系统变成了"只开 Query 不销账"的半成品。
|
||||
|
||||
**设计**:在 `QcExecutor` 的 `upsert qc_field_status` 逻辑中,比较新旧状态,触发自动闭环。
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
// QcExecutor 内部:upsert 前先读取旧状态
|
||||
async upsertFieldStatus(data: FieldStatusData): Promise<void> {
|
||||
const oldRecord = await prisma.qcFieldStatus.findUnique({
|
||||
where: {
|
||||
uq_field_status: {
|
||||
project_id: data.projectId,
|
||||
record_id: data.recordId,
|
||||
event_id: data.eventId,
|
||||
form_name: data.formName,
|
||||
instance_id: data.instanceId,
|
||||
field_name: data.fieldName,
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
|
||||
const oldStatus = oldRecord?.status;
|
||||
|
||||
// 执行 upsert
|
||||
await prisma.qcFieldStatus.upsert({ ... });
|
||||
|
||||
// ===== State Transition Hook =====
|
||||
// FAIL → PASS:自动关闭关联的 eQuery
|
||||
if (oldStatus === 'FAIL' && data.status === 'PASS') {
|
||||
await prisma.iitEquery.updateMany({
|
||||
where: {
|
||||
projectId: data.projectId,
|
||||
recordId: data.recordId,
|
||||
eventId: data.eventId,
|
||||
formName: data.formName,
|
||||
instanceId: data.instanceId,
|
||||
fieldName: data.fieldName,
|
||||
status: { in: ['pending', 'reopened'] },
|
||||
},
|
||||
data: {
|
||||
status: 'auto_closed', // 区分于人工 'closed'
|
||||
respondedAt: new Date(),
|
||||
responseText: 'AI 自动复核通过:数据已修正,质控结果变为 PASS',
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
}
|
||||
|
||||
// PASS → FAIL:如果之前有 auto_closed 的 eQuery,自动重开
|
||||
if (oldStatus === 'PASS' && data.status === 'FAIL') {
|
||||
// 新建 eQuery(不重开旧的,保持审计链清晰)
|
||||
await equeryService.create({ ... });
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**设计决策**:
|
||||
- 自动关闭使用 `auto_closed` 状态(而非复用 `closed`),便于审计区分"AI 自动销账"和"CRC 回复后人工关闭"
|
||||
- `IitEquery` 的 status 枚举需扩展:`pending | responded | reviewing | closed | reopened | auto_closed`
|
||||
- 回退场景(PASS → FAIL)创建新 eQuery 而非重开旧的,保持审计链完整
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 4. 批次 A:数据底座加固(预估 1.5-2 周)
|
||||
|
||||
### 4.1 任务清单
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||||
|
||||
| # | 任务 | 工作量 | 依赖 |
|
||||
|---|------|--------|------|
|
||||
| A1 | Prisma Schema 升级 + Migration | 1 天 | 无 |
|
||||
| | - 新建 `QcFieldStatus` model(五级坐标) | | |
|
||||
| | - `IitQcLog` 加 `formName`, `instanceId` | | |
|
||||
| | - `IitEquery` 加 `instanceId` | | |
|
||||
| | - `IitFieldMapping` 加 `semanticLabel`, `formName`, `ruleCategory` | | |
|
||||
| A2 | `RedcapAdapter.normalizeInstances()` | 0.5 天 | 无 |
|
||||
| | - InstanceID 幽灵状态洗线 | | |
|
||||
| | - 非重复表单强制 `instanceId: 1` | | |
|
||||
| | - 重复表单第一行强制 `1` | | |
|
||||
| A3 | `QcExecutor` 核心服务 | 2.5 天 | A1, A2 |
|
||||
| | - `executeSingle()` 方法(含 Record-Level Context 全量拉取) | | |
|
||||
| | - `executeBatch()` 方法 | | |
|
||||
| | - 五级坐标 upsert `qc_field_status` | | |
|
||||
| | - State Transition Hook:FAIL→PASS 自动关闭 eQuery | | |
|
||||
| | - `IitEquery.status` 枚举扩展 `auto_closed` | | |
|
||||
| | - 改造 `iitBatchController` 调用 `QcExecutor` | | |
|
||||
| A4 | 规则维度重新标注 | 0.5 天 | A1 |
|
||||
| | - `seed-iit-qc-rules.ts` 所有规则加 `ruleCategory: 'D1'|'D3'` | | |
|
||||
| | - `HardRuleEngine.QCRule.category` 枚举扩展 | | |
|
||||
| A5 | 字段语义同步 + 报告语义化 | 1 天 | A1 |
|
||||
| | - `syncSemanticLabels()` 从 REDCap Metadata 自动填充 | | |
|
||||
| | - `QcReportService` 生成报告时查 `semanticLabel` 替换字段名 | | |
|
||||
| A6 | 验证脚本 | 0.5 天 | A3, A4, A5 |
|
||||
| | - 验证 `qc_field_status` 五级坐标正确性 | | |
|
||||
| | - 验证 LLM 报告字段名已语义化 | | |
|
||||
| | - 回归测试:现有 D1 + D3 功能不退化 | | |
|
||||
|
||||
### 4.2 验收标准
|
||||
|
||||
- [ ] 执行一键全量质控后,`qc_field_status` 包含完整的 project × record × event × form × instance × field 数据
|
||||
- [ ] 非重复表单的 `instance_id` 统一为 1
|
||||
- [ ] 重复表单(如 AE)的多个 Instance 各自独立记录
|
||||
- [ ] LLM XML 报告中字段名为中文语义(如"年龄"而非"age")
|
||||
- [ ] 每条 `qc_field_status` 记录的 `rule_category` 正确标注为 D1-D7
|
||||
- [ ] 跨表单规则可正确执行(如 D5 规则需要同时访问实验室表和 AE 表)
|
||||
- [ ] Field 从 FAIL 变 PASS 时,关联的 eQuery 自动变为 `auto_closed`
|
||||
- [ ] 现有的入排标准检查 + 变量范围检查功能不回归
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 5. 批次 B:聚合层与冒泡机制(预估 1.5-2 周)
|
||||
|
||||
### 5.1 任务清单
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||||
|
||||
| # | 任务 | 工作量 | 依赖 |
|
||||
|---|------|--------|------|
|
||||
| B1 | Prisma Schema:新建 `QcEventStatus`,改造 `RecordSummary` | 0.5 天 | 批次 A 完成 |
|
||||
| B2 | `QcExecutor.aggregateDeferred()` | 1.5 天 | B1 |
|
||||
| | - SQL 聚合 field_status → event_status | | |
|
||||
| | - SQL 聚合 event_status → record_summary | | |
|
||||
| | - SQL 聚合 record_summary → project_stats | | |
|
||||
| | - 批量执行后触发一次聚合(防抖) | | |
|
||||
| | - 单条执行后推入 pg-boss 防抖队列 | | |
|
||||
| B3 | 多维报告框架 | 1 天 | B2 |
|
||||
| | - `QcReportService` 按 D1-D7 分章节生成 LLM XML | | |
|
||||
| | - 新增 `<event_overview>` 章节 | | |
|
||||
| | - 新增 `<dimension_summary>` 章节(各维度通过率) | | |
|
||||
| B4 | 定时质控灵活配置 | 1 天 | 批次 A 完成 |
|
||||
| | - 后端:`registerProjectCrons()` 从全局硬编码改为读取项目 `cronExpression` | | |
|
||||
| | - 前端:可视化配置面板(每天/每周/每N小时/高级 Cron) | | |
|
||||
| | - Cron 表达式参考:`0 8 * * *`(每天8:00) / `0 9 * * 1`(每周一) / `0 8 * * 1,3,5`(一三五) | | |
|
||||
| B5 | 前端:受试者×表单热力图原型 | 1 天 | B2 |
|
||||
| | - 从 `qc_event_status` 读取数据 | | |
|
||||
| | - 行 = 受试者,列 = 事件/表单,颜色 = 状态 | | |
|
||||
| B6 | 实时质控激活 | 0.5 天 | B2 |
|
||||
| | - `WebhookController` 接入 `QcExecutor.executeSingle()` | | |
|
||||
| | - 执行后推入防抖聚合队列 | | |
|
||||
| B7 | 端到端验证 | 0.5 天 | B2-B6 |
|
||||
|
||||
### 5.2 验收标准
|
||||
|
||||
- [ ] `qc_field_status` FAIL 后,对应 `qc_event_status` 自动为 FAIL
|
||||
- [ ] `qc_event_status` FAIL 后,对应 `record_summary.latestQcStatus` 自动为 FAIL
|
||||
- [ ] 维度计数正确:`qc_event_status.d1_issues` 等于该事件下 D1 类别 FAIL 的数量
|
||||
- [ ] 批量 1000 条规则执行无死锁(聚合在执行完成后统一进行)
|
||||
- [ ] 不同项目可独立配置定时质控策略
|
||||
- [ ] REDCap 保存表单后 30 秒内三级状态表更新(实时触发)
|
||||
- [ ] 热力图正确展示红/黄/绿状态
|
||||
- [ ] LLM 报告包含维度分章节 + 事件概览
|
||||
- [ ] 报告生成时间 < 2 秒(100 条记录、500 个变量规模)
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 6. 批次 C:新维度引擎(按需,依赖临床专家输入)
|
||||
|
||||
### 6.1 前提条件
|
||||
|
||||
- 批次 A + B 已稳定运行至少 1 周
|
||||
- 临床专家已确认各维度规则的可行性和优先级
|
||||
- 有真实 IIT 项目数据可供验证
|
||||
|
||||
### 6.2 任务清单(按优先级排序)
|
||||
|
||||
| # | 任务 | 工作量 | 说明 |
|
||||
|---|------|--------|------|
|
||||
| C1 | D2 CompletenessEngine(简化版) | 2 天 | 仅统计 required=true 且无 branching_logic 的绝对必填字段缺失率 |
|
||||
| C2 | D6 方案偏离引擎 | 2 天 | 访视超窗检测(目标日 ± N 天) |
|
||||
| C3 | D5 AE 漏报侦测 | 2-3 天 | SoftRule + RAG,实验室异常 → 检查 AE 表有无匹配 |
|
||||
| C4 | 项目健康度评分 | 1 天 | D1-D7 加权综合,可视化展示 |
|
||||
| C5 | 沙盒测试机制 | 1 天 | 历史数据回放 + 结果导出 Excel |
|
||||
|
||||
### 6.3 D2 缺失率的折中过渡法(V1.1 修正:增加时序过滤)
|
||||
|
||||
**问题 1(字段维度)**:在完整的 Branching Logic 解析器实现之前,简单的"总字段数 - 实填数"会严重高估缺失率(把因分支逻辑隐藏的字段也算作缺失)。
|
||||
|
||||
**问题 2(时序维度,V1.1 新增)**:如果一个项目有 V1-V10 共 10 次访视,患者昨天刚入组(当前在 V1),系统去算缺失率会把 V2-V10 的必填字段全部算作"已缺失",导致新入组患者缺失率高达 90%。这是**致命的临床逻辑错误**——那些访视根本还没发生。
|
||||
|
||||
**解法**:双重过滤——字段过滤 + 时序过滤。
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
async function calculateMissingRate(
|
||||
projectId: string,
|
||||
recordId: string
|
||||
): Promise<{ rate: number; denominator: number; numerator: number }> {
|
||||
|
||||
// 1. 字段过滤:只统计绝对必填字段(required=y 且无 branching_logic)
|
||||
const metadata = await redcapAdapter.exportMetadata();
|
||||
const absoluteRequired = metadata.filter(
|
||||
f => f.required_field === 'y' && !f.branching_logic
|
||||
);
|
||||
|
||||
// 2. 时序过滤(V1.1 关键补丁):
|
||||
// 找出该患者在 REDCap 中有实质数据的事件列表
|
||||
const patientRecords = await redcapAdapter.exportRecords({ records: [recordId] });
|
||||
const activeEvents = new Set(
|
||||
patientRecords
|
||||
.filter(r => hasSubstantiveData(r)) // 排除只有 record_id 的空行
|
||||
.map(r => r.redcap_event_name)
|
||||
);
|
||||
|
||||
// 3. 只统计已到达事件中的绝对必填字段
|
||||
const formEventMapping = await redcapAdapter.getFormEventMapping();
|
||||
let denominator = 0;
|
||||
let filled = 0;
|
||||
|
||||
for (const field of absoluteRequired) {
|
||||
// 该字段所属的表单,在哪些事件中出现
|
||||
const fieldEvents = formEventMapping
|
||||
.filter(m => m.form === field.form_name)
|
||||
.map(m => m.unique_event_name);
|
||||
|
||||
// 只计算患者已到达的事件
|
||||
for (const event of fieldEvents) {
|
||||
if (!activeEvents.has(event)) continue; // 未来事件,跳过
|
||||
denominator++;
|
||||
const record = patientRecords.find(
|
||||
r => r.redcap_event_name === event
|
||||
);
|
||||
if (record && record[field.field_name] != null && record[field.field_name] !== '') {
|
||||
filled++;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
const numerator = denominator - filled;
|
||||
const rate = denominator > 0 ? Math.round((numerator / denominator) * 1000) / 10 : 0;
|
||||
return { rate, denominator, numerator };
|
||||
}
|
||||
|
||||
function hasSubstantiveData(record: Record<string, any>): boolean {
|
||||
// 排除只有 record_id / redcap_event_name 等元数据的空行
|
||||
const metaFields = ['record_id', 'redcap_event_name', 'redcap_repeat_instrument', 'redcap_repeat_instance'];
|
||||
return Object.entries(record).some(
|
||||
([key, val]) => !metaFields.includes(key) && val != null && val !== ''
|
||||
);
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
**总结**:
|
||||
- **字段过滤**:`required=y` 且无 `branching_logic` → 排除条件字段
|
||||
- **时序过滤**:只统计患者已有数据的事件 → 排除未来访视
|
||||
- 两层过滤后,分子分母才是临床上无争议的
|
||||
|
||||
### 6.4 沙盒测试机制
|
||||
|
||||
**问题**:临床专家不懂代码,怎么验证新规则的准确性?
|
||||
|
||||
**解法**:开发"历史数据回放"功能:
|
||||
|
||||
```
|
||||
1. 管理员配置新的 D5/D6 规则(状态设为"草稿",不在生产环境生效)
|
||||
2. 点击"沙盒测试"按钮
|
||||
3. 系统拿该项目所有历史患者数据,用草稿规则跑一遍
|
||||
4. 结果不写入 qc_field_status(只存临时表或内存)
|
||||
5. 导出 Excel:"AI 抓出了这 5 个疑似漏报 AE,请主任确认"
|
||||
6. 专家确认 OK → 规则状态改为"已发布",正式生效
|
||||
```
|
||||
|
||||
**实现要点**:
|
||||
- `IitSkill` 增加 `status` 字段:`draft` | `published` | `archived`
|
||||
- `QcExecutor` 加载规则时只取 `status = 'published'` 的
|
||||
- 沙盒执行复用 `QcExecutor` 核心逻辑,但结果写入临时存储
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 7. LLM 报告升级(批次 B 产出)
|
||||
|
||||
### 7.1 多维报告 XML 结构
|
||||
|
||||
```xml
|
||||
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
|
||||
<qc_context project_id="xxx" project_name="test0207" generated="2026-03-15T08:00:00Z">
|
||||
|
||||
<!-- 1. 宏观统计 -->
|
||||
<summary>
|
||||
- 通过率: 92.9%(14 条记录,13 通过,1 失败)
|
||||
- 事件覆盖: 42 个事件已质控,39 通过
|
||||
- 严重问题: 1 | 警告: 2
|
||||
</summary>
|
||||
|
||||
<!-- 2. 维度概览(各维度独立通过率)-->
|
||||
<dimension_summary>
|
||||
- D1 入排合规: 13/14 通过 (92.9%) — 1 条排除标准违规
|
||||
- D3 变量准确: 550/556 通过 (98.9%) — 6 条极值异常
|
||||
- D2 数据完整: --(尚未启用)
|
||||
- D5 安全性: --(尚未启用)
|
||||
- D6 方案偏离: --(尚未启用)
|
||||
</dimension_summary>
|
||||
|
||||
<!-- 3. 事件维度统计 -->
|
||||
<event_overview>
|
||||
- 筛选期: 14/14 通过 (100%)
|
||||
- 基线期: 13/14 通过 (92.9%)
|
||||
- 随访1: 12/12 通过 (100%)
|
||||
</event_overview>
|
||||
|
||||
<!-- 4. 严重问题详情(按受试者 × 事件 × 表单 × 实例定位)-->
|
||||
<critical_issues count="1">
|
||||
<record id="3">
|
||||
<event name="基线期">
|
||||
<form name="入排标准表" instance="1">
|
||||
1. [D1][exc_001] **排除标准检查**: 排除标准第1项 = **1**(标准: 0)
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</form>
|
||||
</event>
|
||||
</record>
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||||
</critical_issues>
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||||
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||||
<!-- 5. 警告问题 -->
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<warnings count="2">
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<record id="7">
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<event name="随访2">
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||||
<form name="实验室检查" instance="1">
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||||
1. [D3][lab_003] **谷丙转氨酶(ALT)**: 当前值 **52 U/L**(正常上限: 50 U/L)
|
||||
</form>
|
||||
</event>
|
||||
</record>
|
||||
</warnings>
|
||||
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||||
</qc_context>
|
||||
```
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**对比 V3.0**:
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- 新增 `<dimension_summary>` —— 各维度独立呈现
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- 新增 `<event_overview>` —— 事件级统计
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- 问题定位从 `record → field` 精确到 `record → event → form → instance → field`
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||||
- 每条问题标注维度代码(如 `[D1]`、`[D3]`)
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---
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## 8. 与四大工具的集成变更
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| 工具 | 批次 A 变更 | 批次 B 变更 |
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|------|------------|------------|
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| `read_report` | 报告字段名语义化 | 新增 `section=dimension_summary` / `section=event_overview` |
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| `look_up_data` | 无变更 | 可附带每个字段的 `qc_status`(从 `qc_field_status` 读取) |
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||||
| `check_quality` | 调用 `QcExecutor` 替代旧逻辑 | 自动触发聚合,结果写入三级状态表 |
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||||
| `search_knowledge` | 无变更 | 无变更 |
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## 9. 风险与缓解
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| 风险 | 概率 | 影响 | 缓解措施 |
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|------|------|------|---------|
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| REDCap InstanceID 返回值不一致 | 高 | 五级坐标不完整 | `RedcapAdapter.normalizeInstances()` 强制标准化(3.1 节) |
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||||
| 跨表单规则拿不到完整上下文 | 高 | D5 规则误判 | Record-Level Context 全量拉取(3.8 节) |
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||||
| eQuery 只开不关 | 高 | 系统不可信 | State Transition Hook 自动闭环(3.9 节) |
|
||||
| 批量质控冒泡导致死锁 | 中 | 数据库卡顿 | 受试者级防抖聚合(3.4 节) |
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||||
| D2 缺失率被高估(无分支逻辑) | 高 | 临床不信任 | 绝对必填字段 + 时序过滤(6.3 节) |
|
||||
| D2 缺失率计入未来访视 | 高 | 新入组患者 90% 缺失 | Event-Aware 过滤,只统计已到达事件(6.3 节) |
|
||||
| 新规则上线后误报过多 | 中 | 影响用户信心 | 沙盒测试 + 专家确认后再发布(6.4 节) |
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||||
| Migration 影响现有数据 | 低 | 数据丢失 | 新增表/列均为追加型,不修改现有数据 |
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## 10. 关键决策记录
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| 决策 | 选择 | 理由 |
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|------|------|------|
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| 数据层级 | 五级(Record → Event → Form → Instance → Field) | 对齐 CDISC ODM,解决重复表单定位 |
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||||
| InstanceID 标准化位置 | `RedcapAdapter` 层统一处理 | 下游无需关心 REDCap 返回值不一致 |
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||||
| 状态优先级 | FAIL(3) > WARNING(2) > UNCERTAIN(1) > PASS(0) | 聚合时始终取最严重状态 |
|
||||
| SKIPPED 变量处理 | 不写入 `qc_field_status` | 减少无意义数据,简化聚合逻辑 |
|
||||
| 实时质控数据拉取范围 | Record-Level(全量拉取该患者所有事件/表单) | 跨表单规则必须有完整上下文 |
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||||
| eQuery 闭环策略 | State Transition Hook(FAIL→PASS 自动关闭) | 避免"只开不关",状态用 `auto_closed` 区分人工关闭 |
|
||||
| 冒泡防抖粒度 | 实时触发用受试者级,批量触发用项目级 | 多 CRC 同时录入不同受试者时互不干扰 |
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||||
| D2 缺失率过渡方案 | 绝对必填字段 + Event-Aware 时序过滤 | 排除条件字段和未来访视,分子分母临床无争议 |
|
||||
| 规则发布流程 | draft → sandbox test → published | 临床专家可验证准确性 |
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||||
| 规则分类 | D1-D7 七大维度 | 对齐 CRA 工作维度,支撑多维报告 |
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||||
| 字段语义化数据源 | REDCap Data Dictionary `field_label` | 已有数据,自动同步,DM 可微调 |
|
||||
| 自动映射 vs 半自动映射 | 半自动(系统建议 + DM 确认) | 全自动 LLM 映射准确率不可控 |
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||||
| V3.0 文档处置 | 保留为历史版本 | 记录从三级到五级的设计演进 |
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||||
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---
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## 11. 时间线总览
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```
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批次 A 批次 B 批次 C
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(数据底座加固) (聚合与冒泡) (新维度引擎)
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┌──────────────────┐ ┌──────────────────┐ ┌──────────────┐
|
||||
│ 1.5-2 周 │ │ 1.5-2 周 │ │ 按需 │
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||||
│ │ │ │ │ │
|
||||
Week 1-2 │ A1 Schema 升级 │ │ │ │ │
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||||
│ A2 InstanceID 洗线│ │ │ │ │
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||||
│ A3 QcExecutor │ │ │ │ │
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||||
│ A4 规则维度标注 │ │ │ │ │
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||||
Week 2-3 │ A5 语义化同步 │ │ │ │ │
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||||
│ A6 验证 │ │ │ │ │
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||||
└────────┬─────────┘ │ │ │ │
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||||
│ 验收通过 │ │ │ │
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||||
Week 3-4 └──────────────►│ B1 Event 表 │ │ │
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||||
│ B2 防抖聚合 │ │ │
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||||
│ B3 多维报告 │ │ │
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||||
Week 4-5 │ B4 定时配置 │ │ │
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||||
│ B5 热力图 │ │ │
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||||
│ B6 实时质控 │ │ │
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||||
│ B7 端到端验证 │ │ │
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||||
└────────┬─────────┘ │ │
|
||||
│ 验收通过 + │ │
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||||
│ 临床专家确认 │ │
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||||
Week 6+ └──────────────►│ C1 D2 缺失率 │
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||||
│ C2 D6 偏离 │
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||||
│ C3 D5 AE │
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||||
│ C4 健康度 │
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||||
│ C5 沙盒测试 │
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└──────────────┘
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||||
```
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||||
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||||
> **一句话总结**:五级坐标让每个质控结论都有精确的 GPS 定位,维度分类让报告从扁平变为多维,异步防抖聚合让冒泡机制可靠落地——这三者共同构成 V3.1 质控引擎的架构基石。先把底座做对(批次 A),再把聚合做稳(批次 B),最后把覆盖做广(批次 C)。
|
||||
@@ -0,0 +1,697 @@
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||||
# 质控引擎架构升级 — 三级数据结构与多模式触发技术设计
|
||||
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||||
> **版本:** V1.0
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||||
> **日期:** 2026-03-01
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||||
> **定位:** 质控引擎核心架构升级,解决当前数据粒度不足、调度僵化、无法精准溯源的根本问题
|
||||
> **关联文档:**
|
||||
> - [V3.0 全新开发计划](./V3.0全新开发计划.md)
|
||||
> - [CRA 智能质控 Agent 四大工具工作原理说明](../../08-对外输出报告/CRA智能质控Agent-四大工具工作原理说明.md)
|
||||
> - [CRA AI 替代工作梳理](../../09-技术评审报告/CRA%20AI%20替代工作梳理2.md)
|
||||
|
||||
---
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||||
|
||||
## 1. 核心认知:研究方案 → 变量清单 → 质控规则 → 质控报告
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||||
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||||
在 IIT 临床研究中,质控体系不是一堆孤立的模块,而是一条**从研究方案到质控报告的完整链条**:
|
||||
|
||||
```
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||||
研究方案(Protocol)
|
||||
│ 定义了:纳入/排除标准、访视窗口、用药规范、AE 监测要求
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||||
▼
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||||
变量清单(Data Dictionary / CRF 变量)
|
||||
│ 将方案中的每一条要求,具体化为 EDC 系统中可采集的字段
|
||||
│ 例:方案规定"年龄 16-35 岁" → CRF 中 age 字段(数值型,范围 16-35)
|
||||
▼
|
||||
质控规则(QC Rules)
|
||||
│ 将变量的合规要求,编码为机器可执行的逻辑
|
||||
│ 例:{ "and": [{ ">=": ["age", 16] }, { "<=": ["age", 35] }] }
|
||||
▼
|
||||
质控报告(QC Report)
|
||||
│ 将规则执行的结果,聚合为人和 AI 可理解的报告
|
||||
│ 例:通过率 92.9%,1 条严重违规(3 号受试者排除标准不合规)
|
||||
▼
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||||
行动(eQuery / 告警 / 监查报告)
|
||||
将报告中的问题,转化为具体的跟进动作
|
||||
```
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||||
|
||||
**这四者是 1:1:1:1 的映射关系**——方案中的每一条要求,对应变量清单中的具体字段,对应一条或多条质控规则,最终体现在质控报告中的一条具体结论。
|
||||
|
||||
**当前问题**:我们的质控引擎在"规则执行"层面已经成熟(HardRuleEngine + SkillRunner),但在**数据存储粒度**和**调度灵活性**上存在显著不足,导致报告聚合困难、历史追溯低效、调度僵化。
|
||||
|
||||
---
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||||
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||||
## 2. 问题诊断
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||||
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||||
### 2.1 数据结构粒度不足
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||||
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||||
REDCap 中的数据天然具有三级结构:
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||||
|
||||
```
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||||
Record(受试者记录)
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||||
└── Event(访视事件,如:筛选期、基线期、随访 1、随访 2...)
|
||||
└── Variable(变量/字段,如:age、gender、lab_alt、consent_date...)
|
||||
```
|
||||
|
||||
**但当前质控数据结构只有 1.5 级**:
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||||
|
||||
| 数据层级 | 当前是否有独立状态表 | 问题 |
|
||||
|---------|------------------|------|
|
||||
| **记录级(Record)** | `record_summary` 表,有 `latestQcStatus` | 有,但缺乏事件维度详情 |
|
||||
| **事件级(Event)** | **无独立表** | 事件状态藏在 `qc_logs` 日志里,查询需 `DISTINCT ON` 聚合,效率低、易出错 |
|
||||
| **变量级(Variable)** | **无独立表** | 变量级结果藏在 `qc_logs.issues` 的 JSON 数组里,无法直接 SQL 查询 |
|
||||
|
||||
**实际后果**:
|
||||
|
||||
1. 之前出现的"通过率为 0%"的 Bug,根本原因之一就是缺少事件级状态表,报告聚合时把不同事件的旧数据混入计算
|
||||
2. 无法回答"3 号受试者在基线期的 age 字段质控状态是什么"这样的精确查询
|
||||
3. 每次生成报告都要从日志中做复杂的 SQL 聚合,性能差且容易遗漏
|
||||
|
||||
### 2.2 定时质控调度僵化
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||||
|
||||
当前定时质控**全局硬编码**为每天 08:00:
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||||
|
||||
```typescript
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||||
// 当前代码(iit-manager/index.ts)
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||||
await jobQueue.schedule('iit_daily_qc', '0 0 * * *', {}, { tz: 'Asia/Shanghai' });
|
||||
```
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||||
|
||||
**问题**:
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||||
- 所有项目共享一个全局调度,无法按项目独立配置
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||||
- 不支持"每周一三五"、"每 6 小时"等灵活策略
|
||||
- 数据库已预留 `cronEnabled` / `cronExpression` 字段,但代码未使用
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||||
|
||||
### 2.3 实时质控未激活
|
||||
|
||||
系统**已实现**了 REDCap DET(Data Entry Trigger)Webhook 接收端,但:
|
||||
- REDCap 端是否配置了 DET 取决于部署环境
|
||||
- Webhook 处理逻辑写入的也是旧的 `qc_logs` 结构,同样存在粒度不足问题
|
||||
|
||||
---
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||||
|
||||
## 3. 设计目标
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||||
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||||
### 3.1 三级质控状态体系
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||||
建立与 REDCap 数据结构 **1:1 对齐**的三级质控状态:
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||||
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||||
```
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||||
┌──────────────────────────────────────────────────────────────────┐
|
||||
│ Record 10 │
|
||||
│ 记录级状态: FAIL(取所有事件中最严重的) │
|
||||
│ │
|
||||
│ ┌──────────────────────────────────────────────────────────┐ │
|
||||
│ │ Event A: 筛选期 │ │
|
||||
│ │ 事件级状态: PASS │ │
|
||||
│ │ │ │
|
||||
│ │ ┌─────────────────────────────────────────────────┐ │ │
|
||||
│ │ │ age = 28 → QC: PASS (规则: 16-35岁) │ │ │
|
||||
│ │ │ gender = 1 → QC: PASS (规则: 非空) │ │ │
|
||||
│ │ │ consent = 1 → QC: PASS (规则: 已签署) │ │ │
|
||||
│ │ └─────────────────────────────────────────────────┘ │ │
|
||||
│ └──────────────────────────────────────────────────────────┘ │
|
||||
│ │
|
||||
│ ┌──────────────────────────────────────────────────────────┐ │
|
||||
│ │ Event B: 基线期 │ │
|
||||
│ │ 事件级状态: FAIL │ │
|
||||
│ │ │ │
|
||||
│ │ ┌─────────────────────────────────────────────────┐ │ │
|
||||
│ │ │ exclusion = 1 → QC: FAIL (规则: 应为0) │ │ │
|
||||
│ │ │ lab_alt = 5.2 → QC: PASS (规则: <40) │ │ │
|
||||
│ │ └─────────────────────────────────────────────────┘ │ │
|
||||
│ └──────────────────────────────────────────────────────────┘ │
|
||||
│ │
|
||||
│ ┌──────────────────────────────────────────────────────────┐ │
|
||||
│ │ Event C: 随访 1 │ │
|
||||
│ │ 事件级状态: PASS │ │
|
||||
│ │ │ │
|
||||
│ │ ┌─────────────────────────────────────────────────┐ │ │
|
||||
│ │ │ followup_date = 2026-03-01 → QC: PASS │ │ │
|
||||
│ │ │ vitals_bp = 120/80 → QC: PASS │ │ │
|
||||
│ │ └─────────────────────────────────────────────────┘ │ │
|
||||
│ └──────────────────────────────────────────────────────────┘ │
|
||||
└──────────────────────────────────────────────────────────────────┘
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 3.2 多模式触发体系
|
||||
|
||||
| 触发模式 | 描述 | 粒度 | 延迟 |
|
||||
|---------|------|------|------|
|
||||
| **实时触发** | REDCap DET Webhook,录入即质控 | 单记录 × 单事件 × 单表单 | 秒级 |
|
||||
| **定时触发** | 按项目独立配置 Cron 策略 | 全量记录 × 全量事件 | 分钟级 |
|
||||
| **手动触发** | 用户点击"一键全量质控"或 AI 调用 | 全量或指定记录 | 分钟级 |
|
||||
|
||||
### 3.3 自底向上的聚合链
|
||||
|
||||
```
|
||||
qc_logs(审计日志,追加型,不删不改,保留完整历史)
|
||||
↓ 每次质控后 upsert ↓
|
||||
qc_field_status(变量级,保持最新状态)
|
||||
↓ 自底向上聚合 ↓
|
||||
qc_event_status(事件级,保持最新状态)
|
||||
↓ 自底向上聚合 ↓
|
||||
record_summary(记录级,保持最新状态)
|
||||
↓ 自底向上聚合 ↓
|
||||
qc_project_stats(项目级统计)
|
||||
↓ 格式化生成 ↓
|
||||
qc_reports(LLM 友好报告 + 人类可读报告)
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 4. 数据库设计
|
||||
|
||||
### 4.1 新增表:`qc_field_status`(变量级质控状态)
|
||||
|
||||
> 每个 **project × record × event × field** 唯一一行,始终反映该变量的**最新**质控状态。
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
CREATE TABLE iit_schema.qc_field_status (
|
||||
id TEXT PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
|
||||
project_id TEXT NOT NULL,
|
||||
record_id TEXT NOT NULL,
|
||||
event_id TEXT NOT NULL, -- REDCap event_name
|
||||
field_name TEXT NOT NULL, -- 变量名(REDCap field_name)
|
||||
|
||||
-- 质控结果
|
||||
status TEXT NOT NULL, -- 'PASS' | 'FAIL' | 'WARNING' | 'SKIPPED'
|
||||
rule_id TEXT, -- 触发的规则 ID
|
||||
rule_name TEXT, -- 规则名称(冗余,查询方便)
|
||||
severity TEXT, -- 'critical' | 'warning' | 'info'
|
||||
message TEXT, -- 质控结论描述
|
||||
actual_value TEXT, -- 实际值
|
||||
expected_value TEXT, -- 期望值/标准
|
||||
|
||||
-- 溯源
|
||||
source_qc_log_id TEXT, -- 关联到 qc_logs 的具体记录
|
||||
triggered_by TEXT NOT NULL, -- 'webhook' | 'cron' | 'manual'
|
||||
last_qc_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
|
||||
-- 唯一约束:每个变量只保留最新状态
|
||||
CONSTRAINT unique_field_status
|
||||
UNIQUE (project_id, record_id, event_id, field_name),
|
||||
|
||||
-- 时间戳
|
||||
created_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
updated_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW()
|
||||
);
|
||||
|
||||
-- 索引
|
||||
CREATE INDEX idx_field_status_record
|
||||
ON iit_schema.qc_field_status (project_id, record_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_field_status_event
|
||||
ON iit_schema.qc_field_status (project_id, record_id, event_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_field_status_fail
|
||||
ON iit_schema.qc_field_status (project_id, status)
|
||||
WHERE status IN ('FAIL', 'WARNING');
|
||||
CREATE INDEX idx_field_status_rule
|
||||
ON iit_schema.qc_field_status (project_id, rule_id);
|
||||
```
|
||||
|
||||
**关键设计决策**:
|
||||
|
||||
- `actual_value` 和 `expected_value` 用 `TEXT` 存储(非 JSONB),因为变量值可能是数字、日期、字符串等多种类型,统一为文本便于展示和比较
|
||||
- `source_qc_log_id` 指向 `qc_logs` 表,支持从状态追溯到具体的质控执行记录
|
||||
- `SKIPPED` 状态用于"字段在该事件中不存在"的情况(如随访期没有 age 字段)
|
||||
|
||||
### 4.2 新增表:`qc_event_status`(事件级质控状态)
|
||||
|
||||
> 每个 **project × record × event** 唯一一行,状态 = 其下所有变量的最严重状态。
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
CREATE TABLE iit_schema.qc_event_status (
|
||||
id TEXT PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
|
||||
project_id TEXT NOT NULL,
|
||||
record_id TEXT NOT NULL,
|
||||
event_id TEXT NOT NULL, -- REDCap event_name
|
||||
event_label TEXT, -- 事件显示名(如"筛选期")
|
||||
|
||||
-- 聚合状态
|
||||
status TEXT NOT NULL, -- 'PASS' | 'FAIL' | 'WARNING'
|
||||
fields_total INT NOT NULL DEFAULT 0, -- 已检查的变量总数
|
||||
fields_passed INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_failed INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_warning INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
fields_skipped INT NOT NULL DEFAULT 0,
|
||||
|
||||
-- 问题摘要(方便快速查询,不需要 JOIN field_status)
|
||||
top_issues JSONB DEFAULT '[]', -- 最严重的 N 条问题摘要
|
||||
|
||||
-- 关联的表单列表
|
||||
forms_checked TEXT[] DEFAULT '{}', -- 该事件中参与质控的表单
|
||||
|
||||
-- 溯源
|
||||
triggered_by TEXT NOT NULL,
|
||||
last_qc_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
|
||||
-- 唯一约束
|
||||
CONSTRAINT unique_event_status
|
||||
UNIQUE (project_id, record_id, event_id),
|
||||
|
||||
-- 时间戳
|
||||
created_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW(),
|
||||
updated_at TIMESTAMPTZ NOT NULL DEFAULT NOW()
|
||||
);
|
||||
|
||||
-- 索引
|
||||
CREATE INDEX idx_event_status_record
|
||||
ON iit_schema.qc_event_status (project_id, record_id);
|
||||
CREATE INDEX idx_event_status_fail
|
||||
ON iit_schema.qc_event_status (project_id, status)
|
||||
WHERE status IN ('FAIL', 'WARNING');
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 4.3 改造表:`record_summary`(记录级质控状态)
|
||||
|
||||
> 在现有 `record_summary` 基础上新增事件维度统计字段:
|
||||
|
||||
```sql
|
||||
-- 新增列(在已有表上 ALTER)
|
||||
ALTER TABLE iit_schema.record_summary
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_total INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_passed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_failed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS events_warning INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_total INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_passed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS fields_failed INT DEFAULT 0,
|
||||
ADD COLUMN IF NOT EXISTS top_issues JSONB DEFAULT '[]';
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 4.4 保留表:`qc_logs`(审计日志,不变)
|
||||
|
||||
`qc_logs` 继续作为**追加型审计日志**,每次质控执行都新增一行,永不删除、永不修改。它是完整的历史记录,用于:
|
||||
|
||||
- 趋势分析(对比不同时间点的质控结果)
|
||||
- 审计追踪(谁在什么时间触发了什么质控)
|
||||
- 回溯调查(某个问题是何时首次被发现的)
|
||||
|
||||
### 4.5 完整数据模型关系图
|
||||
|
||||
```
|
||||
┌─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┐
|
||||
│ iit_schema │
|
||||
│ │
|
||||
│ ┌─────────────┐ ┌──────────────┐ ┌───────────────┐ │
|
||||
│ │ qc_logs │ │ qc_field_ │ │ qc_event_ │ │
|
||||
│ │ (审计日志) │◄────│ status │─────►│ status │ │
|
||||
│ │ │ ref │ (变量级最新) │ 聚合 │ (事件级最新) │ │
|
||||
│ │ 追加型 │ │ │ │ │ │
|
||||
│ │ 不删不改 │ │ project_id │ │ project_id │ │
|
||||
│ │ │ │ record_id │ │ record_id │ │
|
||||
│ │ 每次质控 │ │ event_id │ │ event_id │ │
|
||||
│ │ 一行记录 │ │ field_name │ │ │ │
|
||||
│ │ │ │ status │ │ status │ │
|
||||
│ │ │ │ rule_id │ │ fields_total │ │
|
||||
│ │ │ │ actual_value │ │ fields_passed │ │
|
||||
│ │ │ │ expected_val │ │ fields_failed │ │
|
||||
│ └─────────────┘ └──────────────┘ └───────┬───────┘ │
|
||||
│ │ 聚合 │
|
||||
│ ▼ │
|
||||
│ ┌──────────────┐ ┌───────────────┐ ┌───────────────┐ │
|
||||
│ │ qc_reports │◄────│ qc_project_ │◄────│ record_ │ │
|
||||
│ │ (LLM报告) │ 生成 │ stats │ 聚合 │ summary │ │
|
||||
│ │ │ │ (项目级统计) │ │ (记录级最新) │ │
|
||||
│ │ llm_report │ │ │ │ │ │
|
||||
│ │ summary │ │ total_records │ │ latestQcStatus│ │
|
||||
│ │ issues │ │ passed_records│ │ events_total │ │
|
||||
│ │ │ │ passRate │ │ events_passed │ │
|
||||
│ └──────────────┘ └───────────────┘ └───────────────┘ │
|
||||
│ │
|
||||
└─────────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 5. 多模式触发设计
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||||
|
||||
### 5.1 实时触发(REDCap DET Webhook)
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||||
|
||||
**已有基础**:`WebhookController.ts` 已实现 DET 接收端。
|
||||
|
||||
**升级点**:Webhook 处理完毕后,不仅写 `qc_logs`,还需同步更新三级状态表。
|
||||
|
||||
```
|
||||
REDCap 保存表单
|
||||
↓ DET POST
|
||||
/api/v1/iit/webhooks/redcap
|
||||
↓ 立即返回 200,异步处理
|
||||
WebhookController.processWebhookAsync()
|
||||
↓
|
||||
pg-boss 队列(iit_quality_check,5 分钟防抖)
|
||||
↓
|
||||
QcExecutor.executeSingleRecord(projectId, recordId, eventId, formName)
|
||||
├── 1. RedcapAdapter 拉取该记录该事件的最新数据
|
||||
├── 2. HardRuleEngine 逐规则执行
|
||||
├── 3. 结果写入 qc_logs(追加,审计)
|
||||
├── 4. upsert qc_field_status(逐变量更新最新状态)
|
||||
├── 5. upsert qc_event_status(聚合该事件所有变量状态)
|
||||
├── 6. upsert record_summary(聚合该记录所有事件状态)
|
||||
└── 7. 刷新 qc_project_stats 和 qc_reports 缓存
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 5.2 定时触发(项目级 Cron 配置)
|
||||
|
||||
**改造方案**:
|
||||
|
||||
#### 5.2.1 数据库配置
|
||||
|
||||
`IitProject` 表已有 `cronEnabled` 和 `cronExpression` 字段,直接使用。
|
||||
|
||||
#### 5.2.2 前端配置界面
|
||||
|
||||
在项目管理页面新增"定时质控"配置面板:
|
||||
|
||||
```
|
||||
┌─────────────────────────────────────────────┐
|
||||
│ 定时质控配置 │
|
||||
│ │
|
||||
│ ○ 关闭定时质控 │
|
||||
│ ● 开启定时质控 │
|
||||
│ │
|
||||
│ 频率: │
|
||||
│ ┌─────────────────────────────┐ │
|
||||
│ │ ○ 每天 时间 [08:00]│ │
|
||||
│ │ ○ 每周指定日期 │ │
|
||||
│ │ ☑ 周一 ☐ 周二 ☑ 周三 │ │
|
||||
│ │ ☐ 周四 ☑ 周五 ☐ 周六 ☐ 周日│ │
|
||||
│ │ 时间 [08:00] │ │
|
||||
│ │ ○ 每隔 N 小时 [6] 小时 │ │
|
||||
│ │ ○ 高级(Cron 表达式) │ │
|
||||
│ │ [0 8 * * 1,3,5] │ │
|
||||
│ │ ⓘ Cron 表达式说明 │ │
|
||||
│ └─────────────────────────────┘ │
|
||||
│ │
|
||||
│ 下次执行时间:2026-03-03 周一 08:00 │
|
||||
│ │
|
||||
│ [保存配置] │
|
||||
└─────────────────────────────────────────────┘
|
||||
```
|
||||
|
||||
**Cron 表达式说明**(对临床专家的通俗解释):
|
||||
|
||||
| 配置需求 | 对应表达式 | 含义 |
|
||||
|---------|-----------|------|
|
||||
| 每天 8:00 | `0 8 * * *` | 每天早上 8 点执行 |
|
||||
| 每周一 9:00 | `0 9 * * 1` | 每周一早上 9 点 |
|
||||
| 每周一三五 8:00 | `0 8 * * 1,3,5` | 周一、周三、周五早上 8 点 |
|
||||
| 每 6 小时 | `0 */6 * * *` | 每天 0:00, 6:00, 12:00, 18:00 |
|
||||
| 工作日每天 9:00 | `0 9 * * 1-5` | 周一到周五每天 9 点 |
|
||||
| 每天 8:00 和 20:00 | `0 8,20 * * *` | 早晚各一次 |
|
||||
|
||||
> **说明**:大多数用户通过可视化界面选择即可,系统自动生成 Cron 表达式。只有高级用户需要直接填写表达式。
|
||||
|
||||
#### 5.2.3 后端调度改造
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
// 改造后的逻辑(伪代码)
|
||||
async function registerProjectCrons() {
|
||||
const projects = await prisma.iitProject.findMany({
|
||||
where: { cronEnabled: true, status: 'active' },
|
||||
select: { id: true, cronExpression: true },
|
||||
});
|
||||
|
||||
for (const project of projects) {
|
||||
const cronExpr = project.cronExpression || '0 0 * * *'; // 默认每天 08:00
|
||||
await jobQueue.schedule(
|
||||
`iit_qc_${project.id}`, // 每个项目独立的任务名
|
||||
cronExpr,
|
||||
{ projectId: project.id },
|
||||
{ tz: 'Asia/Shanghai' }
|
||||
);
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 5.3 手动触发
|
||||
|
||||
- **前端入口**:质控驾驶舱"一键全量质控"按钮
|
||||
- **AI 入口**:`check_quality` 工具(用户对话中说"帮我跑一下质控")
|
||||
- **执行流程**:与定时触发相同,复用 `QcExecutor.executeBatch()`
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 6. 质控执行器重构(QcExecutor)
|
||||
|
||||
### 6.1 核心流程
|
||||
|
||||
将当前分散在 `SkillRunner`、`iitBatchController`、`QcReportService` 中的质控执行逻辑,统一收归到 `QcExecutor` 服务中:
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
class QcExecutor {
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 单记录质控(实时触发 / AI 调用)
|
||||
*/
|
||||
async executeSingleRecord(
|
||||
projectId: string,
|
||||
recordId: string,
|
||||
eventId: string,
|
||||
options?: { triggeredBy: 'webhook' | 'manual' }
|
||||
): Promise<void> {
|
||||
// 1. 从 REDCap 拉取该 record × event 的最新数据
|
||||
// 2. 加载适用于该事件的质控规则
|
||||
// 3. 逐规则执行 → 收集变量级结果
|
||||
// 4. 写入 qc_logs(追加审计日志)
|
||||
// 5. upsert qc_field_status(逐变量)
|
||||
// 6. upsert qc_event_status(聚合事件)
|
||||
// 7. upsert record_summary(聚合记录)
|
||||
// 8. 更新 qc_project_stats
|
||||
// 9. 标记 qc_reports 缓存过期
|
||||
}
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 批量质控(定时触发 / 手动触发)
|
||||
*/
|
||||
async executeBatch(
|
||||
projectId: string,
|
||||
options?: { triggeredBy: 'cron' | 'manual' }
|
||||
): Promise<BatchResult> {
|
||||
// 1. 从 REDCap 拉取全量记录(按事件分开)
|
||||
// 2. 基线数据合并(将基线事件数据合并到后续事件)
|
||||
// 3. 逐 record × event 调用 executeSingleRecord 逻辑
|
||||
// 4. 汇总批量结果
|
||||
// 5. 强制刷新 qc_reports
|
||||
// 6. 推送通知(企微等)
|
||||
}
|
||||
|
||||
/**
|
||||
* 自底向上聚合(内部方法)
|
||||
* field_status → event_status → record_summary → project_stats
|
||||
*/
|
||||
private async aggregateUpward(
|
||||
projectId: string,
|
||||
recordId: string,
|
||||
eventId: string
|
||||
): Promise<void> {
|
||||
// 事件级:从 qc_field_status 聚合
|
||||
// status = 所有变量中最严重的状态
|
||||
// fields_total = COUNT(*)
|
||||
// fields_passed = COUNT(status='PASS')
|
||||
// fields_failed = COUNT(status='FAIL')
|
||||
|
||||
// 记录级:从 qc_event_status 聚合
|
||||
// latestQcStatus = 所有事件中最严重的状态
|
||||
// events_total = COUNT(*)
|
||||
// events_passed = COUNT(status='PASS')
|
||||
|
||||
// 项目级:从 record_summary 聚合
|
||||
// passRate = passed_records / total_records * 100
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 6.2 状态优先级
|
||||
|
||||
聚合时始终取"最严重的状态":
|
||||
|
||||
```
|
||||
FAIL (3) > WARNING (2) > UNCERTAIN (1) > PASS (0)
|
||||
```
|
||||
|
||||
规则:
|
||||
- **事件状态** = 其下所有变量状态中最严重的
|
||||
- **记录状态** = 其下所有事件状态中最严重的
|
||||
- 只要有一个变量 FAIL,事件就是 FAIL
|
||||
- 只要有一个事件 FAIL,记录就是 FAIL
|
||||
|
||||
### 6.3 SKIPPED 处理
|
||||
|
||||
当某个变量在某个事件中不存在(如随访期没有 age 字段):
|
||||
- `qc_field_status` 中不写入该变量的记录(而非写 SKIPPED)
|
||||
- 该变量不参与事件级聚合计算
|
||||
- 只有被规则实际检查过的变量才写入 `qc_field_status`
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 7. 报告生成优化
|
||||
|
||||
### 7.1 当前问题
|
||||
|
||||
`QcReportService.aggregateStats()` 目前直接从 `qc_logs` 做 `DISTINCT ON` 聚合,效率低、逻辑复杂。
|
||||
|
||||
### 7.2 优化后
|
||||
|
||||
有了三级状态表后,报告生成变得简单高效:
|
||||
|
||||
```typescript
|
||||
// 报告概览 — 直接从 record_summary 读取
|
||||
const records = await prisma.iitRecordSummary.findMany({
|
||||
where: { projectId },
|
||||
});
|
||||
const totalRecords = records.length;
|
||||
const passedRecords = records.filter(r => r.latestQcStatus === 'PASS').length;
|
||||
const passRate = (passedRecords / totalRecords * 100).toFixed(1);
|
||||
|
||||
// 严重问题列表 — 直接从 qc_field_status 读取
|
||||
const criticalIssues = await prisma.qcFieldStatus.findMany({
|
||||
where: { projectId, status: 'FAIL', severity: 'critical' },
|
||||
orderBy: { lastQcAt: 'desc' },
|
||||
});
|
||||
|
||||
// 事件级统计 — 直接从 qc_event_status 读取
|
||||
const eventStats = await prisma.qcEventStatus.findMany({
|
||||
where: { projectId },
|
||||
});
|
||||
```
|
||||
|
||||
**对比**:
|
||||
|
||||
| 维度 | 改造前 | 改造后 |
|
||||
|------|-------|-------|
|
||||
| 聚合方式 | `DISTINCT ON` 从 qc_logs 实时聚合 | 直接 SELECT 状态表 |
|
||||
| 查询复杂度 | 复杂 SQL + JSON 解析 | 简单 WHERE 过滤 |
|
||||
| 性能 | 随日志增长线性下降 | 恒定(状态表大小固定) |
|
||||
| 正确性 | 容易被旧日志污染 | 始终是最新状态 |
|
||||
|
||||
### 7.3 LLM 报告增强
|
||||
|
||||
三级数据结构让 LLM 报告可以新增"事件维度"章节:
|
||||
|
||||
```xml
|
||||
<qc_context project_id="xxx" project_name="test0207">
|
||||
|
||||
<summary>
|
||||
- 通过率: 92.9%(14 条记录,13 条通过,1 条失败)
|
||||
- 事件覆盖: 42 个事件已质控,39 个通过
|
||||
- 严重问题: 1 | 警告: 0
|
||||
</summary>
|
||||
|
||||
<critical_issues>
|
||||
<record id="3">
|
||||
<event name="基线期">
|
||||
1. [exc_001] **排除标准检查**: 当前值 **1** (标准: 0)
|
||||
</event>
|
||||
</record>
|
||||
</critical_issues>
|
||||
|
||||
<!-- 新增:事件维度统计 -->
|
||||
<event_overview>
|
||||
- 筛选期: 14/14 通过 (100%)
|
||||
- 基线期: 13/14 通过 (92.9%)
|
||||
- 随访1: 12/12 通过 (100%) <!-- 2条记录尚未到达随访1 -->
|
||||
</event_overview>
|
||||
|
||||
</qc_context>
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 8. 与四大工具的集成
|
||||
|
||||
### 8.1 `read_report` — 直接受益
|
||||
|
||||
报告数据来源从"日志聚合"变为"状态表直查",响应更快、数据更准确。
|
||||
|
||||
新增支持按事件维度查询:
|
||||
- `section=event_overview`:各事件的通过率统计
|
||||
- `section=record_detail&record_id=3`:某个记录的三级完整状态
|
||||
|
||||
### 8.2 `look_up_data` — 可增加质控标注
|
||||
|
||||
查询原始数据时,可附带每个字段的质控状态:
|
||||
|
||||
```json
|
||||
{
|
||||
"record_id": "3",
|
||||
"age": { "value": "28", "qc_status": "PASS" },
|
||||
"exclusion": { "value": "1", "qc_status": "FAIL", "message": "排除标准应为0" }
|
||||
}
|
||||
```
|
||||
|
||||
### 8.3 `check_quality` — 执行后更新三级状态
|
||||
|
||||
调用 `QcExecutor`,结果自动写入三级状态表。
|
||||
|
||||
### 8.4 `search_knowledge` — 不受影响
|
||||
|
||||
知识库检索与质控数据结构无关,不需要改动。
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 9. 实施计划
|
||||
|
||||
### Phase 1:三级数据结构(2 天)
|
||||
|
||||
| 任务 | 工作量 | 说明 |
|
||||
|------|--------|------|
|
||||
| 编写 Prisma Schema + Migration | 0.5 天 | 新增 `qc_field_status`、`qc_event_status`,改造 `record_summary` |
|
||||
| 实现 `QcExecutor` 服务 | 1 天 | 统一质控执行 + 三级状态更新逻辑 |
|
||||
| 改造 `iitBatchController` | 0.5 天 | 调用 `QcExecutor` 替代原有分散逻辑 |
|
||||
|
||||
### Phase 2:定时质控灵活配置(1 天)
|
||||
|
||||
| 任务 | 工作量 | 说明 |
|
||||
|------|--------|------|
|
||||
| 后端:项目级 Cron 调度改造 | 0.5 天 | 从全局硬编码改为读取项目配置 |
|
||||
| 前端:定时质控配置面板 | 0.5 天 | 可视化选择 + 高级 Cron 输入 |
|
||||
|
||||
### Phase 3:报告生成优化 + 工具集成(1 天)
|
||||
|
||||
| 任务 | 工作量 | 说明 |
|
||||
|------|--------|------|
|
||||
| 改造 `QcReportService` | 0.5 天 | 从状态表直查替代日志聚合 |
|
||||
| 改造 `ToolsService` | 0.5 天 | `read_report` 和 `check_quality` 适配新结构 |
|
||||
|
||||
### Phase 4:实时质控激活 + 验证(1 天)
|
||||
|
||||
| 任务 | 工作量 | 说明 |
|
||||
|------|--------|------|
|
||||
| 改造 Webhook Worker | 0.5 天 | 处理逻辑接入 `QcExecutor` |
|
||||
| 端到端验证脚本 | 0.5 天 | 覆盖三种触发模式 + 三级数据一致性验证 |
|
||||
|
||||
**总计:约 5 天**
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 10. 验收标准
|
||||
|
||||
| 验收项 | 标准 |
|
||||
|--------|------|
|
||||
| 三级数据一致性 | 执行质控后,`qc_field_status` → `qc_event_status` → `record_summary` 的聚合结果一致 |
|
||||
| 变量级查询 | 能直接查询"3 号受试者在基线期的 age 字段质控状态" |
|
||||
| 事件级查询 | 能直接查询"3 号受试者基线期的整体质控状态" |
|
||||
| 定时质控配置 | 不同项目可配置不同的 Cron 策略,互不影响 |
|
||||
| 实时质控 | REDCap 保存表单后,30 秒内三级状态表更新 |
|
||||
| 报告准确性 | 报告中的通过率与 `record_summary` 中的统计一致 |
|
||||
| 历史追溯 | `qc_logs` 保留完整历史,可追溯任意时间点的质控结果 |
|
||||
| 性能 | 报告生成时间 < 2 秒(100 条记录、500 个变量规模) |
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 11. 关键决策记录
|
||||
|
||||
| 决策 | 选择 | 理由 |
|
||||
|------|------|------|
|
||||
| 变量级状态是否独立建表 | 是,`qc_field_status` | 支持精准查询、避免 JSON 解析、支持索引 |
|
||||
| 事件级状态是否独立建表 | 是,`qc_event_status` | 消除日志聚合的复杂性和出错风险 |
|
||||
| `qc_logs` 是否保留 | 保留,追加型不变 | 审计追踪和趋势分析不可或缺 |
|
||||
| 聚合方向 | 自底向上(变量→事件→记录→项目) | 与 REDCap 数据结构一致,逻辑清晰 |
|
||||
| SKIPPED 变量处理 | 不写入 `qc_field_status` | 减少无意义数据,简化聚合逻辑 |
|
||||
| Cron 配置粒度 | 项目级 | 不同项目节奏不同(I 期 vs III 期) |
|
||||
| 前端 Cron 配置 | 可视化优先 + 高级模式 | 临床团队无需学习 Cron 语法 |
|
||||
| 实时质控防抖 | 5 分钟(pg-boss singleton) | 避免快速连续保存时重复执行 |
|
||||
| `QcExecutor` 统一入口 | 三种触发模式共用一个执行器 | 确保三级数据更新逻辑一致 |
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
> **一句话总结**:研究方案定义了"查什么",变量清单定义了"查哪些字段",质控规则定义了"怎么查",三级数据结构记录了"查的结果",质控报告汇总了"结论是什么"——这条链路从头到尾 1:1 对齐,是 CRA Agent 准确运行的根基。
|
||||
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